MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Oenococcus oeni PSU-1

Total Repeats: 31811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008528	CGC	2	6	57	62	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116490127
2	NC_008528	T	7	7	237	243	0 %	100 %	0 %	0 %	116490127
3	NC_008528	TAA	2	6	285	290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490127
4	NC_008528	ATCAA	2	10	297	306	60 %	20 %	0 %	20 %	116490127
5	NC_008528	GCA	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116490127
6	NC_008528	AAC	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490127
7	NC_008528	GTC	2	6	431	436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490127
8	NC_008528	CTTA	2	8	447	454	25 %	50 %	0 %	25 %	116490127
9	NC_008528	TA	3	6	453	458	50 %	50 %	0 %	0 %	116490127
10	NC_008528	TA	3	6	544	549	50 %	50 %	0 %	0 %	116490127
11	NC_008528	ATGA	2	8	565	572	50 %	25 %	25 %	0 %	116490127
12	NC_008528	AAC	2	6	597	602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490127
13	NC_008528	TCT	2	6	636	641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490127
14	NC_008528	AAG	2	6	686	691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490127
15	NC_008528	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	116490127
16	NC_008528	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490127
17	NC_008528	A	6	6	864	869	100 %	0 %	0 %	0 %	116490127
18	NC_008528	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490127
19	NC_008528	GCCG	3	12	991	1002	0 %	0 %	50 %	50 %	116490127
20	NC_008528	GAT	2	6	1096	1101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490127
21	NC_008528	TGATT	2	10	1119	1128	20 %	60 %	20 %	0 %	116490127
22	NC_008528	A	6	6	1131	1136	100 %	0 %	0 %	0 %	116490127
23	NC_008528	CA	3	6	1243	1248	50 %	0 %	0 %	50 %	116490127
24	NC_008528	CATG	2	8	1254	1261	25 %	25 %	25 %	25 %	116490127
25	NC_008528	A	6	6	1268	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	116490127
26	NC_008528	CAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490127
27	NC_008528	AAACG	2	10	1543	1552	60 %	0 %	20 %	20 %	116490128
28	NC_008528	AAAT	2	8	1560	1567	75 %	25 %	0 %	0 %	116490128
29	NC_008528	ATT	2	6	1603	1608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490128
30	NC_008528	ATCA	2	8	1680	1687	50 %	25 %	0 %	25 %	116490128
31	NC_008528	AGATAA	2	12	1704	1715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116490128
32	NC_008528	A	8	8	1714	1721	100 %	0 %	0 %	0 %	116490128
33	NC_008528	ATT	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490128
34	NC_008528	ATC	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490128
35	NC_008528	TTG	2	6	1838	1843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490128
36	NC_008528	GAT	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490128
37	NC_008528	TCT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490128
38	NC_008528	ATT	2	6	1954	1959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490128
39	NC_008528	TTA	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490128
40	NC_008528	GTC	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490128
41	NC_008528	TGCTT	2	10	2151	2160	0 %	60 %	20 %	20 %	116490128
42	NC_008528	AAC	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490128
43	NC_008528	GATT	2	8	2273	2280	25 %	50 %	25 %	0 %	116490128
44	NC_008528	TGC	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490128
45	NC_008528	CTT	2	6	2330	2335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490128
46	NC_008528	CCA	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116490128
47	NC_008528	TCAG	2	8	2393	2400	25 %	25 %	25 %	25 %	116490128
48	NC_008528	TAT	2	6	2411	2416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490128
49	NC_008528	GAA	2	6	2449	2454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490128
50	NC_008528	TCGA	2	8	2458	2465	25 %	25 %	25 %	25 %	116490128
51	NC_008528	ACA	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490128
52	NC_008528	ATA	3	9	2609	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490128
53	NC_008528	AATT	2	8	2624	2631	50 %	50 %	0 %	0 %	116490128
54	NC_008528	TTA	2	6	2807	2812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490129
55	NC_008528	CGG	2	6	2853	2858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116490129
56	NC_008528	T	6	6	2869	2874	0 %	100 %	0 %	0 %	116490129
57	NC_008528	T	7	7	2895	2901	0 %	100 %	0 %	0 %	116490129
58	NC_008528	TCG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490129
59	NC_008528	TTA	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490130
60	NC_008528	ATA	2	6	3147	3152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490130
61	NC_008528	A	6	6	3260	3265	100 %	0 %	0 %	0 %	116490130
62	NC_008528	ATC	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490130
63	NC_008528	TACA	2	8	3318	3325	50 %	25 %	0 %	25 %	116490130
64	NC_008528	CCG	2	6	3376	3381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116490130
65	NC_008528	ATT	2	6	3420	3425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490130
66	NC_008528	A	6	6	3478	3483	100 %	0 %	0 %	0 %	116490130
67	NC_008528	AAT	2	6	3500	3505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490130
68	NC_008528	ATTG	2	8	3547	3554	25 %	50 %	25 %	0 %	116490130
69	NC_008528	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490130
70	NC_008528	GAC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116490130
71	NC_008528	CGA	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116490130
72	NC_008528	AAG	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490130
73	NC_008528	TAA	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490130
74	NC_008528	ATT	2	6	3757	3762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490130
75	NC_008528	CAT	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490130
76	NC_008528	GAT	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490130
77	NC_008528	GGTT	2	8	3826	3833	0 %	50 %	50 %	0 %	116490130
78	NC_008528	GAC	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116490130
79	NC_008528	GTCA	2	8	3871	3878	25 %	25 %	25 %	25 %	116490130
80	NC_008528	ATG	2	6	3896	3901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490130
81	NC_008528	GAT	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490130
82	NC_008528	TC	3	6	3946	3951	0 %	50 %	0 %	50 %	116490130
83	NC_008528	AAC	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490130
84	NC_008528	TAA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490130
85	NC_008528	A	9	9	4112	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	116490131
86	NC_008528	TGG	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490131
87	NC_008528	TCCA	2	8	4164	4171	25 %	25 %	0 %	50 %	116490131
88	NC_008528	CAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490131
89	NC_008528	CTGG	2	8	4290	4297	0 %	25 %	50 %	25 %	116490131
90	NC_008528	CAT	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490131
91	NC_008528	CGATTA	2	12	4339	4350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116490131
92	NC_008528	GAT	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490131
93	NC_008528	GTG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490131
94	NC_008528	GGT	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490131
95	NC_008528	ATTCG	2	10	4445	4454	20 %	40 %	20 %	20 %	116490131
96	NC_008528	GTT	2	6	4500	4505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490131
97	NC_008528	ACA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490131
98	NC_008528	GAAAT	2	10	4593	4602	60 %	20 %	20 %	0 %	116490131
99	NC_008528	T	6	6	4727	4732	0 %	100 %	0 %	0 %	116490131
100	NC_008528	A	6	6	4781	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	116490131
101	NC_008528	TATG	2	8	4796	4803	25 %	50 %	25 %	0 %	116490131
102	NC_008528	TAAA	2	8	4834	4841	75 %	25 %	0 %	0 %	116490131
103	NC_008528	GAA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490131
104	NC_008528	TGA	2	6	4945	4950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490131
105	NC_008528	TAA	2	6	4958	4963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490131
106	NC_008528	GGT	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490131
107	NC_008528	ATT	2	6	5022	5027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490131
108	NC_008528	A	6	6	5043	5048	100 %	0 %	0 %	0 %	116490131
109	NC_008528	GAT	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490131
110	NC_008528	GTG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490131
111	NC_008528	TCAA	2	8	5118	5125	50 %	25 %	0 %	25 %	116490131
112	NC_008528	CAG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116490131
113	NC_008528	ATC	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490131
114	NC_008528	ATG	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490131
115	NC_008528	ATA	2	6	5374	5379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490131
116	NC_008528	TCG	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490131
117	NC_008528	CGG	2	6	5432	5437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116490131
118	NC_008528	CAAG	2	8	5444	5451	50 %	0 %	25 %	25 %	116490131
119	NC_008528	GAA	2	6	5541	5546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490131
120	NC_008528	TTTA	2	8	5555	5562	25 %	75 %	0 %	0 %	116490131
121	NC_008528	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490131
122	NC_008528	ATT	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490131
123	NC_008528	AT	3	6	5693	5698	50 %	50 %	0 %	0 %	116490131
124	NC_008528	TTGA	2	8	5706	5713	25 %	50 %	25 %	0 %	116490131
125	NC_008528	TATATT	2	12	5721	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490131
126	NC_008528	ACC	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116490131
127	NC_008528	GT	3	6	5779	5784	0 %	50 %	50 %	0 %	116490131
128	NC_008528	TCG	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490131
129	NC_008528	TTG	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490131
130	NC_008528	TG	3	6	6053	6058	0 %	50 %	50 %	0 %	116490131
131	NC_008528	GAA	2	6	6077	6082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490132
132	NC_008528	AAC	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490132
133	NC_008528	TAAA	2	8	6126	6133	75 %	25 %	0 %	0 %	116490132
134	NC_008528	TCG	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490132
135	NC_008528	GCTATC	2	12	6378	6389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116490132
136	NC_008528	CAA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490132
137	NC_008528	ATG	2	6	6534	6539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490132
138	NC_008528	GTT	2	6	6557	6562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490132
139	NC_008528	TTTCCG	2	12	6861	6872	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116490132
140	NC_008528	AATT	2	8	6900	6907	50 %	50 %	0 %	0 %	116490132
141	NC_008528	AAG	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490132
142	NC_008528	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490132
143	NC_008528	GCCAAC	2	12	7016	7027	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116490132
144	NC_008528	TA	3	6	7044	7049	50 %	50 %	0 %	0 %	116490132
145	NC_008528	AACA	2	8	7050	7057	75 %	0 %	0 %	25 %	116490132
146	NC_008528	ATT	2	6	7166	7171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
147	NC_008528	AAAG	2	8	7195	7202	75 %	0 %	25 %	0 %	116490132
148	NC_008528	ATT	2	6	7262	7267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
149	NC_008528	TTA	2	6	7424	7429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
150	NC_008528	ATT	2	6	7484	7489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
151	NC_008528	AAAT	2	8	7513	7520	75 %	25 %	0 %	0 %	116490132
152	NC_008528	CGGA	2	8	7535	7542	25 %	0 %	50 %	25 %	116490132
153	NC_008528	TTC	2	6	7561	7566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490132
154	NC_008528	TGA	2	6	7588	7593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490132
155	NC_008528	AGA	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490132
156	NC_008528	AT	3	6	7627	7632	50 %	50 %	0 %	0 %	116490132
157	NC_008528	GTG	2	6	7671	7676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490132
158	NC_008528	GTG	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490132
159	NC_008528	GAAT	2	8	7692	7699	50 %	25 %	25 %	0 %	116490132
160	NC_008528	ATG	3	9	7704	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490132
161	NC_008528	TTC	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490132
162	NC_008528	TTA	2	6	7842	7847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
163	NC_008528	CCT	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116490132
164	NC_008528	CAAT	2	8	8010	8017	50 %	25 %	0 %	25 %	116490132
165	NC_008528	TTA	2	6	8048	8053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
166	NC_008528	GAAT	2	8	8160	8167	50 %	25 %	25 %	0 %	116490132
167	NC_008528	TGT	2	6	8185	8190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490132
168	NC_008528	ATT	2	6	8228	8233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490132
169	NC_008528	GAA	2	6	8267	8272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490132
170	NC_008528	TCGTGG	2	12	8281	8292	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116490132
171	NC_008528	GTT	2	6	8354	8359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490132
172	NC_008528	TGC	3	9	8413	8421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490132
173	NC_008528	CGGGC	2	10	8436	8445	0 %	0 %	60 %	40 %	116490132
174	NC_008528	AGA	3	9	8515	8523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490132
175	NC_008528	GAA	2	6	8525	8530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490132
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177	NC_008528	CAA	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490132
178	NC_008528	TGA	2	6	8581	8586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490132
179	NC_008528	A	6	6	8598	8603	100 %	0 %	0 %	0 %	116490132
180	NC_008528	A	6	6	8606	8611	100 %	0 %	0 %	0 %	116490132
181	NC_008528	GAT	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490132
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186	NC_008528	T	6	6	8872	8877	0 %	100 %	0 %	0 %	116490133
187	NC_008528	GAT	2	6	8930	8935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490133
188	NC_008528	AAGT	2	8	8997	9004	50 %	25 %	25 %	0 %	116490133
189	NC_008528	T	6	6	9049	9054	0 %	100 %	0 %	0 %	116490134
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193	NC_008528	CTT	2	6	9139	9144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490134
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198	NC_008528	ATC	2	6	9485	9490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116490134
199	NC_008528	GTT	2	6	9552	9557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490134
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201	NC_008528	CAA	2	6	9574	9579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490134
202	NC_008528	TCT	2	6	9600	9605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116490134
203	NC_008528	TGCT	2	8	9611	9618	0 %	50 %	25 %	25 %	116490134
204	NC_008528	ACC	2	6	9728	9733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116490134
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214	NC_008528	TGGCAT	2	12	10423	10434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116490135
215	NC_008528	GGT	2	6	10465	10470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116490135
216	NC_008528	AGC	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116490135
217	NC_008528	GAT	2	6	10627	10632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490135
218	NC_008528	GAT	2	6	10663	10668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116490135
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223	NC_008528	CCA	2	6	11130	11135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116490135
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232	NC_008528	GCT	2	6	12017	12022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490136
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236	NC_008528	CGAA	2	8	12243	12250	50 %	0 %	25 %	25 %	116490137
237	NC_008528	ATA	2	6	12392	12397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116490137
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239	NC_008528	ATT	2	6	12447	12452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490137
240	NC_008528	CGT	2	6	12478	12483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490137
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246	NC_008528	TCAAA	2	10	12740	12749	60 %	20 %	0 %	20 %	116490138
247	NC_008528	CGT	2	6	12824	12829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490138
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249	NC_008528	TAT	2	6	13009	13014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116490138
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253	NC_008528	GTTTT	2	10	13236	13245	0 %	80 %	20 %	0 %	116490139
254	NC_008528	T	6	6	13242	13247	0 %	100 %	0 %	0 %	116490139
255	NC_008528	TTG	2	6	13287	13292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490139
256	NC_008528	TC	3	6	13386	13391	0 %	50 %	0 %	50 %	116490139
257	NC_008528	GA	3	6	13446	13451	50 %	0 %	50 %	0 %	116490139
258	NC_008528	TTG	2	6	13472	13477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116490139
259	NC_008528	A	6	6	13508	13513	100 %	0 %	0 %	0 %	116490139
260	NC_008528	TCAA	2	8	13549	13556	50 %	25 %	0 %	25 %	116490139
261	NC_008528	CAA	2	6	13616	13621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116490139
262	NC_008528	ATTT	2	8	13634	13641	25 %	75 %	0 %	0 %	116490139
263	NC_008528	GTC	2	6	13689	13694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116490139
264	NC_008528	GAA	2	6	13727	13732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116490139
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266	NC_008528	CATT	2	8	13776	13783	25 %	50 %	0 %	25 %	116490139
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