MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.04

Total Repeats: 1455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019764	CAA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019764	TCG	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019764	TTTC	2	8	515	522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019764	TC	3	6	626	631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019764	CTT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019764	TC	3	6	744	749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019764	T	6	6	784	789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019764	ACTC	2	8	808	815	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019764	A	6	6	822	827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019764	TGG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019764	AGC	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019764	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019764	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019764	GCT	2	6	1244	1249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019764	GGA	2	6	1253	1258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019764	T	6	6	1264	1269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019764	CG	3	6	1313	1318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019764	T	6	6	1377	1382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019764	CAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019764	TTGA	2	8	1544	1551	25 %	50 %	25 %	0 %	428315128
21	NC_019764	TGC	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
22	NC_019764	TGG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
23	NC_019764	ATG	2	6	1797	1802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315128
24	NC_019764	CTT	2	6	1876	1881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
25	NC_019764	AAGT	2	8	1890	1897	50 %	25 %	25 %	0 %	428315128
26	NC_019764	T	6	6	1917	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	428315128
27	NC_019764	GCAA	2	8	1939	1946	50 %	0 %	25 %	25 %	428315128
28	NC_019764	GCAG	2	8	1966	1973	25 %	0 %	50 %	25 %	428315128
29	NC_019764	TTCA	2	8	2009	2016	25 %	50 %	0 %	25 %	428315128
30	NC_019764	CTT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
31	NC_019764	GTA	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315128
32	NC_019764	GGT	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
33	NC_019764	CGTC	2	8	2252	2259	0 %	25 %	25 %	50 %	428315128
34	NC_019764	CTCGA	2	10	2393	2402	20 %	20 %	20 %	40 %	428315128
35	NC_019764	GTT	2	6	2441	2446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315128
36	NC_019764	TCG	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
37	NC_019764	TTG	2	6	2493	2498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315128
38	NC_019764	GAA	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315128
39	NC_019764	TCG	2	6	2523	2528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
40	NC_019764	CG	3	6	2545	2550	0 %	0 %	50 %	50 %	428315128
41	NC_019764	TTC	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
42	NC_019764	GGC	2	6	2640	2645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315128
43	NC_019764	CTT	2	6	2683	2688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
44	NC_019764	CTG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
45	NC_019764	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
46	NC_019764	CAA	2	6	2848	2853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315128
47	NC_019764	TCA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428315128
48	NC_019764	GCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315128
49	NC_019764	GCTTGC	2	12	2998	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
50	NC_019764	T	6	6	3031	3036	0 %	100 %	0 %	0 %	428315128
51	NC_019764	TCT	2	6	3143	3148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
52	NC_019764	GAG	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
53	NC_019764	CGAT	2	8	3183	3190	25 %	25 %	25 %	25 %	428315128
54	NC_019764	AT	3	6	3189	3194	50 %	50 %	0 %	0 %	428315128
55	NC_019764	GAG	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
56	NC_019764	TTTC	2	8	3208	3215	0 %	75 %	0 %	25 %	428315128
57	NC_019764	CGG	2	6	3233	3238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315128
58	NC_019764	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315128
59	NC_019764	CT	3	6	3279	3284	0 %	50 %	0 %	50 %	428315128
60	NC_019764	GCT	3	9	3316	3324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
61	NC_019764	G	6	6	3396	3401	0 %	0 %	100 %	0 %	428315128
62	NC_019764	CGG	3	9	3478	3486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315128
63	NC_019764	GCT	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315128
64	NC_019764	GTG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
65	NC_019764	CAC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315128
66	NC_019764	G	6	6	3721	3726	0 %	0 %	100 %	0 %	428315128
67	NC_019764	TCT	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
68	NC_019764	CAA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315128
69	NC_019764	GCA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315128
70	NC_019764	CCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315128
71	NC_019764	TTC	2	6	4004	4009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315128
72	NC_019764	AGG	2	6	4071	4076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
73	NC_019764	GC	3	6	4103	4108	0 %	0 %	50 %	50 %	428315128
74	NC_019764	GAG	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428315128
75	NC_019764	CCG	3	9	4191	4199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315128
76	NC_019764	GTG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315128
77	NC_019764	CCT	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019764	TCA	2	6	4661	4666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019764	AAG	2	6	4860	4865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315129
80	NC_019764	AGA	2	6	4909	4914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315129
81	NC_019764	TGG	2	6	4963	4968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315129
82	NC_019764	CTG	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315129
83	NC_019764	TTG	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315129
84	NC_019764	CG	3	6	5039	5044	0 %	0 %	50 %	50 %	428315129
85	NC_019764	TGC	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315129
86	NC_019764	GTA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315129
87	NC_019764	GCA	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019764	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315130
89	NC_019764	AT	3	6	5174	5179	50 %	50 %	0 %	0 %	428315130
90	NC_019764	AT	3	6	5182	5187	50 %	50 %	0 %	0 %	428315130
91	NC_019764	TTG	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315130
92	NC_019764	GTA	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315130
93	NC_019764	GTT	2	6	5402	5407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315130
94	NC_019764	TGT	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315130
95	NC_019764	AGCA	2	8	5481	5488	50 %	0 %	25 %	25 %	428315130
96	NC_019764	TCG	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315130
97	NC_019764	CCG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428315130
98	NC_019764	AAT	2	6	5562	5567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428315130
99	NC_019764	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315130
100	NC_019764	CGAT	2	8	5838	5845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019764	CTG	3	9	5888	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019764	ACCA	2	8	5955	5962	50 %	0 %	0 %	50 %	428315131
103	NC_019764	ACC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315131
104	NC_019764	A	6	6	6149	6154	100 %	0 %	0 %	0 %	428315131
105	NC_019764	GCG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428315131
106	NC_019764	TGC	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315131
107	NC_019764	GAT	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315131
108	NC_019764	CCA	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428315131
109	NC_019764	CTC	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428315131
110	NC_019764	GAA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315131
111	NC_019764	TATT	2	8	6405	6412	25 %	75 %	0 %	0 %	428315131
112	NC_019764	TGC	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315131
113	NC_019764	GC	3	6	6562	6567	0 %	0 %	50 %	50 %	428315131
114	NC_019764	TCGC	2	8	6570	6577	0 %	25 %	25 %	50 %	428315131
115	NC_019764	G	6	6	6587	6592	0 %	0 %	100 %	0 %	428315131
116	NC_019764	GCA	2	6	6675	6680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
117	NC_019764	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315131
118	NC_019764	ATT	2	6	6788	6793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428315131
119	NC_019764	AGT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315131
120	NC_019764	GA	3	6	6817	6822	50 %	0 %	50 %	0 %	428315131
121	NC_019764	TCGC	2	8	6896	6903	0 %	25 %	25 %	50 %	428315131
122	NC_019764	TGCT	2	8	7007	7014	0 %	50 %	25 %	25 %	428315131
123	NC_019764	CAA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315131
124	NC_019764	TCGA	2	8	7095	7102	25 %	25 %	25 %	25 %	428315131
125	NC_019764	AGT	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428315131
126	NC_019764	AGC	3	9	7162	7170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
127	NC_019764	CTG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315131
128	NC_019764	CGTG	2	8	7230	7237	0 %	25 %	50 %	25 %	428315131
129	NC_019764	AGAA	2	8	7246	7253	75 %	0 %	25 %	0 %	428315131
130	NC_019764	CAG	2	6	7343	7348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
131	NC_019764	AGC	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428315131
132	NC_019764	ATG	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019764	CTT	2	6	7475	7480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019764	CTG	3	9	7499	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019764	CGG	3	9	7521	7529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019764	GTT	2	6	7543	7548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019764	TGC	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019764	TACC	2	8	7612	7619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019764	CTG	3	9	7639	7647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019764	TTG	2	6	7680	7685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019764	CTA	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019764	TC	3	6	7778	7783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019764	GCT	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019764	CAG	2	6	7934	7939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019764	GCT	2	6	7991	7996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019764	TGA	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019764	ATT	2	6	8034	8039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019764	GGC	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019764	CAAG	2	8	8168	8175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019764	TTTG	2	8	8222	8229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019764	ACTCA	2	10	8295	8304	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_019764	TGC	2	6	8327	8332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019764	CTG	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019764	AGAT	2	8	8522	8529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019764	AGCAA	2	10	8583	8592	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_019764	TGA	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019764	CGC	2	6	8657	8662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_019764	T	6	6	8854	8859	0 %	100 %	0 %	0 %	428315132
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163	NC_019764	TCT	2	6	9247	9252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315132
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172	NC_019764	GA	3	6	9816	9821	50 %	0 %	50 %	0 %	428315132
173	NC_019764	AAC	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428315132
174	NC_019764	ATCG	2	8	9832	9839	25 %	25 %	25 %	25 %	428315132
175	NC_019764	GAA	2	6	9868	9873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428315132
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265	NC_019764	TGT	2	6	15187	15192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019764	T	6	6	15360	15365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019764	TACC	2	8	15458	15465	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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269	NC_019764	CTCC	2	8	15559	15566	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
270	NC_019764	A	7	7	15688	15694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019764	CAA	2	6	15733	15738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_019764	CTG	2	6	15789	15794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_019764	A	6	6	15824	15829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019764	TTGT	2	8	15860	15867	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019764	TTG	2	6	15929	15934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428315137
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289	NC_019764	AAC	2	6	16596	16601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_019764	GTT	2	6	16605	16610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_019764	CT	3	6	21685	21690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
394	NC_019764	CTT	2	6	21790	21795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428315141
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402	NC_019764	CTG	2	6	22149	22154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315141
403	NC_019764	TGC	2	6	22182	22187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428315141
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453	NC_019764	AGAA	2	8	24557	24564	75 %	0 %	25 %	0 %	428315142
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464	NC_019764	TGG	2	6	25155	25160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
465	NC_019764	AGT	2	6	25161	25166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_019764	TTCC	2	8	25215	25222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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470	NC_019764	CT	3	6	25324	25329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
471	NC_019764	TTTA	2	8	25336	25343	25 %	75 %	0 %	0 %	428315143
472	NC_019764	AGTTCT	2	12	25345	25356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428315143
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498	NC_019764	TGG	2	6	26453	26458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428315144
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