MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ochrobactrum anthropi ATCC 49188 plasmid pOANT03

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009671	ATG	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009671	CAT	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009671	TCC	2	6	1275	1280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009671	AAC	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009671	TGC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009671	GTGGC	2	10	1343	1352	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009671	GCC	2	6	1770	1775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009671	T	7	7	2250	2256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009671	GAA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009671	GAC	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009671	TTC	2	6	2312	2317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009671	GGT	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009671	CGG	2	6	2422	2427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009671	CGC	2	6	3302	3307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009671	TTGA	2	8	3386	3393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009671	CCG	2	6	3416	3421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009671	AGA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009671	TA	3	6	3494	3499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009671	CTG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009671	T	6	6	3549	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009671	AC	3	6	3560	3565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009671	CGT	2	6	3577	3582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009671	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009671	CAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009671	ATC	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009671	ACT	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009671	GAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009671	TCA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009671	ACCG	2	8	3947	3954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009671	TTTTGA	2	12	4012	4023	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009671	CA	3	6	4131	4136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009671	GATC	2	8	4141	4148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009671	CAC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009671	ACG	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009671	GCTG	2	8	4207	4214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009671	CG	3	6	4245	4250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009671	GTT	2	6	4402	4407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009671	CG	3	6	4432	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009671	AAT	2	6	4467	4472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009671	CG	3	6	4536	4541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009671	GGT	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009671	C	6	6	4716	4721	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_009671	CAAAC	2	10	6066	6075	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009671	TGATG	2	10	6923	6932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009671	AGGC	2	8	6947	6954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009671	CA	3	6	6982	6987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009671	CTT	2	6	7046	7051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009671	AG	3	6	7109	7114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009671	GGC	2	6	12194	12199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009671	GCCAC	2	10	12617	12626	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009671	GCA	2	6	12652	12657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009671	GTT	2	6	12665	12670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009671	GGA	2	6	12689	12694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009671	GAT	2	6	13809	13814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009671	CAT	2	6	13893	13898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009671	GCG	2	6	13978	13983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009671	ATT	2	6	14001	14006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009671	GTC	2	6	14039	14044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009671	AATC	2	8	14797	14804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009671	TG	3	6	14872	14877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009671	GGATG	2	10	14903	14912	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009671	ATT	2	6	14954	14959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009671	TCC	2	6	16291	16296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009671	TGG	2	6	18714	18719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009671	CGC	2	6	19823	19828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009671	ACG	2	6	19868	19873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009671	TCC	2	6	21733	21738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009671	TTC	2	6	21791	21796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009671	ATC	2	6	22556	22561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009671	TTC	2	6	22614	22619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009671	GAGG	2	8	22686	22693	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009671	TATAT	2	10	22723	22732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009671	GA	3	6	24407	24412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009671	CAG	2	6	25229	25234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009671	A	7	7	25342	25348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009671	ACC	2	6	25383	25388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009671	CGC	2	6	26237	26242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009671	GTTG	2	8	26287	26294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009671	CAG	2	6	26302	26307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009671	ATC	2	6	26312	26317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009671	CCA	2	6	26402	26407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009671	AGC	2	6	26503	26508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009671	TCT	2	6	27386	27391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009671	AAC	2	6	27456	27461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009671	AACA	2	8	27472	27479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009671	TCG	2	6	27506	27511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009671	TGT	2	6	27513	27518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009671	TCA	2	6	27526	27531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009671	CTT	2	6	29131	29136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009671	CG	3	6	30001	30006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009671	GGT	2	6	30069	30074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009671	GT	3	6	31325	31330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009671	GCG	2	6	31407	31412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009671	GTT	2	6	34408	34413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009671	GGCAC	2	10	35154	35163	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009671	AAAAGA	2	12	37548	37559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009671	TC	4	8	37586	37593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009671	CAA	2	6	38935	38940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009671	TAA	2	6	38958	38963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009671	TCA	2	6	39002	39007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009671	TGA	2	6	39848	39853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009671	TCC	2	6	39877	39882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009671	GAA	2	6	41172	41177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009671	AT	3	6	41484	41489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009671	ACG	2	6	41539	41544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009671	TTC	2	6	41591	41596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009671	TCT	2	6	42402	42407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009671	TCAGC	2	10	42416	42425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009671	AAATCA	2	12	42459	42470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009671	TTC	2	6	42477	42482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009671	GCC	2	6	42506	42511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009671	ATGGA	2	10	42604	42613	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009671	TA	3	6	42697	42702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009671	TTCA	2	8	42742	42749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009671	TTA	2	6	42764	42769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009671	T	6	6	42818	42823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009671	CCTT	2	8	42829	42836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009671	T	7	7	42835	42841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009671	GTTG	2	8	43474	43481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009671	CCTT	2	8	43533	43540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009671	AGA	2	6	43547	43552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009671	AT	3	6	43710	43715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009671	TGT	2	6	44436	44441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009671	TA	3	6	44528	44533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009671	AAC	2	6	44687	44692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009671	AT	3	6	44739	44744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009671	GAA	3	9	44764	44772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009671	GCATC	2	10	45773	45782	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009671	TCC	2	6	45814	45819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009671	CACGA	2	10	45826	45835	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009671	GTG	2	6	45838	45843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009671	TCA	2	6	48842	48847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009671	CCCT	2	8	48848	48855	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_009671	TTC	2	6	49588	49593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009671	CAC	2	6	49620	49625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009671	TCGTG	2	10	49628	49637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009671	TGT	2	6	49736	49741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009671	AAG	2	6	52201	52206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009671	TCA	2	6	53532	53537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009671	CACTGG	2	12	53583	53594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009671	G	6	6	53624	53629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009671	TA	3	6	53649	53654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009671	TTCA	2	8	53704	53711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009671	AGA	2	6	53747	53752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009671	CCG	2	6	54852	54857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009671	AACGT	2	10	54903	54912	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009671	ATGG	2	8	55001	55008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009671	TGGG	2	8	55468	55475	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009671	GAT	2	6	55499	55504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009671	TC	3	6	58477	58482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009671	ATC	2	6	58517	58522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009671	CTC	2	6	61019	61024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_009671	CTTTGC	2	12	61058	61069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_009671	TCTA	2	8	61107	61114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_009671	A	6	6	61146	61151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009671	ATA	2	6	61279	61284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009671	CAT	2	6	64636	64641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_009671	A	8	8	65595	65602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009671	GCG	2	6	65603	65608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_009671	A	6	6	66239	66244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009671	CCT	2	6	66250	66255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_009671	AT	3	6	66363	66368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009671	ACC	2	6	66383	66388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_009671	TAA	2	6	67397	67402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009671	CGG	3	9	67411	67419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_009671	ATG	2	6	67445	67450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009671	AGT	2	6	67454	67459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_009671	TGC	2	6	67530	67535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_009671	GT	3	6	67625	67630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009671	CGG	2	6	67672	67677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_009671	GGT	2	6	67836	67841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_009671	ATC	2	6	67944	67949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_009671	AAT	2	6	93552	93557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009671	CGC	2	6	93575	93580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.