MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000868	AG	3	6	27247	27252	50 %	0 %	50 %	0 %	161723322
502	NC_000868	ATA	2	6	27313	27318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161723322
503	NC_000868	GAT	2	6	27339	27344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161723322
504	NC_000868	AAT	2	6	27423	27428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161723322
505	NC_000868	TCG	2	6	27431	27436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723322
506	NC_000868	AG	3	6	27480	27485	50 %	0 %	50 %	0 %	161723322
507	NC_000868	TTGA	2	8	27577	27584	25 %	50 %	25 %	0 %	14520248
508	NC_000868	ATT	2	6	27673	27678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520248
509	NC_000868	GA	3	6	27679	27684	50 %	0 %	50 %	0 %	14520248
510	NC_000868	TGG	2	6	27727	27732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520248
511	NC_000868	AAT	2	6	27792	27797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520248
512	NC_000868	GAA	2	6	27819	27824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520248
513	NC_000868	AGGAA	2	10	27864	27873	60 %	0 %	40 %	0 %	14520248
514	NC_000868	TTC	2	6	27877	27882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520248
515	NC_000868	TAA	2	6	27926	27931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520248
516	NC_000868	GA	3	6	27939	27944	50 %	0 %	50 %	0 %	14520248
517	NC_000868	GT	3	6	27955	27960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_000868	ATTT	2	8	27965	27972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_000868	T	6	6	27984	27989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_000868	TAT	2	6	28003	28008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_000868	TTC	2	6	28063	28068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_000868	TAAA	2	8	28074	28081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_000868	CTAT	2	8	28164	28171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_000868	AGG	2	6	28185	28190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_000868	TAG	2	6	28238	28243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520249
526	NC_000868	GAA	2	6	28309	28314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520249
527	NC_000868	CTT	2	6	28317	28322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520249
528	NC_000868	CGG	2	6	28326	28331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520249
529	NC_000868	GGC	2	6	28446	28451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520249
530	NC_000868	ACT	2	6	28547	28552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520249
531	NC_000868	ATA	2	6	28603	28608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520249
532	NC_000868	ATA	2	6	28723	28728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520249
533	NC_000868	ACG	2	6	28769	28774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520249
534	NC_000868	TAA	2	6	28787	28792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520249
535	NC_000868	ATA	2	6	28795	28800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520249
536	NC_000868	TCG	2	6	28805	28810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520249
537	NC_000868	GGA	2	6	28840	28845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520249
538	NC_000868	GTTCG	2	10	28944	28953	0 %	40 %	40 %	20 %	14520249
539	NC_000868	ATA	2	6	28969	28974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520249
540	NC_000868	CAA	2	6	29001	29006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520249
541	NC_000868	CGT	2	6	29043	29048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520249
542	NC_000868	GAT	2	6	29133	29138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520249
543	NC_000868	CCA	2	6	29167	29172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520249
544	NC_000868	CGT	2	6	29256	29261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520249
545	NC_000868	AAG	2	6	29287	29292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520249
546	NC_000868	A	6	6	29309	29314	100 %	0 %	0 %	0 %	14520249
547	NC_000868	CAT	2	6	29435	29440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520249
548	NC_000868	AAC	2	6	29523	29528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520249
549	NC_000868	ATA	2	6	29611	29616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520249
550	NC_000868	GAG	2	6	29650	29655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520249
551	NC_000868	TTTTTA	2	12	29686	29697	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_000868	TTC	2	6	29701	29706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_000868	AG	3	6	29727	29732	50 %	0 %	50 %	0 %	14520250
554	NC_000868	TCT	2	6	29767	29772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520250
555	NC_000868	CATCC	2	10	29831	29840	20 %	20 %	0 %	60 %	14520250
556	NC_000868	CAC	2	6	29935	29940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
557	NC_000868	CAT	2	6	29954	29959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520250
558	NC_000868	TGG	2	6	29964	29969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520250
559	NC_000868	TCC	2	6	30088	30093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520250
560	NC_000868	GAAC	2	8	30104	30111	50 %	0 %	25 %	25 %	14520250
561	NC_000868	CT	3	6	30154	30159	0 %	50 %	0 %	50 %	14520250
562	NC_000868	AACT	2	8	30171	30178	50 %	25 %	0 %	25 %	14520250
563	NC_000868	CGTAG	2	10	30252	30261	20 %	20 %	40 %	20 %	14520250
564	NC_000868	GAG	2	6	30420	30425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520250
565	NC_000868	CTC	2	6	30429	30434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520250
566	NC_000868	TCA	2	6	30442	30447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520250
567	NC_000868	TCCAA	2	10	30547	30556	40 %	20 %	0 %	40 %	14520250
568	NC_000868	GTT	2	6	30558	30563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520250
569	NC_000868	TA	3	6	30684	30689	50 %	50 %	0 %	0 %	14520250
570	NC_000868	CTT	2	6	30750	30755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520250
571	NC_000868	AGT	2	6	30861	30866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520250
572	NC_000868	CTA	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520250
573	NC_000868	CTC	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520250
574	NC_000868	ACC	2	6	30985	30990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
575	NC_000868	ACC	2	6	31026	31031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
576	NC_000868	TTC	2	6	31230	31235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520250
577	NC_000868	CCCT	2	8	31238	31245	0 %	25 %	0 %	75 %	14520250
578	NC_000868	CAC	2	6	31298	31303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
579	NC_000868	CTTA	2	8	31335	31342	25 %	50 %	0 %	25 %	14520250
580	NC_000868	GTA	2	6	31458	31463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520250
581	NC_000868	TTG	2	6	31671	31676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520251
582	NC_000868	ACG	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520251
583	NC_000868	TCC	2	6	31704	31709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520251
584	NC_000868	TCCC	2	8	31832	31839	0 %	25 %	0 %	75 %	14520251
585	NC_000868	TTA	2	6	31987	31992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520251
586	NC_000868	CTC	2	6	32009	32014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520251
587	NC_000868	CTC	2	6	32030	32035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520251
588	NC_000868	TTC	2	6	32040	32045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520251
589	NC_000868	TA	3	6	32081	32086	50 %	50 %	0 %	0 %	14520251
590	NC_000868	CTAGCC	2	12	32106	32117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14520251
591	NC_000868	T	6	6	32120	32125	0 %	100 %	0 %	0 %	14520251
592	NC_000868	TTC	2	6	32216	32221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520251
593	NC_000868	CGG	2	6	32245	32250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520251
594	NC_000868	TATC	2	8	32251	32258	25 %	50 %	0 %	25 %	14520251
595	NC_000868	CCA	2	6	32337	32342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520251
596	NC_000868	ATC	2	6	32378	32383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520251
597	NC_000868	TTTAA	2	10	32444	32453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_000868	ATT	2	6	32516	32521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_000868	GAA	2	6	32564	32569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_000868	TAA	2	6	32578	32583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_000868	GGCAG	2	10	32662	32671	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
602	NC_000868	TAATTC	2	12	32740	32751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_000868	A	6	6	32778	32783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_000868	CTT	2	6	32819	32824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_000868	TCC	2	6	32832	32837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_000868	TTC	2	6	32841	32846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_000868	TTA	2	6	32907	32912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_000868	ACA	2	6	32937	32942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_000868	TAT	2	6	32945	32950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_000868	ATCC	2	8	32970	32977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_000868	CCT	2	6	33022	33027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520252
612	NC_000868	TTC	2	6	33033	33038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520252
613	NC_000868	TTGCT	2	10	33068	33077	0 %	60 %	20 %	20 %	14520252
614	NC_000868	GTA	2	6	33080	33085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520252
615	NC_000868	CTT	2	6	33086	33091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520252
616	NC_000868	GCCT	2	8	33137	33144	0 %	25 %	25 %	50 %	14520252
617	NC_000868	GTAG	2	8	33163	33170	25 %	25 %	50 %	0 %	14520252
618	NC_000868	TTC	3	9	33406	33414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_000868	GT	3	6	33429	33434	0 %	50 %	50 %	0 %	14520253
620	NC_000868	TAC	2	6	33489	33494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520253
621	NC_000868	CATC	2	8	33495	33502	25 %	25 %	0 %	50 %	14520253
622	NC_000868	ATTAGC	2	12	33725	33736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14520253
623	NC_000868	GCTC	2	8	33756	33763	0 %	25 %	25 %	50 %	14520253
624	NC_000868	TAG	2	6	33890	33895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520253
625	NC_000868	GAGCTA	2	12	33903	33914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14520253
626	NC_000868	ACTAA	2	10	33962	33971	60 %	20 %	0 %	20 %	14520253
627	NC_000868	CAA	2	6	33985	33990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520253
628	NC_000868	ATGC	2	8	34056	34063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_000868	TAAAC	2	10	34102	34111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
630	NC_000868	AT	3	6	34206	34211	50 %	50 %	0 %	0 %	14520254
631	NC_000868	TAG	2	6	34270	34275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520254
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633	NC_000868	AGG	2	6	34429	34434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520254
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765	NC_000868	TGG	2	6	41449	41454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520264
766	NC_000868	GGT	2	6	41489	41494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520264
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