MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.04

Total Repeats: 1209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019764	TTGA	2	8	1544	1551	25 %	50 %	25 %	0 %	428315128
2	NC_019764	TGC	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
3	NC_019764	TGG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
4	NC_019764	ATG	2	6	1797	1802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315128
5	NC_019764	CTT	2	6	1876	1881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
6	NC_019764	AAGT	2	8	1890	1897	50 %	25 %	25 %	0 %	428315128
7	NC_019764	T	6	6	1917	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	428315128
8	NC_019764	GCAA	2	8	1939	1946	50 %	0 %	25 %	25 %	428315128
9	NC_019764	GCAG	2	8	1966	1973	25 %	0 %	50 %	25 %	428315128
10	NC_019764	TTCA	2	8	2009	2016	25 %	50 %	0 %	25 %	428315128
11	NC_019764	CTT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
12	NC_019764	GTA	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315128
13	NC_019764	GGT	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
14	NC_019764	CGTC	2	8	2252	2259	0 %	25 %	25 %	50 %	428315128
15	NC_019764	CTCGA	2	10	2393	2402	20 %	20 %	20 %	40 %	428315128
16	NC_019764	GTT	2	6	2441	2446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315128
17	NC_019764	TCG	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
18	NC_019764	TTG	2	6	2493	2498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315128
19	NC_019764	GAA	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315128
20	NC_019764	TCG	2	6	2523	2528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
21	NC_019764	CG	3	6	2545	2550	0 %	0 %	50 %	50 %	428315128
22	NC_019764	TTC	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
23	NC_019764	GGC	2	6	2640	2645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315128
24	NC_019764	CTT	2	6	2683	2688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
25	NC_019764	CTG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
26	NC_019764	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
27	NC_019764	CAA	2	6	2848	2853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315128
28	NC_019764	TCA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315128
29	NC_019764	GCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315128
30	NC_019764	GCTTGC	2	12	2998	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
31	NC_019764	T	6	6	3031	3036	0 %	100 %	0 %	0 %	428315128
32	NC_019764	TCT	2	6	3143	3148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
33	NC_019764	GAG	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
34	NC_019764	CGAT	2	8	3183	3190	25 %	25 %	25 %	25 %	428315128
35	NC_019764	AT	3	6	3189	3194	50 %	50 %	0 %	0 %	428315128
36	NC_019764	GAG	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
37	NC_019764	TTTC	2	8	3208	3215	0 %	75 %	0 %	25 %	428315128
38	NC_019764	CGG	2	6	3233	3238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315128
39	NC_019764	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315128
40	NC_019764	CT	3	6	3279	3284	0 %	50 %	0 %	50 %	428315128
41	NC_019764	GCT	3	9	3316	3324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
42	NC_019764	G	6	6	3396	3401	0 %	0 %	100 %	0 %	428315128
43	NC_019764	CGG	3	9	3478	3486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315128
44	NC_019764	GCT	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
45	NC_019764	GTG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
46	NC_019764	CAC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315128
47	NC_019764	G	6	6	3721	3726	0 %	0 %	100 %	0 %	428315128
48	NC_019764	TCT	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
49	NC_019764	CAA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315128
50	NC_019764	GCA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315128
51	NC_019764	CCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315128
52	NC_019764	TTC	2	6	4004	4009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
53	NC_019764	AGG	2	6	4071	4076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
54	NC_019764	GC	3	6	4103	4108	0 %	0 %	50 %	50 %	428315128
55	NC_019764	GAG	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
56	NC_019764	CCG	3	9	4191	4199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315128
57	NC_019764	GTG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
58	NC_019764	AAG	2	6	4860	4865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315129
59	NC_019764	AGA	2	6	4909	4914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315129
60	NC_019764	TGG	2	6	4963	4968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315129
61	NC_019764	CTG	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315129
62	NC_019764	TTG	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315129
63	NC_019764	CG	3	6	5039	5044	0 %	0 %	50 %	50 %	428315129
64	NC_019764	TGC	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315129
65	NC_019764	GTA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315129
66	NC_019764	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315130
67	NC_019764	AT	3	6	5174	5179	50 %	50 %	0 %	0 %	428315130
68	NC_019764	AT	3	6	5182	5187	50 %	50 %	0 %	0 %	428315130
69	NC_019764	TTG	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315130
70	NC_019764	GTA	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315130
71	NC_019764	GTT	2	6	5402	5407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315130
72	NC_019764	TGT	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315130
73	NC_019764	AGCA	2	8	5481	5488	50 %	0 %	25 %	25 %	428315130
74	NC_019764	TCG	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315130
75	NC_019764	CCG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315130
76	NC_019764	AAT	2	6	5562	5567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315130
77	NC_019764	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315130
78	NC_019764	ACCA	2	8	5955	5962	50 %	0 %	0 %	50 %	428315131
79	NC_019764	ACC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315131
80	NC_019764	A	6	6	6149	6154	100 %	0 %	0 %	0 %	428315131
81	NC_019764	GCG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315131
82	NC_019764	TGC	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315131
83	NC_019764	GAT	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315131
84	NC_019764	CCA	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315131
85	NC_019764	CTC	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315131
86	NC_019764	GAA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315131
87	NC_019764	TATT	2	8	6405	6412	25 %	75 %	0 %	0 %	428315131
88	NC_019764	TGC	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315131
89	NC_019764	GC	3	6	6562	6567	0 %	0 %	50 %	50 %	428315131
90	NC_019764	TCGC	2	8	6570	6577	0 %	25 %	25 %	50 %	428315131
91	NC_019764	G	6	6	6587	6592	0 %	0 %	100 %	0 %	428315131
92	NC_019764	GCA	2	6	6675	6680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
93	NC_019764	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315131
94	NC_019764	ATT	2	6	6788	6793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315131
95	NC_019764	AGT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315131
96	NC_019764	GA	3	6	6817	6822	50 %	0 %	50 %	0 %	428315131
97	NC_019764	TCGC	2	8	6896	6903	0 %	25 %	25 %	50 %	428315131
98	NC_019764	TGCT	2	8	7007	7014	0 %	50 %	25 %	25 %	428315131
99	NC_019764	CAA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315131
100	NC_019764	TCGA	2	8	7095	7102	25 %	25 %	25 %	25 %	428315131
101	NC_019764	AGT	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315131
102	NC_019764	AGC	3	9	7162	7170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
103	NC_019764	CTG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315131
104	NC_019764	CGTG	2	8	7230	7237	0 %	25 %	50 %	25 %	428315131
105	NC_019764	AGAA	2	8	7246	7253	75 %	0 %	25 %	0 %	428315131
106	NC_019764	CAG	2	6	7343	7348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
107	NC_019764	AGC	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
108	NC_019764	T	6	6	8854	8859	0 %	100 %	0 %	0 %	428315132
109	NC_019764	A	7	7	9019	9025	100 %	0 %	0 %	0 %	428315132
110	NC_019764	GCA	2	6	9129	9134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315132
111	NC_019764	CGC	2	6	9206	9211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315132
112	NC_019764	GCTC	2	8	9231	9238	0 %	25 %	25 %	50 %	428315132
113	NC_019764	TCT	2	6	9247	9252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315132
114	NC_019764	TCGA	2	8	9267	9274	25 %	25 %	25 %	25 %	428315132
115	NC_019764	CAAC	2	8	9286	9293	50 %	0 %	0 %	50 %	428315132
116	NC_019764	TAC	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315132
117	NC_019764	TGTT	2	8	9468	9475	0 %	75 %	25 %	0 %	428315132
118	NC_019764	A	8	8	9505	9512	100 %	0 %	0 %	0 %	428315132
119	NC_019764	AGA	2	6	9523	9528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315132
120	NC_019764	TTC	2	6	9677	9682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315132
121	NC_019764	AGCA	2	8	9767	9774	50 %	0 %	25 %	25 %	428315132
122	NC_019764	GA	3	6	9816	9821	50 %	0 %	50 %	0 %	428315132
123	NC_019764	AAC	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315132
124	NC_019764	ATCG	2	8	9832	9839	25 %	25 %	25 %	25 %	428315132
125	NC_019764	GAA	2	6	9868	9873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315132
126	NC_019764	CGAT	2	8	9900	9907	25 %	25 %	25 %	25 %	428315132
127	NC_019764	AAC	2	6	10016	10021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315133
128	NC_019764	CAGC	3	12	10056	10067	25 %	0 %	25 %	50 %	428315133
129	NC_019764	AAG	2	6	10083	10088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315133
130	NC_019764	CTG	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315133
131	NC_019764	TC	3	6	10193	10198	0 %	50 %	0 %	50 %	428315133
132	NC_019764	CGA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315133
133	NC_019764	A	6	6	10326	10331	100 %	0 %	0 %	0 %	428315133
134	NC_019764	CGT	2	6	10360	10365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315133
135	NC_019764	GAA	2	6	10430	10435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315133
136	NC_019764	TCGA	2	8	10455	10462	25 %	25 %	25 %	25 %	428315133
137	NC_019764	CTT	2	6	10618	10623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315133
138	NC_019764	CAG	2	6	10649	10654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315133
139	NC_019764	GAA	2	6	10685	10690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315133
140	NC_019764	GGA	2	6	10723	10728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315133
141	NC_019764	AGC	2	6	10737	10742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315133
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143	NC_019764	ATTG	2	8	11099	11106	25 %	50 %	25 %	0 %	428315133
144	NC_019764	GTT	2	6	11207	11212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315133
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149	NC_019764	TTG	2	6	11772	11777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315134
150	NC_019764	CTA	2	6	11869	11874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315134
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152	NC_019764	ATC	2	6	12033	12038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315134
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154	NC_019764	TTC	2	6	12108	12113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315134
155	NC_019764	CTCAA	2	10	12148	12157	40 %	20 %	0 %	40 %	428315134
156	NC_019764	A	7	7	12169	12175	100 %	0 %	0 %	0 %	428315134
157	NC_019764	A	6	6	12321	12326	100 %	0 %	0 %	0 %	428315134
158	NC_019764	GCT	2	6	12368	12373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315134
159	NC_019764	ATCG	2	8	12393	12400	25 %	25 %	25 %	25 %	428315134
160	NC_019764	TAC	2	6	12462	12467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315134
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162	NC_019764	TAC	2	6	12783	12788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315134
163	NC_019764	TTGCT	2	10	12824	12833	0 %	60 %	20 %	20 %	428315134
164	NC_019764	GCA	2	6	12856	12861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315134
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168	NC_019764	TAT	2	6	12963	12968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315134
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172	NC_019764	CTG	2	6	13332	13337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315135
173	NC_019764	A	7	7	13358	13364	100 %	0 %	0 %	0 %	428315135
174	NC_019764	ACA	2	6	13409	13414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315135
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181	NC_019764	CCTTA	2	10	13804	13813	20 %	40 %	0 %	40 %	428315135
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248	NC_019764	CAA	2	6	18571	18576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315139
249	NC_019764	CCT	2	6	18585	18590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315139
250	NC_019764	GA	3	6	18635	18640	50 %	0 %	50 %	0 %	428315139
251	NC_019764	CA	4	8	18701	18708	50 %	0 %	0 %	50 %	428315139
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259	NC_019764	T	6	6	18895	18900	0 %	100 %	0 %	0 %	428315139
260	NC_019764	TAA	2	6	18917	18922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315139
261	NC_019764	GAT	2	6	18964	18969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315139
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263	NC_019764	A	6	6	19112	19117	100 %	0 %	0 %	0 %	428315139
264	NC_019764	CTG	2	6	19174	19179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315139
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266	NC_019764	CGC	2	6	19228	19233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315139
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272	NC_019764	TTTG	2	8	19570	19577	0 %	75 %	25 %	0 %	428315139
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376	NC_019764	TTGAG	2	10	25986	25995	20 %	40 %	40 %	0 %	428315144
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381	NC_019764	TGCT	2	8	26227	26234	0 %	50 %	25 %	25 %	428315144
382	NC_019764	G	6	6	26235	26240	0 %	0 %	100 %	0 %	428315144
383	NC_019764	GTT	2	6	26261	26266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315144
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387	NC_019764	GCTG	2	8	26393	26400	0 %	25 %	50 %	25 %	428315144
388	NC_019764	TCT	3	9	26403	26411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315144
389	NC_019764	ACA	2	6	26422	26427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315144
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391	NC_019764	TGG	2	6	26453	26458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315144
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