MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019694	ATTT	2	8	38	45	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019694	A	6	6	93	98	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019694	CACCG	2	10	114	123	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_019694	CTG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019694	ACC	2	6	1290	1295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019694	GCTGT	2	10	1321	1330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019694	ACA	2	6	1344	1349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019694	CTAA	2	8	1350	1357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019694	ATG	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019694	AGC	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019694	A	6	6	2017	2022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019694	T	6	6	2027	2032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019694	TTC	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019694	CTC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019694	AGG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019694	TTA	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019694	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019694	C	6	6	2506	2511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_019694	GCA	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019694	AAG	2	6	2634	2639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019694	GTG	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019694	CAA	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019694	TGGT	2	8	3213	3220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019694	GCG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019694	AGA	2	6	3290	3295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019694	TCA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019694	AAT	2	6	3379	3384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019694	ATTT	2	8	4785	4792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019694	AACCC	2	10	4861	4870	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_019694	ACC	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019694	A	7	7	4936	4942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019694	T	7	7	4958	4964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019694	CTA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019694	TCT	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019694	AAT	2	6	5303	5308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019694	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019694	TTG	2	6	5375	5380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019694	TAC	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019694	TTAAT	2	10	5563	5572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019694	TCC	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019694	CTA	2	6	5634	5639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019694	C	7	7	5937	5943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_019694	GTT	3	9	5954	5962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019694	TTAA	2	8	5995	6002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019694	CCA	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019694	CAA	3	9	6239	6247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019694	GCC	2	6	6250	6255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019694	AAAC	2	8	6348	6355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019694	TTG	2	6	6434	6439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019694	G	6	6	6444	6449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019694	TGCTG	2	10	6460	6469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019694	TGG	2	6	6480	6485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019694	CTG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019694	AGC	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019694	ATG	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019694	CTG	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019694	CTG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019694	GGA	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019694	T	6	6	7130	7135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019694	GCT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019694	A	6	6	7207	7212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019694	A	7	7	7283	7289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019694	AATC	2	8	8730	8737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019694	GGGGT	2	10	11740	11749	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019694	AAACC	2	10	11775	11784	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019694	TGGT	2	8	11807	11814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019694	AAG	2	6	13381	13386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019694	AATAG	2	10	13392	13401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019694	TGA	2	6	13486	13491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019694	ACT	2	6	14576	14581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019694	ATT	2	6	14646	14651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019694	T	6	6	14730	14735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019694	T	7	7	14816	14822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019694	CAA	2	6	14849	14854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019694	TCC	2	6	15565	15570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019694	AGCG	2	8	15649	15656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019694	TAA	2	6	15740	15745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019694	ATTT	2	8	15759	15766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019694	GCCA	2	8	15797	15804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019694	AAT	2	6	15821	15826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019694	AACTA	2	10	15853	15862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019694	ACG	2	6	15863	15868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019694	A	8	8	15916	15923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019694	GTT	2	6	15943	15948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019694	CCA	2	6	15972	15977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019694	TACA	2	8	15994	16001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019694	ATCT	2	8	16011	16018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019694	CAAGGT	2	12	19249	19260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019694	AACCG	2	10	19288	19297	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019694	CTG	2	6	19310	19315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019694	GGC	2	6	19345	19350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019694	TCA	2	6	19383	19388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019694	ATTC	2	8	20194	20201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019694	AATT	2	8	20234	20241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019694	GTT	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019694	T	7	7	20389	20395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019694	A	7	7	20425	20431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019694	GCA	2	6	20440	20445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019694	A	7	7	21885	21891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019694	A	6	6	21938	21943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019694	T	7	7	23038	23044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019694	ACCT	2	8	23046	23053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019694	TGA	2	6	23091	23096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019694	CATCTA	2	12	23134	23145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019694	A	6	6	31853	31858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019694	TCC	2	6	31859	31864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019694	A	6	6	31907	31912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019694	TC	3	6	31922	31927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019694	ACAAT	2	10	31942	31951	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019694	ATTAA	2	10	32966	32975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019694	TGA	2	6	32980	32985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019694	CT	3	6	33047	33052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019694	ATTT	2	8	33054	33061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019694	ATA	2	6	33062	33067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019694	GACTG	2	10	33209	33218	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019694	AAG	2	6	33228	33233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019694	A	6	6	33298	33303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019694	ACTT	2	8	33360	33367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019694	A	6	6	33373	33378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019694	ACA	2	6	33427	33432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019694	AT	3	6	33434	33439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019694	TTGC	2	8	33455	33462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019694	A	7	7	33478	33484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019694	A	6	6	33508	33513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019694	A	7	7	33558	33564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019694	TC	4	8	33572	33579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019694	AGA	2	6	33588	33593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019694	ACA	2	6	33594	33599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019694	ATT	2	6	34573	34578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019694	TGA	2	6	34590	34595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019694	CTG	2	6	37210	37215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019694	GCAA	2	8	38610	38617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019694	TTATT	2	10	38637	38646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019694	TCA	2	6	38650	38655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019694	GA	3	6	38693	38698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019694	CT	3	6	38730	38735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019694	TGG	2	6	38837	38842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019694	TCC	2	6	38884	38889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019694	GAAA	2	8	38933	38940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019694	CCA	2	6	38950	38955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_019694	TTG	3	9	38968	38976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019694	CAT	2	6	39051	39056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019694	TGTT	2	8	39086	39093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019694	TG	3	6	39112	39117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019694	T	6	6	39128	39133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019694	T	6	6	39202	39207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019694	A	6	6	39247	39252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019694	TAG	2	6	39281	39286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019694	ATG	2	6	39319	39324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019694	TCT	2	6	40080	40085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_019694	TAC	2	6	40197	40202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_019694	CTG	2	6	41960	41965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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229	NC_019694	TGA	2	6	47992	47997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.