MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_000868	CA	3	6	1720043	1720048	50 %	0 %	0 %	50 %	14521941
31502	NC_000868	TCA	2	6	1720079	1720084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521941
31503	NC_000868	CCTAT	2	10	1720115	1720124	20 %	40 %	0 %	40 %	14521941
31504	NC_000868	TTC	2	6	1720172	1720177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521941
31505	NC_000868	AGC	2	6	1720273	1720278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521941
31506	NC_000868	CCA	2	6	1720280	1720285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521941
31507	NC_000868	GAT	2	6	1720305	1720310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521941
31508	NC_000868	ACA	2	6	1720358	1720363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521941
31509	NC_000868	TTC	2	6	1720400	1720405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521941
31510	NC_000868	GCTC	2	8	1720452	1720459	0 %	25 %	25 %	50 %	14521941
31511	NC_000868	TCT	2	6	1720524	1720529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521941
31512	NC_000868	CCT	2	6	1720553	1720558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31513	NC_000868	GTTT	2	8	1720597	1720604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31514	NC_000868	TCT	2	6	1720640	1720645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31515	NC_000868	CTC	2	6	1720657	1720662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31516	NC_000868	AATT	2	8	1720666	1720673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31517	NC_000868	GAA	2	6	1720861	1720866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31518	NC_000868	AAGA	2	8	1720871	1720878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31519	NC_000868	TTTTC	2	10	1720899	1720908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31520	NC_000868	GAAAG	2	10	1720946	1720955	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31521	NC_000868	GAT	2	6	1720963	1720968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31522	NC_000868	CAT	2	6	1721079	1721084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521942
31523	NC_000868	TCA	2	6	1721126	1721131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521942
31524	NC_000868	CCT	2	6	1721150	1721155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521942
31525	NC_000868	ATC	2	6	1721211	1721216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521942
31526	NC_000868	GTA	2	6	1721220	1721225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521942
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31528	NC_000868	CCTCC	2	10	1721424	1721433	0 %	20 %	0 %	80 %	14521942
31529	NC_000868	CCT	2	6	1721450	1721455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521942
31530	NC_000868	GCG	2	6	1721473	1721478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521942
31531	NC_000868	TCC	2	6	1721580	1721585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521942
31532	NC_000868	CCTT	2	8	1721588	1721595	0 %	50 %	0 %	50 %	14521942
31533	NC_000868	TTCAC	2	10	1721661	1721670	20 %	40 %	0 %	40 %	33356827
31534	NC_000868	CTT	2	6	1721739	1721744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356827
31535	NC_000868	CT	3	6	1721759	1721764	0 %	50 %	0 %	50 %	33356827
31536	NC_000868	GAAC	2	8	1721766	1721773	50 %	0 %	25 %	25 %	33356827
31537	NC_000868	CCCTC	2	10	1721841	1721850	0 %	20 %	0 %	80 %	33356827
31538	NC_000868	TCCT	2	8	1721863	1721870	0 %	50 %	0 %	50 %	33356827
31539	NC_000868	ATT	2	6	1721946	1721951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31540	NC_000868	TTAA	2	8	1721966	1721973	50 %	50 %	0 %	0 %	33356828
31541	NC_000868	CTG	2	6	1722077	1722082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33356828
31542	NC_000868	AAC	2	6	1722156	1722161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33356828
31543	NC_000868	CCCTTT	2	12	1722223	1722234	0 %	50 %	0 %	50 %	33356828
31544	NC_000868	CTT	2	6	1722261	1722266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356828
31545	NC_000868	GAA	3	9	1722288	1722296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33356828
31546	NC_000868	TCG	2	6	1722326	1722331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33356828
31547	NC_000868	CCT	2	6	1722350	1722355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33356828
31548	NC_000868	TTC	2	6	1722357	1722362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356828
31549	NC_000868	TCT	2	6	1722473	1722478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356828
31550	NC_000868	CTTTTT	2	12	1722565	1722576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	14521945
31551	NC_000868	ACC	2	6	1722764	1722769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521945
31552	NC_000868	AGGTT	2	10	1722843	1722852	20 %	40 %	40 %	0 %	14521945
31553	NC_000868	ATG	2	6	1722887	1722892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521945
31554	NC_000868	TAG	2	6	1722952	1722957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521945
31555	NC_000868	AAG	2	6	1722979	1722984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521945
31556	NC_000868	GGA	2	6	1723004	1723009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521945
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31558	NC_000868	CTT	2	6	1723132	1723137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521946
31559	NC_000868	GGT	2	6	1723172	1723177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521946
31560	NC_000868	TC	3	6	1723234	1723239	0 %	50 %	0 %	50 %	14521946
31561	NC_000868	CCT	2	6	1723305	1723310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521946
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31565	NC_000868	TG	3	6	1723569	1723574	0 %	50 %	50 %	0 %	14521946
31566	NC_000868	CTC	2	6	1723591	1723596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521946
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31569	NC_000868	CTC	2	6	1723687	1723692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521946
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31572	NC_000868	CGT	3	9	1723870	1723878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521946
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31588	NC_000868	TCT	2	6	1724745	1724750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521947
31589	NC_000868	CGA	2	6	1724790	1724795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521947
31590	NC_000868	ATCT	2	8	1724806	1724813	25 %	50 %	0 %	25 %	14521947
31591	NC_000868	TCCT	2	8	1724832	1724839	0 %	50 %	0 %	50 %	14521947
31592	NC_000868	CT	3	6	1724894	1724899	0 %	50 %	0 %	50 %	14521947
31593	NC_000868	TCA	2	6	1724945	1724950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521947
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31596	NC_000868	ACC	2	6	1725028	1725033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31597	NC_000868	GGA	2	6	1725125	1725130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521948
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31601	NC_000868	TTCCAG	2	12	1725333	1725344	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	14521948
31602	NC_000868	ACT	2	6	1725437	1725442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521948
31603	NC_000868	CGTGA	2	10	1725466	1725475	20 %	20 %	40 %	20 %	14521948
31604	NC_000868	TCA	3	9	1725546	1725554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521948
31605	NC_000868	TCCA	2	8	1725564	1725571	25 %	25 %	0 %	50 %	14521948
31606	NC_000868	GAACA	2	10	1725607	1725616	60 %	0 %	20 %	20 %	14521948
31607	NC_000868	TC	3	6	1725686	1725691	0 %	50 %	0 %	50 %	14521948
31608	NC_000868	ATC	2	6	1725697	1725702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521948
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31610	NC_000868	ATT	2	6	1725737	1725742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521948
31611	NC_000868	TCT	2	6	1725767	1725772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521948
31612	NC_000868	TAA	2	6	1725831	1725836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521948
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31614	NC_000868	TGA	2	6	1726101	1726106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521948
31615	NC_000868	GGC	2	6	1726118	1726123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521948
31616	NC_000868	GTA	2	6	1726159	1726164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521948
31617	NC_000868	GTC	2	6	1726183	1726188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521948
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31975	NC_000868	TTA	2	6	1744039	1744044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521963
31976	NC_000868	CCTTC	2	10	1744078	1744087	0 %	40 %	0 %	60 %	14521963
31977	NC_000868	CTT	2	6	1744141	1744146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521963
31978	NC_000868	TCTT	2	8	1744165	1744172	0 %	75 %	0 %	25 %	14521963
31979	NC_000868	TCG	2	6	1744176	1744181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521963
31980	NC_000868	TAT	2	6	1744250	1744255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521963
31981	NC_000868	CTC	2	6	1744290	1744295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521963
31982	NC_000868	CCT	2	6	1744322	1744327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521963
31983	NC_000868	CTT	2	6	1744333	1744338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521963
31984	NC_000868	TCT	2	6	1744345	1744350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521963
31985	NC_000868	CCT	2	6	1744354	1744359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521963
31986	NC_000868	AT	3	6	1744377	1744382	50 %	50 %	0 %	0 %	14521963
31987	NC_000868	ATT	2	6	1744419	1744424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521963
31988	NC_000868	TCC	2	6	1744449	1744454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31989	NC_000868	ATT	2	6	1744483	1744488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521964
31990	NC_000868	AGC	2	6	1744536	1744541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521964
31991	NC_000868	CTTA	2	8	1744575	1744582	25 %	50 %	0 %	25 %	14521964
31992	NC_000868	AGT	2	6	1744648	1744653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521964
31993	NC_000868	ACT	2	6	1744674	1744679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521964
31994	NC_000868	CCACCT	2	12	1744705	1744716	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	14521964
31995	NC_000868	GGA	2	6	1744790	1744795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521964
31996	NC_000868	TTC	2	6	1744813	1744818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521964
31997	NC_000868	GCA	2	6	1744843	1744848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521964
31998	NC_000868	GGC	2	6	1744878	1744883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521964
31999	NC_000868	CCT	2	6	1744949	1744954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521964
32000	NC_000868	ATG	2	6	1745192	1745197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521965

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