MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oscillatoria acuminata PCC 6304 chromosome

Total Repeats: 109436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019693	TC	3	6	206	211	0 %	50 %	0 %	50 %	428210538
2	NC_019693	AAC	2	6	311	316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428210538
3	NC_019693	TGAT	2	8	324	331	25 %	50 %	25 %	0 %	428210538
4	NC_019693	GTC	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210538
5	NC_019693	CAC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210538
6	NC_019693	TCA	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210538
7	NC_019693	TCC	2	6	541	546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210538
8	NC_019693	TGG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428210538
9	NC_019693	AAC	2	6	593	598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428210538
10	NC_019693	TGC	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210538
11	NC_019693	GTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428210538
12	NC_019693	TC	3	6	732	737	0 %	50 %	0 %	50 %	428210538
13	NC_019693	TGC	2	6	790	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210538
14	NC_019693	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210538
15	NC_019693	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210538
16	NC_019693	T	7	7	905	911	0 %	100 %	0 %	0 %	428210538
17	NC_019693	C	7	7	967	973	0 %	0 %	0 %	100 %	428210538
18	NC_019693	A	8	8	1077	1084	100 %	0 %	0 %	0 %	428210538
19	NC_019693	AT	3	6	1126	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	428210538
20	NC_019693	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210538
21	NC_019693	GAG	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210538
22	NC_019693	GC	3	6	1367	1372	0 %	0 %	50 %	50 %	428210538
23	NC_019693	GAG	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210538
24	NC_019693	ACG	2	6	1454	1459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210538
25	NC_019693	A	6	6	1476	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	428210538
26	NC_019693	GCG	2	6	1484	1489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428210538
27	NC_019693	ATG	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210538
28	NC_019693	ATTT	2	8	1949	1956	25 %	75 %	0 %	0 %	428210539
29	NC_019693	CCA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210539
30	NC_019693	CTC	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210539
31	NC_019693	CAG	2	6	2064	2069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210539
32	NC_019693	GCC	2	6	2121	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210539
33	NC_019693	ACCCTC	2	12	2145	2156	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428210539
34	NC_019693	CAT	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210539
35	NC_019693	CGA	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210539
36	NC_019693	CTG	3	9	2245	2253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210539
37	NC_019693	CCA	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210539
38	NC_019693	CACCTC	2	12	2276	2287	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428210539
39	NC_019693	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210539
40	NC_019693	CTGC	2	8	2367	2374	0 %	25 %	25 %	50 %	428210539
41	NC_019693	CCG	2	6	2419	2424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210539
42	NC_019693	CAAG	2	8	2432	2439	50 %	0 %	25 %	25 %	428210539
43	NC_019693	GCC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210539
44	NC_019693	AGA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210539
45	NC_019693	CGA	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210539
46	NC_019693	TGA	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210539
47	NC_019693	GGA	2	6	2700	2705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210539
48	NC_019693	ATA	2	6	2851	2856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428210539
49	NC_019693	CT	6	12	2892	2903	0 %	50 %	0 %	50 %	428210539
50	NC_019693	GA	3	6	2959	2964	50 %	0 %	50 %	0 %	428210539
51	NC_019693	GGT	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428210539
52	NC_019693	CGC	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210539
53	NC_019693	GAG	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210540
54	NC_019693	CCA	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210540
55	NC_019693	ATC	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210540
56	NC_019693	CTG	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210540
57	NC_019693	ATC	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210540
58	NC_019693	GC	3	6	4178	4183	0 %	0 %	50 %	50 %	428210540
59	NC_019693	TGA	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210540
60	NC_019693	GCA	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210540
61	NC_019693	TTTA	2	8	4438	4445	25 %	75 %	0 %	0 %	428210540
62	NC_019693	GAA	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210540
63	NC_019693	A	6	6	4606	4611	100 %	0 %	0 %	0 %	428210540
64	NC_019693	GGC	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428210540
65	NC_019693	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428210540
66	NC_019693	GAT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210540
67	NC_019693	CGGA	2	8	4904	4911	25 %	0 %	50 %	25 %	428210540
68	NC_019693	CCT	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210540
69	NC_019693	GGAT	2	8	4948	4955	25 %	25 %	50 %	0 %	428210540
70	NC_019693	TTA	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210540
71	NC_019693	AGA	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210540
72	NC_019693	GAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210540
73	NC_019693	CAT	3	9	5400	5408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210541
74	NC_019693	AGG	2	6	5431	5436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210541
75	NC_019693	GGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210541
76	NC_019693	TGA	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210541
77	NC_019693	G	6	6	5498	5503	0 %	0 %	100 %	0 %	428210541
78	NC_019693	GAT	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210541
79	NC_019693	TCA	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210541
80	NC_019693	AG	3	6	5639	5644	50 %	0 %	50 %	0 %	428210541
81	NC_019693	TCA	2	6	5678	5683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210541
82	NC_019693	CTG	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210542
83	NC_019693	TCA	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210542
84	NC_019693	TCG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210543
85	NC_019693	T	6	6	6339	6344	0 %	100 %	0 %	0 %	428210543
86	NC_019693	GCA	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210543
87	NC_019693	GGC	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428210543
88	NC_019693	G	6	6	6432	6437	0 %	0 %	100 %	0 %	428210543
89	NC_019693	CAC	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210543
90	NC_019693	GAT	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210543
91	NC_019693	AGT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210543
92	NC_019693	CGA	2	6	6569	6574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210543
93	NC_019693	TAT	2	6	6654	6659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210543
94	NC_019693	CGT	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210543
95	NC_019693	C	7	7	6755	6761	0 %	0 %	0 %	100 %	428210543
96	NC_019693	TCCT	2	8	6767	6774	0 %	50 %	0 %	50 %	428210543
97	NC_019693	ACG	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210543
98	NC_019693	AGA	2	6	6858	6863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210543
99	NC_019693	CTC	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210543
100	NC_019693	GAA	3	9	6930	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210543
101	NC_019693	AGA	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428210543
102	NC_019693	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210543
103	NC_019693	CCGT	2	8	7123	7130	0 %	25 %	25 %	50 %	428210544
104	NC_019693	C	7	7	7137	7143	0 %	0 %	0 %	100 %	428210544
105	NC_019693	A	6	6	7200	7205	100 %	0 %	0 %	0 %	428210544
106	NC_019693	CCT	2	6	7206	7211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210544
107	NC_019693	CCA	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210544
108	NC_019693	CGA	2	6	7320	7325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210544
109	NC_019693	CAA	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428210544
110	NC_019693	TGAT	2	8	7709	7716	25 %	50 %	25 %	0 %	428210544
111	NC_019693	CAC	2	6	8057	8062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210545
112	NC_019693	TGA	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210545
113	NC_019693	GAC	2	6	8182	8187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210545
114	NC_019693	CGC	2	6	8217	8222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210545
115	NC_019693	TCG	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210545
116	NC_019693	TCA	2	6	8410	8415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210545
117	NC_019693	G	7	7	8814	8820	0 %	0 %	100 %	0 %	428210546
118	NC_019693	TTC	2	6	8874	8879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210546
119	NC_019693	A	7	7	8940	8946	100 %	0 %	0 %	0 %	428210546
120	NC_019693	TCT	2	6	9056	9061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210546
121	NC_019693	TCT	2	6	9108	9113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210546
122	NC_019693	T	6	6	9122	9127	0 %	100 %	0 %	0 %	428210546
123	NC_019693	GGA	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428210546
124	NC_019693	CTTT	2	8	9189	9196	0 %	75 %	0 %	25 %	428210546
125	NC_019693	T	6	6	9331	9336	0 %	100 %	0 %	0 %	428210546
126	NC_019693	ACTG	2	8	9362	9369	25 %	25 %	25 %	25 %	428210546
127	NC_019693	GGAC	2	8	9420	9427	25 %	0 %	50 %	25 %	428210546
128	NC_019693	T	6	6	9466	9471	0 %	100 %	0 %	0 %	428210546
129	NC_019693	ATT	2	6	9473	9478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210546
130	NC_019693	TAA	2	6	9521	9526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428210546
131	NC_019693	GCC	2	6	9563	9568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210546
132	NC_019693	AT	3	6	9609	9614	50 %	50 %	0 %	0 %	428210546
133	NC_019693	GTT	2	6	9619	9624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428210546
134	NC_019693	T	6	6	9623	9628	0 %	100 %	0 %	0 %	428210546
135	NC_019693	TC	3	6	9636	9641	0 %	50 %	0 %	50 %	428210546
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137	NC_019693	T	6	6	9719	9724	0 %	100 %	0 %	0 %	428210546
138	NC_019693	TA	3	6	9748	9753	50 %	50 %	0 %	0 %	428210546
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262	NC_019693	G	6	6	17558	17563	0 %	0 %	100 %	0 %	428210551
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264	NC_019693	CCAA	2	8	17601	17608	50 %	0 %	0 %	50 %	428210551
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394	NC_019693	TGC	2	6	27288	27293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210558
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470	NC_019693	ATA	2	6	32901	32906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428210562
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498	NC_019693	A	6	6	35180	35185	100 %	0 %	0 %	0 %	428210564
499	NC_019693	CAA	2	6	35258	35263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428210564
500	NC_019693	GCT	3	9	35303	35311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210564

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