MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.01

Total Repeats: 1170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019763	TCA	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019763	TTG	2	6	58	63	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019763	AGTT	2	8	91	98	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019763	TCTT	2	8	541	548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019763	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019763	AGG	2	6	594	599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019763	GTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019763	ACT	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019763	GA	3	6	2085	2090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019763	TTG	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019763	CTG	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019763	GCT	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019763	GAC	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019763	ATT	2	6	2297	2302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019763	TAA	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019763	CTC	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019763	CGA	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019763	ATTA	2	8	2406	2413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019763	GGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019763	GTTGG	2	10	2767	2776	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019763	AG	3	6	2792	2797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019763	TCAT	2	8	3320	3327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019763	AAG	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019763	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019763	GAG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019763	CTA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019763	TTTA	2	8	5327	5334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019763	TGTC	2	8	5360	5367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019763	TG	3	6	5400	5405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019763	TTC	2	6	5409	5414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019763	GTG	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019763	CAC	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019763	ATG	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019763	TAAC	2	8	8251	8258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019763	GAA	2	6	8310	8315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019763	GTA	2	6	8318	8323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019763	CTC	2	6	8403	8408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019763	T	6	6	8451	8456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019763	T	6	6	8475	8480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019763	TTC	2	6	8549	8554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019763	TTC	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019763	ATT	2	6	8568	8573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019763	ATTAT	2	10	8612	8621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019763	ATT	2	6	8638	8643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019763	TTAA	2	8	8680	8687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019763	TCAA	2	8	8768	8775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019763	TAA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019763	CCTT	3	12	8916	8927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019763	TTC	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019763	GCA	2	6	9002	9007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019763	AGC	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019763	TGC	2	6	9207	9212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019763	TGCT	2	8	9307	9314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019763	CT	3	6	9428	9433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019763	ATT	2	6	9454	9459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019763	CGT	2	6	9470	9475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019763	AGA	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019763	TTA	2	6	9562	9567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019763	TGCT	2	8	9578	9585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019763	ATT	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019763	ATTT	2	8	9699	9706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019763	GTTG	2	8	10341	10348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019763	GTT	2	6	10352	10357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019763	GTT	2	6	10359	10364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019763	GTT	2	6	10373	10378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019763	CGG	2	6	10389	10394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019763	ATTT	2	8	11621	11628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019763	GTT	2	6	12375	12380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019763	TAGTT	2	10	12382	12391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019763	AAC	2	6	12412	12417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019763	ACA	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019763	ATT	2	6	13955	13960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019763	TTC	2	6	14036	14041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019763	TCA	2	6	14100	14105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019763	CAA	2	6	14147	14152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019763	GAT	2	6	14160	14165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019763	T	7	7	14183	14189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019763	GGT	2	6	14198	14203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019763	CTC	2	6	14229	14234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019763	CTT	2	6	14237	14242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019763	TGGA	2	8	14264	14271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019763	TGA	2	6	14321	14326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019763	CG	3	6	14336	14341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019763	TTGCT	2	10	14408	14417	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019763	CCA	2	6	14496	14501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019763	CCAAA	2	10	14528	14537	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_019763	T	6	6	15074	15079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019763	T	7	7	15486	15492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019763	ATTTCT	2	12	15857	15868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019763	AG	3	6	15894	15899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019763	TTC	2	6	15922	15927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019763	CT	3	6	15964	15969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019763	TGG	2	6	15974	15979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019763	TTG	2	6	16404	16409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019763	GCA	2	6	16416	16421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019763	CCTGAA	2	12	16568	16579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019763	ATC	2	6	16633	16638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019763	TACC	2	8	16718	16725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019763	TCC	2	6	16754	16759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019763	GGC	2	6	16778	16783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019763	GT	3	6	16809	16814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019763	AGC	2	6	16838	16843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019763	CGTT	2	8	16880	16887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019763	AGG	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019763	A	6	6	17086	17091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019763	TCC	2	6	17106	17111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019763	CCT	2	6	17114	17119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_019763	TTA	2	6	17287	17292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019763	ATT	2	6	17317	17322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019763	GTT	2	6	17426	17431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019763	CG	3	6	17488	17493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019763	GGC	2	6	17499	17504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019763	GCC	2	6	17508	17513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019763	AGA	2	6	17588	17593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019763	TTG	2	6	17606	17611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019763	CCT	2	6	17742	17747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019763	TGT	2	6	17794	17799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019763	CCA	2	6	17805	17810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_019763	GT	3	6	18609	18614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019763	T	6	6	18736	18741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019763	T	6	6	20435	20440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019763	TTCA	2	8	20536	20543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019763	ATT	2	6	20562	20567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019763	CTTTT	2	10	20582	20591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019763	GC	4	8	20615	20622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019763	A	6	6	20642	20647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019763	AAACTT	2	12	20683	20694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019763	CAGC	2	8	20705	20712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019763	ATA	2	6	20719	20724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019763	AAAC	2	8	20763	20770	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019763	GGACG	2	10	20787	20796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019763	ATT	2	6	20851	20856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019763	AC	3	6	20874	20879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019763	AAT	2	6	20952	20957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019763	CTT	2	6	20959	20964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019763	ACAAA	2	10	20971	20980	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019763	AGA	2	6	20984	20989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019763	TCT	2	6	21052	21057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019763	ATT	2	6	21104	21109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019763	CCA	2	6	22862	22867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_019763	AGG	2	6	22890	22895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019763	CGG	2	6	22896	22901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019763	TTG	2	6	22928	22933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019763	A	7	7	22991	22997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019763	T	7	7	23049	23055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019763	T	6	6	23057	23062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019763	CCT	2	6	23873	23878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_019763	TGT	2	6	23966	23971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_019763	TGA	2	6	27408	27413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_019763	CTT	2	6	27660	27665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_019763	GGT	2	6	30426	30431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019763	TGT	2	6	30435	30440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_019763	T	6	6	47929	47934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_019763	TATTT	2	10	58374	58383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_019763	GTT	2	6	58406	58411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_019763	CTT	2	6	97656	97661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_019763	T	6	6	97982	97987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_019763	TGA	2	6	98218	98223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_019763	CTA	2	6	98444	98449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_019763	AAG	2	6	98469	98474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_019763	TAG	2	6	98501	98506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_019763	GAT	2	6	98593	98598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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