MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112

Total Repeats: 111966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019729	AAC	2	6	158	163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315183
2	NC_019729	GAAAC	2	10	305	314	60 %	0 %	20 %	20 %	428315183
3	NC_019729	GCA	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315183
4	NC_019729	CGC	2	6	357	362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315183
5	NC_019729	C	7	7	390	396	0 %	0 %	0 %	100 %	428315183
6	NC_019729	GTC	2	6	439	444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315183
7	NC_019729	CAA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315183
8	NC_019729	CCTC	2	8	473	480	0 %	25 %	0 %	75 %	428315183
9	NC_019729	T	6	6	608	613	0 %	100 %	0 %	0 %	428315183
10	NC_019729	CGC	2	6	648	653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315183
11	NC_019729	TTA	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315183
12	NC_019729	AAG	2	6	755	760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315183
13	NC_019729	T	6	6	763	768	0 %	100 %	0 %	0 %	428315183
14	NC_019729	AGT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315183
15	NC_019729	A	6	6	937	942	100 %	0 %	0 %	0 %	428315183
16	NC_019729	GAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315183
17	NC_019729	CCG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315183
18	NC_019729	GCA	2	6	1254	1259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315183
19	NC_019729	CGG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315183
20	NC_019729	TGT	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315183
21	NC_019729	TCCC	2	8	2202	2209	0 %	25 %	0 %	75 %	428315184
22	NC_019729	TAG	2	6	2243	2248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315184
23	NC_019729	GCA	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315184
24	NC_019729	GGC	3	9	2332	2340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315184
25	NC_019729	GA	3	6	2396	2401	50 %	0 %	50 %	0 %	428315184
26	NC_019729	AGA	2	6	2409	2414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315184
27	NC_019729	GAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315184
28	NC_019729	GCC	2	6	2535	2540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315184
29	NC_019729	CTA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315184
30	NC_019729	CGA	2	6	2589	2594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315184
31	NC_019729	AGT	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315184
32	NC_019729	GAA	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315184
33	NC_019729	AAG	2	6	2723	2728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315184
34	NC_019729	AGAA	2	8	2769	2776	75 %	0 %	25 %	0 %	428315184
35	NC_019729	AGT	2	6	2832	2837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315184
36	NC_019729	ACC	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315184
37	NC_019729	CCT	2	6	2915	2920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315184
38	NC_019729	AGAA	2	8	2967	2974	75 %	0 %	25 %	0 %	428315184
39	NC_019729	A	7	7	2993	2999	100 %	0 %	0 %	0 %	428315184
40	NC_019729	GCA	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315184
41	NC_019729	CGA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315184
42	NC_019729	CAA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315185
43	NC_019729	GTG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315185
44	NC_019729	CCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315185
45	NC_019729	T	7	7	3720	3726	0 %	100 %	0 %	0 %	428315185
46	NC_019729	GCT	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315185
47	NC_019729	TGGC	2	8	3756	3763	0 %	25 %	50 %	25 %	428315185
48	NC_019729	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315185
49	NC_019729	GCGGG	2	10	3797	3806	0 %	0 %	80 %	20 %	428315185
50	NC_019729	AATT	2	8	3833	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	428315185
51	NC_019729	TGA	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315185
52	NC_019729	ACT	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315185
53	NC_019729	AGC	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315185
54	NC_019729	T	6	6	4235	4240	0 %	100 %	0 %	0 %	428315185
55	NC_019729	T	6	6	4252	4257	0 %	100 %	0 %	0 %	428315185
56	NC_019729	TCAC	2	8	4263	4270	25 %	25 %	0 %	50 %	428315185
57	NC_019729	ATG	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315185
58	NC_019729	AGT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315185
59	NC_019729	TGC	2	6	4440	4445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315185
60	NC_019729	TTG	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315185
61	NC_019729	CTA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315185
62	NC_019729	AAT	2	6	4677	4682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315185
63	NC_019729	CCG	2	6	4721	4726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315185
64	NC_019729	TTG	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315185
65	NC_019729	AGG	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315185
66	NC_019729	TAG	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315186
67	NC_019729	CTG	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315186
68	NC_019729	TGC	2	6	6192	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315186
69	NC_019729	GCT	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315186
70	NC_019729	TTGC	2	8	6371	6378	0 %	50 %	25 %	25 %	428315186
71	NC_019729	CCA	2	6	6384	6389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315186
72	NC_019729	GGT	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315186
73	NC_019729	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315186
74	NC_019729	GCT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315186
75	NC_019729	G	8	8	6649	6656	0 %	0 %	100 %	0 %	428315186
76	NC_019729	GAC	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315186
77	NC_019729	A	6	6	6717	6722	100 %	0 %	0 %	0 %	428315186
78	NC_019729	GAG	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315186
79	NC_019729	CAT	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315186
80	NC_019729	TGC	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315186
81	NC_019729	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	428315186
82	NC_019729	GAT	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315186
83	NC_019729	TAA	2	6	7163	7168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315186
84	NC_019729	A	6	6	7304	7309	100 %	0 %	0 %	0 %	428315187
85	NC_019729	A	7	7	7318	7324	100 %	0 %	0 %	0 %	428315187
86	NC_019729	CTGG	2	8	7332	7339	0 %	25 %	50 %	25 %	428315187
87	NC_019729	CTT	2	6	7372	7377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315187
88	NC_019729	AGG	2	6	7443	7448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315187
89	NC_019729	CAC	2	6	7506	7511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315187
90	NC_019729	CT	3	6	7542	7547	0 %	50 %	0 %	50 %	428315187
91	NC_019729	C	6	6	7582	7587	0 %	0 %	0 %	100 %	428315187
92	NC_019729	GCA	2	6	7595	7600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315187
93	NC_019729	AAC	2	6	7635	7640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315187
94	NC_019729	CCAG	2	8	7655	7662	25 %	0 %	25 %	50 %	428315187
95	NC_019729	TAC	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315187
96	NC_019729	TCG	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315187
97	NC_019729	ATAC	2	8	7799	7806	50 %	25 %	0 %	25 %	428315187
98	NC_019729	AT	3	6	7866	7871	50 %	50 %	0 %	0 %	428315187
99	NC_019729	CTG	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315187
100	NC_019729	CAC	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315187
101	NC_019729	AGA	2	6	8010	8015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315187
102	NC_019729	CCT	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315187
103	NC_019729	CAAA	2	8	8058	8065	75 %	0 %	0 %	25 %	428315187
104	NC_019729	A	6	6	8076	8081	100 %	0 %	0 %	0 %	428315187
105	NC_019729	ATT	2	6	8090	8095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315187
106	NC_019729	A	9	9	8289	8297	100 %	0 %	0 %	0 %	428315188
107	NC_019729	GCA	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315188
108	NC_019729	TAT	2	6	8477	8482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315188
109	NC_019729	G	6	6	8494	8499	0 %	0 %	100 %	0 %	428315188
110	NC_019729	AGG	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315188
111	NC_019729	CCACTG	2	12	8671	8682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428315188
112	NC_019729	GAA	2	6	8708	8713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315188
113	NC_019729	AGT	2	6	8714	8719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315188
114	NC_019729	CTA	2	6	8749	8754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315188
115	NC_019729	TGA	2	6	8758	8763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315188
116	NC_019729	GCA	2	6	8785	8790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315188
117	NC_019729	GGC	2	6	8808	8813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315188
118	NC_019729	GTA	2	6	8835	8840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315188
119	NC_019729	T	6	6	8849	8854	0 %	100 %	0 %	0 %	428315188
120	NC_019729	AGC	2	6	8894	8899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315188
121	NC_019729	CTTTA	2	10	8993	9002	20 %	60 %	0 %	20 %	428315188
122	NC_019729	TCA	2	6	9058	9063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315188
123	NC_019729	GAG	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315188
124	NC_019729	GC	3	6	9131	9136	0 %	0 %	50 %	50 %	428315188
125	NC_019729	AAC	2	6	9147	9152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315188
126	NC_019729	GCG	2	6	9246	9251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315188
127	NC_019729	GAT	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315188
128	NC_019729	CAC	2	6	9293	9298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315188
129	NC_019729	ATG	2	6	9309	9314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315188
130	NC_019729	GGT	2	6	9315	9320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315188
131	NC_019729	CTG	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315188
132	NC_019729	CCTA	2	8	9462	9469	25 %	25 %	0 %	50 %	428315188
133	NC_019729	AAG	2	6	9496	9501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315188
134	NC_019729	TTTGG	2	10	9585	9594	0 %	60 %	40 %	0 %	428315188
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265	NC_019729	AAT	2	6	20383	20388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315195
266	NC_019729	A	8	8	20391	20398	100 %	0 %	0 %	0 %	428315195
267	NC_019729	AAAT	2	8	20403	20410	75 %	25 %	0 %	0 %	428315195
268	NC_019729	CAC	2	6	20429	20434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315195
269	NC_019729	AATA	2	8	20441	20448	75 %	25 %	0 %	0 %	428315195
270	NC_019729	AAC	2	6	20461	20466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315195
271	NC_019729	AATT	2	8	20493	20500	50 %	50 %	0 %	0 %	428315195
272	NC_019729	AG	3	6	20548	20553	50 %	0 %	50 %	0 %	428315195
273	NC_019729	GA	3	6	20651	20656	50 %	0 %	50 %	0 %	428315195
274	NC_019729	TGA	2	6	20854	20859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315196
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276	NC_019729	CGGTG	2	10	20899	20908	0 %	20 %	60 %	20 %	428315196
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278	NC_019729	AAG	2	6	21173	21178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315196
279	NC_019729	TAT	2	6	21248	21253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315196
280	NC_019729	TGA	2	6	21298	21303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315196
281	NC_019729	GCT	2	6	21410	21415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315196
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283	NC_019729	ACC	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315196
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286	NC_019729	CTGA	2	8	21665	21672	25 %	25 %	25 %	25 %	428315196
287	NC_019729	TCAGC	2	10	21711	21720	20 %	20 %	20 %	40 %	428315196
288	NC_019729	CTTA	2	8	22065	22072	25 %	50 %	0 %	25 %	428315196
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293	NC_019729	GAAT	2	8	22791	22798	50 %	25 %	25 %	0 %	428315197
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298	NC_019729	A	6	6	23107	23112	100 %	0 %	0 %	0 %	428315198
299	NC_019729	CTGA	2	8	23161	23168	25 %	25 %	25 %	25 %	428315198
300	NC_019729	TAAT	2	8	23240	23247	50 %	50 %	0 %	0 %	428315198
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372	NC_019729	GCTG	2	8	28901	28908	0 %	25 %	50 %	25 %	428315202
373	NC_019729	GA	3	6	28955	28960	50 %	0 %	50 %	0 %	428315202
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385	NC_019729	CG	3	6	29957	29962	0 %	0 %	50 %	50 %	428315204
386	NC_019729	ACC	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315204
387	NC_019729	T	6	6	30037	30042	0 %	100 %	0 %	0 %	428315204
388	NC_019729	TGC	2	6	30187	30192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315204
389	NC_019729	AAT	2	6	30208	30213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315204
390	NC_019729	TCC	2	6	30232	30237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315204
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392	NC_019729	GTC	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315204
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