MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_000868	CTC	2	6	55009	55014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520279
1003	NC_000868	ATT	2	6	55025	55030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520279
1004	NC_000868	GGA	2	6	55305	55310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520279
1005	NC_000868	ACCT	2	8	55312	55319	25 %	25 %	0 %	50 %	14520279
1006	NC_000868	TAT	2	6	55333	55338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520279
1007	NC_000868	CTC	2	6	55459	55464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520279
1008	NC_000868	CT	3	6	55480	55485	0 %	50 %	0 %	50 %	14520279
1009	NC_000868	CCTC	2	8	55491	55498	0 %	25 %	0 %	75 %	14520279
1010	NC_000868	TTC	2	6	55609	55614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520279
1011	NC_000868	TC	3	6	55613	55618	0 %	50 %	0 %	50 %	14520279
1012	NC_000868	TC	3	6	55672	55677	0 %	50 %	0 %	50 %	14520279
1013	NC_000868	CTC	2	6	55759	55764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520279
1014	NC_000868	TCC	3	9	55778	55786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520279
1015	NC_000868	AT	3	6	55794	55799	50 %	50 %	0 %	0 %	14520279
1016	NC_000868	CCA	2	6	55842	55847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_000868	CAA	2	6	55904	55909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520280
1018	NC_000868	ACC	2	6	55949	55954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520280
1019	NC_000868	GT	3	6	55956	55961	0 %	50 %	50 %	0 %	14520280
1020	NC_000868	CT	3	6	55974	55979	0 %	50 %	0 %	50 %	14520280
1021	NC_000868	TTC	2	6	55992	55997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520280
1022	NC_000868	CAG	2	6	56045	56050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520280
1023	NC_000868	CTT	2	6	56092	56097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520280
1024	NC_000868	T	6	6	56182	56187	0 %	100 %	0 %	0 %	14520280
1025	NC_000868	ACT	2	6	56228	56233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520280
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1030	NC_000868	TTC	2	6	56462	56467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520280
1031	NC_000868	CTT	2	6	56572	56577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520280
1032	NC_000868	T	6	6	56612	56617	0 %	100 %	0 %	0 %	14520280
1033	NC_000868	TTA	2	6	56668	56673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520280
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1035	NC_000868	CTTAT	2	10	56724	56733	20 %	60 %	0 %	20 %	14520280
1036	NC_000868	TC	3	6	56763	56768	0 %	50 %	0 %	50 %	14520280
1037	NC_000868	AAG	2	6	56864	56869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520280
1038	NC_000868	TACC	2	8	56890	56897	25 %	25 %	0 %	50 %	14520280
1039	NC_000868	GCG	3	9	56908	56916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_000868	CCT	2	6	56947	56952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_000868	GCT	2	6	57010	57015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_000868	GGC	2	6	57134	57139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_000868	CGG	2	6	57177	57182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_000868	C	6	6	57207	57212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1045	NC_000868	CGC	2	6	57222	57227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_000868	ACT	2	6	57234	57239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_000868	TA	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_000868	TTA	2	6	57316	57321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_000868	TTC	2	6	57338	57343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_000868	TCAAA	2	10	57344	57353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_000868	GAAT	2	8	57385	57392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_000868	GTT	2	6	57463	57468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520281
1053	NC_000868	CAG	2	6	57564	57569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520281
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1055	NC_000868	TAT	2	6	57646	57651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520281
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1058	NC_000868	AACG	2	8	57820	57827	50 %	0 %	25 %	25 %	14520281
1059	NC_000868	TTCC	2	8	57890	57897	0 %	50 %	0 %	50 %	14520281
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1064	NC_000868	GCTC	2	8	58113	58120	0 %	25 %	25 %	50 %	14520281
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1066	NC_000868	CTT	2	6	58151	58156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520282
1067	NC_000868	GA	3	6	58178	58183	50 %	0 %	50 %	0 %	14520282
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1070	NC_000868	ATT	2	6	58374	58379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520282
1071	NC_000868	TCC	2	6	58389	58394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520282
1072	NC_000868	TA	3	6	58498	58503	50 %	50 %	0 %	0 %	14520282
1073	NC_000868	CT	4	8	58512	58519	0 %	50 %	0 %	50 %	14520282
1074	NC_000868	TA	3	6	58577	58582	50 %	50 %	0 %	0 %	14520282
1075	NC_000868	CAC	2	6	58618	58623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520282
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1079	NC_000868	TAA	2	6	58805	58810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_000868	GGTGAG	2	12	58912	58923	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_000868	AGA	3	9	59025	59033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_000868	GTGA	2	8	59037	59044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_000868	AG	3	6	59070	59075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_000868	AAG	2	6	59088	59093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_000868	AGCA	2	8	59141	59148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_000868	A	7	7	59196	59202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_000868	AAAAG	2	10	59217	59226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_000868	AGA	2	6	59291	59296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_000868	GAA	2	6	59329	59334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_000868	GGCT	2	8	59386	59393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1092	NC_000868	AG	3	6	59800	59805	50 %	0 %	50 %	0 %	14520283
1093	NC_000868	AAG	2	6	59939	59944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520284
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1096	NC_000868	TAA	2	6	60204	60209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520284
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1098	NC_000868	GAAC	2	8	60373	60380	50 %	0 %	25 %	25 %	14520284
1099	NC_000868	AAGA	2	8	60509	60516	75 %	0 %	25 %	0 %	14520284
1100	NC_000868	GGGA	2	8	60530	60537	25 %	0 %	75 %	0 %	14520284
1101	NC_000868	GAAAG	2	10	60605	60614	60 %	0 %	40 %	0 %	14520284
1102	NC_000868	AAC	3	9	60632	60640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520284
1103	NC_000868	GAG	2	6	60674	60679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520284
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1105	NC_000868	CT	3	6	60780	60785	0 %	50 %	0 %	50 %	14520284
1106	NC_000868	GAA	2	6	61027	61032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520284
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1109	NC_000868	GGA	2	6	61244	61249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520284
1110	NC_000868	GATA	2	8	61309	61316	50 %	25 %	25 %	0 %	14520284
1111	NC_000868	ATA	2	6	61429	61434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298204368
1112	NC_000868	GTA	2	6	61497	61502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298204368
1113	NC_000868	GA	3	6	61522	61527	50 %	0 %	50 %	0 %	298204368
1114	NC_000868	GAT	2	6	61551	61556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298204368
1115	NC_000868	GAG	2	6	61581	61586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298204368
1116	NC_000868	ATG	2	6	61592	61597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298204368
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1118	NC_000868	GCT	2	6	61619	61624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520285
1119	NC_000868	CTT	2	6	61672	61677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520285
1120	NC_000868	GGA	2	6	61679	61684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520285
1121	NC_000868	GAT	2	6	61709	61714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520285
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1123	NC_000868	ACG	2	6	61925	61930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520285
1124	NC_000868	AGC	2	6	61969	61974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520285
1125	NC_000868	AGA	2	6	61976	61981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520285
1126	NC_000868	AAG	2	6	62036	62041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520285
1127	NC_000868	GCC	2	6	62096	62101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520285
1128	NC_000868	AAG	2	6	62120	62125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520285
1129	NC_000868	AAG	2	6	62138	62143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520285
1130	NC_000868	TGC	2	6	62185	62190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520285
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1132	NC_000868	ATC	2	6	62390	62395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520286
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