MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Octadecabacter arcticus 238 plasmid pOA238_118

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020909	GAA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020909	A	6	6	53	58	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020909	TGAA	2	8	71	78	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020909	TTC	2	6	1555	1560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020909	AAT	2	6	2397	2402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020909	TTG	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020909	CAA	3	9	2494	2502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020909	TCGC	2	8	2927	2934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020909	CG	3	6	2998	3003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020909	CTG	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020909	TGC	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020909	GAT	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020909	AG	3	6	3258	3263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020909	A	6	6	3291	3296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020909	TCT	2	6	3317	3322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020909	GCG	2	6	3345	3350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020909	AGGGC	2	10	3358	3367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020909	TCA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020909	A	6	6	3507	3512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020909	TCG	2	6	3577	3582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020909	TTGTT	2	10	3609	3618	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020909	AGTCT	2	10	3654	3663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020909	CCGACA	2	12	3742	3753	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020909	ATT	2	6	3831	3836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020909	CGC	2	6	3903	3908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020909	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020909	GCT	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020909	A	6	6	4470	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020909	G	6	6	4490	4495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020909	ACG	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020909	CG	3	6	5386	5391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020909	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020909	AACA	2	8	5587	5594	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020909	CAA	2	6	7198	7203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020909	CGG	2	6	7234	7239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020909	AGGCG	2	10	7564	7573	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020909	CTG	2	6	7755	7760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020909	TAAT	2	8	7772	7779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020909	A	6	6	7793	7798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020909	AGA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020909	AG	3	6	7949	7954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020909	TGC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020909	TCG	2	6	8023	8028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020909	AT	3	6	8043	8048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020909	ATTA	2	8	8101	8108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020909	ACAATG	3	18	8113	8130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020909	GC	3	6	8421	8426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020909	CAC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020909	ATT	2	6	8746	8751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020909	TGGC	2	8	8768	8775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020909	ATG	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020909	ATC	2	6	8822	8827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020909	AGG	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020909	GAT	2	6	8934	8939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020909	GACGG	2	10	9085	9094	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020909	TGT	3	9	9111	9119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020909	GC	3	6	9166	9171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020909	GCG	2	6	9198	9203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020909	GTT	2	6	9225	9230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020909	GTC	2	6	9250	9255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020909	CAT	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020909	TTG	2	6	9341	9346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020909	CGCC	2	8	9363	9370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_020909	TGG	2	6	9546	9551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020909	GGT	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020909	TTTTC	2	10	9596	9605	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020909	CA	3	6	9648	9653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020909	GCT	2	6	9842	9847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020909	TGAT	2	8	9848	9855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020909	TTC	2	6	11223	11228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020909	TCTGGC	2	12	11266	11277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020909	GCA	2	6	11306	11311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020909	GGC	2	6	11359	11364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020909	GAC	2	6	11381	11386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020909	GCA	2	6	11393	11398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020909	GAT	2	6	11420	11425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020909	GCC	3	9	11495	11503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020909	GTG	2	6	11581	11586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020909	GCG	2	6	11590	11595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020909	CGT	2	6	11623	11628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020909	GCT	2	6	11696	11701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020909	T	6	6	11726	11731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020909	CAA	2	6	11857	11862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020909	CAA	2	6	11969	11974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020909	A	6	6	12754	12759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020909	AAT	2	6	12791	12796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020909	ATG	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020909	GC	3	6	12867	12872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020909	CAC	2	6	12951	12956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020909	ATC	2	6	12962	12967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020909	ACG	2	6	14029	14034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020909	CTT	2	6	14421	14426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020909	TCAT	2	8	14451	14458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020909	CAA	2	6	14472	14477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020909	TAC	2	6	14916	14921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020909	TTG	2	6	15513	15518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020909	GTT	2	6	15548	15553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020909	GAA	2	6	15571	15576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020909	TC	3	6	18572	18577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020909	T	8	8	18582	18589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020909	AAG	2	6	18590	18595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020909	CTTT	2	8	18611	18618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020909	GTGG	2	8	18673	18680	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020909	TTG	2	6	18722	18727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020909	TTC	2	6	18750	18755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020909	TAA	2	6	18766	18771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020909	CAG	2	6	19754	19759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020909	A	6	6	19782	19787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020909	TTC	2	6	23296	23301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020909	GTA	2	6	27034	27039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020909	CTG	2	6	27458	27463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020909	TTG	2	6	27783	27788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020909	AGCA	2	8	27791	27798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020909	GAA	2	6	28428	28433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020909	AAGA	2	8	28439	28446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020909	TGT	2	6	28454	28459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020909	ACGGC	2	10	28604	28613	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_020909	T	6	6	28627	28632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020909	T	8	8	28736	28743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020909	TC	3	6	28834	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020909	ATTA	2	8	29481	29488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020909	TGC	2	6	29513	29518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020909	GTC	2	6	31564	31569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020909	TTAAA	2	10	31594	31603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020909	ATCA	2	8	31683	31690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020909	CTG	2	6	31698	31703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020909	GAAGGC	2	12	31714	31725	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020909	TAT	2	6	31753	31758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020909	GA	3	6	31776	31781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020909	GGGT	2	8	33327	33334	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020909	TGA	2	6	33370	33375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020909	TTG	2	6	33387	33392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020909	GTT	2	6	34839	34844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020909	TAT	2	6	34850	34855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020909	T	6	6	34865	34870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020909	TTA	2	6	34933	34938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020909	CAA	2	6	34966	34971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020909	GCA	2	6	34986	34991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020909	ACC	3	9	35020	35028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_020909	GAA	2	6	35040	35045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020909	TGA	2	6	35063	35068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020909	ATACC	2	10	35075	35084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_020909	TGC	2	6	37212	37217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020909	GAAAGC	2	12	37234	37245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_020909	A	7	7	37293	37299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020909	GAA	2	6	37312	37317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020909	A	6	6	37334	37339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020909	CAG	2	6	37359	37364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020909	TCT	2	6	37397	37402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_020909	T	6	6	40410	40415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020909	T	6	6	40725	40730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020909	TAA	2	6	40745	40750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020909	TTC	2	6	41066	41071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020909	CGGT	2	8	41096	41103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020909	T	8	8	41114	41121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020909	GCAA	2	8	41161	41168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_020909	TCG	2	6	41222	41227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_020909	GTTT	2	8	50594	50601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_020909	T	6	6	50614	50619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020909	GCT	2	6	52203	52208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_020909	ATC	3	9	52226	52234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_020909	ACT	2	6	52241	52246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_020909	TGC	2	6	52248	52253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_020909	GCC	2	6	55547	55552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_020909	T	6	6	55560	55565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020909	CCT	2	6	55583	55588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_020909	GAA	2	6	55831	55836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020909	GTG	2	6	55878	55883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_020909	CGT	2	6	57242	57247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_020909	GCT	2	6	62570	62575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_020909	TCCA	2	8	94536	94543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
276	NC_020909	GGCA	2	8	94550	94557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
277	NC_020909	CTTCT	2	10	94750	94759	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
278	NC_020909	CAG	2	6	94912	94917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_020909	CGGAT	2	10	95071	95080	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_020909	TGG	2	6	95095	95100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020909	CG	3	6	95944	95949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_020909	AGGA	2	8	95985	95992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020909	CCA	2	6	96021	96026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_020909	TCA	2	6	96047	96052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_020909	CTGG	2	8	96104	96111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
286	NC_020909	GAA	2	6	96117	96122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020909	GCC	2	6	96172	96177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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289	NC_020909	CAG	2	6	96495	96500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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411	NC_020909	ACG	3	9	117585	117593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_020909	TGC	2	6	117601	117606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_020909	AAC	2	6	117823	117828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_020909	G	6	6	117877	117882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
421	NC_020909	GCC	2	6	117929	117934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.