MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Opitutus terrae PB90-1 chromosome

Total Repeats: 139560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010571	GCGGCT	2	12	220	231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182411827
2	NC_010571	CGG	2	6	234	239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411827
3	NC_010571	CG	3	6	311	316	0 %	0 %	50 %	50 %	182411827
4	NC_010571	ACC	2	6	317	322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411827
5	NC_010571	CGC	2	6	360	365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411827
6	NC_010571	ACG	2	6	381	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411827
7	NC_010571	CGC	2	6	397	402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411827
8	NC_010571	TCG	3	9	438	446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411827
9	NC_010571	AAC	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182411827
10	NC_010571	CGC	3	9	469	477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411827
11	NC_010571	AAC	2	6	590	595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182411827
12	NC_010571	CG	4	8	601	608	0 %	0 %	50 %	50 %	182411827
13	NC_010571	CGA	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411827
14	NC_010571	AGG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182411827
15	NC_010571	TTC	2	6	764	769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182411827
16	NC_010571	GGT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182411827
17	NC_010571	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411827
18	NC_010571	CG	3	6	827	832	0 %	0 %	50 %	50 %	182411827
19	NC_010571	CCG	2	6	888	893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411827
20	NC_010571	GCA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411827
21	NC_010571	GGC	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411827
22	NC_010571	CCG	2	6	1015	1020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411827
23	NC_010571	GC	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	182411827
24	NC_010571	TGC	3	9	1098	1106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411827
25	NC_010571	CAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182411827
26	NC_010571	CT	3	6	1279	1284	0 %	50 %	0 %	50 %	182411827
27	NC_010571	CGG	2	6	1306	1311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411827
28	NC_010571	ACA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182411827
29	NC_010571	CCA	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411827
30	NC_010571	CG	3	6	1380	1385	0 %	0 %	50 %	50 %	182411827
31	NC_010571	GCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411827
32	NC_010571	GC	3	6	1423	1428	0 %	0 %	50 %	50 %	182411827
33	NC_010571	AGC	2	6	1634	1639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411828
34	NC_010571	CCT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182411828
35	NC_010571	CGC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411828
36	NC_010571	TC	3	6	1677	1682	0 %	50 %	0 %	50 %	182411828
37	NC_010571	A	6	6	1693	1698	100 %	0 %	0 %	0 %	182411828
38	NC_010571	TCG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411828
39	NC_010571	CGATCT	2	12	1755	1766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182411828
40	NC_010571	C	7	7	1848	1854	0 %	0 %	0 %	100 %	182411828
41	NC_010571	CCG	2	6	1880	1885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411828
42	NC_010571	A	8	8	1889	1896	100 %	0 %	0 %	0 %	182411828
43	NC_010571	CTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182411828
44	NC_010571	CGGC	2	8	1952	1959	0 %	0 %	50 %	50 %	182411828
45	NC_010571	CCG	2	6	1975	1980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411828
46	NC_010571	CGA	3	9	1998	2006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411828
47	NC_010571	CCCG	2	8	2022	2029	0 %	0 %	25 %	75 %	182411828
48	NC_010571	GC	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	182411828
49	NC_010571	GCG	2	6	2093	2098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411828
50	NC_010571	TCG	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411828
51	NC_010571	TCAG	2	8	2171	2178	25 %	25 %	25 %	25 %	182411828
52	NC_010571	GCCCG	2	10	2408	2417	0 %	0 %	40 %	60 %	182411829
53	NC_010571	T	7	7	2421	2427	0 %	100 %	0 %	0 %	182411829
54	NC_010571	CCA	2	6	2437	2442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411829
55	NC_010571	TCA	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182411829
56	NC_010571	TGCCCC	2	12	2487	2498	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	182411829
57	NC_010571	GCG	2	6	2515	2520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411829
58	NC_010571	GCC	2	6	2521	2526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
59	NC_010571	ATC	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182411829
60	NC_010571	GGC	2	6	2568	2573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411829
61	NC_010571	TCC	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182411829
62	NC_010571	GAT	2	6	2597	2602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182411829
63	NC_010571	CG	3	6	2660	2665	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
64	NC_010571	CGC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
65	NC_010571	CGC	2	6	2708	2713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
66	NC_010571	CGC	2	6	2717	2722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
67	NC_010571	GTC	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411829
68	NC_010571	CCAG	2	8	2752	2759	25 %	0 %	25 %	50 %	182411829
69	NC_010571	CGCC	2	8	2767	2774	0 %	0 %	25 %	75 %	182411829
70	NC_010571	CGC	2	6	2800	2805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
71	NC_010571	CCG	2	6	2835	2840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
72	NC_010571	GCT	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411829
73	NC_010571	CGG	2	6	2884	2889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411829
74	NC_010571	GTC	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411829
75	NC_010571	CGCGC	2	10	2944	2953	0 %	0 %	40 %	60 %	182411829
76	NC_010571	GCA	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
77	NC_010571	CAG	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
78	NC_010571	CCG	2	6	3078	3083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
79	NC_010571	GAC	2	6	3092	3097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
80	NC_010571	CGC	2	6	3113	3118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
81	NC_010571	CG	4	8	3163	3170	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
82	NC_010571	CAC	2	6	3303	3308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411829
83	NC_010571	CGA	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
84	NC_010571	TGC	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411829
85	NC_010571	GCA	2	6	3523	3528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
86	NC_010571	CAG	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
87	NC_010571	GCC	2	6	3624	3629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
88	NC_010571	GTT	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182411829
89	NC_010571	TCC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182411829
90	NC_010571	GTC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411829
91	NC_010571	ACC	2	6	3780	3785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411829
92	NC_010571	C	6	6	3799	3804	0 %	0 %	0 %	100 %	182411829
93	NC_010571	TTC	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182411829
94	NC_010571	CG	3	6	3887	3892	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
95	NC_010571	CCGG	2	8	3895	3902	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
96	NC_010571	GTG	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182411829
97	NC_010571	TCC	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182411829
98	NC_010571	CG	3	6	4025	4030	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
99	NC_010571	CGC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
100	NC_010571	CAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411829
101	NC_010571	CCG	2	6	4106	4111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411829
102	NC_010571	CCCA	2	8	4116	4123	25 %	0 %	0 %	75 %	182411829
103	NC_010571	GC	4	8	4145	4152	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
104	NC_010571	CGTC	2	8	4226	4233	0 %	25 %	25 %	50 %	182411829
105	NC_010571	CG	4	8	4281	4288	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
106	NC_010571	CG	3	6	4305	4310	0 %	0 %	50 %	50 %	182411829
107	NC_010571	GCG	2	6	4344	4349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411829
108	NC_010571	CCAG	2	8	4350	4357	25 %	0 %	25 %	50 %	182411829
109	NC_010571	GCC	2	6	4570	4575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411830
110	NC_010571	CAG	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411830
111	NC_010571	GC	5	10	4623	4632	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
112	NC_010571	CCT	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182411830
113	NC_010571	GCT	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411830
114	NC_010571	CGG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411830
115	NC_010571	GC	3	6	4794	4799	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
116	NC_010571	CAC	2	6	4813	4818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411830
117	NC_010571	CCA	2	6	4848	4853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411830
118	NC_010571	CCG	2	6	4916	4921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411830
119	NC_010571	GC	4	8	4957	4964	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
120	NC_010571	CGC	2	6	5008	5013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411830
121	NC_010571	GCG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182411830
122	NC_010571	CG	3	6	5065	5070	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
123	NC_010571	CAG	2	6	5092	5097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411830
124	NC_010571	CCA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411830
125	NC_010571	TCGCC	2	10	5211	5220	0 %	20 %	20 %	60 %	182411830
126	NC_010571	CACG	2	8	5236	5243	25 %	0 %	25 %	50 %	182411830
127	NC_010571	TGC	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411830
128	NC_010571	ACCGC	2	10	5304	5313	20 %	0 %	20 %	60 %	182411830
129	NC_010571	ACC	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411830
130	NC_010571	GCAC	2	8	5379	5386	25 %	0 %	25 %	50 %	182411830
131	NC_010571	GC	4	8	5391	5398	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
132	NC_010571	CCG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411830
133	NC_010571	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182411830
134	NC_010571	CG	3	6	5483	5488	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
135	NC_010571	CG	4	8	5512	5519	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
136	NC_010571	CGT	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411830
137	NC_010571	CG	3	6	5602	5607	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
138	NC_010571	TCG	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411830
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162	NC_010571	CG	3	6	6539	6544	0 %	0 %	50 %	50 %	182411830
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169	NC_010571	CAG	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411831
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171	NC_010571	CAG	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411831
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176	NC_010571	CGT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411832
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245	NC_010571	CCG	2	6	9907	9912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411835
246	NC_010571	CCCG	2	8	9976	9983	0 %	0 %	25 %	75 %	182411835
247	NC_010571	GC	5	10	9996	10005	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
248	NC_010571	GGA	2	6	10006	10011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182411835
249	NC_010571	CGT	2	6	10039	10044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411835
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252	NC_010571	GCAC	2	8	10116	10123	25 %	0 %	25 %	50 %	182411835
253	NC_010571	GCCGC	2	10	10144	10153	0 %	0 %	40 %	60 %	182411835
254	NC_010571	CGC	2	6	10175	10180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411835
255	NC_010571	GAG	2	6	10187	10192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182411835
256	NC_010571	CGA	2	6	10240	10245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
257	NC_010571	CG	3	6	10251	10256	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
258	NC_010571	CGT	2	6	10261	10266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411835
259	NC_010571	CTC	2	6	10289	10294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182411835
260	NC_010571	GCT	2	6	10315	10320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411835
261	NC_010571	CAT	3	9	10336	10344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182411835
262	NC_010571	CGA	2	6	10345	10350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
263	NC_010571	CTCA	2	8	10363	10370	25 %	25 %	0 %	50 %	182411835
264	NC_010571	TCA	2	6	10434	10439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182411835
265	NC_010571	GAC	2	6	10481	10486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
266	NC_010571	CGC	2	6	10539	10544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411835
267	NC_010571	CGA	2	6	10546	10551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
268	NC_010571	ACG	2	6	10566	10571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
269	NC_010571	CAT	2	6	10672	10677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182411835
270	NC_010571	AGC	3	9	10685	10693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
271	NC_010571	CGAG	2	8	10716	10723	25 %	0 %	50 %	25 %	182411835
272	NC_010571	GCT	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411835
273	NC_010571	CGGC	2	8	10795	10802	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
274	NC_010571	AGC	3	9	10815	10823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
275	NC_010571	GCA	2	6	10840	10845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
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279	NC_010571	CGA	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
280	NC_010571	GCT	2	6	11224	11229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411835
281	NC_010571	GC	3	6	11241	11246	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
282	NC_010571	TGC	2	6	11289	11294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411835
283	NC_010571	CGGC	2	8	11321	11328	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
284	NC_010571	CGA	2	6	11350	11355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
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286	NC_010571	GAT	2	6	11503	11508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182411835
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288	NC_010571	CG	3	6	11528	11533	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
289	NC_010571	CG	3	6	11580	11585	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
290	NC_010571	CAG	3	9	11603	11611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
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298	NC_010571	CCG	2	6	11950	11955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411835
299	NC_010571	CG	3	6	11967	11972	0 %	0 %	50 %	50 %	182411835
300	NC_010571	CGA	2	6	11992	11997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
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303	NC_010571	GCA	2	6	12039	12044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411835
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385	NC_010571	GCCG	2	8	15416	15423	0 %	0 %	50 %	50 %	182411837
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389	NC_010571	CGC	3	9	15570	15578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411837
390	NC_010571	ATC	2	6	15580	15585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182411837
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393	NC_010571	CG	3	6	15624	15629	0 %	0 %	50 %	50 %	182411837
394	NC_010571	GAT	2	6	15654	15659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182411837
395	NC_010571	GC	3	6	15683	15688	0 %	0 %	50 %	50 %	182411837
396	NC_010571	AAC	2	6	15742	15747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182411837
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401	NC_010571	CCG	2	6	15980	15985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411837
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469	NC_010571	GCCAC	2	10	20027	20036	20 %	0 %	20 %	60 %	182411842
470	NC_010571	GCA	2	6	20141	20146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182411842
471	NC_010571	CGAG	2	8	20270	20277	25 %	0 %	50 %	25 %	182411842
472	NC_010571	GCT	2	6	20300	20305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182411842
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477	NC_010571	CG	4	8	20447	20454	0 %	0 %	50 %	50 %	182411842
478	NC_010571	GAT	2	6	20457	20462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182411842
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497	NC_010571	ACC	2	6	21093	21098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182411843
498	NC_010571	CGC	2	6	21113	21118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411843
499	NC_010571	CCG	3	9	21127	21135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411843
500	NC_010571	CCG	2	6	21199	21204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182411843

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