MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oscillibacter valericigenes Sjm18-20 plasmid pOBV01

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016046	CGG	2	6	1741	1746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016046	TCT	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016046	C	6	6	1784	1789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_016046	CTT	2	6	1809	1814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016046	AG	3	6	1831	1836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016046	TAA	2	6	1856	1861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016046	GCG	2	6	1971	1976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016046	TGAT	2	8	2002	2009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016046	AATC	2	8	2011	2018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016046	TCA	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016046	CGGG	2	8	2136	2143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016046	TAAA	2	8	2171	2178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016046	ACA	2	6	2186	2191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016046	TAA	2	6	2192	2197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016046	GAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016046	GGC	2	6	2819	2824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016046	GCC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016046	GTG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016046	A	7	7	2872	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016046	ACA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016046	AAT	2	6	2928	2933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016046	GAAAG	2	10	5027	5036	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016046	GGGC	2	8	5039	5046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016046	GCCC	2	8	5053	5060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016046	ATGT	2	8	5767	5774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016046	GTATTT	2	12	5821	5832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016046	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016046	TCTT	2	8	5841	5848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016046	AAT	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016046	GGGTTA	2	12	6205	6216	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016046	CGG	2	6	6618	6623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016046	TCT	2	6	6643	6648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016046	C	6	6	6661	6666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_016046	CTT	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016046	AG	3	6	6708	6713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016046	TAA	2	6	6733	6738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016046	GCG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016046	TGAT	2	8	6879	6886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016046	AATC	2	8	6888	6895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016046	CGGG	2	8	7013	7020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016046	TAAA	2	8	7048	7055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016046	ACA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016046	TAA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016046	TAA	3	9	7103	7111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016046	AGA	2	6	7118	7123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016046	GAA	2	6	7152	7157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016046	GAAG	2	8	8129	8136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016046	CGG	2	6	8846	8851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016046	GCCC	2	8	8857	8864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016046	ATA	2	6	8884	8889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016046	TAA	3	9	8919	8927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016046	CGAG	2	8	8955	8962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016046	GAAAG	2	10	9906	9915	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016046	GCT	2	6	11050	11055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016046	TG	3	6	11902	11907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016046	GGC	2	6	11951	11956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016046	ATC	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016046	GATA	2	8	12432	12439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016046	ACTT	2	8	12466	12473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016046	TGT	2	6	12479	12484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016046	GTA	2	6	12500	12505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016046	TAC	2	6	12526	12531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016046	TAT	2	6	12576	12581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016046	ACC	2	6	13304	13309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016046	CGG	2	6	13722	13727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016046	GCC	2	6	13732	13737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016046	TCT	2	6	13747	13752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016046	C	6	6	13765	13770	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_016046	CTT	2	6	13790	13795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016046	AG	3	6	13812	13817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016046	TAA	2	6	13837	13842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016046	GCG	2	6	13952	13957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016046	TGAT	2	8	13983	13990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016046	AATC	2	8	13992	13999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016046	TCA	2	6	14093	14098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016046	CGGG	2	8	14117	14124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016046	TAAA	2	8	14152	14159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016046	ACA	2	6	14167	14172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016046	TAA	2	6	14173	14178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016046	ACA	2	6	14185	14190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016046	GAA	2	6	14211	14216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016046	ACA	2	6	15538	15543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016046	GGC	2	6	15577	15582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016046	AAAC	2	8	15598	15605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016046	A	6	6	15657	15662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016046	GTT	2	6	15692	15697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016046	ACT	2	6	15701	15706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016046	ACA	2	6	15718	15723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016046	AAG	2	6	16995	17000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016046	AGG	2	6	18252	18257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016046	GGC	2	6	18271	18276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016046	GTTTT	2	10	18350	18359	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016046	CTT	2	6	18381	18386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016046	AGCA	2	8	18387	18394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016046	TTCGT	2	10	18414	18423	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016046	GCA	2	6	18524	18529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016046	TGC	2	6	18536	18541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016046	CTG	3	9	18607	18615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016046	TATT	2	8	18620	18627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016046	CCG	2	6	18634	18639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016046	GAA	2	6	18649	18654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016046	CTA	2	6	18687	18692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016046	AAT	2	6	21349	21354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016046	AT	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016046	TTA	2	6	21378	21383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016046	T	8	8	21398	21405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016046	TGT	2	6	21417	21422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016046	AATAC	2	10	21429	21438	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016046	AAG	2	6	23372	23377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016046	AC	3	6	26706	26711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016046	A	6	6	26717	26722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016046	GCA	2	6	26756	26761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016046	TTAA	2	8	26767	26774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016046	TGAA	2	8	30975	30982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016046	AAT	2	6	38394	38399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016046	GCG	2	6	39274	39279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016046	CAA	2	6	39379	39384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016046	TA	3	6	40256	40261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016046	ACA	2	6	40284	40289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016046	TAA	2	6	40311	40316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016046	AGGAA	2	10	40750	40759	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016046	ACA	2	6	43069	43074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016046	GGC	2	6	43128	43133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016046	TCG	2	6	43143	43148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016046	CAG	2	6	43173	43178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016046	TAA	2	6	43185	43190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016046	T	6	6	43233	43238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016046	ACA	2	6	44018	44023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016046	TCTT	2	8	44058	44065	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016046	TATTG	2	10	44108	44117	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016046	GCG	2	6	44589	44594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016046	CGA	2	6	44602	44607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016046	TGC	2	6	44619	44624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016046	A	6	6	44669	44674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016046	GTA	2	6	44680	44685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016046	G	6	6	49422	49427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016046	C	6	6	49438	49443	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_016046	AAAG	2	8	50680	50687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016046	AAGC	2	8	51260	51267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016046	TGC	2	6	51283	51288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016046	CGG	2	6	51433	51438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016046	TCT	2	6	51458	51463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016046	C	6	6	51476	51481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_016046	CTT	2	6	51501	51506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016046	AG	3	6	51523	51528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016046	TAA	2	6	51548	51553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016046	GCG	2	6	51663	51668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016046	TGAT	2	8	51694	51701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016046	AATC	2	8	51703	51710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016046	CGGG	2	8	51828	51835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016046	TAAA	2	8	51863	51870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016046	ACA	2	6	51878	51883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016046	TAA	2	6	51884	51889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016046	GAA	2	6	51922	51927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016046	AAC	2	6	52863	52868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_016046	ATGT	2	8	53260	53267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016046	G	6	6	54835	54840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016046	ACA	2	6	55433	55438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_016046	AAAT	2	8	58976	58983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016046	T	6	6	60019	60024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016046	CTTTTT	2	12	60034	60045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_016046	T	7	7	60059	60065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016046	T	8	8	60087	60094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016046	ATT	2	6	60104	60109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016046	TAA	2	6	60138	60143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016046	GAAA	2	8	60161	60168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016046	AGTA	2	8	60179	60186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016046	ACC	2	6	60308	60313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_016046	A	6	6	60326	60331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016046	ACA	2	6	60374	60379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_016046	AT	3	6	60483	60488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016046	GCT	2	6	60513	60518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_016046	TTA	2	6	60524	60529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016046	ATGGC	2	10	60541	60550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_016046	T	6	6	60563	60568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.