MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oceanithermus profundus DSM 14977 chromosome

Total Repeats: 3827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014761	CGC	2	6	11	16	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014761	TTG	2	6	42	47	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014761	CCGCGG	2	12	1436	1447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014761	CGC	2	6	1466	1471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014761	GCC	2	6	1525	1530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014761	CCTT	2	8	1625	1632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014761	GGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014761	CGG	2	6	8718	8723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014761	CCA	2	6	9998	10003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014761	GAA	2	6	11155	11160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014761	CCG	2	6	11163	11168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014761	GCG	2	6	11173	11178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014761	T	6	6	11180	11185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014761	GC	4	8	11207	11214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014761	T	6	6	11289	11294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014761	TCC	2	6	15568	15573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014761	CG	3	6	15619	15624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014761	CG	3	6	15634	15639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014761	GGGGT	2	10	15664	15673	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014761	GCG	2	6	16915	16920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014761	G	6	6	21163	21168	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014761	CGG	2	6	21808	21813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014761	CGT	2	6	21822	21827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014761	CCGC	2	8	23157	23164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014761	GC	3	6	23184	23189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014761	CG	3	6	23634	23639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014761	GC	3	6	23655	23660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014761	AGC	2	6	26507	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014761	TC	3	6	26544	26549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014761	ACA	2	6	26655	26660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014761	GAA	3	9	26685	26693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014761	TGA	2	6	26695	26700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014761	GAT	2	6	26775	26780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014761	T	7	7	26791	26797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014761	ACA	2	6	26800	26805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014761	AGA	2	6	26831	26836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014761	C	6	6	26841	26846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_014761	CCA	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014761	AAT	2	6	26921	26926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014761	TAC	2	6	26997	27002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014761	CAC	2	6	27012	27017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014761	CA	3	6	27037	27042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014761	AGA	2	6	27056	27061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014761	ATT	3	9	27066	27074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014761	CAC	2	6	27087	27092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014761	ATA	2	6	27181	27186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014761	CT	3	6	27227	27232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014761	GA	3	6	27277	27282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014761	AGTT	2	8	27313	27320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014761	GCG	2	6	29956	29961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014761	GCGCG	2	10	29973	29982	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014761	CAAG	2	8	30406	30413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014761	GAC	2	6	35646	35651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014761	CGG	2	6	35653	35658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014761	GA	4	8	35707	35714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014761	GCC	2	6	38798	38803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014761	GC	3	6	38883	38888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014761	GT	3	6	38893	38898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014761	CGC	2	6	38942	38947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014761	GCC	2	6	38965	38970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014761	CGGGG	2	10	39568	39577	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014761	CAAA	2	8	39619	39626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014761	GAA	2	6	39627	39632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014761	GGGA	2	8	40219	40226	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014761	CCTAG	2	10	40264	40273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014761	AGG	2	6	40302	40307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014761	CTG	3	9	40366	40374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014761	GAT	2	6	40426	40431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014761	ATG	2	6	40459	40464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014761	GAAG	2	8	40494	40501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014761	ACGT	2	8	40523	40530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014761	C	7	7	40557	40563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_014761	T	6	6	40564	40569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014761	CAC	2	6	40843	40848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014761	GGCC	2	8	40849	40856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014761	CGTG	2	8	40884	40891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014761	GAAG	2	8	40928	40935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014761	GCT	2	6	40982	40987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014761	GCA	2	6	41007	41012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014761	TGC	2	6	41020	41025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014761	TCG	2	6	41066	41071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014761	CG	3	6	41194	41199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014761	AC	3	6	41216	41221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014761	GCAA	2	8	41306	41313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014761	GGT	2	6	41320	41325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014761	AGG	2	6	41347	41352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014761	CGC	2	6	41367	41372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014761	CTC	2	6	41487	41492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014761	ACG	2	6	41529	41534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014761	CAA	2	6	41564	41569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014761	TCGTCA	2	12	41580	41591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014761	GC	4	8	41674	41681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014761	ATA	2	6	44440	44445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014761	GGT	2	6	44480	44485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014761	CCT	2	6	51878	51883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014761	CCT	2	6	54886	54891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014761	TA	3	6	54931	54936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014761	A	7	7	54938	54944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014761	CGG	3	9	54970	54978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014761	CTC	2	6	59566	59571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014761	AGCG	2	8	59681	59688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014761	GCTC	2	8	59709	59716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014761	TGC	2	6	59736	59741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014761	ACCC	2	8	63377	63384	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_014761	AGCT	2	8	64614	64621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014761	CGG	2	6	64623	64628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014761	GC	3	6	64871	64876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014761	AT	3	6	66897	66902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014761	ACG	2	6	67027	67032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014761	GGA	2	6	67051	67056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014761	TCC	2	6	68759	68764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014761	GGC	2	6	69660	69665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014761	GGGA	2	8	69671	69678	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014761	GCC	2	6	69690	69695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014761	CCTTT	2	10	71032	71041	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014761	TTC	2	6	71902	71907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014761	CGC	3	9	71926	71934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014761	GGA	2	6	71942	71947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014761	CCT	2	6	72532	72537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014761	CGC	2	6	72546	72551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014761	CCT	2	6	72604	72609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014761	ACG	2	6	72797	72802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014761	GCC	2	6	72826	72831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014761	GCC	3	9	72843	72851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014761	GC	3	6	74287	74292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014761	CGGG	2	8	74317	74324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014761	CCGG	2	8	74335	74342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014761	GACGC	2	10	74455	74464	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014761	GCC	2	6	74466	74471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014761	GCG	2	6	74477	74482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014761	AGG	2	6	74486	74491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014761	CGC	2	6	76318	76323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014761	GC	3	6	76322	76327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014761	TTC	2	6	76336	76341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014761	CGTT	2	8	77056	77063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014761	GCC	2	6	77068	77073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014761	AGG	2	6	77092	77097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014761	GGC	2	6	77827	77832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014761	GTT	2	6	77851	77856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014761	ATAC	2	8	79701	79708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014761	GCTG	2	8	79711	79718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014761	AAG	2	6	79807	79812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014761	TAAT	2	8	87708	87715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014761	TATT	2	8	87751	87758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014761	TCAAA	2	10	87774	87783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014761	TGG	2	6	87969	87974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014761	TGG	2	6	87979	87984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014761	CAGC	2	8	88012	88019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014761	CA	4	8	88829	88836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014761	GCG	2	6	88880	88885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014761	GC	3	6	88953	88958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014761	CCT	2	6	89344	89349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014761	CTTGC	2	10	89356	89365	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_014761	GGT	2	6	89390	89395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014761	CG	3	6	89396	89401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_014761	CCGT	2	8	89402	89409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014761	AGG	2	6	89427	89432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014761	CCCG	2	8	89969	89976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159	NC_014761	GGC	2	6	93720	93725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_014761	GAG	2	6	93745	93750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014761	GAG	2	6	93753	93758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014761	GCC	2	6	97317	97322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_014761	CG	3	6	97355	97360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_014761	TCG	2	6	97583	97588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_014761	GC	3	6	97610	97615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_014761	TGG	2	6	97684	97689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014761	GTC	2	6	97735	97740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_014761	GCCC	2	8	97781	97788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
171	NC_014761	TGGG	2	8	97805	97812	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014761	CCCG	2	8	99700	99707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_014761	GGAC	2	8	99755	99762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_014761	TGC	2	6	99777	99782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_014761	CCG	2	6	99847	99852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_014761	AGG	2	6	101646	101651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_014761	TGG	2	6	102730	102735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014761	GCCCG	2	10	102844	102853	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
192	NC_014761	CCT	2	6	103323	103328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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194	NC_014761	CCA	2	6	103367	103372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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196	NC_014761	TAG	2	6	103386	103391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_014761	GCC	2	6	174799	174804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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295	NC_014761	GCC	2	6	185936	185941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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421	NC_014761	CCGC	2	8	261870	261877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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424	NC_014761	GC	3	6	262313	262318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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429	NC_014761	GC	4	8	262512	262519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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462	NC_014761	GT	3	6	279313	279318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
463	NC_014761	TCC	2	6	279364	279369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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