MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_000868	CA	3	6	109872	109877	50 %	0 %	0 %	50 %	14520331
2002	NC_000868	CTC	2	6	109951	109956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520331
2003	NC_000868	GTA	2	6	110005	110010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520331
2004	NC_000868	GGA	2	6	110013	110018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520331
2005	NC_000868	GAT	2	6	110131	110136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520331
2006	NC_000868	GTTCA	2	10	110164	110173	20 %	40 %	20 %	20 %	14520331
2007	NC_000868	ATTT	2	8	110206	110213	25 %	75 %	0 %	0 %	14520331
2008	NC_000868	TC	3	6	110293	110298	0 %	50 %	0 %	50 %	14520331
2009	NC_000868	GAA	2	6	110353	110358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520331
2010	NC_000868	TTA	2	6	110379	110384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520331
2011	NC_000868	C	6	6	110424	110429	0 %	0 %	0 %	100 %	14520331
2012	NC_000868	TA	3	6	110454	110459	50 %	50 %	0 %	0 %	14520331
2013	NC_000868	CTC	2	6	110477	110482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520331
2014	NC_000868	CTCA	2	8	110539	110546	25 %	25 %	0 %	50 %	14520331
2015	NC_000868	CCTT	2	8	110763	110770	0 %	50 %	0 %	50 %	14520331
2016	NC_000868	CAA	2	6	110797	110802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520331
2017	NC_000868	CT	3	6	110824	110829	0 %	50 %	0 %	50 %	14520331
2018	NC_000868	ATG	2	6	110884	110889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_000868	AAG	2	6	110927	110932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520332
2020	NC_000868	AAG	2	6	110991	110996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520332
2021	NC_000868	AAGG	2	8	111284	111291	50 %	0 %	50 %	0 %	14520332
2022	NC_000868	CTT	2	6	111300	111305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520332
2023	NC_000868	GATAA	2	10	111314	111323	60 %	20 %	20 %	0 %	14520332
2024	NC_000868	TAA	2	6	111360	111365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520332
2025	NC_000868	AAGG	2	8	111424	111431	50 %	0 %	50 %	0 %	14520332
2026	NC_000868	GGAAA	2	10	111544	111553	60 %	0 %	40 %	0 %	14520332
2027	NC_000868	GGT	2	6	111560	111565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520332
2028	NC_000868	CCAA	2	8	111662	111669	50 %	0 %	0 %	50 %	14520333
2029	NC_000868	AG	3	6	111683	111688	50 %	0 %	50 %	0 %	14520333
2030	NC_000868	GAA	2	6	111774	111779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520333
2031	NC_000868	GAG	2	6	111795	111800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520333
2032	NC_000868	TCG	2	6	111862	111867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520333
2033	NC_000868	AG	3	6	111871	111876	50 %	0 %	50 %	0 %	14520333
2034	NC_000868	TACGTG	2	12	111885	111896	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14520333
2035	NC_000868	GAA	2	6	111977	111982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520333
2036	NC_000868	CAT	2	6	112007	112012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520333
2037	NC_000868	AGAGG	2	10	112103	112112	40 %	0 %	60 %	0 %	14520333
2038	NC_000868	GGA	2	6	112168	112173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520333
2039	NC_000868	CCT	2	6	112199	112204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520333
2040	NC_000868	CTG	2	6	112273	112278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520333
2041	NC_000868	GGA	2	6	112317	112322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520333
2042	NC_000868	GAA	3	9	112328	112336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520333
2043	NC_000868	CAC	2	6	112380	112385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520333
2044	NC_000868	AGA	2	6	112468	112473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520333
2045	NC_000868	TGGA	2	8	112523	112530	25 %	25 %	50 %	0 %	14520333
2046	NC_000868	AGG	2	6	112629	112634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520333
2047	NC_000868	GTG	2	6	112721	112726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520333
2048	NC_000868	GTTC	2	8	112727	112734	0 %	50 %	25 %	25 %	14520333
2049	NC_000868	CTA	2	6	112739	112744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520333
2050	NC_000868	TATAA	2	10	112776	112785	60 %	40 %	0 %	0 %	14520333
2051	NC_000868	GAA	2	6	112862	112867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520333
2052	NC_000868	ATA	2	6	112872	112877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520333
2053	NC_000868	AAT	2	6	112913	112918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520333
2054	NC_000868	CTT	2	6	113008	113013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520334
2055	NC_000868	T	6	6	113012	113017	0 %	100 %	0 %	0 %	14520334
2056	NC_000868	TAT	2	6	113069	113074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520334
2057	NC_000868	AGG	2	6	113283	113288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520334
2058	NC_000868	AT	3	6	113330	113335	50 %	50 %	0 %	0 %	14520334
2059	NC_000868	CTC	2	6	113365	113370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520335
2060	NC_000868	CCT	2	6	113380	113385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520335
2061	NC_000868	TCC	2	6	113422	113427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520335
2062	NC_000868	T	6	6	113456	113461	0 %	100 %	0 %	0 %	14520335
2063	NC_000868	GAT	2	6	113488	113493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520335
2064	NC_000868	ACCT	2	8	113503	113510	25 %	25 %	0 %	50 %	14520335
2065	NC_000868	CTT	2	6	113521	113526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520335
2066	NC_000868	ACC	2	6	113587	113592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2067	NC_000868	TAG	2	6	113599	113604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_000868	TTCTC	2	10	113713	113722	0 %	60 %	0 %	40 %	14520336
2069	NC_000868	AGTGTT	2	12	113910	113921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	14520336
2070	NC_000868	TTC	2	6	113962	113967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520336
2071	NC_000868	GAA	2	6	113984	113989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520336
2072	NC_000868	GCT	2	6	113996	114001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520336
2073	NC_000868	CTA	2	6	114022	114027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520336
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2075	NC_000868	TTGCA	2	10	114276	114285	20 %	40 %	20 %	20 %	14520336
2076	NC_000868	CCTC	2	8	114567	114574	0 %	25 %	0 %	75 %	14520337
2077	NC_000868	C	6	6	114592	114597	0 %	0 %	0 %	100 %	14520337
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2082	NC_000868	TTA	2	6	114999	115004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520337
2083	NC_000868	CATG	2	8	115010	115017	25 %	25 %	25 %	25 %	14520337
2084	NC_000868	CTTTTT	2	12	115094	115105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2085	NC_000868	CTT	2	6	115153	115158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_000868	T	6	6	115172	115177	0 %	100 %	0 %	0 %	14520338
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2089	NC_000868	TCT	2	6	115283	115288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
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2092	NC_000868	TTC	2	6	115471	115476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
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2094	NC_000868	TCT	2	6	115691	115696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
2095	NC_000868	ATA	2	6	115950	115955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520338
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2097	NC_000868	GA	3	6	116069	116074	50 %	0 %	50 %	0 %	14520338
2098	NC_000868	AGG	2	6	116080	116085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520338
2099	NC_000868	AGG	2	6	116092	116097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520338
2100	NC_000868	TAT	2	6	116151	116156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520338
2101	NC_000868	AG	3	6	116182	116187	50 %	0 %	50 %	0 %	14520338
2102	NC_000868	TCA	2	6	116197	116202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520338
2103	NC_000868	AACT	2	8	116307	116314	50 %	25 %	0 %	25 %	14520338
2104	NC_000868	CCT	2	6	116342	116347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520338
2105	NC_000868	GAT	2	6	116402	116407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520338
2106	NC_000868	GGT	2	6	116412	116417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520338
2107	NC_000868	CTT	2	6	116425	116430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
2108	NC_000868	CTT	2	6	116556	116561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
2109	NC_000868	TCT	2	6	116627	116632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
2110	NC_000868	TAT	2	6	116745	116750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520338
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2112	NC_000868	AGG	2	6	116863	116868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520338
2113	NC_000868	TCA	2	6	116869	116874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520338
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2116	NC_000868	CCAG	2	8	117156	117163	25 %	0 %	25 %	50 %	14520338
2117	NC_000868	GAA	2	6	117432	117437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520338
2118	NC_000868	CTTT	2	8	117476	117483	0 %	75 %	0 %	25 %	14520338
2119	NC_000868	CCG	2	6	117499	117504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520338
2120	NC_000868	AGG	2	6	117534	117539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520338
2121	NC_000868	TC	3	6	117549	117554	0 %	50 %	0 %	50 %	14520338
2122	NC_000868	TGG	2	6	117647	117652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520338
2123	NC_000868	GGC	2	6	117708	117713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520338
2124	NC_000868	TTC	2	6	117823	117828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520338
2125	NC_000868	CT	3	6	118078	118083	0 %	50 %	0 %	50 %	14520338
2126	NC_000868	AT	3	6	118119	118124	50 %	50 %	0 %	0 %	14520338
2127	NC_000868	CCA	2	6	118155	118160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520338
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2212	NC_000868	GAAGT	2	10	123116	123125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2213	NC_000868	ATTCT	2	10	123173	123182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2214	NC_000868	T	6	6	123182	123187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2215	NC_000868	A	6	6	123318	123323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2218	NC_000868	A	7	7	123493	123499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2219	NC_000868	TCCTC	2	10	123541	123550	0 %	40 %	0 %	60 %	14520341
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2230	NC_000868	GCT	2	6	124463	124468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520342
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2243	NC_000868	TCCTC	2	10	125113	125122	0 %	40 %	0 %	60 %	14520343
2244	NC_000868	TC	3	6	125150	125155	0 %	50 %	0 %	50 %	14520343
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2250	NC_000868	AGG	2	6	125424	125429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520343
2251	NC_000868	GAT	2	6	125455	125460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520343
2252	NC_000868	CAC	2	6	125462	125467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520343
2253	NC_000868	GAA	2	6	125484	125489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520343
2254	NC_000868	CTT	2	6	125526	125531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520344
2255	NC_000868	AGTG	2	8	125592	125599	25 %	25 %	50 %	0 %	14520344
2256	NC_000868	TTC	2	6	125637	125642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520344
2257	NC_000868	TCC	2	6	125696	125701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520344
2258	NC_000868	CTC	2	6	125802	125807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520344
2259	NC_000868	AGATT	2	10	125828	125837	40 %	40 %	20 %	0 %	14520344
2260	NC_000868	AAG	2	6	125890	125895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520344
2261	NC_000868	ACG	2	6	125896	125901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520344
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2263	NC_000868	AGG	2	6	125997	126002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520344
2264	NC_000868	TC	3	6	126019	126024	0 %	50 %	0 %	50 %	14520344
2265	NC_000868	AAG	2	6	126043	126048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520344
2266	NC_000868	ATT	2	6	126067	126072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520344
2267	NC_000868	GCTC	2	8	126092	126099	0 %	25 %	25 %	50 %	14520344
2268	NC_000868	TGCCC	2	10	126102	126111	0 %	20 %	20 %	60 %	14520344
2269	NC_000868	TCC	2	6	126190	126195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520344
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2271	NC_000868	AGT	2	6	126361	126366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520345
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2274	NC_000868	TTC	2	6	126554	126559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520345
2275	NC_000868	TTC	2	6	126566	126571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520345
2276	NC_000868	CT	3	6	126585	126590	0 %	50 %	0 %	50 %	14520345
2277	NC_000868	AAGCTT	2	12	126602	126613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14520345
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2282	NC_000868	TAT	2	6	126944	126949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520345
2283	NC_000868	ATT	2	6	126987	126992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520345
2284	NC_000868	AT	4	8	127004	127011	50 %	50 %	0 %	0 %	14520345
2285	NC_000868	ATG	2	6	127072	127077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520345
2286	NC_000868	TGA	2	6	127099	127104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520346
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2290	NC_000868	ATG	2	6	127423	127428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520346
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2293	NC_000868	TCT	2	6	127487	127492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520346
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2303	NC_000868	TCA	2	6	128157	128162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520347
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2319	NC_000868	GTT	2	6	129365	129370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2320	NC_000868	GA	3	6	129397	129402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2321	NC_000868	TGAAG	2	10	129585	129594	40 %	20 %	40 %	0 %	14520349
2322	NC_000868	AAG	2	6	129664	129669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520349
2323	NC_000868	AAAT	2	8	129680	129687	75 %	25 %	0 %	0 %	14520349
2324	NC_000868	AGG	2	6	129710	129715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520349
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2330	NC_000868	AAG	2	6	129964	129969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520349
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2334	NC_000868	TGA	2	6	130080	130085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520349
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2337	NC_000868	TACG	2	8	130293	130300	25 %	25 %	25 %	25 %	14520349
2338	NC_000868	GTA	2	6	130356	130361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520350
2339	NC_000868	TTA	2	6	130390	130395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520350
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2343	NC_000868	TC	3	6	130888	130893	0 %	50 %	0 %	50 %	14520350
2344	NC_000868	ATA	2	6	130896	130901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520350
2345	NC_000868	GGAAG	2	10	130970	130979	40 %	0 %	60 %	0 %	14520350
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2356	NC_000868	ATA	2	6	131463	131468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520350
2357	NC_000868	AGG	2	6	131491	131496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520350
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2360	NC_000868	AAGG	2	8	131663	131670	50 %	0 %	50 %	0 %	14520350
2361	NC_000868	CGGC	2	8	131893	131900	0 %	0 %	50 %	50 %	14520350
2362	NC_000868	TCG	2	6	131938	131943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520350
2363	NC_000868	AAG	2	6	132015	132020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520350
2364	NC_000868	GTTAGG	2	12	132030	132041	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	14520350
2365	NC_000868	AG	3	6	132043	132048	50 %	0 %	50 %	0 %	14520350
2366	NC_000868	TC	3	6	132054	132059	0 %	50 %	0 %	50 %	14520350
2367	NC_000868	ATT	2	6	132115	132120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2368	NC_000868	TA	3	6	132167	132172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2369	NC_000868	TGG	2	6	132222	132227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520351
2370	NC_000868	AGTATA	2	12	132271	132282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	14520351
2371	NC_000868	AG	3	6	132297	132302	50 %	0 %	50 %	0 %	14520351
2372	NC_000868	GAG	2	6	132344	132349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520351
2373	NC_000868	AAC	2	6	132385	132390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520351
2374	NC_000868	AGAAT	2	10	132397	132406	60 %	20 %	20 %	0 %	14520351
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2376	NC_000868	GAT	2	6	132450	132455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520351
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