MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000868	TC	3	6	83116	83121	0 %	50 %	0 %	50 %	14520312
1502	NC_000868	AGG	2	6	83199	83204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520312
1503	NC_000868	GTATC	2	10	83247	83256	20 %	40 %	20 %	20 %	14520312
1504	NC_000868	GGA	2	6	83391	83396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520312
1505	NC_000868	TGG	2	6	83465	83470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520312
1506	NC_000868	GCT	2	6	83489	83494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520312
1507	NC_000868	TAT	2	6	83526	83531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520312
1508	NC_000868	CTA	2	6	83573	83578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520312
1509	NC_000868	TAT	2	6	83660	83665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520312
1510	NC_000868	ATT	2	6	83799	83804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520313
1511	NC_000868	CTC	2	6	83854	83859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520313
1512	NC_000868	CTTG	2	8	83862	83869	0 %	50 %	25 %	25 %	14520313
1513	NC_000868	ATC	2	6	83896	83901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520313
1514	NC_000868	TAAGAG	2	12	83939	83950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	14520313
1515	NC_000868	TTCT	2	8	84080	84087	0 %	75 %	0 %	25 %	14520313
1516	NC_000868	TAGCA	2	10	84093	84102	40 %	20 %	20 %	20 %	14520313
1517	NC_000868	GGGGTT	2	12	84283	84294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520313
1518	NC_000868	GGA	2	6	84424	84429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520313
1519	NC_000868	TACACT	2	12	84439	84450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520313
1520	NC_000868	AGGG	2	8	84639	84646	25 %	0 %	75 %	0 %	14520313
1521	NC_000868	TC	3	6	84706	84711	0 %	50 %	0 %	50 %	14520314
1522	NC_000868	ATG	2	6	84815	84820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520314
1523	NC_000868	TTG	2	6	84867	84872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520314
1524	NC_000868	CAT	2	6	84878	84883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520314
1525	NC_000868	TAA	2	6	84885	84890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520314
1526	NC_000868	TACT	2	8	85085	85092	25 %	50 %	0 %	25 %	14520314
1527	NC_000868	AAT	2	6	85186	85191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520314
1528	NC_000868	CTAT	2	8	85207	85214	25 %	50 %	0 %	25 %	14520314
1529	NC_000868	AGGA	2	8	85244	85251	50 %	0 %	50 %	0 %	14520314
1530	NC_000868	ATA	2	6	85256	85261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520314
1531	NC_000868	TCT	2	6	85267	85272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520314
1532	NC_000868	TGG	2	6	85321	85326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520314
1533	NC_000868	GAA	2	6	85465	85470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520314
1534	NC_000868	CTC	2	6	85502	85507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520314
1535	NC_000868	AGG	2	6	85510	85515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520314
1536	NC_000868	TTG	2	6	85583	85588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520314
1537	NC_000868	AATT	2	8	85600	85607	50 %	50 %	0 %	0 %	14520314
1538	NC_000868	TACCAA	2	12	85623	85634	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	14520314
1539	NC_000868	ATT	2	6	85652	85657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520314
1540	NC_000868	TCATT	2	10	85665	85674	20 %	60 %	0 %	20 %	14520314
1541	NC_000868	CTT	2	6	85679	85684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520314
1542	NC_000868	GA	3	6	85785	85790	50 %	0 %	50 %	0 %	14520314
1543	NC_000868	ATA	2	6	85793	85798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520314
1544	NC_000868	TA	3	6	85812	85817	50 %	50 %	0 %	0 %	14520314
1545	NC_000868	AG	3	6	85868	85873	50 %	0 %	50 %	0 %	14520314
1546	NC_000868	TAC	2	6	85901	85906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520314
1547	NC_000868	TGA	2	6	85948	85953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520314
1548	NC_000868	A	6	6	86015	86020	100 %	0 %	0 %	0 %	14520314
1549	NC_000868	A	7	7	86028	86034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_000868	TTG	2	6	86195	86200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520315
1551	NC_000868	TTG	2	6	86291	86296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520315
1552	NC_000868	GA	3	6	86339	86344	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1553	NC_000868	TGA	2	6	86445	86450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520315
1554	NC_000868	AGCA	2	8	86452	86459	50 %	0 %	25 %	25 %	14520315
1555	NC_000868	ATC	2	6	86598	86603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520315
1556	NC_000868	CAG	2	6	86644	86649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1557	NC_000868	TGA	2	6	86676	86681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520315
1558	NC_000868	GTT	2	6	86788	86793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520315
1559	NC_000868	AGA	2	6	86795	86800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1560	NC_000868	ACAA	2	8	86848	86855	75 %	0 %	0 %	25 %	14520315
1561	NC_000868	AAAG	2	8	86979	86986	75 %	0 %	25 %	0 %	14520315
1562	NC_000868	TCA	2	6	86996	87001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520315
1563	NC_000868	AGGGA	2	10	87015	87024	40 %	0 %	60 %	0 %	14520315
1564	NC_000868	ACCGTT	2	12	87025	87036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	14520315
1565	NC_000868	AGA	2	6	87122	87127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1566	NC_000868	GAC	2	6	87178	87183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1567	NC_000868	AAC	2	6	87216	87221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520315
1568	NC_000868	ACC	2	6	87232	87237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520315
1569	NC_000868	GGTAG	2	10	87313	87322	20 %	20 %	60 %	0 %	14520315
1570	NC_000868	AAGG	2	8	87358	87365	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1571	NC_000868	ACG	2	6	87379	87384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1572	NC_000868	GAA	2	6	87449	87454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1573	NC_000868	AG	3	6	87478	87483	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1574	NC_000868	GAAG	2	8	87510	87517	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1575	NC_000868	AAG	2	6	87523	87528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1576	NC_000868	AGA	3	9	87608	87616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1577	NC_000868	AGG	2	6	87620	87625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1578	NC_000868	AGC	2	6	87642	87647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1579	NC_000868	CAC	2	6	87659	87664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520315
1580	NC_000868	AG	3	6	87714	87719	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1581	NC_000868	CTA	2	6	87751	87756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520315
1582	NC_000868	TCA	2	6	87803	87808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520315
1583	NC_000868	AGG	2	6	87809	87814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1584	NC_000868	AGG	2	6	87818	87823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1585	NC_000868	CCAA	2	8	87913	87920	50 %	0 %	0 %	50 %	14520315
1586	NC_000868	AG	3	6	87928	87933	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1587	NC_000868	AGG	2	6	87939	87944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1588	NC_000868	AG	3	6	87960	87965	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1589	NC_000868	TGGA	2	8	87978	87985	25 %	25 %	50 %	0 %	14520315
1590	NC_000868	AGA	2	6	87994	87999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1591	NC_000868	CCAG	2	8	88008	88015	25 %	0 %	25 %	50 %	14520315
1592	NC_000868	AAG	2	6	88045	88050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1593	NC_000868	GTC	2	6	88051	88056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1594	NC_000868	ACA	3	9	88067	88075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520315
1595	NC_000868	AAGG	2	8	88116	88123	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1596	NC_000868	CA	3	6	88157	88162	50 %	0 %	0 %	50 %	14520315
1597	NC_000868	AAT	2	6	88179	88184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520315
1598	NC_000868	GCA	2	6	88201	88206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1599	NC_000868	ATC	2	6	88210	88215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520315
1600	NC_000868	AGG	2	6	88229	88234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1601	NC_000868	ACG	2	6	88322	88327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520315
1602	NC_000868	AC	3	6	88330	88335	50 %	0 %	0 %	50 %	14520315
1603	NC_000868	TAA	2	6	88496	88501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520315
1604	NC_000868	AG	3	6	88521	88526	50 %	0 %	50 %	0 %	14520315
1605	NC_000868	AAGA	2	8	88548	88555	75 %	0 %	25 %	0 %	14520315
1606	NC_000868	GAG	2	6	88564	88569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1607	NC_000868	GAA	2	6	88576	88581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520315
1608	NC_000868	GAG	2	6	88582	88587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520315
1609	NC_000868	TGT	2	6	88645	88650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520316
1610	NC_000868	AAG	2	6	88686	88691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520316
1611	NC_000868	AAT	2	6	88796	88801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520316
1612	NC_000868	TC	3	6	88957	88962	0 %	50 %	0 %	50 %	14520316
1613	NC_000868	GTT	2	6	88974	88979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520316
1614	NC_000868	CTTCC	2	10	89047	89056	0 %	40 %	0 %	60 %	14520316
1615	NC_000868	ATT	2	6	89106	89111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520316
1616	NC_000868	ATGCCA	2	12	89199	89210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	14520316
1617	NC_000868	AGCA	2	8	89221	89228	50 %	0 %	25 %	25 %	14520316
1618	NC_000868	GA	3	6	89232	89237	50 %	0 %	50 %	0 %	14520316
1619	NC_000868	TCA	2	6	89276	89281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520316
1620	NC_000868	AGT	2	6	89285	89290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520316
1621	NC_000868	TAG	2	6	89391	89396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520317
1622	NC_000868	ATA	2	6	89399	89404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520317
1623	NC_000868	AAG	2	6	89486	89491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520317
1624	NC_000868	A	6	6	89615	89620	100 %	0 %	0 %	0 %	14520317
1625	NC_000868	ATA	2	6	89627	89632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520317
1626	NC_000868	TGG	2	6	89773	89778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520317
1627	NC_000868	GAA	2	6	89813	89818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520317
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