MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Oligotropha carboxidovorans OM5 plasmid pHCG3

Total Repeats: 2639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015689	GC	3	6	196	201	0 %	0 %	50 %	50 %	337739123
2	NC_015689	CTG	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739123
3	NC_015689	AAC	2	6	341	346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337739123
4	NC_015689	AAGCG	2	10	409	418	40 %	0 %	40 %	20 %	337739123
5	NC_015689	CGG	2	6	437	442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739123
6	NC_015689	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739123
7	NC_015689	GT	3	6	549	554	0 %	50 %	50 %	0 %	337739123
8	NC_015689	GT	3	6	801	806	0 %	50 %	50 %	0 %	337739123
9	NC_015689	ATG	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739123
10	NC_015689	CGC	2	6	873	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739123
11	NC_015689	CGC	2	6	913	918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739123
12	NC_015689	ATC	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739123
13	NC_015689	ATG	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739123
14	NC_015689	TCC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337739123
15	NC_015689	CGATC	2	10	1069	1078	20 %	20 %	20 %	40 %	337739123
16	NC_015689	GCAAA	2	10	1184	1193	60 %	0 %	20 %	20 %	337739123
17	NC_015689	CGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739123
18	NC_015689	GC	5	10	1240	1249	0 %	0 %	50 %	50 %	337739123
19	NC_015689	CGC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739123
20	NC_015689	CGT	2	6	1379	1384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739124
21	NC_015689	CTC	3	9	1403	1411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337739124
22	NC_015689	GTT	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337739124
23	NC_015689	CAG	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739124
24	NC_015689	TTGC	2	8	1498	1505	0 %	50 %	25 %	25 %	337739124
25	NC_015689	GGC	2	6	1516	1521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739124
26	NC_015689	GAC	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739124
27	NC_015689	GAC	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739124
28	NC_015689	GGA	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739124
29	NC_015689	TCGA	2	8	1666	1673	25 %	25 %	25 %	25 %	337739124
30	NC_015689	GCGG	2	8	1710	1717	0 %	0 %	75 %	25 %	337739124
31	NC_015689	CCGG	2	8	1731	1738	0 %	0 %	50 %	50 %	337739124
32	NC_015689	GATG	2	8	1851	1858	25 %	25 %	50 %	0 %	337739124
33	NC_015689	CG	3	6	1874	1879	0 %	0 %	50 %	50 %	337739124
34	NC_015689	GCGG	2	8	1926	1933	0 %	0 %	75 %	25 %	337739124
35	NC_015689	CG	3	6	1939	1944	0 %	0 %	50 %	50 %	337739124
36	NC_015689	TCA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739124
37	NC_015689	GGC	2	6	1991	1996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739124
38	NC_015689	AAGGC	2	10	2036	2045	40 %	0 %	40 %	20 %	337739124
39	NC_015689	GGC	3	9	2043	2051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739124
40	NC_015689	TCC	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337739124
41	NC_015689	CGA	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739124
42	NC_015689	GGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739124
43	NC_015689	GGC	2	6	2178	2183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739124
44	NC_015689	TCG	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739124
45	NC_015689	CG	3	6	2249	2254	0 %	0 %	50 %	50 %	337739124
46	NC_015689	AGT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739125
47	NC_015689	GCC	2	6	2872	2877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739125
48	NC_015689	GATC	2	8	2889	2896	25 %	25 %	25 %	25 %	337739125
49	NC_015689	CCG	2	6	2944	2949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739125
50	NC_015689	GCG	2	6	3075	3080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739125
51	NC_015689	GCC	2	6	3083	3088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739125
52	NC_015689	TCA	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739125
53	NC_015689	GAG	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739125
54	NC_015689	GAT	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739125
55	NC_015689	GAG	2	6	3391	3396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739125
56	NC_015689	ACTA	2	8	3468	3475	50 %	25 %	0 %	25 %	337739125
57	NC_015689	CG	3	6	3528	3533	0 %	0 %	50 %	50 %	337739125
58	NC_015689	A	7	7	3572	3578	100 %	0 %	0 %	0 %	337739125
59	NC_015689	GCG	2	6	3619	3624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739125
60	NC_015689	ACG	3	9	3635	3643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739125
61	NC_015689	GAT	2	6	3648	3653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739125
62	NC_015689	GCC	2	6	3760	3765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739125
63	NC_015689	AGG	2	6	3788	3793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739125
64	NC_015689	CGC	2	6	3819	3824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739125
65	NC_015689	CGCT	2	8	3937	3944	0 %	25 %	25 %	50 %	337739125
66	NC_015689	CCG	2	6	3970	3975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739125
67	NC_015689	CGG	2	6	4123	4128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739125
68	NC_015689	GA	3	6	4134	4139	50 %	0 %	50 %	0 %	337739125
69	NC_015689	TGACC	2	10	4149	4158	20 %	20 %	20 %	40 %	337739125
70	NC_015689	GGA	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739125
71	NC_015689	CGG	2	6	4232	4237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
72	NC_015689	GCT	2	6	4313	4318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739126
73	NC_015689	TCG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739126
74	NC_015689	CGG	2	6	4343	4348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
75	NC_015689	AGG	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739126
76	NC_015689	GC	3	6	4363	4368	0 %	0 %	50 %	50 %	337739126
77	NC_015689	CGG	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
78	NC_015689	GGC	2	6	4437	4442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
79	NC_015689	GGCG	2	8	4454	4461	0 %	0 %	75 %	25 %	337739126
80	NC_015689	CGG	2	6	4516	4521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
81	NC_015689	CGA	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739126
82	NC_015689	CGA	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739126
83	NC_015689	GCG	2	6	4734	4739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
84	NC_015689	CCG	2	6	4744	4749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739126
85	NC_015689	CAG	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739126
86	NC_015689	CTTC	2	8	4847	4854	0 %	50 %	0 %	50 %	337739126
87	NC_015689	CGG	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
88	NC_015689	GCG	2	6	4878	4883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
89	NC_015689	GCC	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739126
90	NC_015689	TCG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739126
91	NC_015689	CGGCC	2	10	5004	5013	0 %	0 %	40 %	60 %	337739126
92	NC_015689	G	6	6	5062	5067	0 %	0 %	100 %	0 %	337739126
93	NC_015689	GCC	2	6	5084	5089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739126
94	NC_015689	GCC	2	6	5108	5113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739126
95	NC_015689	GCG	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
96	NC_015689	AGT	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739126
97	NC_015689	CG	3	6	5168	5173	0 %	0 %	50 %	50 %	337739126
98	NC_015689	AGGGG	2	10	5229	5238	20 %	0 %	80 %	0 %	337739126
99	NC_015689	GCC	2	6	5241	5246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739126
100	NC_015689	CGGC	2	8	5255	5262	0 %	0 %	50 %	50 %	337739126
101	NC_015689	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	337739126
102	NC_015689	CGA	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739126
103	NC_015689	CGG	2	6	5304	5309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739126
104	NC_015689	GTC	2	6	5316	5321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739126
105	NC_015689	CG	3	6	5342	5347	0 %	0 %	50 %	50 %	337739126
106	NC_015689	TA	3	6	5369	5374	50 %	50 %	0 %	0 %	337739126
107	NC_015689	GC	3	6	5498	5503	0 %	0 %	50 %	50 %	337739127
108	NC_015689	CCG	2	6	5521	5526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739127
109	NC_015689	TGA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739127
110	NC_015689	GCG	2	6	5605	5610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739127
111	NC_015689	CGC	2	6	5613	5618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739127
112	NC_015689	ATCC	2	8	5620	5627	25 %	25 %	0 %	50 %	337739127
113	NC_015689	CG	3	6	5631	5636	0 %	0 %	50 %	50 %	337739127
114	NC_015689	GGC	2	6	5663	5668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739127
115	NC_015689	GCTGTC	2	12	5673	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739127
116	NC_015689	GGC	2	6	5730	5735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739127
117	NC_015689	GCG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739127
118	NC_015689	CCCGG	2	10	5776	5785	0 %	0 %	40 %	60 %	337739127
119	NC_015689	GGC	2	6	5807	5812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739127
120	NC_015689	AGCGC	2	10	5822	5831	20 %	0 %	40 %	40 %	337739127
121	NC_015689	CGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739127
122	NC_015689	GCC	3	9	5956	5964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739127
123	NC_015689	CGC	2	6	5970	5975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739127
124	NC_015689	GCCGT	2	10	6064	6073	0 %	20 %	40 %	40 %	337739127
125	NC_015689	CCG	2	6	6090	6095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739127
126	NC_015689	GC	3	6	6105	6110	0 %	0 %	50 %	50 %	337739127
127	NC_015689	GAC	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739127
128	NC_015689	GC	4	8	6169	6176	0 %	0 %	50 %	50 %	337739127
129	NC_015689	TCT	2	6	6228	6233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337739127
130	NC_015689	CGG	2	6	6236	6241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739127
131	NC_015689	TGG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739127
132	NC_015689	TGA	2	6	6287	6292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739127
133	NC_015689	GGA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739127
134	NC_015689	CGCCGG	2	12	6309	6320	0 %	0 %	50 %	50 %	337739127
135	NC_015689	GCA	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739127
136	NC_015689	GCC	2	6	6347	6352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739127
137	NC_015689	TGG	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739127
138	NC_015689	CG	4	8	6440	6447	0 %	0 %	50 %	50 %	337739128
139	NC_015689	GATCTC	2	12	6458	6469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337739128
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141	NC_015689	ATGG	2	8	6508	6515	25 %	25 %	50 %	0 %	337739128
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145	NC_015689	GTC	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739128
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149	NC_015689	CGA	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739128
150	NC_015689	GGTCGC	2	12	6655	6666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	337739128
151	NC_015689	CGG	2	6	6667	6672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739128
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153	NC_015689	CAG	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739128
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158	NC_015689	GC	3	6	6912	6917	0 %	0 %	50 %	50 %	337739128
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171	NC_015689	ATG	2	6	7938	7943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739130
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250	NC_015689	AGGC	2	8	11899	11906	25 %	0 %	50 %	25 %	337739136
251	NC_015689	ATC	2	6	11919	11924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739136
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256	NC_015689	TAG	2	6	12132	12137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739136
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260	NC_015689	TCG	2	6	12309	12314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739136
261	NC_015689	CG	3	6	12334	12339	0 %	0 %	50 %	50 %	337739136
262	NC_015689	CCG	2	6	12343	12348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739136
263	NC_015689	GC	4	8	12362	12369	0 %	0 %	50 %	50 %	337739136
264	NC_015689	CGG	2	6	12406	12411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739136
265	NC_015689	CGA	2	6	12433	12438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739136
266	NC_015689	CGAATC	2	12	12475	12486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337739136
267	NC_015689	GCT	2	6	12505	12510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739136
268	NC_015689	GCG	2	6	12528	12533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739136
269	NC_015689	CGC	2	6	12581	12586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739136
270	NC_015689	TCG	2	6	12588	12593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739136
271	NC_015689	TGC	2	6	12615	12620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739136
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273	NC_015689	CGATGT	2	12	12688	12699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337739136
274	NC_015689	GCC	2	6	12746	12751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739136
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277	NC_015689	GAAAA	2	10	12791	12800	80 %	0 %	20 %	0 %	337739136
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280	NC_015689	GCG	2	6	12884	12889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739136
281	NC_015689	TCG	2	6	12891	12896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739136
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284	NC_015689	CG	4	8	13085	13092	0 %	0 %	50 %	50 %	337739137
285	NC_015689	CGG	2	6	13115	13120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739137
286	NC_015689	GAC	2	6	13164	13169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739137
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289	NC_015689	CTCGAT	2	12	13275	13286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337739137
290	NC_015689	TCG	2	6	13313	13318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739137
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293	NC_015689	CGG	2	6	13358	13363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739137
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297	NC_015689	GC	3	6	13573	13578	0 %	0 %	50 %	50 %	337739137
298	NC_015689	CGATC	2	10	13607	13616	20 %	20 %	20 %	40 %	337739137
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388	NC_015689	GTT	2	6	18519	18524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337739142
389	NC_015689	GCA	2	6	18735	18740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739143
390	NC_015689	CAA	2	6	18855	18860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337739143
391	NC_015689	CTG	2	6	18889	18894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739143
392	NC_015689	GTCGA	2	10	18962	18971	20 %	20 %	40 %	20 %	337739143
393	NC_015689	GC	3	6	18972	18977	0 %	0 %	50 %	50 %	337739143
394	NC_015689	CGA	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739143
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398	NC_015689	GCC	2	6	19412	19417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739143
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401	NC_015689	CG	3	6	19514	19519	0 %	0 %	50 %	50 %	337739143
402	NC_015689	CGAA	2	8	19599	19606	50 %	0 %	25 %	25 %	337739143
403	NC_015689	A	6	6	19627	19632	100 %	0 %	0 %	0 %	337739143
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429	NC_015689	CTG	2	6	21279	21284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739144
430	NC_015689	GTT	2	6	21338	21343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337739144
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481	NC_015689	TGC	2	6	23943	23948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739147
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496	NC_015689	GC	4	8	24432	24439	0 %	0 %	50 %	50 %	337739147
497	NC_015689	GAGC	2	8	24501	24508	25 %	0 %	50 %	25 %	337739147
498	NC_015689	ATCCG	2	10	24515	24524	20 %	20 %	20 %	40 %	337739147
499	NC_015689	CG	3	6	24523	24528	0 %	0 %	50 %	50 %	337739147
500	NC_015689	CGT	2	6	24547	24552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739147

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