MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.01

Total Repeats: 5779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019763	TCA	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019763	TTG	2	6	58	63	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019763	AGTT	2	8	91	98	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019763	CTC	2	6	253	258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428320976
5	NC_019763	CTTCAG	2	12	282	293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428320976
6	NC_019763	CTGAAC	2	12	424	435	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428320976
7	NC_019763	A	7	7	460	466	100 %	0 %	0 %	0 %	428320976
8	NC_019763	TCTT	2	8	541	548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019763	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019763	AGG	2	6	594	599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019763	ATC	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320977
12	NC_019763	GATA	2	8	674	681	50 %	25 %	25 %	0 %	428320977
13	NC_019763	TGC	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320977
14	NC_019763	CAG	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320977
15	NC_019763	TCG	2	6	878	883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320977
16	NC_019763	ACA	2	6	968	973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320977
17	NC_019763	T	6	6	1008	1013	0 %	100 %	0 %	0 %	428320977
18	NC_019763	GCA	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320977
19	NC_019763	TAA	2	6	1094	1099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320977
20	NC_019763	TACC	2	8	1104	1111	25 %	25 %	0 %	50 %	428320977
21	NC_019763	GATG	2	8	1120	1127	25 %	25 %	50 %	0 %	428320977
22	NC_019763	GTA	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320977
23	NC_019763	CAAC	2	8	1354	1361	50 %	0 %	0 %	50 %	428320977
24	NC_019763	A	6	6	1362	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
25	NC_019763	CAGA	2	8	1388	1395	50 %	0 %	25 %	25 %	428320977
26	NC_019763	CAAAA	2	10	1409	1418	80 %	0 %	0 %	20 %	428320977
27	NC_019763	A	6	6	1434	1439	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
28	NC_019763	AGA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320977
29	NC_019763	GAT	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320977
30	NC_019763	TGA	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320977
31	NC_019763	A	6	6	1622	1627	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
32	NC_019763	A	6	6	1640	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	428320977
33	NC_019763	TG	3	6	1821	1826	0 %	50 %	50 %	0 %	428320977
34	NC_019763	CAC	2	6	1951	1956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320977
35	NC_019763	GTG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320977
36	NC_019763	GTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019763	ACT	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019763	GA	3	6	2085	2090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019763	TTG	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019763	CTG	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019763	GCT	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019763	GAC	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019763	ATT	2	6	2297	2302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019763	TAA	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019763	CTC	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019763	CGA	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019763	ATTA	2	8	2406	2413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019763	GGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019763	TAT	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320978
50	NC_019763	AAC	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320978
51	NC_019763	TGC	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320978
52	NC_019763	A	7	7	2635	2641	100 %	0 %	0 %	0 %	428320978
53	NC_019763	C	7	7	2645	2651	0 %	0 %	0 %	100 %	428320978
54	NC_019763	A	7	7	2676	2682	100 %	0 %	0 %	0 %	428320978
55	NC_019763	C	7	7	2686	2692	0 %	0 %	0 %	100 %	428320978
56	NC_019763	TAAT	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	428320978
57	NC_019763	TAA	2	6	2737	2742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320978
58	NC_019763	GTTGG	2	10	2767	2776	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019763	AG	3	6	2792	2797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019763	GCT	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320979
61	NC_019763	CTG	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320979
62	NC_019763	GAT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320979
63	NC_019763	TC	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	428320979
64	NC_019763	TGC	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320979
65	NC_019763	CGA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320979
66	NC_019763	CTAT	2	8	3273	3280	25 %	50 %	0 %	25 %	428320979
67	NC_019763	A	7	7	3281	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	428320979
68	NC_019763	TCAT	2	8	3320	3327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019763	AAG	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019763	A	6	6	3382	3387	100 %	0 %	0 %	0 %	428320980
71	NC_019763	GTG	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320980
72	NC_019763	GCA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320980
73	NC_019763	CCA	2	6	3589	3594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320980
74	NC_019763	A	6	6	3635	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	428320980
75	NC_019763	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320980
76	NC_019763	TTGAGG	2	12	3731	3742	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428320980
77	NC_019763	CAGA	2	8	3803	3810	50 %	0 %	25 %	25 %	428320980
78	NC_019763	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019763	GAG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019763	GCT	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320981
81	NC_019763	CTA	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320981
82	NC_019763	AGG	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320981
83	NC_019763	GCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320981
84	NC_019763	CAT	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320981
85	NC_019763	GGA	2	6	4178	4183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320981
86	NC_019763	AATC	2	8	4215	4222	50 %	25 %	0 %	25 %	428320981
87	NC_019763	A	6	6	4228	4233	100 %	0 %	0 %	0 %	428320981
88	NC_019763	TAA	2	6	4253	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320981
89	NC_019763	ACC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320981
90	NC_019763	ATCG	2	8	4310	4317	25 %	25 %	25 %	25 %	428320981
91	NC_019763	CACT	2	8	4366	4373	25 %	25 %	0 %	50 %	428320981
92	NC_019763	TGG	2	6	4381	4386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320981
93	NC_019763	CTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320981
94	NC_019763	CTA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019763	CGAT	2	8	4652	4659	25 %	25 %	25 %	25 %	428320982
96	NC_019763	AT	3	6	4680	4685	50 %	50 %	0 %	0 %	428320982
97	NC_019763	CTG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320982
98	NC_019763	GC	3	6	4812	4817	0 %	0 %	50 %	50 %	428320982
99	NC_019763	TGA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320982
100	NC_019763	CAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320982
101	NC_019763	CAC	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320982
102	NC_019763	AGC	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320982
103	NC_019763	TGC	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320982
104	NC_019763	GGC	2	6	5242	5247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320982
105	NC_019763	TTTA	2	8	5327	5334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019763	TGTC	2	8	5360	5367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019763	TG	3	6	5400	5405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019763	TTC	2	6	5409	5414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019763	GCA	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
110	NC_019763	TTG	2	6	5584	5589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320983
111	NC_019763	TA	3	6	5600	5605	50 %	50 %	0 %	0 %	428320983
112	NC_019763	GCC	2	6	5786	5791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320983
113	NC_019763	GTTT	2	8	5831	5838	0 %	75 %	25 %	0 %	428320983
114	NC_019763	ATT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320983
115	NC_019763	ATTG	2	8	5853	5860	25 %	50 %	25 %	0 %	428320983
116	NC_019763	ACC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320983
117	NC_019763	CTT	2	6	6146	6151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320983
118	NC_019763	CGA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
119	NC_019763	TGC	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320983
120	NC_019763	GCT	2	6	6208	6213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320983
121	NC_019763	CGAT	2	8	6287	6294	25 %	25 %	25 %	25 %	428320983
122	NC_019763	CGA	2	6	6304	6309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
123	NC_019763	TGC	3	9	6332	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320983
124	NC_019763	TGT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320983
125	NC_019763	GCA	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
126	NC_019763	AG	3	6	6445	6450	50 %	0 %	50 %	0 %	428320983
127	NC_019763	TAT	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320983
128	NC_019763	TAATT	2	10	6531	6540	40 %	60 %	0 %	0 %	428320983
129	NC_019763	TGG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320983
130	NC_019763	ATT	2	6	6583	6588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320983
131	NC_019763	GCA	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320983
132	NC_019763	GAAA	2	8	6829	6836	75 %	0 %	25 %	0 %	428320983
133	NC_019763	GCG	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320983
134	NC_019763	ATG	2	6	6851	6856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320983
135	NC_019763	GTG	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019763	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320984
137	NC_019763	CCG	2	6	6942	6947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320984
138	NC_019763	T	6	6	6963	6968	0 %	100 %	0 %	0 %	428320984
139	NC_019763	GGA	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320984
140	NC_019763	TGA	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320984
141	NC_019763	ATCT	2	8	7104	7111	25 %	50 %	0 %	25 %	428320984
142	NC_019763	ATC	2	6	7177	7182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320984
143	NC_019763	TAA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320984
144	NC_019763	AAAT	2	8	7416	7423	75 %	25 %	0 %	0 %	428320984
145	NC_019763	GAGAT	2	10	7491	7500	40 %	20 %	40 %	0 %	428320984
146	NC_019763	CTG	2	6	7524	7529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320984
147	NC_019763	GCT	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320984
148	NC_019763	CA	3	6	7716	7721	50 %	0 %	0 %	50 %	428320984
149	NC_019763	ACA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320984
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152	NC_019763	TTC	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320984
153	NC_019763	AGT	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320984
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155	NC_019763	CAC	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_019763	ATG	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019763	TAAC	2	8	8251	8258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_019763	GAA	2	6	8310	8315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019763	GTA	2	6	8318	8323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_019763	T	6	6	8451	8456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019763	T	6	6	8475	8480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019763	TTC	2	6	8549	8554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_019763	TTC	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_019763	ATT	2	6	8568	8573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019763	ATTAT	2	10	8612	8621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019763	ATT	2	6	8638	8643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019763	TTAA	2	8	8680	8687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019763	TCAA	2	8	8768	8775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_019763	TAA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019763	CCTT	3	12	8916	8927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_019763	TTC	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_019763	GCA	2	6	9002	9007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_019763	TGC	2	6	9207	9212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_019763	TGCT	2	8	9307	9314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_019763	CT	3	6	9428	9433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
178	NC_019763	ATT	2	6	9454	9459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019763	CGT	2	6	9470	9475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_019763	TTA	2	6	9562	9567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019763	TGCT	2	8	9578	9585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_019763	ATT	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019763	ATTT	2	8	9699	9706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019763	AG	3	6	9945	9950	50 %	0 %	50 %	0 %	428320985
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191	NC_019763	GTTG	2	8	10341	10348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_019763	TCA	2	6	14100	14105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_019763	GAT	2	6	14160	14165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019763	T	7	7	14183	14189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019763	GGT	2	6	14198	14203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019763	CTC	2	6	14229	14234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_019763	CTT	2	6	14237	14242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_019763	TGGA	2	8	14264	14271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019763	TGA	2	6	14321	14326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_019763	CG	3	6	14336	14341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_019763	TTGCT	2	10	14408	14417	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_019763	CCA	2	6	14496	14501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_019763	CCAAA	2	10	14528	14537	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_019763	CTT	2	6	14707	14712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320991
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398	NC_019763	AG	3	6	21174	21179	50 %	0 %	50 %	0 %	428320998
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