MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oligotropha carboxidovorans OM5 chromosome

Total Repeats: 80666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011386	CCGGC	2	10	197	206	0 %	0 %	40 %	60 %	209883161
2	NC_011386	GCC	2	6	226	231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
3	NC_011386	GCC	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
4	NC_011386	CG	3	6	416	421	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
5	NC_011386	GCGA	2	8	461	468	25 %	0 %	50 %	25 %	209883161
6	NC_011386	GCG	2	6	500	505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883161
7	NC_011386	TGT	2	6	528	533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209883161
8	NC_011386	ATG	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209883161
9	NC_011386	CGC	3	9	564	572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
10	NC_011386	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
11	NC_011386	CCG	2	6	667	672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
12	NC_011386	GGT	2	6	695	700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209883161
13	NC_011386	GAT	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209883161
14	NC_011386	CCG	2	6	723	728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
15	NC_011386	TGC	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
16	NC_011386	GTC	2	6	764	769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
17	NC_011386	CGGCG	2	10	811	820	0 %	0 %	60 %	40 %	209883161
18	NC_011386	GCC	2	6	832	837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
19	NC_011386	CGC	2	6	868	873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
20	NC_011386	GGC	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883161
21	NC_011386	CGGCC	2	10	982	991	0 %	0 %	40 %	60 %	209883161
22	NC_011386	CAT	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209883161
23	NC_011386	ACG	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883161
24	NC_011386	CCGG	2	8	1133	1140	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
25	NC_011386	CGG	2	6	1150	1155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883161
26	NC_011386	CGG	2	6	1204	1209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883161
27	NC_011386	GAT	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209883161
28	NC_011386	CGC	2	6	1240	1245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
29	NC_011386	ATCT	2	8	1469	1476	25 %	50 %	0 %	25 %	209883161
30	NC_011386	CGG	2	6	1477	1482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883161
31	NC_011386	GC	3	6	1545	1550	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
32	NC_011386	TGA	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209883161
33	NC_011386	TCA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209883161
34	NC_011386	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
35	NC_011386	AAGG	2	8	1808	1815	50 %	0 %	50 %	0 %	209883161
36	NC_011386	GCCG	2	8	1838	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
37	NC_011386	CG	3	6	1870	1875	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
38	NC_011386	GCT	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
39	NC_011386	GACGC	2	10	1961	1970	20 %	0 %	40 %	40 %	209883161
40	NC_011386	GC	3	6	1969	1974	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
41	NC_011386	TGC	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
42	NC_011386	CCG	3	9	1998	2006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
43	NC_011386	CGC	2	6	2032	2037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
44	NC_011386	CCGG	2	8	2082	2089	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
45	NC_011386	CGC	2	6	2105	2110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883161
46	NC_011386	GCG	2	6	2138	2143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883161
47	NC_011386	CTG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
48	NC_011386	GC	3	6	2150	2155	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
49	NC_011386	TCT	2	6	2158	2163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209883161
50	NC_011386	CG	4	8	2195	2202	0 %	0 %	50 %	50 %	209883161
51	NC_011386	TCG	3	9	2247	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883161
52	NC_011386	TTC	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209883162
53	NC_011386	CG	3	6	2602	2607	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
54	NC_011386	TGC	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883162
55	NC_011386	GC	3	6	2649	2654	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
56	NC_011386	CG	3	6	2664	2669	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
57	NC_011386	CGC	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883162
58	NC_011386	GT	3	6	2714	2719	0 %	50 %	50 %	0 %	209883162
59	NC_011386	CG	3	6	2724	2729	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
60	NC_011386	AAC	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209883162
61	NC_011386	CG	3	6	2748	2753	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
62	NC_011386	GGT	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209883162
63	NC_011386	GCC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883162
64	NC_011386	GCG	2	6	2824	2829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883162
65	NC_011386	GC	3	6	2836	2841	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
66	NC_011386	CCG	2	6	2846	2851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883162
67	NC_011386	CGA	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883162
68	NC_011386	CG	3	6	2984	2989	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
69	NC_011386	GCC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883162
70	NC_011386	CGCC	2	8	3071	3078	0 %	0 %	25 %	75 %	209883162
71	NC_011386	CG	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
72	NC_011386	CG	3	6	3111	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
73	NC_011386	CGA	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883162
74	NC_011386	GC	3	6	3204	3209	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
75	NC_011386	CGC	2	6	3313	3318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883162
76	NC_011386	CG	3	6	3353	3358	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
77	NC_011386	GCCG	2	8	3363	3370	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
78	NC_011386	GCC	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883162
79	NC_011386	CTGCG	2	10	3386	3395	0 %	20 %	40 %	40 %	209883162
80	NC_011386	CG	3	6	3394	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	209883162
81	NC_011386	CGA	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883162
82	NC_011386	GAT	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209883162
83	NC_011386	TCG	2	6	3512	3517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883163
84	NC_011386	TCG	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883163
85	NC_011386	AGC	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883163
86	NC_011386	CGC	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883163
87	NC_011386	GAGCGT	2	12	3769	3780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209883163
88	NC_011386	CGA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883163
89	NC_011386	CGG	2	6	3810	3815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883163
90	NC_011386	GC	4	8	3915	3922	0 %	0 %	50 %	50 %	209883164
91	NC_011386	TCG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883164
92	NC_011386	CG	3	6	3967	3972	0 %	0 %	50 %	50 %	209883164
93	NC_011386	CGA	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883164
94	NC_011386	TCA	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209883164
95	NC_011386	GAC	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883164
96	NC_011386	GCC	2	6	4162	4167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883164
97	NC_011386	GC	3	6	4193	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	209883164
98	NC_011386	GC	3	6	4338	4343	0 %	0 %	50 %	50 %	209883164
99	NC_011386	GC	3	6	4439	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	209883164
100	NC_011386	GCG	3	9	4461	4469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883164
101	NC_011386	CCA	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209883165
102	NC_011386	GCC	2	6	4541	4546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883165
103	NC_011386	CGC	2	6	4655	4660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883165
104	NC_011386	CGC	2	6	4694	4699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883165
105	NC_011386	GC	3	6	4708	4713	0 %	0 %	50 %	50 %	209883165
106	NC_011386	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209883165
107	NC_011386	GCCG	2	8	4749	4756	0 %	0 %	50 %	50 %	209883165
108	NC_011386	CGA	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883165
109	NC_011386	GCG	3	9	4806	4814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883165
110	NC_011386	GC	3	6	4937	4942	0 %	0 %	50 %	50 %	209883165
111	NC_011386	GGT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209883166
112	NC_011386	GCA	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883166
113	NC_011386	CG	3	6	5097	5102	0 %	0 %	50 %	50 %	209883166
114	NC_011386	GAAGC	2	10	5181	5190	40 %	0 %	40 %	20 %	209883166
115	NC_011386	CGTC	2	8	5193	5200	0 %	25 %	25 %	50 %	209883166
116	NC_011386	CGG	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883167
117	NC_011386	CG	4	8	5268	5275	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
118	NC_011386	GCCG	2	8	5307	5314	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
119	NC_011386	GAC	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883167
120	NC_011386	GGC	2	6	5356	5361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883167
121	NC_011386	CG	4	8	5403	5410	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
122	NC_011386	GC	3	6	5419	5424	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
123	NC_011386	CCGG	2	8	5460	5467	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
124	NC_011386	GC	3	6	5473	5478	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
125	NC_011386	CGG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883167
126	NC_011386	AGC	2	6	5564	5569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883167
127	NC_011386	CGG	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883167
128	NC_011386	GAC	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883167
129	NC_011386	CG	3	6	5664	5669	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
130	NC_011386	CGA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883167
131	NC_011386	CG	3	6	5706	5711	0 %	0 %	50 %	50 %	209883167
132	NC_011386	GCT	2	6	5715	5720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209883167
133	NC_011386	CGC	2	6	5829	5834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883167
134	NC_011386	AGC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883167
135	NC_011386	CGA	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883167
136	NC_011386	GC	3	6	5951	5956	0 %	0 %	50 %	50 %	209883168
137	NC_011386	GCA	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883168
138	NC_011386	GCG	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883168
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140	NC_011386	CAGC	2	8	6258	6265	25 %	0 %	25 %	50 %	209883168
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145	NC_011386	CGA	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883168
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262	NC_011386	AGCC	2	8	13626	13633	25 %	0 %	25 %	50 %	209883178
263	NC_011386	CTT	3	9	13676	13684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209883178
264	NC_011386	CGG	2	6	13699	13704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883178
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266	NC_011386	CGG	2	6	13729	13734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209883178
267	NC_011386	CCG	2	6	13813	13818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883178
268	NC_011386	CG	3	6	13972	13977	0 %	0 %	50 %	50 %	209883178
269	NC_011386	CCG	2	6	13984	13989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209883178
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393	NC_011386	AGC	2	6	20125	20130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883184
394	NC_011386	AGC	2	6	20143	20148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883184
395	NC_011386	ACG	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883184
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499	NC_011386	CCA	2	6	26296	26301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209883188
500	NC_011386	AGC	2	6	26325	26330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209883188

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