MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.01

Total Repeats: 4609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019763	CTC	2	6	253	258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428320976
2	NC_019763	CTTCAG	2	12	282	293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428320976
3	NC_019763	CTGAAC	2	12	424	435	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428320976
4	NC_019763	A	7	7	460	466	100 %	0 %	0 %	0 %	428320976
5	NC_019763	ATC	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320977
6	NC_019763	GATA	2	8	674	681	50 %	25 %	25 %	0 %	428320977
7	NC_019763	TGC	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320977
8	NC_019763	CAG	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320977
9	NC_019763	TCG	2	6	878	883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320977
10	NC_019763	ACA	2	6	968	973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320977
11	NC_019763	T	6	6	1008	1013	0 %	100 %	0 %	0 %	428320977
12	NC_019763	GCA	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320977
13	NC_019763	TAA	2	6	1094	1099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320977
14	NC_019763	TACC	2	8	1104	1111	25 %	25 %	0 %	50 %	428320977
15	NC_019763	GATG	2	8	1120	1127	25 %	25 %	50 %	0 %	428320977
16	NC_019763	GTA	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320977
17	NC_019763	CAAC	2	8	1354	1361	50 %	0 %	0 %	50 %	428320977
18	NC_019763	A	6	6	1362	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
19	NC_019763	CAGA	2	8	1388	1395	50 %	0 %	25 %	25 %	428320977
20	NC_019763	CAAAA	2	10	1409	1418	80 %	0 %	0 %	20 %	428320977
21	NC_019763	A	6	6	1434	1439	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
22	NC_019763	AGA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320977
23	NC_019763	GAT	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320977
24	NC_019763	TGA	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320977
25	NC_019763	A	6	6	1622	1627	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
26	NC_019763	A	6	6	1640	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
27	NC_019763	TG	3	6	1821	1826	0 %	50 %	50 %	0 %	428320977
28	NC_019763	CAC	2	6	1951	1956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320977
29	NC_019763	GTG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320977
30	NC_019763	TAT	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320978
31	NC_019763	AAC	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320978
32	NC_019763	TGC	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320978
33	NC_019763	A	7	7	2635	2641	100 %	0 %	0 %	0 %	428320978
34	NC_019763	C	7	7	2645	2651	0 %	0 %	0 %	100 %	428320978
35	NC_019763	A	7	7	2676	2682	100 %	0 %	0 %	0 %	428320978
36	NC_019763	C	7	7	2686	2692	0 %	0 %	0 %	100 %	428320978
37	NC_019763	TAAT	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	428320978
38	NC_019763	TAA	2	6	2737	2742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320978
39	NC_019763	GCT	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320979
40	NC_019763	CTG	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320979
41	NC_019763	GAT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320979
42	NC_019763	TC	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	428320979
43	NC_019763	TGC	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320979
44	NC_019763	CGA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320979
45	NC_019763	CTAT	2	8	3273	3280	25 %	50 %	0 %	25 %	428320979
46	NC_019763	A	7	7	3281	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	428320979
47	NC_019763	A	6	6	3382	3387	100 %	0 %	0 %	0 %	428320980
48	NC_019763	GTG	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320980
49	NC_019763	GCA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320980
50	NC_019763	CCA	2	6	3589	3594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320980
51	NC_019763	A	6	6	3635	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	428320980
52	NC_019763	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320980
53	NC_019763	TTGAGG	2	12	3731	3742	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428320980
54	NC_019763	CAGA	2	8	3803	3810	50 %	0 %	25 %	25 %	428320980
55	NC_019763	GCT	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320981
56	NC_019763	CTA	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320981
57	NC_019763	AGG	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320981
58	NC_019763	GCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320981
59	NC_019763	CAT	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320981
60	NC_019763	GGA	2	6	4178	4183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320981
61	NC_019763	AATC	2	8	4215	4222	50 %	25 %	0 %	25 %	428320981
62	NC_019763	A	6	6	4228	4233	100 %	0 %	0 %	0 %	428320981
63	NC_019763	TAA	2	6	4253	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320981
64	NC_019763	ACC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320981
65	NC_019763	ATCG	2	8	4310	4317	25 %	25 %	25 %	25 %	428320981
66	NC_019763	CACT	2	8	4366	4373	25 %	25 %	0 %	50 %	428320981
67	NC_019763	TGG	2	6	4381	4386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320981
68	NC_019763	CTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320981
69	NC_019763	CGAT	2	8	4652	4659	25 %	25 %	25 %	25 %	428320982
70	NC_019763	AT	3	6	4680	4685	50 %	50 %	0 %	0 %	428320982
71	NC_019763	CTG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320982
72	NC_019763	GC	3	6	4812	4817	0 %	0 %	50 %	50 %	428320982
73	NC_019763	TGA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320982
74	NC_019763	CAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320982
75	NC_019763	CAC	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320982
76	NC_019763	AGC	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320982
77	NC_019763	TGC	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320982
78	NC_019763	GGC	2	6	5242	5247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320982
79	NC_019763	GCA	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
80	NC_019763	TTG	2	6	5584	5589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320983
81	NC_019763	TA	3	6	5600	5605	50 %	50 %	0 %	0 %	428320983
82	NC_019763	GCC	2	6	5786	5791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320983
83	NC_019763	GTTT	2	8	5831	5838	0 %	75 %	25 %	0 %	428320983
84	NC_019763	ATT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320983
85	NC_019763	ATTG	2	8	5853	5860	25 %	50 %	25 %	0 %	428320983
86	NC_019763	ACC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320983
87	NC_019763	CTT	2	6	6146	6151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320983
88	NC_019763	CGA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
89	NC_019763	TGC	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320983
90	NC_019763	GCT	2	6	6208	6213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320983
91	NC_019763	CGAT	2	8	6287	6294	25 %	25 %	25 %	25 %	428320983
92	NC_019763	CGA	2	6	6304	6309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
93	NC_019763	TGC	3	9	6332	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320983
94	NC_019763	TGT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320983
95	NC_019763	GCA	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
96	NC_019763	AG	3	6	6445	6450	50 %	0 %	50 %	0 %	428320983
97	NC_019763	TAT	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320983
98	NC_019763	TAATT	2	10	6531	6540	40 %	60 %	0 %	0 %	428320983
99	NC_019763	TGG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320983
100	NC_019763	ATT	2	6	6583	6588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320983
101	NC_019763	GCA	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
102	NC_019763	GAAA	2	8	6829	6836	75 %	0 %	25 %	0 %	428320983
103	NC_019763	GCG	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320983
104	NC_019763	ATG	2	6	6851	6856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320983
105	NC_019763	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320984
106	NC_019763	CCG	2	6	6942	6947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320984
107	NC_019763	T	6	6	6963	6968	0 %	100 %	0 %	0 %	428320984
108	NC_019763	GGA	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320984
109	NC_019763	TGA	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320984
110	NC_019763	ATCT	2	8	7104	7111	25 %	50 %	0 %	25 %	428320984
111	NC_019763	ATC	2	6	7177	7182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320984
112	NC_019763	TAA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320984
113	NC_019763	AAAT	2	8	7416	7423	75 %	25 %	0 %	0 %	428320984
114	NC_019763	GAGAT	2	10	7491	7500	40 %	20 %	40 %	0 %	428320984
115	NC_019763	CTG	2	6	7524	7529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320984
116	NC_019763	GCT	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320984
117	NC_019763	CA	3	6	7716	7721	50 %	0 %	0 %	50 %	428320984
118	NC_019763	ACA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320984
119	NC_019763	ATT	2	6	7851	7856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320984
120	NC_019763	TGC	2	6	7959	7964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320984
121	NC_019763	TTC	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320984
122	NC_019763	AGT	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320984
123	NC_019763	ATT	2	6	8062	8067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320984
124	NC_019763	AG	3	6	9945	9950	50 %	0 %	50 %	0 %	428320985
125	NC_019763	TCG	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320985
126	NC_019763	CGC	2	6	10084	10089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320985
127	NC_019763	AG	3	6	10096	10101	50 %	0 %	50 %	0 %	428320985
128	NC_019763	CAAA	2	8	10311	10318	75 %	0 %	0 %	25 %	428320985
129	NC_019763	T	6	6	10325	10330	0 %	100 %	0 %	0 %	428320985
130	NC_019763	TCC	2	6	10531	10536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428320986
131	NC_019763	CG	3	6	10548	10553	0 %	0 %	50 %	50 %	428320986
132	NC_019763	CCG	2	6	10699	10704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320986
133	NC_019763	CGA	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320986
134	NC_019763	AAT	2	6	10956	10961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320986
135	NC_019763	TTC	2	6	10971	10976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320986
136	NC_019763	CAA	2	6	10980	10985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320986
137	NC_019763	CT	3	6	11001	11006	0 %	50 %	0 %	50 %	428320986
138	NC_019763	GAG	2	6	11033	11038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320986
139	NC_019763	GTTT	2	8	11101	11108	0 %	75 %	25 %	0 %	428320987
140	NC_019763	CT	3	6	11142	11147	0 %	50 %	0 %	50 %	428320987
141	NC_019763	CCTG	2	8	11206	11213	0 %	25 %	25 %	50 %	428320987
142	NC_019763	TCG	2	6	11244	11249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320987
143	NC_019763	CTGG	2	8	11334	11341	0 %	25 %	50 %	25 %	428320987
144	NC_019763	C	6	6	11436	11441	0 %	0 %	0 %	100 %	428320987
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148	NC_019763	TTG	2	6	11547	11552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320987
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151	NC_019763	GC	3	6	11865	11870	0 %	0 %	50 %	50 %	428320988
152	NC_019763	AACA	2	8	11894	11901	75 %	0 %	0 %	25 %	428320988
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248	NC_019763	TCCA	2	8	19861	19868	25 %	25 %	0 %	50 %	428320997
249	NC_019763	ACGA	2	8	19875	19882	50 %	0 %	25 %	25 %	428320997
250	NC_019763	TCT	2	6	19890	19895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320997
251	NC_019763	GCT	2	6	19945	19950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320997
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256	NC_019763	TGGA	2	8	20181	20188	25 %	25 %	50 %	0 %	428320997
257	NC_019763	A	6	6	20319	20324	100 %	0 %	0 %	0 %	428320997
258	NC_019763	GGT	2	6	20352	20357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320997
259	NC_019763	AG	3	6	21174	21179	50 %	0 %	50 %	0 %	428320998
260	NC_019763	T	6	6	21198	21203	0 %	100 %	0 %	0 %	428320998
261	NC_019763	GCTTCT	2	12	21210	21221	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428320998
262	NC_019763	TTC	2	6	21289	21294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320998
263	NC_019763	TTC	2	6	21298	21303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320998
264	NC_019763	CGC	2	6	21373	21378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320998
265	NC_019763	TCGC	2	8	21423	21430	0 %	25 %	25 %	50 %	428320998
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267	NC_019763	TGTC	2	8	21474	21481	0 %	50 %	25 %	25 %	428320998
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271	NC_019763	CAC	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320998
272	NC_019763	TTC	2	6	21697	21702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320998
273	NC_019763	CTA	2	6	21840	21845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320998
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280	NC_019763	CTTT	2	8	22336	22343	0 %	75 %	0 %	25 %	428320999
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286	NC_019763	AG	3	6	22757	22762	50 %	0 %	50 %	0 %	428320999
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293	NC_019763	AGC	2	6	23510	23515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428321000
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296	NC_019763	CCT	2	6	23722	23727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428321000
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381	NC_019763	GAC	2	6	29752	29757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428321006
382	NC_019763	CGA	2	6	29758	29763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428321006
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384	NC_019763	GCC	2	6	30678	30683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428321007
385	NC_019763	AGA	2	6	30827	30832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428321007
386	NC_019763	T	7	7	30875	30881	0 %	100 %	0 %	0 %	428321007
387	NC_019763	A	6	6	30889	30894	100 %	0 %	0 %	0 %	428321007
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