MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.03

Total Repeats: 805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019731	TGCG	2	8	126	133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019731	TAA	2	6	186	191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019731	AGCA	2	8	527	534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019731	CAA	2	6	613	618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019731	GA	3	6	708	713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019731	GGTT	2	8	747	754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019731	CT	3	6	767	772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019731	ATC	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019731	GGC	2	6	1008	1013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019731	ACC	2	6	1215	1220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019731	ATG	2	6	1257	1262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019731	ATC	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019731	A	6	6	2517	2522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019731	TGT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019731	CAA	2	6	3344	3349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019731	CCGC	2	8	3354	3361	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_019731	A	8	8	3378	3385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019731	AGA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019731	ACAA	2	8	3412	3419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019731	A	7	7	3418	3424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019731	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019731	CAG	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019731	TCT	2	6	3513	3518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019731	GA	3	6	3570	3575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019731	AC	3	6	6974	6979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019731	AAGT	2	8	7048	7055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019731	CAG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019731	GA	3	6	7121	7126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019731	GCC	2	6	7128	7133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019731	CAT	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019731	AAC	2	6	7149	7154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019731	AGA	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019731	AGGAAC	2	12	7258	7269	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019731	GCA	2	6	7593	7598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019731	GCA	2	6	7624	7629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019731	GCA	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019731	T	6	6	7683	7688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019731	A	6	6	7701	7706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019731	TTG	2	6	7714	7719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019731	T	6	6	7869	7874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019731	TTG	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019731	TC	4	8	7917	7924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019731	AGCA	2	8	7928	7935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019731	AAACAA	2	12	7973	7984	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019731	TTGGT	2	10	8667	8676	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019731	CTAGT	2	10	8819	8828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019731	TAG	2	6	8831	8836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019731	TGT	2	6	9009	9014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019731	AGC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019731	TGC	2	6	9044	9049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019731	AGCG	2	8	9064	9071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019731	CTTG	2	8	9181	9188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019731	T	6	6	9244	9249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019731	AGCCA	2	10	9283	9292	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019731	CAA	2	6	9378	9383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019731	A	7	7	9437	9443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019731	TAGCAA	2	12	9458	9469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019731	AT	3	6	9479	9484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019731	TACCGA	2	12	9488	9499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019731	GCTC	2	8	9541	9548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019731	CTAC	2	8	9549	9556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019731	AGC	2	6	9567	9572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019731	ATT	2	6	9654	9659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019731	TCGA	2	8	10945	10952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019731	CGG	2	6	10979	10984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019731	TAC	2	6	11038	11043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019731	CTGC	2	8	11071	11078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019731	AATTC	2	10	11111	11120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019731	TTG	2	6	11154	11159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019731	A	6	6	11171	11176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019731	TTG	2	6	11185	11190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019731	T	6	6	11341	11346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019731	TCGTG	2	10	11354	11363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019731	TC	4	8	11389	11396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019731	AGCA	2	8	11400	11407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019731	A	6	6	11448	11453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019731	TGC	2	6	11807	11812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019731	TTC	2	6	11814	11819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019731	CTT	2	6	11852	11857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019731	CCG	2	6	11913	11918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019731	CTG	2	6	11922	11927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019731	GAGTC	2	10	11938	11947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019731	TGC	2	6	11981	11986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019731	CGAG	2	8	11987	11994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019731	AAC	2	6	12111	12116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019731	ATT	2	6	12135	12140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019731	GCA	3	9	12150	12158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019731	AT	3	6	12187	12192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019731	ATA	2	6	12212	12217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019731	CAA	2	6	12226	12231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019731	GTAA	2	8	12257	12264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019731	ATCA	2	8	12292	12299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019731	A	6	6	12359	12364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019731	ACA	2	6	12412	12417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019731	CAAT	2	8	12448	12455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019731	AAT	3	9	12453	12461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019731	ATG	2	6	12489	12494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019731	CGC	2	6	12495	12500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019731	AATA	2	8	12640	12647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019731	TAT	2	6	12809	12814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019731	GGT	2	6	22143	22148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019731	GAG	2	6	24266	24271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019731	ATG	2	6	24276	24281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019731	GGA	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019731	ATC	2	6	24402	24407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019731	AT	3	6	24409	24414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019731	TAT	2	6	24450	24455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019731	AGT	2	6	24490	24495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019731	TCA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019731	AGC	2	6	24552	24557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019731	GCA	2	6	24560	24565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019731	AG	3	6	24581	24586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019731	TGA	2	6	24596	24601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019731	CAA	2	6	24616	24621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019731	ATA	2	6	24629	24634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019731	AAG	2	6	24692	24697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019731	GCGG	2	8	24742	24749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019731	GGTT	2	8	24840	24847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019731	TAT	2	6	24850	24855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019731	GAA	2	6	24949	24954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019731	CTT	2	6	24988	24993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019731	CCTT	2	8	25074	25081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019731	AAATC	2	10	25084	25093	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019731	AGA	2	6	25107	25112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019731	AGA	2	6	25125	25130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019731	AAT	2	6	25145	25150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019731	A	6	6	25178	25183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019731	AAG	2	6	25196	25201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019731	T	6	6	25207	25212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019731	AATT	2	8	26079	26086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019731	ATC	2	6	26108	26113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019731	CTGAC	2	10	26116	26125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019731	CGAA	2	8	26128	26135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019731	ATG	2	6	26144	26149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019731	ATC	2	6	27038	27043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019731	CTGAC	2	10	27046	27055	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019731	GGA	2	6	27089	27094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019731	CGAT	2	8	30807	30814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019731	TAG	2	6	30833	30838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019731	TGAA	2	8	31513	31520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019731	TGC	2	6	31630	31635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019731	AAG	2	6	31642	31647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019731	TC	3	6	31697	31702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019731	CAG	3	9	31788	31796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019731	AAAC	2	8	31821	31828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019731	GCCCA	2	10	31913	31922	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_019731	AT	3	6	31959	31964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019731	T	6	6	34393	34398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019731	A	6	6	34485	34490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019731	A	6	6	34523	34528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019731	AATAGC	2	12	34531	34542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_019731	TAT	2	6	34554	34559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019731	TCT	2	6	34645	34650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019731	T	7	7	34659	34665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_019731	AT	3	6	35146	35151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019731	GTT	2	6	35156	35161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_019731	GAT	2	6	35298	35303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019731	T	6	6	35303	35308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019731	GTCG	2	8	35343	35350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_019731	GGT	2	6	35457	35462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_019731	TTGA	2	8	35576	35583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019731	CTG	2	6	35792	35797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_019731	CT	3	6	35938	35943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_019731	ATTG	2	8	40823	40830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_019731	GAC	2	6	40892	40897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_019731	ACG	2	6	41036	41041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_019731	AAC	2	6	41353	41358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_019731	GAT	2	6	41783	41788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_019731	AGT	2	6	41855	41860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_019731	TCCACT	2	12	50845	50856	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
290	NC_019731	TCT	2	6	50905	50910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_019731	GTTA	2	8	76872	76879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
433	NC_019731	TCG	2	6	76889	76894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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