MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004578	AGC	2	6	56606	56611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867282
1002	NC_004578	CAATT	2	10	56612	56621	40 %	40 %	0 %	20 %	28867282
1003	NC_004578	TCG	2	6	56645	56650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867282
1004	NC_004578	CAT	2	6	56652	56657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867282
1005	NC_004578	TTG	2	6	56753	56758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867282
1006	NC_004578	AGC	2	6	56815	56820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867282
1007	NC_004578	CAT	2	6	56896	56901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867282
1008	NC_004578	GAAA	2	8	56915	56922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004578	TCGGCG	2	12	57052	57063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28867283
1010	NC_004578	TCA	2	6	57077	57082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867283
1011	NC_004578	TCT	2	6	57127	57132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867283
1012	NC_004578	CAA	2	6	57156	57161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867283
1013	NC_004578	CACC	2	8	57287	57294	25 %	0 %	0 %	75 %	28867283
1014	NC_004578	C	6	6	57299	57304	0 %	0 %	0 %	100 %	28867283
1015	NC_004578	CGG	2	6	57400	57405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_004578	TGG	2	6	57451	57456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004578	CGGCG	2	10	57532	57541	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_004578	GGC	2	6	57620	57625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_004578	GTTGC	2	10	57645	57654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_004578	TGCC	2	8	57718	57725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_004578	GGC	2	6	57731	57736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_004578	GCG	2	6	57741	57746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_004578	ATC	2	6	57759	57764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_004578	CGG	2	6	57766	57771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_004578	GAG	2	6	57780	57785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004578	TGC	2	6	57892	57897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_004578	TGT	2	6	57991	57996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004578	GCC	2	6	58004	58009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_004578	GCT	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_004578	GTT	2	6	58049	58054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004578	GCC	2	6	58055	58060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_004578	GGC	2	6	58088	58093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_004578	GTCG	2	8	58100	58107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_004578	TGG	2	6	58183	58188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_004578	GCG	2	6	58189	58194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_004578	AAAT	2	8	58209	58216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004578	CTG	2	6	58241	58246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_004578	CTA	2	6	58278	58283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_004578	GAT	2	6	58303	58308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004578	CAG	2	6	58330	58335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_004578	TAA	2	6	58385	58390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28867284
1042	NC_004578	CGA	2	6	58403	58408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1043	NC_004578	ACG	2	6	58483	58488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1044	NC_004578	CAT	2	6	58547	58552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867284
1045	NC_004578	GAA	2	6	58641	58646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867284
1046	NC_004578	GC	3	6	58665	58670	0 %	0 %	50 %	50 %	28867284
1047	NC_004578	TCG	2	6	58679	58684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1048	NC_004578	GAA	2	6	58701	58706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867284
1049	NC_004578	GCA	2	6	58709	58714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1050	NC_004578	GCT	2	6	58716	58721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1051	NC_004578	A	6	6	58723	58728	100 %	0 %	0 %	0 %	28867284
1052	NC_004578	CGC	2	6	58762	58767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867284
1053	NC_004578	CGA	2	6	58823	58828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1054	NC_004578	CTG	2	6	58836	58841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1055	NC_004578	TGC	2	6	58861	58866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1056	NC_004578	GATC	2	8	58952	58959	25 %	25 %	25 %	25 %	28867284
1057	NC_004578	CTT	3	9	59021	59029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867284
1058	NC_004578	A	6	6	59038	59043	100 %	0 %	0 %	0 %	28867284
1059	NC_004578	CGAC	2	8	59044	59051	25 %	0 %	25 %	50 %	28867284
1060	NC_004578	GC	3	6	59129	59134	0 %	0 %	50 %	50 %	28867284
1061	NC_004578	TATG	2	8	59135	59142	25 %	50 %	25 %	0 %	28867284
1062	NC_004578	CCG	2	6	59152	59157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867284
1063	NC_004578	CGG	2	6	59258	59263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867284
1064	NC_004578	CAGA	2	8	59271	59278	50 %	0 %	25 %	25 %	28867284
1065	NC_004578	GCT	2	6	59311	59316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1066	NC_004578	TCG	2	6	59377	59382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1067	NC_004578	GAA	2	6	59447	59452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867284
1068	NC_004578	ATGC	2	8	59502	59509	25 %	25 %	25 %	25 %	28867284
1069	NC_004578	TCAT	2	8	59582	59589	25 %	50 %	0 %	25 %	28867284
1070	NC_004578	TCG	2	6	59602	59607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1071	NC_004578	CGA	2	6	59659	59664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867284
1072	NC_004578	CTT	2	6	59759	59764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867284
1073	NC_004578	TC	3	6	59868	59873	0 %	50 %	0 %	50 %	28867284
1074	NC_004578	CG	3	6	59893	59898	0 %	0 %	50 %	50 %	28867284
1075	NC_004578	AGC	2	6	59925	59930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_004578	TGA	2	6	59956	59961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_004578	CCTG	2	8	60034	60041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_004578	AATGT	2	10	60084	60093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_004578	CCG	2	6	60103	60108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_004578	CAG	2	6	60111	60116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_004578	GA	3	6	60155	60160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_004578	GTG	2	6	60189	60194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_004578	CT	3	6	60200	60205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_004578	C	6	6	60292	60297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1085	NC_004578	CAC	2	6	60394	60399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_004578	CAG	2	6	60408	60413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867285
1087	NC_004578	CAG	2	6	60452	60457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867285
1088	NC_004578	TGT	2	6	60469	60474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867285
1089	NC_004578	GC	3	6	60518	60523	0 %	0 %	50 %	50 %	28867285
1090	NC_004578	TCG	2	6	60567	60572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867285
1091	NC_004578	CCTCTT	2	12	60586	60597	0 %	50 %	0 %	50 %	28867285
1092	NC_004578	GCC	2	6	60611	60616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867285
1093	NC_004578	ATTTG	2	10	60628	60637	20 %	60 %	20 %	0 %	28867285
1094	NC_004578	CA	3	6	60757	60762	50 %	0 %	0 %	50 %	28867285
1095	NC_004578	GTG	2	6	60786	60791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867285
1096	NC_004578	TGA	2	6	60820	60825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867285
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1099	NC_004578	GC	3	6	60949	60954	0 %	0 %	50 %	50 %	28867285
1100	NC_004578	CGGT	2	8	60971	60978	0 %	25 %	50 %	25 %	28867285
1101	NC_004578	TGCC	2	8	61017	61024	0 %	25 %	25 %	50 %	28867285
1102	NC_004578	CCA	2	6	61065	61070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867285
1103	NC_004578	GTT	2	6	61090	61095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867285
1104	NC_004578	TGT	2	6	61304	61309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867285
1105	NC_004578	TCC	2	6	61362	61367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867285
1106	NC_004578	A	7	7	61440	61446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_004578	CT	3	6	61557	61562	0 %	50 %	0 %	50 %	28867286
1108	NC_004578	CGC	2	6	61580	61585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867286
1109	NC_004578	CGTC	2	8	61589	61596	0 %	25 %	25 %	50 %	28867286
1110	NC_004578	GCC	3	9	61725	61733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_004578	GTT	2	6	61769	61774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004578	GGT	2	6	61828	61833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004578	TCG	2	6	62166	62171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867287
1114	NC_004578	TGA	2	6	62278	62283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867287
1115	NC_004578	CCA	2	6	62289	62294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867287
1116	NC_004578	TGAT	2	8	62346	62353	25 %	50 %	25 %	0 %	28867287
1117	NC_004578	GTC	2	6	62430	62435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867287
1118	NC_004578	GGA	2	6	62455	62460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867287
1119	NC_004578	CGA	2	6	62515	62520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867287
1120	NC_004578	AGA	2	6	62530	62535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867287
1121	NC_004578	AC	3	6	62586	62591	50 %	0 %	0 %	50 %	28867287
1122	NC_004578	GCT	3	9	62606	62614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867287
1123	NC_004578	GGC	2	6	62641	62646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867287
1124	NC_004578	CG	3	6	62657	62662	0 %	0 %	50 %	50 %	28867287
1125	NC_004578	GTC	2	6	62671	62676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867287
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1127	NC_004578	GGT	2	6	62775	62780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867287
1128	NC_004578	ATG	2	6	62790	62795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867287
1129	NC_004578	CGT	2	6	62797	62802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867287
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1131	NC_004578	GTC	2	6	62849	62854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867287
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1491	NC_004578	ACC	2	6	82083	82088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1494	NC_004578	CGA	2	6	82217	82222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1497	NC_004578	CTG	2	6	82281	82286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_004578	GC	3	6	82293	82298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1499	NC_004578	CCAC	2	8	82405	82412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1500	NC_004578	GGC	2	6	82419	82424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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