MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oceanimonas sp. GK1 plasmid pOCEGK01

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016746	ATT	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374337030
2	NC_016746	CCA	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374337030
3	NC_016746	AC	3	6	1487	1492	50 %	0 %	0 %	50 %	374337030
4	NC_016746	GGT	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337030
5	NC_016746	GCCG	2	8	2424	2431	0 %	0 %	50 %	50 %	374337031
6	NC_016746	GCCA	2	8	2451	2458	25 %	0 %	25 %	50 %	374337031
7	NC_016746	A	6	6	2458	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	374337031
8	NC_016746	CAG	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337031
9	NC_016746	TGC	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337031
10	NC_016746	TGC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337031
11	NC_016746	GCC	2	6	2898	2903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337031
12	NC_016746	A	6	6	2916	2921	100 %	0 %	0 %	0 %	374337031
13	NC_016746	AGG	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374337031
14	NC_016746	AACG	2	8	2982	2989	50 %	0 %	25 %	25 %	374337031
15	NC_016746	TTG	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374337031
16	NC_016746	C	6	6	3047	3052	0 %	0 %	0 %	100 %	374337031
17	NC_016746	CTG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337031
18	NC_016746	G	6	6	3303	3308	0 %	0 %	100 %	0 %	374337031
19	NC_016746	CGC	2	6	4165	4170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337032
20	NC_016746	T	6	6	4231	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	374337032
21	NC_016746	CCA	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374337032
22	NC_016746	CCCT	3	12	4263	4274	0 %	25 %	0 %	75 %	374337032
23	NC_016746	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337032
24	NC_016746	CGG	2	6	4425	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337032
25	NC_016746	GCG	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337032
26	NC_016746	ACCTGC	2	12	4616	4627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374337032
27	NC_016746	GCC	2	6	4660	4665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337032
28	NC_016746	GCG	2	6	4712	4717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337032
29	NC_016746	TCG	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337032
30	NC_016746	ATTC	2	8	5283	5290	25 %	50 %	0 %	25 %	374337033
31	NC_016746	ATC	2	6	5319	5324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337033
32	NC_016746	ACCA	2	8	5420	5427	50 %	0 %	0 %	50 %	374337033
33	NC_016746	GCA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337033
34	NC_016746	CCTA	2	8	5474	5481	25 %	25 %	0 %	50 %	374337033
35	NC_016746	GTC	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337033
36	NC_016746	TAG	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337033
37	NC_016746	GCACA	2	10	5636	5645	40 %	0 %	20 %	40 %	374337033
38	NC_016746	CCAG	2	8	5692	5699	25 %	0 %	25 %	50 %	374337033
39	NC_016746	GTG	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337033
40	NC_016746	CGT	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337034
41	NC_016746	ATG	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337034
42	NC_016746	GCT	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337034
43	NC_016746	TCAA	2	8	5984	5991	50 %	25 %	0 %	25 %	374337034
44	NC_016746	TCA	3	9	5999	6007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337034
45	NC_016746	ATC	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337035
46	NC_016746	CTG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337035
47	NC_016746	ACA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374337035
48	NC_016746	GCC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
49	NC_016746	TGC	3	9	6357	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337035
50	NC_016746	GTA	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337035
51	NC_016746	GCC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
52	NC_016746	GCTC	2	8	6536	6543	0 %	25 %	25 %	50 %	374337035
53	NC_016746	CAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337035
54	NC_016746	GCC	2	6	6554	6559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
55	NC_016746	GCC	3	9	6605	6613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
56	NC_016746	GGT	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337035
57	NC_016746	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374337035
58	NC_016746	GCT	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337035
59	NC_016746	GCC	2	6	7045	7050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337036
60	NC_016746	CGA	2	6	7068	7073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337036
61	NC_016746	GA	3	6	7077	7082	50 %	0 %	50 %	0 %	374337036
62	NC_016746	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337037
63	NC_016746	TCT	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374337037
64	NC_016746	GGT	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337037
65	NC_016746	CAGA	2	8	7371	7378	50 %	0 %	25 %	25 %	374337037
66	NC_016746	GCA	2	6	7384	7389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337037
67	NC_016746	TCGTA	2	10	7409	7418	20 %	40 %	20 %	20 %	374337038
68	NC_016746	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337038
69	NC_016746	TCG	2	6	7485	7490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337038
70	NC_016746	C	6	6	7502	7507	0 %	0 %	0 %	100 %	374337038
71	NC_016746	GCCT	2	8	7563	7570	0 %	25 %	25 %	50 %	374337038
72	NC_016746	GGCTG	2	10	7668	7677	0 %	20 %	60 %	20 %	374337038
73	NC_016746	GCC	2	6	7702	7707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337038
74	NC_016746	GGCA	2	8	7755	7762	25 %	0 %	50 %	25 %	374337038
75	NC_016746	AG	3	6	7902	7907	50 %	0 %	50 %	0 %	374337038
76	NC_016746	A	6	6	8074	8079	100 %	0 %	0 %	0 %	374337038
77	NC_016746	TGCT	2	8	8105	8112	0 %	50 %	25 %	25 %	374337038
78	NC_016746	AAC	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374337038

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.