MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Octadecabacter antarcticus 307 plasmid pOA307_63

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020907	G	6	6	3	8	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020907	AAG	2	6	51	56	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020907	GCT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020907	AGG	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020907	CGC	2	6	2426	2431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020907	ACA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020907	A	7	7	2437	2443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020907	GCG	2	6	2467	2472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020907	TGG	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020907	TG	3	6	3960	3965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020907	TCATC	2	10	3971	3980	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020907	TGCT	2	8	4059	4066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020907	A	7	7	4116	4122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020907	GCC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020907	CAAT	2	8	4216	4223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020907	GAA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020907	TCA	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020907	GCAC	2	8	5279	5286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020907	AG	3	6	5325	5330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020907	T	7	7	5358	5364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020907	CAG	2	6	5459	5464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020907	TGA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020907	GCT	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020907	AAAC	2	8	5513	5520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020907	T	6	6	5592	5597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020907	A	6	6	5798	5803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020907	ATT	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020907	CGT	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020907	GTT	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020907	GCC	2	6	6025	6030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020907	CGC	2	6	6485	6490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020907	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020907	CA	3	6	6546	6551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020907	CAC	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_020907	CGC	2	6	6681	6686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020907	TGC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020907	TC	3	6	6820	6825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020907	CTG	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020907	GAA	2	6	7234	7239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020907	CCGA	2	8	7757	7764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020907	TCCTG	2	10	7794	7803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_020907	AAGC	2	8	7815	7822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020907	TGC	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020907	TAA	2	6	7880	7885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020907	CAG	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020907	TCG	2	6	7921	7926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020907	ATT	2	6	8006	8011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020907	AGA	2	6	9751	9756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020907	GCA	2	6	9760	9765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020907	GCT	2	6	9794	9799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020907	TTG	2	6	9813	9818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020907	ACCT	2	8	9940	9947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020907	CA	3	6	10772	10777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020907	ATCT	2	8	10831	10838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020907	TGT	2	6	16274	16279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020907	GCG	2	6	17979	17984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020907	GCC	2	6	17990	17995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020907	TG	3	6	21874	21879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020907	ACC	2	6	22108	22113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020907	ACT	2	6	22135	22140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020907	GCTTT	2	10	23084	23093	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020907	GC	4	8	23245	23252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020907	GAC	2	6	23304	23309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020907	A	6	6	25768	25773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020907	GT	3	6	29902	29907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020907	TGAA	2	8	29913	29920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020907	TGG	2	6	29945	29950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020907	AGC	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020907	GTT	2	6	30072	30077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020907	TGT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020907	ATC	2	6	30145	30150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020907	GTTT	2	8	30244	30251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020907	GATCA	2	10	30850	30859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020907	GAT	2	6	30880	30885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020907	CGG	2	6	30936	30941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020907	C	6	6	30955	30960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_020907	CAT	2	6	31029	31034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020907	TCC	2	6	31066	31071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020907	CAG	2	6	31152	31157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020907	GCCGA	2	10	32844	32853	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_020907	GTT	2	6	33593	33598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020907	TGA	2	6	33609	33614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020907	TGAG	2	8	36158	36165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020907	ATTCT	2	10	36180	36189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020907	GCC	2	6	36316	36321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020907	ACA	2	6	36329	36334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020907	GGCC	2	8	36335	36342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020907	GTG	2	6	36406	36411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020907	TGG	2	6	36475	36480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020907	TTG	2	6	36482	36487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020907	TGG	2	6	36507	36512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020907	CG	3	6	36517	36522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020907	CCG	2	6	36552	36557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_020907	TTG	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020907	GC	3	6	36720	36725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020907	TATC	2	8	36755	36762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020907	CGG	2	6	36784	36789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020907	TAC	2	6	36865	36870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020907	TGC	2	6	36885	36890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020907	CCTT	2	8	36915	36922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020907	CGC	2	6	36938	36943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020907	CA	3	6	36999	37004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020907	ATCGC	2	10	37504	37513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020907	CG	3	6	37520	37525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020907	GTT	2	6	37617	37622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020907	ATC	2	6	37657	37662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020907	TAA	2	6	37679	37684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020907	TG	3	6	38758	38763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020907	GC	3	6	38799	38804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020907	GCC	2	6	38853	38858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020907	CATC	2	8	38860	38867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020907	GTGC	2	8	38891	38898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020907	GTG	2	6	38977	38982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020907	CAT	2	6	38988	38993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020907	GTC	2	6	39016	39021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020907	TAA	2	6	39068	39073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020907	TCC	2	6	42211	42216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020907	T	6	6	42227	42232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020907	TTC	2	6	42273	42278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020907	CAT	2	6	42367	42372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020907	ATG	2	6	42487	42492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020907	TCTT	2	8	42546	42553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020907	TC	3	6	45746	45751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020907	ACG	2	6	46240	46245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020907	GTC	2	6	46313	46318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020907	TGA	2	6	46373	46378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020907	CAT	2	6	46396	46401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020907	TGG	2	6	46407	46412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020907	TCGT	2	8	46494	46501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020907	CAC	2	6	46657	46662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020907	ATT	2	6	47058	47063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020907	CG	3	6	47069	47074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020907	CAC	2	6	47109	47114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020907	CCT	2	6	47124	47129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_020907	GACTC	2	10	47162	47171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_020907	ATT	2	6	47229	47234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020907	A	6	6	47282	47287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020907	G	6	6	47405	47410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020907	TTTCT	2	10	47456	47465	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020907	C	6	6	47488	47493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_020907	ACC	2	6	47507	47512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_020907	TTAT	2	8	47526	47533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020907	GT	3	6	47557	47562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020907	C	6	6	47586	47591	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_020907	CAC	2	6	47648	47653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_020907	A	6	6	47680	47685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020907	GCG	2	6	47717	47722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_020907	ACAA	2	8	47733	47740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020907	GCA	2	6	47753	47758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_020907	C	6	6	47790	47795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_020907	CAT	2	6	48764	48769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_020907	ATA	2	6	48876	48881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020907	A	6	6	49571	49576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020907	C	6	6	49660	49665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_020907	GCA	2	6	50476	50481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_020907	CCT	2	6	50573	50578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_020907	TGT	2	6	51368	51373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020907	C	8	8	51459	51466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
159	NC_020907	TGC	2	6	51484	51489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_020907	GC	4	8	51623	51630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_020907	CAT	2	6	51649	51654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_020907	A	7	7	51686	51692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_020907	TGT	2	6	52012	52017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020907	TGT	2	6	52023	52028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020907	GCC	2	6	52046	52051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_020907	TTG	2	6	52067	52072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020907	CTG	2	6	52081	52086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_020907	GCT	2	6	52334	52339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_020907	AGA	2	6	52406	52411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_020907	GCG	2	6	52592	52597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_020907	CGC	2	6	52804	52809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
194	NC_020907	CG	3	6	52835	52840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_020907	GC	3	6	52904	52909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
197	NC_020907	ACC	2	6	53068	53073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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253	NC_020907	GTT	2	6	62841	62846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020907	AAC	2	6	62847	62852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.