MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.03

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019731	GA	4	8	231	238	50 %	0 %	50 %	0 %	428315020
2	NC_019731	AGTTT	2	10	247	256	20 %	60 %	20 %	0 %	428315020
3	NC_019731	A	7	7	273	279	100 %	0 %	0 %	0 %	428315020
4	NC_019731	CGC	2	6	294	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315020
5	NC_019731	TA	3	6	326	331	50 %	50 %	0 %	0 %	428315020
6	NC_019731	GTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315020
7	NC_019731	ACA	2	6	368	373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315020
8	NC_019731	AGA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315020
9	NC_019731	AGG	2	6	431	436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315020
10	NC_019731	AG	3	6	456	461	50 %	0 %	50 %	0 %	428315020
11	NC_019731	AGT	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315020
12	NC_019731	CTC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315021
13	NC_019731	AAC	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315021
14	NC_019731	CAAG	2	8	1143	1150	50 %	0 %	25 %	25 %	428315021
15	NC_019731	TTA	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315022
16	NC_019731	TTG	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315022
17	NC_019731	AG	3	6	1428	1433	50 %	0 %	50 %	0 %	428315022
18	NC_019731	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315022
19	NC_019731	GGACT	2	10	1545	1554	20 %	20 %	40 %	20 %	428315022
20	NC_019731	ACA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315022
21	NC_019731	AGA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315022
22	NC_019731	CCAAAC	2	12	1700	1711	50 %	0 %	0 %	50 %	428315022
23	NC_019731	TGA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315022
24	NC_019731	CGC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315022
25	NC_019731	TTG	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315022
26	NC_019731	CTGC	2	8	1922	1929	0 %	25 %	25 %	50 %	428315022
27	NC_019731	CCAG	2	8	1958	1965	25 %	0 %	25 %	50 %	428315022
28	NC_019731	AATC	2	8	2020	2027	50 %	25 %	0 %	25 %	428315022
29	NC_019731	GTC	2	6	2064	2069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315022
30	NC_019731	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315022
31	NC_019731	AAC	2	6	2191	2196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315022
32	NC_019731	CT	3	6	2200	2205	0 %	50 %	0 %	50 %	428315022
33	NC_019731	CCGAG	2	10	2335	2344	20 %	0 %	40 %	40 %	428315022
34	NC_019731	GAT	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315023
35	NC_019731	GAA	2	6	2638	2643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315023
36	NC_019731	ATGG	2	8	2669	2676	25 %	25 %	50 %	0 %	428315023
37	NC_019731	ACG	2	6	2699	2704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315023
38	NC_019731	ACC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315023
39	NC_019731	GAA	2	6	2791	2796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315023
40	NC_019731	AGA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315024
41	NC_019731	AGCA	2	8	2859	2866	50 %	0 %	25 %	25 %	428315024
42	NC_019731	AAG	2	6	2894	2899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315024
43	NC_019731	CTG	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315024
44	NC_019731	A	6	6	3037	3042	100 %	0 %	0 %	0 %	428315024
45	NC_019731	GGC	2	6	3256	3261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315024
46	NC_019731	CAA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315024
47	NC_019731	T	6	6	3283	3288	0 %	100 %	0 %	0 %	428315024
48	NC_019731	GTT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315025
49	NC_019731	AAT	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315025
50	NC_019731	CA	3	6	3774	3779	50 %	0 %	0 %	50 %	428315025
51	NC_019731	ACG	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315025
52	NC_019731	ACT	2	6	3896	3901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315025
53	NC_019731	CTG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315025
54	NC_019731	A	6	6	4051	4056	100 %	0 %	0 %	0 %	428315025
55	NC_019731	CGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315025
56	NC_019731	GTG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315025
57	NC_019731	GAT	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315025
58	NC_019731	ATG	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315025
59	NC_019731	AAAC	2	8	4536	4543	75 %	0 %	0 %	25 %	428315025
60	NC_019731	CAG	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315025
61	NC_019731	TGC	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315025
62	NC_019731	ACC	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315025
63	NC_019731	TCA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315025
64	NC_019731	TAGCGG	2	12	4932	4943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428315025
65	NC_019731	TGC	2	6	4955	4960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315025
66	NC_019731	ACTT	2	8	4973	4980	25 %	50 %	0 %	25 %	428315025
67	NC_019731	GAA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315025
68	NC_019731	ATT	2	6	5046	5051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315025
69	NC_019731	TGG	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315025
70	NC_019731	GGC	2	6	5134	5139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315025
71	NC_019731	A	8	8	5177	5184	100 %	0 %	0 %	0 %	428315025
72	NC_019731	CAAC	2	8	5405	5412	50 %	0 %	0 %	50 %	428315025
73	NC_019731	TC	3	6	5559	5564	0 %	50 %	0 %	50 %	428315025
74	NC_019731	ACA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315025
75	NC_019731	CAC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315025
76	NC_019731	TTG	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315025
77	NC_019731	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315025
78	NC_019731	GCA	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315025
79	NC_019731	ACA	2	6	5923	5928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315025
80	NC_019731	TCA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315025
81	NC_019731	GAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315025
82	NC_019731	TAA	2	6	6030	6035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315025
83	NC_019731	AAC	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315025
84	NC_019731	GGA	2	6	6177	6182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315025
85	NC_019731	GCC	2	6	6216	6221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315025
86	NC_019731	GCGA	2	8	6251	6258	25 %	0 %	50 %	25 %	428315025
87	NC_019731	AT	3	6	6294	6299	50 %	50 %	0 %	0 %	428315025
88	NC_019731	CGAC	2	8	6437	6444	25 %	0 %	25 %	50 %	428315025
89	NC_019731	A	6	6	6532	6537	100 %	0 %	0 %	0 %	428315025
90	NC_019731	A	7	7	6576	6582	100 %	0 %	0 %	0 %	428315025
91	NC_019731	GTGA	2	8	6601	6608	25 %	25 %	50 %	0 %	428315025
92	NC_019731	CTA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315025
93	NC_019731	CTCAGC	2	12	6647	6658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428315025
94	NC_019731	ACA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315025
95	NC_019731	GACGCC	2	12	6789	6800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428315025
96	NC_019731	CAG	2	6	6866	6871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315025
97	NC_019731	TGC	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315025
98	NC_019731	GGA	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315026
99	NC_019731	TGG	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315026
100	NC_019731	GCT	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315026
101	NC_019731	GCGA	2	8	7378	7385	25 %	0 %	50 %	25 %	428315026
102	NC_019731	AAT	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315026
103	NC_019731	G	8	8	7455	7462	0 %	0 %	100 %	0 %	428315026
104	NC_019731	AGCA	2	8	7475	7482	50 %	0 %	25 %	25 %	428315026
105	NC_019731	TGAGT	2	10	7511	7520	20 %	40 %	40 %	0 %	428315026
106	NC_019731	GCA	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315026
107	NC_019731	AATTC	2	10	7579	7588	40 %	40 %	0 %	20 %	428315026
108	NC_019731	ACGA	2	8	8045	8052	50 %	0 %	25 %	25 %	428315027
109	NC_019731	CAT	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315027
110	NC_019731	CAG	2	6	8074	8079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315027
111	NC_019731	GCT	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315027
112	NC_019731	AGG	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315027
113	NC_019731	TCC	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315027
114	NC_019731	CGT	2	6	8162	8167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315027
115	NC_019731	GGC	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315027
116	NC_019731	GCTC	2	8	8215	8222	0 %	25 %	25 %	50 %	428315027
117	NC_019731	C	7	7	8399	8405	0 %	0 %	0 %	100 %	428315027
118	NC_019731	GAG	2	6	8452	8457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315027
119	NC_019731	GAG	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315027
120	NC_019731	ACA	2	6	8507	8512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315027
121	NC_019731	ATT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315027
122	NC_019731	A	6	6	8586	8591	100 %	0 %	0 %	0 %	428315028
123	NC_019731	T	6	6	8599	8604	0 %	100 %	0 %	0 %	428315028
124	NC_019731	T	6	6	8609	8614	0 %	100 %	0 %	0 %	428315028
125	NC_019731	T	7	7	8634	8640	0 %	100 %	0 %	0 %	428315028
126	NC_019731	TC	3	6	9790	9795	0 %	50 %	0 %	50 %	428315029
127	NC_019731	TGC	2	6	9831	9836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315029
128	NC_019731	TAT	2	6	9865	9870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315029
129	NC_019731	AAGC	2	8	9892	9899	50 %	0 %	25 %	25 %	428315029
130	NC_019731	CCAG	2	8	9945	9952	25 %	0 %	25 %	50 %	428315029
131	NC_019731	CTG	2	6	9986	9991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315029
132	NC_019731	AAGC	2	8	10002	10009	50 %	0 %	25 %	25 %	428315029
133	NC_019731	GGCA	2	8	10067	10074	25 %	0 %	50 %	25 %	428315029
134	NC_019731	TTGA	2	8	10144	10151	25 %	50 %	25 %	0 %	428315029
135	NC_019731	TCG	2	6	10214	10219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315029
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262	NC_019731	TGA	2	6	18947	18952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315032
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264	NC_019731	TTC	2	6	18991	18996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315032
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267	NC_019731	GGA	2	6	19184	19189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315032
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389	NC_019731	GAT	2	6	28509	28514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315037
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497	NC_019731	CGC	2	6	36903	36908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315040
498	NC_019731	CTAA	2	8	36922	36929	50 %	25 %	0 %	25 %	428315040
499	NC_019731	GCT	2	6	37048	37053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315040
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