MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oligotropha carboxidovorans OM5 chromosome

Total Repeats: 77776

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015684	CGCA	2	8	190	197	25 %	0 %	25 %	50 %	337739248
2	NC_015684	CGG	2	6	214	219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739248
3	NC_015684	GCT	2	6	297	302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
4	NC_015684	CGC	2	6	367	372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
5	NC_015684	GAG	2	6	398	403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739248
6	NC_015684	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739248
7	NC_015684	GC	3	6	442	447	0 %	0 %	50 %	50 %	337739248
8	NC_015684	CGG	2	6	487	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739248
9	NC_015684	CGC	2	6	495	500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
10	NC_015684	TCG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
11	NC_015684	GCC	2	6	560	565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
12	NC_015684	GCC	2	6	585	590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
13	NC_015684	GCG	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739248
14	NC_015684	CTG	2	6	656	661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
15	NC_015684	TCG	2	6	738	743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
16	NC_015684	CGA	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739248
17	NC_015684	GCCG	2	8	884	891	0 %	0 %	50 %	50 %	337739248
18	NC_015684	GGT	2	6	895	900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739248
19	NC_015684	GCC	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
20	NC_015684	CGA	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739248
21	NC_015684	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739248
22	NC_015684	GAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337739248
23	NC_015684	CG	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	337739248
24	NC_015684	CCA	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337739248
25	NC_015684	CCGC	2	8	1222	1229	0 %	0 %	25 %	75 %	337739248
26	NC_015684	CGT	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
27	NC_015684	CG	3	6	1273	1278	0 %	0 %	50 %	50 %	337739248
28	NC_015684	CTG	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
29	NC_015684	CGC	2	6	1316	1321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
30	NC_015684	GTG	2	6	1331	1336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739248
31	NC_015684	GACGCT	2	12	1369	1380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337739248
32	NC_015684	GCC	2	6	1401	1406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739248
33	NC_015684	CGG	2	6	1411	1416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739248
34	NC_015684	ACCAC	2	10	1422	1431	40 %	0 %	0 %	60 %	337739248
35	NC_015684	TGC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739248
36	NC_015684	CGA	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739248
37	NC_015684	CG	3	6	1718	1723	0 %	0 %	50 %	50 %	337739249
38	NC_015684	TC	3	6	1736	1741	0 %	50 %	0 %	50 %	337739249
39	NC_015684	GTG	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739249
40	NC_015684	CGACCT	2	12	1840	1851	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337739249
41	NC_015684	CGG	2	6	1872	1877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739249
42	NC_015684	CGG	2	6	1888	1893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739249
43	NC_015684	CCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337739249
44	NC_015684	GC	3	6	1981	1986	0 %	0 %	50 %	50 %	337739249
45	NC_015684	CGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739249
46	NC_015684	GCC	2	6	2096	2101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739249
47	NC_015684	CGCA	2	8	2123	2130	25 %	0 %	25 %	50 %	337739249
48	NC_015684	GAG	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337739249
49	NC_015684	CTA	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739249
50	NC_015684	ATCT	2	8	2174	2181	25 %	50 %	0 %	25 %	337739249
51	NC_015684	GC	3	6	2215	2220	0 %	0 %	50 %	50 %	337739249
52	NC_015684	CGAC	2	8	2226	2233	25 %	0 %	25 %	50 %	337739249
53	NC_015684	CGGC	2	8	2277	2284	0 %	0 %	50 %	50 %	337739249
54	NC_015684	AAC	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337739249
55	NC_015684	TCG	3	9	2484	2492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739249
56	NC_015684	GGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739249
57	NC_015684	CGA	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739249
58	NC_015684	CGAG	2	8	2538	2545	25 %	0 %	50 %	25 %	337739249
59	NC_015684	CG	3	6	2552	2557	0 %	0 %	50 %	50 %	337739249
60	NC_015684	GGT	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739249
61	NC_015684	CGC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739249
62	NC_015684	CA	3	6	2951	2956	50 %	0 %	0 %	50 %	337739250
63	NC_015684	CCGA	2	8	2957	2964	25 %	0 %	25 %	50 %	337739250
64	NC_015684	GCC	2	6	2972	2977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739250
65	NC_015684	GCAG	2	8	3024	3031	25 %	0 %	50 %	25 %	337739250
66	NC_015684	AAG	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337739250
67	NC_015684	CAGCA	2	10	3104	3113	40 %	0 %	20 %	40 %	337739250
68	NC_015684	CGC	2	6	3139	3144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739250
69	NC_015684	ACG	2	6	3186	3191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739250
70	NC_015684	TCC	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337739250
71	NC_015684	GCCTCA	2	12	3356	3367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337739251
72	NC_015684	GTG	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739251
73	NC_015684	GCT	2	6	3474	3479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739251
74	NC_015684	GCGCC	2	10	3498	3507	0 %	0 %	40 %	60 %	337739251
75	NC_015684	CG	3	6	3529	3534	0 %	0 %	50 %	50 %	337739251
76	NC_015684	CGA	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739251
77	NC_015684	CGG	2	6	3566	3571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739251
78	NC_015684	GC	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	337739251
79	NC_015684	GGC	2	6	3634	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739251
80	NC_015684	CG	4	8	3652	3659	0 %	0 %	50 %	50 %	337739251
81	NC_015684	GATG	2	8	3732	3739	25 %	25 %	50 %	0 %	337739251
82	NC_015684	GCG	3	9	3765	3773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739251
83	NC_015684	CTT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337739251
84	NC_015684	CG	3	6	3818	3823	0 %	0 %	50 %	50 %	337739251
85	NC_015684	CTG	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739251
86	NC_015684	CCG	2	6	3917	3922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
87	NC_015684	GCC	2	6	3940	3945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
88	NC_015684	CGC	2	6	3984	3989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
89	NC_015684	GCGCG	2	10	3990	3999	0 %	0 %	60 %	40 %	337739251
90	NC_015684	CG	3	6	4017	4022	0 %	0 %	50 %	50 %	337739251
91	NC_015684	TGGA	2	8	4039	4046	25 %	25 %	50 %	0 %	337739251
92	NC_015684	TGA	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739251
93	NC_015684	CCG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
94	NC_015684	GCC	2	6	4112	4117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
95	NC_015684	CGC	3	9	4125	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
96	NC_015684	GACC	2	8	4161	4168	25 %	0 %	25 %	50 %	337739251
97	NC_015684	GAA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337739251
98	NC_015684	GAAG	2	8	4203	4210	50 %	0 %	50 %	0 %	337739251
99	NC_015684	GCT	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739251
100	NC_015684	CGA	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739251
101	NC_015684	CGC	3	9	4336	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
102	NC_015684	CGA	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739251
103	NC_015684	CGG	2	6	4374	4379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739251
104	NC_015684	AGGC	2	8	4421	4428	25 %	0 %	50 %	25 %	337739251
105	NC_015684	CGC	2	6	4469	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739251
106	NC_015684	CCCG	2	8	4835	4842	0 %	0 %	25 %	75 %	337739252
107	NC_015684	GCT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739252
108	NC_015684	GTC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739252
109	NC_015684	CGA	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739252
110	NC_015684	CG	3	6	5037	5042	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
111	NC_015684	CGA	2	6	5083	5088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739252
112	NC_015684	CCGA	2	8	5102	5109	25 %	0 %	25 %	50 %	337739252
113	NC_015684	TCA	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739252
114	NC_015684	CGG	2	6	5167	5172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
115	NC_015684	CGG	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
116	NC_015684	CGGCGT	2	12	5215	5226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	337739252
117	NC_015684	GTC	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739252
118	NC_015684	GCG	2	6	5274	5279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
119	NC_015684	CGG	2	6	5347	5352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
120	NC_015684	GCG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
121	NC_015684	GCG	2	6	5532	5537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
122	NC_015684	CAA	2	6	5566	5571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337739252
123	NC_015684	GGT	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739252
124	NC_015684	GC	3	6	5602	5607	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
125	NC_015684	TGG	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739252
126	NC_015684	GTGCT	2	10	5669	5678	0 %	40 %	40 %	20 %	337739252
127	NC_015684	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337739252
128	NC_015684	CGG	2	6	5704	5709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
129	NC_015684	GAA	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337739252
130	NC_015684	CGA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739252
131	NC_015684	TCC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337739252
132	NC_015684	GGT	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739252
133	NC_015684	CAT	2	6	5920	5925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739252
134	NC_015684	GGCCGC	2	12	5998	6009	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
135	NC_015684	GC	3	6	6008	6013	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
136	NC_015684	GC	3	6	6020	6025	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
137	NC_015684	CGC	2	6	6044	6049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739252
138	NC_015684	TCG	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739252
139	NC_015684	GGC	2	6	6152	6157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739252
140	NC_015684	TGC	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739252
141	NC_015684	GC	5	10	6229	6238	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
142	NC_015684	GTC	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739252
143	NC_015684	CGA	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739252
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147	NC_015684	TTC	3	9	6404	6412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337739252
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149	NC_015684	CG	3	6	6480	6485	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
150	NC_015684	GC	4	8	6514	6521	0 %	0 %	50 %	50 %	337739252
151	NC_015684	CGA	2	6	6550	6555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739252
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157	NC_015684	CGC	2	6	6748	6753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739252
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170	NC_015684	CTCG	2	8	7237	7244	0 %	25 %	25 %	50 %	337739252
171	NC_015684	CGATC	2	10	7487	7496	20 %	20 %	20 %	40 %	337739253
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174	NC_015684	CCGCAT	2	12	7683	7694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337739253
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248	NC_015684	CGA	2	6	11096	11101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739256
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250	NC_015684	CGC	3	9	11160	11168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739256
251	NC_015684	TCG	2	6	11176	11181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739256
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253	NC_015684	ATTAAT	2	12	11299	11310	50 %	50 %	0 %	0 %	337739256
254	NC_015684	AGCA	2	8	11407	11414	50 %	0 %	25 %	25 %	337739257
255	NC_015684	GAT	2	6	11470	11475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739257
256	NC_015684	CCG	2	6	11496	11501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739257
257	NC_015684	TC	3	6	11511	11516	0 %	50 %	0 %	50 %	337739257
258	NC_015684	GCT	2	6	11554	11559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
259	NC_015684	TCA	2	6	11604	11609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739257
260	NC_015684	CGCC	2	8	11614	11621	0 %	0 %	25 %	75 %	337739257
261	NC_015684	GCTC	2	8	11637	11644	0 %	25 %	25 %	50 %	337739257
262	NC_015684	CGC	2	6	11647	11652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739257
263	NC_015684	CGC	2	6	11698	11703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739257
264	NC_015684	CCTGAT	2	12	11740	11751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337739257
265	NC_015684	GTG	2	6	11762	11767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739257
266	NC_015684	TGA	2	6	11859	11864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739257
267	NC_015684	TGA	2	6	11898	11903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739257
268	NC_015684	GCG	2	6	11923	11928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739257
269	NC_015684	TGA	3	9	11967	11975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337739257
270	NC_015684	GCT	2	6	11992	11997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
271	NC_015684	GGC	2	6	12003	12008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739257
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273	NC_015684	GC	3	6	12100	12105	0 %	0 %	50 %	50 %	337739257
274	NC_015684	CTT	2	6	12154	12159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337739257
275	NC_015684	TCG	2	6	12210	12215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
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278	NC_015684	ACG	2	6	12357	12362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337739257
279	NC_015684	CG	3	6	12390	12395	0 %	0 %	50 %	50 %	337739257
280	NC_015684	TGC	2	6	12420	12425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
281	NC_015684	AGCC	2	8	12452	12459	25 %	0 %	25 %	50 %	337739257
282	NC_015684	TCG	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
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285	NC_015684	GCT	2	6	12616	12621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
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287	NC_015684	GCG	2	6	12731	12736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739257
288	NC_015684	CTG	2	6	12740	12745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
289	NC_015684	GGCGC	2	10	12747	12756	0 %	0 %	60 %	40 %	337739257
290	NC_015684	CGT	2	6	12759	12764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
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292	NC_015684	CGC	3	9	12781	12789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739257
293	NC_015684	GC	3	6	12788	12793	0 %	0 %	50 %	50 %	337739257
294	NC_015684	GGC	2	6	12795	12800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739257
295	NC_015684	GCG	2	6	12821	12826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739257
296	NC_015684	TCG	2	6	12861	12866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739257
297	NC_015684	TTC	2	6	12890	12895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337739257
298	NC_015684	CGG	2	6	12913	12918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739257
299	NC_015684	TGG	2	6	12921	12926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739257
300	NC_015684	GTG	2	6	12971	12976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739257
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304	NC_015684	CGCC	2	8	13375	13382	0 %	0 %	25 %	75 %	337739258
305	NC_015684	GGCT	2	8	13385	13392	0 %	25 %	50 %	25 %	337739258
306	NC_015684	GGC	2	6	13477	13482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337739258
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379	NC_015684	CAT	2	6	16425	16430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739262
380	NC_015684	CG	4	8	16456	16463	0 %	0 %	50 %	50 %	337739262
381	NC_015684	ATC	2	6	16484	16489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337739262
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386	NC_015684	TGG	2	6	16844	16849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337739263
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389	NC_015684	GC	3	6	16996	17001	0 %	0 %	50 %	50 %	337739263
390	NC_015684	CGC	2	6	17068	17073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337739263
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392	NC_015684	CGT	2	6	17292	17297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337739263
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