MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	TTATC	2	10	502	511	20 %	60 %	0 %	20 %	14520219
2	NC_000868	ATTTA	2	10	1306	1315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000868	GCGTA	2	10	3108	3117	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000868	TAAAT	2	10	3276	3285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000868	CTTCC	2	10	3361	3370	0 %	40 %	0 %	60 %	14520224
6	NC_000868	GAAAG	2	10	5499	5508	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000868	TTAAC	2	10	5626	5635	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_000868	ACCTC	2	10	5931	5940	20 %	20 %	0 %	60 %	14520226
9	NC_000868	GGAAA	2	10	6495	6504	60 %	0 %	40 %	0 %	14520227
10	NC_000868	GAAAG	2	10	10671	10680	60 %	0 %	40 %	0 %	14520231
11	NC_000868	AATTT	2	10	13997	14006	40 %	60 %	0 %	0 %	14520234
12	NC_000868	TCCTC	2	10	15258	15267	0 %	40 %	0 %	60 %	14520235
13	NC_000868	TATTC	2	10	17257	17266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_000868	CTCCA	2	10	18552	18561	20 %	20 %	0 %	60 %	14520239
15	NC_000868	CAATC	2	10	20184	20193	40 %	20 %	0 %	40 %	14520240
16	NC_000868	GCTAT	2	10	20437	20446	20 %	40 %	20 %	20 %	14520240
17	NC_000868	CAGTA	2	10	20450	20459	40 %	20 %	20 %	20 %	14520240
18	NC_000868	AGTTT	2	10	22423	22432	20 %	60 %	20 %	0 %	14520242
19	NC_000868	AATGG	2	10	22449	22458	40 %	20 %	40 %	0 %	14520242
20	NC_000868	AGGAA	2	10	27864	27873	60 %	0 %	40 %	0 %	14520248
21	NC_000868	GTTCG	2	10	28944	28953	0 %	40 %	40 %	20 %	14520249
22	NC_000868	CATCC	2	10	29831	29840	20 %	20 %	0 %	60 %	14520250
23	NC_000868	CGTAG	2	10	30252	30261	20 %	20 %	40 %	20 %	14520250
24	NC_000868	TCCAA	2	10	30547	30556	40 %	20 %	0 %	40 %	14520250
25	NC_000868	TTTAA	2	10	32444	32453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000868	GGCAG	2	10	32662	32671	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_000868	TTGCT	2	10	33068	33077	0 %	60 %	20 %	20 %	14520252
28	NC_000868	ACTAA	2	10	33962	33971	60 %	20 %	0 %	20 %	14520253
29	NC_000868	TAAAC	2	10	34102	34111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_000868	CTTTT	2	10	37510	37519	0 %	80 %	0 %	20 %	14520258
31	NC_000868	GCATT	2	10	37897	37906	20 %	40 %	20 %	20 %	14520259
32	NC_000868	AAGGA	2	10	42251	42260	60 %	0 %	40 %	0 %	14520265
33	NC_000868	CCAAC	2	10	43429	43438	40 %	0 %	0 %	60 %	14520266
34	NC_000868	TTCCT	2	10	43675	43684	0 %	60 %	0 %	40 %	14520266
35	NC_000868	TCCTT	2	10	43728	43737	0 %	60 %	0 %	40 %	14520267
36	NC_000868	TTTCC	2	10	45607	45616	0 %	60 %	0 %	40 %	14520270
37	NC_000868	AGAAA	2	10	49567	49576	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000868	AAGTT	2	10	52799	52808	40 %	40 %	20 %	0 %	14520277
39	NC_000868	CTTCC	2	10	53186	53195	0 %	40 %	0 %	60 %	14520277
40	NC_000868	GCTCT	2	10	54334	54343	0 %	40 %	20 %	40 %	14520278
41	NC_000868	CTTAT	2	10	56724	56733	20 %	60 %	0 %	20 %	14520280
42	NC_000868	TCAAA	2	10	57344	57353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_000868	AAAAG	2	10	59217	59226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000868	GAAAG	2	10	60605	60614	60 %	0 %	40 %	0 %	14520284
45	NC_000868	TGCAA	2	10	62791	62800	40 %	20 %	20 %	20 %	14520287
46	NC_000868	AGATA	2	10	62875	62884	60 %	20 %	20 %	0 %	14520287
47	NC_000868	CTTCG	2	10	64284	64293	0 %	40 %	20 %	40 %	14520290
48	NC_000868	AGAGG	2	10	65161	65170	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000868	GAGAA	2	10	67590	67599	60 %	0 %	40 %	0 %	14520293
50	NC_000868	CCATC	2	10	69035	69044	20 %	20 %	0 %	60 %	14520294
51	NC_000868	TCTAT	2	10	69629	69638	20 %	60 %	0 %	20 %	14520295
52	NC_000868	AGCAT	2	10	71549	71558	40 %	20 %	20 %	20 %	14520298
53	NC_000868	AGGTG	2	10	71995	72004	20 %	20 %	60 %	0 %	14520298
54	NC_000868	GGAAG	2	10	80843	80852	40 %	0 %	60 %	0 %	33356667
55	NC_000868	TCTCA	2	10	81996	82005	20 %	40 %	0 %	40 %	14520309
56	NC_000868	GTATC	2	10	83247	83256	20 %	40 %	20 %	20 %	14520312
57	NC_000868	TAGCA	2	10	84093	84102	40 %	20 %	20 %	20 %	14520313
58	NC_000868	TCATT	2	10	85665	85674	20 %	60 %	0 %	20 %	14520314
59	NC_000868	AGGGA	2	10	87015	87024	40 %	0 %	60 %	0 %	14520315
60	NC_000868	GGTAG	2	10	87313	87322	20 %	20 %	60 %	0 %	14520315
61	NC_000868	CTTCC	2	10	89047	89056	0 %	40 %	0 %	60 %	14520316
62	NC_000868	AATTA	2	10	91937	91946	60 %	40 %	0 %	0 %	14520319
63	NC_000868	CCGTT	2	10	94840	94849	0 %	40 %	20 %	40 %	33356668
64	NC_000868	TCCCC	2	10	95462	95471	0 %	20 %	0 %	80 %	33356668
65	NC_000868	GAAGG	2	10	98869	98878	40 %	0 %	60 %	0 %	14520326
66	NC_000868	AGAGA	2	10	99889	99898	60 %	0 %	40 %	0 %	14520327
67	NC_000868	AGAGG	2	10	102304	102313	40 %	0 %	60 %	0 %	14520327
68	NC_000868	TAAGA	2	10	103471	103480	60 %	20 %	20 %	0 %	14520328
69	NC_000868	TAGGT	2	10	103483	103492	20 %	40 %	40 %	0 %	14520328
70	NC_000868	AAGCC	2	10	104420	104429	40 %	0 %	20 %	40 %	14520328
71	NC_000868	CACAA	2	10	104768	104777	60 %	0 %	0 %	40 %	14520328
72	NC_000868	TTCAA	2	10	105965	105974	40 %	40 %	0 %	20 %	14520328
73	NC_000868	CAGAG	2	10	107862	107871	40 %	0 %	40 %	20 %	14520329
74	NC_000868	AGGGA	2	10	107935	107944	40 %	0 %	60 %	0 %	14520329
75	NC_000868	AGAGG	2	10	108426	108435	40 %	0 %	60 %	0 %	14520329
76	NC_000868	GTTCA	2	10	110164	110173	20 %	40 %	20 %	20 %	14520331
77	NC_000868	GATAA	2	10	111314	111323	60 %	20 %	20 %	0 %	14520332
78	NC_000868	GGAAA	2	10	111544	111553	60 %	0 %	40 %	0 %	14520332
79	NC_000868	AGAGG	2	10	112103	112112	40 %	0 %	60 %	0 %	14520333
80	NC_000868	TATAA	2	10	112776	112785	60 %	40 %	0 %	0 %	14520333
81	NC_000868	TTCTC	2	10	113713	113722	0 %	60 %	0 %	40 %	14520336
82	NC_000868	TTGCA	2	10	114276	114285	20 %	40 %	20 %	20 %	14520336
83	NC_000868	ACTTC	2	10	120984	120993	20 %	40 %	0 %	40 %	14520339
84	NC_000868	GAAGT	2	10	123116	123125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000868	ATTCT	2	10	123173	123182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_000868	TCCTC	2	10	123541	123550	0 %	40 %	0 %	60 %	14520341
87	NC_000868	TCCTC	2	10	125113	125122	0 %	40 %	0 %	60 %	14520343
88	NC_000868	AGATT	2	10	125828	125837	40 %	40 %	20 %	0 %	14520344
89	NC_000868	TGCCC	2	10	126102	126111	0 %	20 %	20 %	60 %	14520344
90	NC_000868	AAACC	2	10	126521	126530	60 %	0 %	0 %	40 %	14520345
91	NC_000868	GCTCA	2	10	128871	128880	20 %	20 %	20 %	40 %	14520348
92	NC_000868	TGAAG	2	10	129585	129594	40 %	20 %	40 %	0 %	14520349
93	NC_000868	GGAAG	2	10	130970	130979	40 %	0 %	60 %	0 %	14520350
94	NC_000868	AGAAT	2	10	132397	132406	60 %	20 %	20 %	0 %	14520351
95	NC_000868	CGTAT	2	10	132953	132962	20 %	40 %	20 %	20 %	14520351
96	NC_000868	CTTAT	2	10	134160	134169	20 %	60 %	0 %	20 %	14520352
97	NC_000868	GAGTT	2	10	134439	134448	20 %	40 %	40 %	0 %	14520352
98	NC_000868	GCATT	2	10	135545	135554	20 %	40 %	20 %	20 %	14520353
99	NC_000868	TAATT	2	10	135987	135996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000868	GAAAG	2	10	138089	138098	60 %	0 %	40 %	0 %	14520356
101	NC_000868	CCTAT	2	10	139502	139511	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_000868	TAAGA	2	10	143680	143689	60 %	20 %	20 %	0 %	14520360
103	NC_000868	AGAGG	2	10	143881	143890	40 %	0 %	60 %	0 %	14520360
104	NC_000868	GGGAG	2	10	144991	145000	20 %	0 %	80 %	0 %	14520361
105	NC_000868	AAGGA	2	10	145968	145977	60 %	0 %	40 %	0 %	14520363
106	NC_000868	AAGCC	2	10	146386	146395	40 %	0 %	20 %	40 %	14520363
107	NC_000868	GATAG	2	10	147513	147522	40 %	20 %	40 %	0 %	14520364
108	NC_000868	ATTTT	2	10	147881	147890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000868	ATTCT	2	10	147991	148000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_000868	ACGAG	2	10	148827	148836	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_000868	CCCTC	2	10	152539	152548	0 %	20 %	0 %	80 %	14520367
112	NC_000868	GCTAA	2	10	153235	153244	40 %	20 %	20 %	20 %	14520368
113	NC_000868	CCCTC	2	10	156647	156656	0 %	20 %	0 %	80 %	14520371
114	NC_000868	AGGTC	2	10	158701	158710	20 %	20 %	40 %	20 %	14520374
115	NC_000868	TTTTC	2	10	161812	161821	0 %	80 %	0 %	20 %	14520377
116	NC_000868	TTTTC	2	10	162617	162626	0 %	80 %	0 %	20 %	14520377
117	NC_000868	TTTTG	2	10	162910	162919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000868	TAGCT	2	10	164183	164192	20 %	40 %	20 %	20 %	14520379
119	NC_000868	ATCCC	2	10	164346	164355	20 %	20 %	0 %	60 %	14520379
120	NC_000868	AGGGA	2	10	164633	164642	40 %	0 %	60 %	0 %	14520380
121	NC_000868	CCTCT	2	10	167551	167560	0 %	40 %	0 %	60 %	14520384
122	NC_000868	AGAGG	2	10	170059	170068	40 %	0 %	60 %	0 %	14520387
123	NC_000868	ATAGT	2	10	170966	170975	40 %	40 %	20 %	0 %	14520388
124	NC_000868	CCCTT	2	10	172698	172707	0 %	40 %	0 %	60 %	14520390
125	NC_000868	TGGAG	2	10	173887	173896	20 %	20 %	60 %	0 %	14520391
126	NC_000868	CACCG	2	10	174527	174536	20 %	0 %	20 %	60 %	14520393
127	NC_000868	GAATA	2	10	175255	175264	60 %	20 %	20 %	0 %	14520394
128	NC_000868	AAAGT	2	10	175456	175465	60 %	20 %	20 %	0 %	14520394
129	NC_000868	GATTG	2	10	177328	177337	20 %	40 %	40 %	0 %	14520395
130	NC_000868	AGGGC	2	10	177782	177791	20 %	0 %	60 %	20 %	14520395
131	NC_000868	ATGAA	2	10	178304	178313	60 %	20 %	20 %	0 %	14520396
132	NC_000868	TTGGA	2	10	178469	178478	20 %	40 %	40 %	0 %	14520396
133	NC_000868	AAGCT	2	10	179749	179758	40 %	20 %	20 %	20 %	14520397
134	NC_000868	CTGGA	2	10	182238	182247	20 %	20 %	40 %	20 %	14520398
135	NC_000868	AGAGG	2	10	182582	182591	40 %	0 %	60 %	0 %	14520398
136	NC_000868	GAGCT	2	10	185098	185107	20 %	20 %	40 %	20 %	14520399
137	NC_000868	ATATT	2	10	185554	185563	40 %	60 %	0 %	0 %	14520399
138	NC_000868	TCGAG	2	10	186220	186229	20 %	20 %	40 %	20 %	14520400
139	NC_000868	TCCCC	2	10	186266	186275	0 %	20 %	0 %	80 %	14520400
140	NC_000868	CTTAT	2	10	186814	186823	20 %	60 %	0 %	20 %	33356669
141	NC_000868	TTAGC	2	10	188120	188129	20 %	40 %	20 %	20 %	14520402
142	NC_000868	GAAAA	2	10	188827	188836	80 %	0 %	20 %	0 %	14520402
143	NC_000868	ATAGA	2	10	189033	189042	60 %	20 %	20 %	0 %	14520403
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149	NC_000868	TTAGC	2	10	194625	194634	20 %	40 %	20 %	20 %	14520409
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154	NC_000868	GTGCC	2	10	205451	205460	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_000868	GGTCG	2	10	206465	206474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_000868	GGCTC	2	10	206835	206844	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_000868	GAGGG	2	10	207433	207442	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
158	NC_000868	CGGGT	2	10	209076	209085	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
159	NC_000868	CCCTT	2	10	211264	211273	0 %	40 %	0 %	60 %	14520420
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161	NC_000868	AACTT	2	10	211983	211992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_000868	GGAAA	2	10	212784	212793	60 %	0 %	40 %	0 %	14520422
163	NC_000868	AGTTG	2	10	214229	214238	20 %	40 %	40 %	0 %	14520423
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179	NC_000868	GCATG	2	10	228562	228571	20 %	20 %	40 %	20 %	14520439
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181	NC_000868	GAGCT	2	10	235461	235470	20 %	20 %	40 %	20 %	14520444
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183	NC_000868	CTATC	2	10	235649	235658	20 %	40 %	0 %	40 %	14520444
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185	NC_000868	ATTTC	2	10	237795	237804	20 %	60 %	0 %	20 %	14520446
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187	NC_000868	AGGGG	2	10	239680	239689	20 %	0 %	80 %	0 %	14520447
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197	NC_000868	TGAAT	2	10	250819	250828	40 %	40 %	20 %	0 %	14520461
198	NC_000868	AAGGA	2	10	250923	250932	60 %	0 %	40 %	0 %	14520461
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206	NC_000868	GATTG	2	10	263005	263014	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_000868	AACTT	2	10	266818	266827	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_000868	TATCA	2	10	299982	299991	40 %	40 %	0 %	20 %	14520511
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234	NC_000868	GAAAA	2	10	303876	303885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_000868	TTCCC	2	10	314301	314310	0 %	40 %	0 %	60 %	14520521
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250	NC_000868	CCTTC	2	10	330791	330800	0 %	40 %	0 %	60 %	14520546
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252	NC_000868	CCTTC	2	10	331213	331222	0 %	40 %	0 %	60 %	14520547
253	NC_000868	TCTCA	2	10	331790	331799	20 %	40 %	0 %	40 %	14520549
254	NC_000868	CCTCT	2	10	334746	334755	0 %	40 %	0 %	60 %	14520555
255	NC_000868	CCCTT	2	10	337382	337391	0 %	40 %	0 %	60 %	14520559
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257	NC_000868	CTTCC	2	10	344212	344221	0 %	40 %	0 %	60 %	14520569
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259	NC_000868	AGGAG	2	10	346425	346434	40 %	0 %	60 %	0 %	14520571
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261	NC_000868	TTGGA	2	10	346911	346920	20 %	40 %	40 %	0 %	14520571
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263	NC_000868	TCAAG	2	10	347646	347655	40 %	20 %	20 %	20 %	14520571
264	NC_000868	TAATT	2	10	348571	348580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_000868	CTCAA	2	10	350736	350745	40 %	20 %	0 %	40 %	14520575
266	NC_000868	GCTCC	2	10	350898	350907	0 %	20 %	20 %	60 %	14520575
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268	NC_000868	TCCTC	2	10	355416	355425	0 %	40 %	0 %	60 %	14520579
269	NC_000868	TCCCC	2	10	356014	356023	0 %	20 %	0 %	80 %	14520580
270	NC_000868	TTTTG	2	10	357959	357968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_000868	TTCCT	2	10	499492	499501	0 %	60 %	0 %	40 %	14520737
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390	NC_000868	GGATT	2	10	501272	501281	20 %	40 %	40 %	0 %	14520739
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401	NC_000868	TCTCC	2	10	514609	514618	0 %	40 %	0 %	60 %	14520759
402	NC_000868	GGGGA	2	10	516685	516694	20 %	0 %	80 %	0 %	14520762
403	NC_000868	ATTGG	2	10	517234	517243	20 %	40 %	40 %	0 %	14520763
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