MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000868	GCC	2	6	167448	167453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520384
3002	NC_000868	TCA	2	6	167481	167486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520384
3003	NC_000868	CCTCT	2	10	167551	167560	0 %	40 %	0 %	60 %	14520384
3004	NC_000868	GGC	2	6	167597	167602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520384
3005	NC_000868	TCCTCG	2	12	167613	167624	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14520384
3006	NC_000868	TAG	2	6	167684	167689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520384
3007	NC_000868	CCT	2	6	167710	167715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520384
3008	NC_000868	TAAA	2	8	167747	167754	75 %	25 %	0 %	0 %	14520384
3009	NC_000868	CTT	2	6	167789	167794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520384
3010	NC_000868	TCG	2	6	167850	167855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520384
3011	NC_000868	GTA	2	6	167873	167878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520384
3012	NC_000868	TCT	2	6	167901	167906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520384
3013	NC_000868	CCCTTG	2	12	168000	168011	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	14520384
3014	NC_000868	TATC	2	8	168037	168044	25 %	50 %	0 %	25 %	14520384
3015	NC_000868	TC	3	6	168244	168249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_000868	AAG	2	6	168323	168328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520385
3017	NC_000868	G	6	6	168383	168388	0 %	0 %	100 %	0 %	14520385
3018	NC_000868	AT	3	6	168449	168454	50 %	50 %	0 %	0 %	14520385
3019	NC_000868	GTA	2	6	168590	168595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520385
3020	NC_000868	AGG	2	6	168608	168613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520385
3021	NC_000868	TGA	2	6	168643	168648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520385
3022	NC_000868	TGA	2	6	168688	168693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520385
3023	NC_000868	T	6	6	168757	168762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_000868	AT	3	6	168808	168813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_000868	T	6	6	168830	168835	0 %	100 %	0 %	0 %	14520386
3026	NC_000868	GCC	2	6	168840	168845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520386
3027	NC_000868	CAT	2	6	168902	168907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520386
3028	NC_000868	CCA	2	6	168921	168926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520386
3029	NC_000868	ATA	2	6	168963	168968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520386
3030	NC_000868	GTT	2	6	169030	169035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520386
3031	NC_000868	GTT	2	6	169049	169054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520386
3032	NC_000868	ATG	2	6	169150	169155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520386
3033	NC_000868	ATGC	2	8	169182	169189	25 %	25 %	25 %	25 %	14520386
3034	NC_000868	AGG	2	6	169194	169199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520386
3035	NC_000868	ACCT	2	8	169209	169216	25 %	25 %	0 %	50 %	14520386
3036	NC_000868	AGA	2	6	169229	169234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520386
3037	NC_000868	TA	4	8	169281	169288	50 %	50 %	0 %	0 %	14520386
3038	NC_000868	TTAA	2	8	169365	169372	50 %	50 %	0 %	0 %	14520386
3039	NC_000868	ATA	2	6	169566	169571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520386
3040	NC_000868	AAG	2	6	169611	169616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520386
3041	NC_000868	AAG	2	6	169625	169630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520386
3042	NC_000868	GAT	2	6	169650	169655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520386
3043	NC_000868	GTA	2	6	169666	169671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520386
3044	NC_000868	TCT	2	6	169768	169773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520386
3045	NC_000868	TGA	2	6	169860	169865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520387
3046	NC_000868	AGA	2	6	169886	169891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520387
3047	NC_000868	G	6	6	169930	169935	0 %	0 %	100 %	0 %	14520387
3048	NC_000868	GGAACT	2	12	169970	169981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14520387
3049	NC_000868	ACG	2	6	169988	169993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520387
3050	NC_000868	AT	3	6	170009	170014	50 %	50 %	0 %	0 %	14520387
3051	NC_000868	AGA	2	6	170023	170028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520387
3052	NC_000868	AGAGG	2	10	170059	170068	40 %	0 %	60 %	0 %	14520387
3053	NC_000868	GA	3	6	170083	170088	50 %	0 %	50 %	0 %	14520387
3054	NC_000868	TAT	2	6	170143	170148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520387
3055	NC_000868	GAG	2	6	170183	170188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520387
3056	NC_000868	GTTC	2	8	170191	170198	0 %	50 %	25 %	25 %	14520387
3057	NC_000868	GGA	2	6	170311	170316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520387
3058	NC_000868	GAA	2	6	170485	170490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520387
3059	NC_000868	GAA	2	6	170548	170553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520387
3060	NC_000868	ATA	2	6	170683	170688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520388
3061	NC_000868	TAA	2	6	170696	170701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520388
3062	NC_000868	GTG	2	6	170702	170707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520388
3063	NC_000868	ATAGT	2	10	170966	170975	40 %	40 %	20 %	0 %	14520388
3064	NC_000868	ATC	2	6	171075	171080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520388
3065	NC_000868	AAG	2	6	171109	171114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520388
3066	NC_000868	GA	3	6	171141	171146	50 %	0 %	50 %	0 %	14520388
3067	NC_000868	ATA	2	6	171244	171249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520388
3068	NC_000868	GA	3	6	171261	171266	50 %	0 %	50 %	0 %	14520388
3069	NC_000868	TA	3	6	171297	171302	50 %	50 %	0 %	0 %	14520388
3070	NC_000868	ACTT	2	8	171399	171406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_000868	AGT	2	6	171416	171421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_000868	AATT	2	8	171422	171429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_000868	GCTTTA	2	12	171457	171468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3074	NC_000868	TTC	2	6	171471	171476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_000868	TTA	2	6	171483	171488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_000868	TAT	2	6	171572	171577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520389
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3078	NC_000868	TGG	2	6	171768	171773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520389
3079	NC_000868	CTTT	2	8	171932	171939	0 %	75 %	0 %	25 %	14520389
3080	NC_000868	AAG	2	6	171967	171972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520389
3081	NC_000868	GAA	2	6	172067	172072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520389
3082	NC_000868	TC	3	6	172283	172288	0 %	50 %	0 %	50 %	14520390
3083	NC_000868	TCA	2	6	172413	172418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520390
3084	NC_000868	AT	3	6	172499	172504	50 %	50 %	0 %	0 %	14520390
3085	NC_000868	TTG	2	6	172509	172514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520390
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3087	NC_000868	TAA	2	6	172572	172577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520390
3088	NC_000868	CCCTT	2	10	172698	172707	0 %	40 %	0 %	60 %	14520390
3089	NC_000868	CCCT	2	8	172729	172736	0 %	25 %	0 %	75 %	14520390
3090	NC_000868	TGGCTT	2	12	172818	172829	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	14520390
3091	NC_000868	CCT	2	6	172831	172836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520390
3092	NC_000868	GCT	2	6	172931	172936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520390
3093	NC_000868	TTG	2	6	173039	173044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520390
3094	NC_000868	CT	3	6	173046	173051	0 %	50 %	0 %	50 %	14520390
3095	NC_000868	ATG	2	6	173204	173209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520390
3096	NC_000868	TGG	2	6	173332	173337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_000868	GGC	2	6	173365	173370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520391
3098	NC_000868	AGG	2	6	173414	173419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520391
3099	NC_000868	TCG	2	6	173421	173426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520391
3100	NC_000868	AT	3	6	173445	173450	50 %	50 %	0 %	0 %	14520391
3101	NC_000868	GGA	2	6	173452	173457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520391
3102	NC_000868	AAG	2	6	173468	173473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520391
3103	NC_000868	GGAT	2	8	173485	173492	25 %	25 %	50 %	0 %	14520391
3104	NC_000868	ATA	2	6	173549	173554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520391
3105	NC_000868	CTTA	2	8	173607	173614	25 %	50 %	0 %	25 %	14520391
3106	NC_000868	ATA	2	6	173696	173701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520391
3107	NC_000868	AG	3	6	173752	173757	50 %	0 %	50 %	0 %	14520391
3108	NC_000868	GAA	2	6	173758	173763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520391
3109	NC_000868	TCC	2	6	173769	173774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520391
3110	NC_000868	GGAA	2	8	173802	173809	50 %	0 %	50 %	0 %	14520391
3111	NC_000868	GA	4	8	173862	173869	50 %	0 %	50 %	0 %	14520391
3112	NC_000868	TGGAG	2	10	173887	173896	20 %	20 %	60 %	0 %	14520391
3113	NC_000868	GTG	2	6	173897	173902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520391
3114	NC_000868	TGA	2	6	173905	173910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520391
3115	NC_000868	TGG	2	6	173978	173983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520392
3116	NC_000868	TCG	2	6	174096	174101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520392
3117	NC_000868	CTT	2	6	174109	174114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520392
3118	NC_000868	GGT	2	6	174167	174172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520392
3119	NC_000868	AGA	2	6	174215	174220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520392
3120	NC_000868	TC	3	6	174254	174259	0 %	50 %	0 %	50 %	14520392
3121	NC_000868	GAGG	2	8	174389	174396	25 %	0 %	75 %	0 %	14520392
3122	NC_000868	CACCG	2	10	174527	174536	20 %	0 %	20 %	60 %	14520393
3123	NC_000868	GAGG	2	8	174566	174573	25 %	0 %	75 %	0 %	14520393
3124	NC_000868	GTA	2	6	174772	174777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520393
3125	NC_000868	TTA	2	6	174813	174818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_000868	CT	3	6	174827	174832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3252	NC_000868	CTA	2	6	181211	181216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520398
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3281	NC_000868	ATA	2	6	182753	182758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520398
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3343	NC_000868	TA	3	6	185985	185990	50 %	50 %	0 %	0 %	14520400
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3355	NC_000868	TC	3	6	186680	186685	0 %	50 %	0 %	50 %	14520400
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3376	NC_000868	TCAAGT	2	12	187603	187614	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33356669
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3379	NC_000868	CTT	2	6	187739	187744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356669
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