MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oceanimonas sp. GK1 plasmid pOCEGK01

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016746	ATC	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016746	CAG	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016746	CCTG	2	8	154	161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016746	CCTC	2	8	202	209	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_016746	CCG	2	6	247	252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016746	CAG	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016746	CGT	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016746	TGGG	2	8	369	376	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016746	GTAG	2	8	433	440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016746	TGA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016746	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016746	A	6	6	637	642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016746	GCT	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016746	GCC	2	6	717	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016746	TGA	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016746	GCT	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016746	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016746	CCT	2	6	837	842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016746	GGC	2	6	925	930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016746	T	7	7	1016	1022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016746	CGG	2	6	1028	1033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016746	A	6	6	1044	1049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016746	GGT	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016746	CCTG	2	8	1599	1606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016746	GCC	2	6	1607	1612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016746	GAC	2	6	1643	1648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016746	GGC	2	6	1657	1662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016746	CG	3	6	1779	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016746	TC	3	6	1786	1791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016746	C	9	9	1890	1898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_016746	CAAAC	2	10	2077	2086	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016746	ATC	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016746	AAC	2	6	2144	2149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016746	CAC	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016746	CCG	2	6	3379	3384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016746	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016746	CT	3	6	3442	3447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016746	GTA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016746	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016746	ACA	2	6	3652	3657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016746	CTTCG	2	10	3692	3701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016746	CTC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016746	TAT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016746	T	7	7	3740	3746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016746	C	7	7	3769	3775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_016746	TAT	2	6	3784	3789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016746	ACA	2	6	3860	3865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016746	ACAT	2	8	3926	3933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016746	TAG	2	6	3947	3952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016746	TTA	2	6	4051	4056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016746	ACC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016746	TTC	2	6	5268	5273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016746	AGCA	2	8	6136	6143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016746	A	6	6	6151	6156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016746	CTG	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016746	T	6	6	6215	6220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016746	AATTT	2	10	6233	6242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016746	TC	3	6	6244	6249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016746	A	6	6	8142	8147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016746	GAA	2	6	8219	8224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016746	ACT	2	6	8243	8248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016746	A	7	7	8315	8321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016746	GAT	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016746	GCCG	2	8	8389	8396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.