MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 chromosome

Total Repeats: 46127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002663	CGCC	2	8	295399	295406	0 %	0 %	25 %	75 %	15602127
6002	NC_002663	GAC	2	6	295469	295474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602127
6003	NC_002663	TAA	2	6	295508	295513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602127
6004	NC_002663	CAT	2	6	295589	295594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602127
6005	NC_002663	ATAA	2	8	295599	295606	75 %	25 %	0 %	0 %	15602127
6006	NC_002663	CCA	2	6	295668	295673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602127
6007	NC_002663	TGC	2	6	295682	295687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602127
6008	NC_002663	AAAG	2	8	295697	295704	75 %	0 %	25 %	0 %	15602127
6009	NC_002663	GCT	2	6	295725	295730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602127
6010	NC_002663	AAAC	2	8	295751	295758	75 %	0 %	0 %	25 %	15602127
6011	NC_002663	ATC	2	6	295805	295810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602127
6012	NC_002663	GTA	2	6	295885	295890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602127
6013	NC_002663	ATT	2	6	295899	295904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602127
6014	NC_002663	GTA	2	6	295942	295947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602128
6015	NC_002663	TAA	2	6	296074	296079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602128
6016	NC_002663	TAA	2	6	296119	296124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602128
6017	NC_002663	ATA	2	6	296135	296140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602128
6018	NC_002663	AAT	2	6	296158	296163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602128
6019	NC_002663	GCA	2	6	296271	296276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602128
6020	NC_002663	ATG	2	6	296294	296299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602128
6021	NC_002663	TAA	2	6	296488	296493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602128
6022	NC_002663	AC	3	6	296521	296526	50 %	0 %	0 %	50 %	15602128
6023	NC_002663	AT	3	6	296546	296551	50 %	50 %	0 %	0 %	15602128
6024	NC_002663	A	6	6	296651	296656	100 %	0 %	0 %	0 %	15602128
6025	NC_002663	AAGT	2	8	296671	296678	50 %	25 %	25 %	0 %	15602128
6026	NC_002663	ACC	2	6	296703	296708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602128
6027	NC_002663	TTC	2	6	296747	296752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602128
6028	NC_002663	AAT	2	6	296936	296941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602129
6029	NC_002663	TTC	2	6	296969	296974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602129
6030	NC_002663	TAA	2	6	296996	297001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602129
6031	NC_002663	CAA	2	6	297022	297027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602129
6032	NC_002663	CAA	2	6	297145	297150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602129
6033	NC_002663	T	6	6	297156	297161	0 %	100 %	0 %	0 %	15602129
6034	NC_002663	TTG	2	6	297194	297199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602129
6035	NC_002663	AAT	2	6	297221	297226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602129
6036	NC_002663	CTT	3	9	297247	297255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602129
6037	NC_002663	ACC	2	6	297390	297395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602129
6038	NC_002663	GTT	3	9	297415	297423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602129
6039	NC_002663	ACC	2	6	297425	297430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602129
6040	NC_002663	TTC	2	6	297461	297466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602129
6041	NC_002663	TGACG	2	10	297604	297613	20 %	20 %	40 %	20 %	15602129
6042	NC_002663	AAT	2	6	297653	297658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602129
6043	NC_002663	TTC	2	6	297674	297679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602129
6044	NC_002663	TGT	2	6	297704	297709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602129
6045	NC_002663	TTG	2	6	297753	297758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602129
6046	NC_002663	GTTAA	2	10	297762	297771	40 %	40 %	20 %	0 %	15602129
6047	NC_002663	AAT	2	6	297824	297829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602129
6048	NC_002663	TGAAC	2	10	297840	297849	40 %	20 %	20 %	20 %	15602129
6049	NC_002663	AAAT	2	8	297902	297909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_002663	A	6	6	297941	297946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_002663	AATA	2	8	297974	297981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_002663	A	6	6	297995	298000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_002663	AG	3	6	298007	298012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_002663	T	6	6	298023	298028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_002663	GAT	2	6	298130	298135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_002663	ACC	2	6	298231	298236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602130
6057	NC_002663	ACA	2	6	298311	298316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602130
6058	NC_002663	ATT	2	6	298320	298325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602130
6059	NC_002663	CTTC	2	8	298381	298388	0 %	50 %	0 %	50 %	15602130
6060	NC_002663	GTG	2	6	298493	298498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602130
6061	NC_002663	GAG	2	6	298522	298527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15602130
6062	NC_002663	TTA	2	6	298529	298534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602130
6063	NC_002663	ATA	2	6	298616	298621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602130
6064	NC_002663	AGA	2	6	298665	298670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602130
6065	NC_002663	GAA	2	6	298714	298719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602130
6066	NC_002663	T	6	6	298738	298743	0 %	100 %	0 %	0 %	15602130
6067	NC_002663	TGG	2	6	298785	298790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602130
6068	NC_002663	CA	3	6	298864	298869	50 %	0 %	0 %	50 %	15602130
6069	NC_002663	GCTT	2	8	298905	298912	0 %	50 %	25 %	25 %	15602130
6070	NC_002663	CAG	2	6	298934	298939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602130
6071	NC_002663	CAGA	2	8	298954	298961	50 %	0 %	25 %	25 %	15602130
6072	NC_002663	CAG	2	6	299080	299085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602130
6073	NC_002663	TTG	2	6	299087	299092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602130
6074	NC_002663	CAA	2	6	299104	299109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602130
6075	NC_002663	A	6	6	299118	299123	100 %	0 %	0 %	0 %	15602130
6076	NC_002663	ATGA	2	8	299161	299168	50 %	25 %	25 %	0 %	15602130
6077	NC_002663	GGA	2	6	299317	299322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15602130
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6080	NC_002663	T	7	7	299475	299481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_002663	TTG	2	6	299512	299517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602131
6082	NC_002663	A	6	6	299546	299551	100 %	0 %	0 %	0 %	15602131
6083	NC_002663	TAA	2	6	299620	299625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602131
6084	NC_002663	TTG	2	6	299626	299631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602131
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6087	NC_002663	CAT	2	6	299853	299858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602131
6088	NC_002663	TATT	2	8	299891	299898	25 %	75 %	0 %	0 %	15602131
6089	NC_002663	GAG	2	6	299907	299912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15602131
6090	NC_002663	CT	3	6	299987	299992	0 %	50 %	0 %	50 %	15602131
6091	NC_002663	CGC	2	6	300007	300012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15602131
6092	NC_002663	GAG	2	6	300021	300026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15602131
6093	NC_002663	CTT	2	6	300048	300053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602131
6094	NC_002663	TTA	2	6	300104	300109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602131
6095	NC_002663	TCG	2	6	300189	300194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602131
6096	NC_002663	TAA	2	6	300204	300209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602131
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6099	NC_002663	CG	3	6	300310	300315	0 %	0 %	50 %	50 %	15602131
6100	NC_002663	TACT	2	8	300336	300343	25 %	50 %	0 %	25 %	15602131
6101	NC_002663	GCA	2	6	300368	300373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602131
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6105	NC_002663	ATA	2	6	300501	300506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602131
6106	NC_002663	TC	3	6	300535	300540	0 %	50 %	0 %	50 %	15602131
6107	NC_002663	GA	3	6	300597	300602	50 %	0 %	50 %	0 %	15602131
6108	NC_002663	CTT	2	6	300639	300644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602131
6109	NC_002663	TTTG	2	8	300645	300652	0 %	75 %	25 %	0 %	15602131
6110	NC_002663	CCT	2	6	300671	300676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15602131
6111	NC_002663	TGA	2	6	300770	300775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602131
6112	NC_002663	TTG	2	6	300838	300843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602131
6113	NC_002663	AAT	2	6	300844	300849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602131
6114	NC_002663	GTT	2	6	300942	300947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602131
6115	NC_002663	CTG	2	6	300999	301004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602131
6116	NC_002663	CAC	2	6	301026	301031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602131
6117	NC_002663	GAA	2	6	301032	301037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602131
6118	NC_002663	T	6	6	301072	301077	0 %	100 %	0 %	0 %	15602131
6119	NC_002663	AAT	2	6	301109	301114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602131
6120	NC_002663	TAA	2	6	301150	301155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602131
6121	NC_002663	TTTG	2	8	301200	301207	0 %	75 %	25 %	0 %	15602131
6122	NC_002663	TGA	2	6	301211	301216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602131
6123	NC_002663	AGC	2	6	301288	301293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602131
6124	NC_002663	GTTAAT	2	12	301402	301413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15602131
6125	NC_002663	TCTT	2	8	301466	301473	0 %	75 %	0 %	25 %	15602131
6126	NC_002663	T	6	6	301519	301524	0 %	100 %	0 %	0 %	15602131
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6139	NC_002663	A	7	7	302190	302196	100 %	0 %	0 %	0 %	15602132
6140	NC_002663	CAT	2	6	302267	302272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602132
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6143	NC_002663	CA	3	6	302375	302380	50 %	0 %	0 %	50 %	15602132
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6157	NC_002663	GTT	2	6	303277	303282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602132
6158	NC_002663	T	6	6	303363	303368	0 %	100 %	0 %	0 %	15602132
6159	NC_002663	TAA	2	6	303392	303397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6245	NC_002663	A	6	6	307534	307539	100 %	0 %	0 %	0 %	15602135
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6251	NC_002663	ATG	2	6	307886	307891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602135
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6253	NC_002663	TTG	2	6	308173	308178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602136
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6342	NC_002663	CGT	2	6	312595	312600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6362	NC_002663	CAT	2	6	313846	313851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602141
6363	NC_002663	AG	3	6	313857	313862	50 %	0 %	50 %	0 %	15602141
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6366	NC_002663	TTAA	2	8	313972	313979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6368	NC_002663	A	9	9	314018	314026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6369	NC_002663	TAAA	2	8	314030	314037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6370	NC_002663	A	6	6	314068	314073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6371	NC_002663	AAAG	2	8	314157	314164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6372	NC_002663	TTA	3	9	314213	314221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6373	NC_002663	GGT	2	6	314238	314243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6374	NC_002663	A	7	7	314252	314258	100 %	0 %	0 %	0 %	15602142
6375	NC_002663	GGT	2	6	314296	314301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602142
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6377	NC_002663	ATT	2	6	314441	314446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602142
6378	NC_002663	TGCA	2	8	314564	314571	25 %	25 %	25 %	25 %	15602142
6379	NC_002663	A	6	6	314732	314737	100 %	0 %	0 %	0 %	15602142
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6488	NC_002663	A	6	6	320508	320513	100 %	0 %	0 %	0 %	15602146
6489	NC_002663	CAAA	2	8	320564	320571	75 %	0 %	0 %	25 %	15602146
6490	NC_002663	TGA	2	6	320576	320581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602146
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6492	NC_002663	TGG	2	6	320612	320617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602146
6493	NC_002663	GAT	2	6	320667	320672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602146
6494	NC_002663	TGA	2	6	320692	320697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602146
6495	NC_002663	GGT	2	6	320709	320714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602146
6496	NC_002663	AGA	3	9	320720	320728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602146
6497	NC_002663	GCT	2	6	320733	320738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602146
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6499	NC_002663	CGT	2	6	320765	320770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602146
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