MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Oceanithermus profundus DSM 14977 plasmid pOCEPR01

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014753	CG	3	6	23	28	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014753	CTT	2	6	38	43	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014753	CTC	2	6	2516	2521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014753	CAT	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014753	CCT	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014753	TCC	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014753	CGC	2	6	5352	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014753	G	6	6	5396	5401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014753	CAA	2	6	5427	5432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014753	GCG	2	6	5441	5446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014753	CTC	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014753	GCC	2	6	5513	5518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014753	GC	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014753	CGT	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014753	CG	3	6	5606	5611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014753	TCC	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014753	TCG	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014753	CTT	2	6	9392	9397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014753	GTC	2	6	9402	9407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014753	GCG	2	6	9424	9429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014753	TCGT	2	8	9471	9478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014753	CTT	2	6	9485	9490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014753	GTGC	2	8	9504	9511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014753	TCC	2	6	9545	9550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014753	CCT	2	6	9650	9655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014753	T	7	7	9655	9661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014753	TTTAT	2	10	9670	9679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014753	GTT	2	6	9725	9730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014753	CCA	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014753	TGCA	2	8	9895	9902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014753	TGA	2	6	12206	12211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014753	CCT	2	6	12264	12269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014753	GAG	2	6	12277	12282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014753	AAG	2	6	12297	12302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014753	AGG	2	6	12410	12415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014753	TCCCC	2	10	12955	12964	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_014753	C	6	6	12961	12966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_014753	TTCA	2	8	12991	12998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014753	CTTC	2	8	13884	13891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014753	TCC	2	6	14406	14411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014753	CTTT	2	8	14418	14425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014753	T	7	7	14423	14429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014753	TCA	2	6	14500	14505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014753	CCT	2	6	15615	15620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014753	GC	3	6	15638	15643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014753	CCT	2	6	16498	16503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014753	TCC	2	6	19329	19334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014753	GGT	3	9	19377	19385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014753	TGC	2	6	19412	19417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014753	CG	3	6	19423	19428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014753	GCCT	2	8	19448	19455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014753	CG	3	6	19489	19494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014753	GCGA	2	8	19518	19525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014753	AGG	2	6	19576	19581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014753	TGGA	2	8	19624	19631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014753	GCGAG	2	10	19697	19706	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014753	TTCGC	2	10	19719	19728	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014753	TTC	2	6	19729	19734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014753	CTTTC	2	10	19749	19758	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014753	CG	3	6	19788	19793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014753	CCT	2	6	21393	21398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014753	GCGG	2	8	21406	21413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014753	CGG	2	6	21841	21846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014753	CCG	2	6	21852	21857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014753	CCT	2	6	23340	23345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014753	GCC	3	9	23363	23371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014753	CTC	3	9	23391	23399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014753	TCC	2	6	23830	23835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014753	AGG	2	6	24900	24905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014753	CTTG	2	8	25007	25014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014753	CCG	2	6	25025	25030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014753	TCC	2	6	25928	25933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014753	TCC	2	6	26653	26658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014753	CCT	2	6	26899	26904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014753	CTC	2	6	27789	27794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014753	TGG	2	6	27819	27824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014753	CCT	2	6	29924	29929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014753	TCC	2	6	31159	31164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014753	GCG	2	6	32284	32289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014753	AAG	2	6	32316	32321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014753	CGT	2	6	32360	32365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014753	CCT	2	6	36244	36249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014753	CGG	2	6	36256	36261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014753	CGG	2	6	36288	36293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014753	CCT	2	6	36524	36529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014753	CGC	2	6	36539	36544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014753	A	6	6	36552	36557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014753	AC	3	6	36977	36982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014753	C	7	7	36982	36988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_014753	CAC	3	9	36998	37006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014753	CTCCC	3	15	37020	37034	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
92	NC_014753	GCG	2	6	37083	37088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014753	G	6	6	37100	37105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014753	GTGG	2	8	37114	37121	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014753	G	6	6	37120	37125	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014753	GGGT	2	8	37142	37149	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014753	CCT	2	6	38434	38439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014753	TCCT	2	8	40007	40014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014753	G	6	6	40087	40092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014753	CG	3	6	41975	41980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014753	GAG	2	6	41995	42000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014753	CGGAG	2	10	42736	42745	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014753	GTGC	2	8	42765	42772	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014753	AGG	2	6	42780	42785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014753	CA	3	6	42810	42815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014753	TGGG	2	8	42861	42868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014753	AGG	2	6	42900	42905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014753	TCG	2	6	42908	42913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014753	G	6	6	44166	44171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014753	G	6	6	44179	44184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014753	ACC	2	6	44201	44206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014753	GGAC	2	8	44262	44269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014753	CT	3	6	44282	44287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014753	GCGG	2	8	44296	44303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014753	GTG	2	6	45555	45560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014753	GGAA	2	8	45581	45588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014753	TCC	2	6	46476	46481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014753	GC	3	6	46538	46543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014753	GCC	2	6	46608	46613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014753	CGG	2	6	46623	46628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014753	TTG	2	6	46650	46655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014753	TC	3	6	46768	46773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014753	GC	3	6	47902	47907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014753	TCG	2	6	47911	47916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014753	CAC	2	6	47925	47930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014753	TGG	2	6	47935	47940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014753	TCT	2	6	48563	48568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014753	GAC	2	6	48590	48595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014753	CTT	2	6	48884	48889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014753	GGT	2	6	48906	48911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014753	GGC	2	6	48932	48937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014753	TAC	2	6	50165	50170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014753	GTA	2	6	50177	50182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014753	T	6	6	50203	50208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014753	CAC	2	6	50743	50748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014753	CCT	2	6	56132	56137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014753	TCC	2	6	56808	56813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014753	A	6	6	56887	56892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014753	GCC	2	6	60623	60628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014753	CGC	2	6	60638	60643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_014753	T	6	6	60662	60667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014753	AGGCG	2	10	61809	61818	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014753	CTC	2	6	63742	63747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014753	GAA	2	6	63758	63763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014753	GC	3	6	66110	66115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014753	GC	3	6	66127	66132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014753	TCC	2	6	68184	68189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_014753	CCA	2	6	68194	68199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_014753	CCT	2	6	71175	71180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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151	NC_014753	C	7	7	72254	72260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
152	NC_014753	TCC	2	6	72261	72266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014753	ACC	2	6	72268	72273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_014753	G	9	9	72284	72292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014753	C	8	8	72305	72312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
156	NC_014753	TCC	2	6	72313	72318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NC_014753	G	7	7	72336	72342	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014753	C	7	7	72355	72361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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165	NC_014753	ACC	2	6	72420	72425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_014753	G	11	11	72436	72446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014753	GAGGT	2	10	128846	128855	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014753	TC	3	6	128942	128947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
279	NC_014753	GCA	2	6	129111	129116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_014753	AGG	2	6	129198	129203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014753	CCG	2	6	129210	129215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_014753	CTC	2	6	130725	130730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_014753	AGT	2	6	130851	130856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014753	CAG	2	6	130879	130884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_014753	TAA	2	6	130962	130967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014753	CAAAA	2	10	130996	131005	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_014753	AGA	3	9	131051	131059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014753	GAT	2	6	131076	131081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014753	CGT	2	6	131117	131122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_014753	TCA	2	6	131143	131148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_014753	GCA	2	6	131187	131192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_014753	CT	3	6	131538	131543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
296	NC_014753	CGT	2	6	133350	133355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_014753	TGC	2	6	133358	133363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_014753	GCG	2	6	133429	133434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_014753	GCC	2	6	133479	133484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_014753	GAT	2	6	133494	133499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014753	TCCC	2	8	133564	133571	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
302	NC_014753	GCA	2	6	133610	133615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_014753	CGG	2	6	133754	133759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_014753	GTC	2	6	133767	133772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_014753	CTT	2	6	133782	133787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_014753	T	6	6	133925	133930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_014753	TTCT	2	8	133952	133959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
308	NC_014753	ACC	3	9	133960	133968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
309	NC_014753	ACT	2	6	134963	134968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_014753	CG	3	6	135005	135010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
311	NC_014753	GC	3	6	135027	135032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
312	NC_014753	CGGG	2	8	135067	135074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
313	NC_014753	ATC	2	6	135091	135096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_014753	CG	3	6	135129	135134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
315	NC_014753	ACA	2	6	135141	135146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
316	NC_014753	CG	3	6	135190	135195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
317	NC_014753	GCT	2	6	135204	135209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
318	NC_014753	GCG	2	6	135233	135238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
319	NC_014753	CG	3	6	135252	135257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
320	NC_014753	CG	3	6	135313	135318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.