MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Onion yellows phytoplasma OY-M

Total Repeats: 18998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005303	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
2	NC_005303	TAA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
3	NC_005303	AAT	2	6	27	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
4	NC_005303	TGA	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938487
5	NC_005303	A	7	7	94	100	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
6	NC_005303	GAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938487
7	NC_005303	A	6	6	116	121	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
8	NC_005303	TTA	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938487
9	NC_005303	AT	3	6	160	165	50 %	50 %	0 %	0 %	39938487
10	NC_005303	A	6	6	179	184	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
11	NC_005303	A	7	7	187	193	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
12	NC_005303	GAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938487
13	NC_005303	A	6	6	215	220	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
14	NC_005303	A	7	7	242	248	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
15	NC_005303	A	8	8	250	257	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
16	NC_005303	TGA	3	9	267	275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938487
17	NC_005303	A	7	7	275	281	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
18	NC_005303	AAT	2	6	346	351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
19	NC_005303	ATG	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938487
20	NC_005303	ATA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
21	NC_005303	TTGAAA	2	12	440	451	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	39938487
22	NC_005303	TAA	2	6	468	473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
23	NC_005303	TGT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39938487
24	NC_005303	TAA	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
25	NC_005303	A	7	7	559	565	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
26	NC_005303	GAA	2	6	571	576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938487
27	NC_005303	A	8	8	575	582	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
28	NC_005303	TA	3	6	599	604	50 %	50 %	0 %	0 %	39938487
29	NC_005303	A	7	7	667	673	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
30	NC_005303	A	6	6	685	690	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
31	NC_005303	GAA	2	6	721	726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938487
32	NC_005303	ACCA	2	8	730	737	50 %	0 %	0 %	50 %	39938487
33	NC_005303	GGA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39938487
34	NC_005303	TGA	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938487
35	NC_005303	T	6	6	847	852	0 %	100 %	0 %	0 %	39938487
36	NC_005303	ATT	2	6	855	860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938487
37	NC_005303	TTTA	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	39938487
38	NC_005303	A	6	6	924	929	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
39	NC_005303	TAT	2	6	930	935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938487
40	NC_005303	ATC	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39938487
41	NC_005303	A	7	7	1062	1068	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
42	NC_005303	TTGAT	2	10	1076	1085	20 %	60 %	20 %	0 %	39938487
43	NC_005303	CTT	3	9	1088	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39938487
44	NC_005303	TAA	2	6	1101	1106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
45	NC_005303	TTA	2	6	1129	1134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938487
46	NC_005303	TTG	2	6	1138	1143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39938487
47	NC_005303	TGATAT	2	12	1167	1178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	39938487
48	NC_005303	A	7	7	1219	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
49	NC_005303	ATG	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938487
50	NC_005303	A	6	6	1253	1258	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
51	NC_005303	GTT	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39938487
52	NC_005303	T	6	6	1278	1283	0 %	100 %	0 %	0 %	39938487
53	NC_005303	A	7	7	1312	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
54	NC_005303	ACA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39938487
55	NC_005303	TTG	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39938487
56	NC_005303	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	39938487
57	NC_005303	A	6	6	1445	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
58	NC_005303	A	8	8	1453	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
59	NC_005303	A	7	7	1482	1488	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
60	NC_005303	A	7	7	1507	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	39938487
61	NC_005303	TAA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938487
62	NC_005303	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938488
63	NC_005303	T	7	7	1856	1862	0 %	100 %	0 %	0 %	39938488
64	NC_005303	AAC	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39938488
65	NC_005303	A	6	6	1883	1888	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
66	NC_005303	A	6	6	1898	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
67	NC_005303	T	6	6	1905	1910	0 %	100 %	0 %	0 %	39938488
68	NC_005303	TAA	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938488
69	NC_005303	A	6	6	2023	2028	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
70	NC_005303	A	7	7	2074	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
71	NC_005303	TTAA	2	8	2092	2099	50 %	50 %	0 %	0 %	39938488
72	NC_005303	T	6	6	2121	2126	0 %	100 %	0 %	0 %	39938488
73	NC_005303	AAATTA	2	12	2155	2166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938488
74	NC_005303	T	6	6	2181	2186	0 %	100 %	0 %	0 %	39938488
75	NC_005303	TTTC	2	8	2198	2205	0 %	75 %	0 %	25 %	39938488
76	NC_005303	T	6	6	2238	2243	0 %	100 %	0 %	0 %	39938488
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78	NC_005303	AAAT	2	8	2261	2268	75 %	25 %	0 %	0 %	39938488
79	NC_005303	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
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81	NC_005303	A	9	9	2375	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
82	NC_005303	TAA	2	6	2427	2432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938488
83	NC_005303	AGA	2	6	2439	2444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938488
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86	NC_005303	GAT	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938488
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88	NC_005303	TTA	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938488
89	NC_005303	ATTT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	39938488
90	NC_005303	TCT	3	9	2731	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39938488
91	NC_005303	A	6	6	2765	2770	100 %	0 %	0 %	0 %	39938488
92	NC_005303	AGA	2	6	2829	2834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938488
93	NC_005303	AGT	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938488
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95	NC_005303	TAT	2	6	2898	2903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938488
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97	NC_005303	TGAT	2	8	2961	2968	25 %	50 %	25 %	0 %	39938488
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102	NC_005303	A	7	7	4629	4635	100 %	0 %	0 %	0 %	39938489
103	NC_005303	TAAA	2	8	4637	4644	75 %	25 %	0 %	0 %	39938489
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106	NC_005303	T	8	8	4695	4702	0 %	100 %	0 %	0 %	39938489
107	NC_005303	TA	3	6	4769	4774	50 %	50 %	0 %	0 %	39938489
108	NC_005303	AT	4	8	4837	4844	50 %	50 %	0 %	0 %	39938489
109	NC_005303	TCC	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39938489
110	NC_005303	ATG	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39938490
111	NC_005303	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938490
112	NC_005303	AATG	2	8	5073	5080	50 %	25 %	25 %	0 %	39938490
113	NC_005303	ATTTG	2	10	5094	5103	20 %	60 %	20 %	0 %	39938490
114	NC_005303	AGA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39938490
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120	NC_005303	CTA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39938491
121	NC_005303	AAT	2	6	5506	5511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938491
122	NC_005303	ATT	2	6	5516	5521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938491
123	NC_005303	TA	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	39938491
124	NC_005303	TGT	2	6	5537	5542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39938491
125	NC_005303	AAT	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938491
126	NC_005303	T	7	7	5624	5630	0 %	100 %	0 %	0 %	39938491
127	NC_005303	ATAAC	2	10	5644	5653	60 %	20 %	0 %	20 %	39938491
128	NC_005303	ATT	2	6	5683	5688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938491
129	NC_005303	TA	3	6	5709	5714	50 %	50 %	0 %	0 %	39938491
130	NC_005303	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	39938491
131	NC_005303	TAAA	2	8	5754	5761	75 %	25 %	0 %	0 %	39938491
132	NC_005303	A	6	6	5791	5796	100 %	0 %	0 %	0 %	39938491
133	NC_005303	TAAAA	2	10	5797	5806	80 %	20 %	0 %	0 %	39938491
134	NC_005303	AAT	2	6	5837	5842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938491
135	NC_005303	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39938491
136	NC_005303	T	7	7	5853	5859	0 %	100 %	0 %	0 %	39938491
137	NC_005303	TA	3	6	5871	5876	50 %	50 %	0 %	0 %	39938491
138	NC_005303	ACC	3	9	5898	5906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39938491
139	NC_005303	AGC	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39938491
140	NC_005303	ATATAA	2	12	5918	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39938491
141	NC_005303	ATTTAA	2	12	5980	5991	50 %	50 %	0 %	0 %	39938491
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143	NC_005303	TTC	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39938491
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