MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.05

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019732	GCC	2	6	1	6	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019732	CCCG	2	8	9	16	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019732	A	6	6	39	44	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019732	ATT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019732	CTGG	2	8	207	214	0 %	25 %	50 %	25 %	428320965
6	NC_019732	CAT	2	6	224	229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320965
7	NC_019732	A	6	6	337	342	100 %	0 %	0 %	0 %	428320965
8	NC_019732	CAC	2	6	369	374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320965
9	NC_019732	GAG	2	6	382	387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320965
10	NC_019732	CGAG	2	8	459	466	25 %	0 %	50 %	25 %	428320965
11	NC_019732	CAA	2	6	541	546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320965
12	NC_019732	CTG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320965
13	NC_019732	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320965
14	NC_019732	ATC	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320965
15	NC_019732	AGAGAA	2	12	760	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320965
16	NC_019732	GAG	2	6	781	786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320965
17	NC_019732	CGATCG	2	12	857	868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428320965
18	NC_019732	CAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320965
19	NC_019732	A	6	6	922	927	100 %	0 %	0 %	0 %	428320965
20	NC_019732	GGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320965
21	NC_019732	ACA	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320966
22	NC_019732	ACT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320966
23	NC_019732	T	6	6	1104	1109	0 %	100 %	0 %	0 %	428320966
24	NC_019732	TAA	2	6	1333	1338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019732	TC	3	6	1439	1444	0 %	50 %	0 %	50 %	428320967
26	NC_019732	GAC	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320967
27	NC_019732	CGCC	2	8	1478	1485	0 %	0 %	25 %	75 %	428320967
28	NC_019732	TTA	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320967
29	NC_019732	GGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320967
30	NC_019732	CGC	2	6	1699	1704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320968
31	NC_019732	CTG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320968
32	NC_019732	AGAC	2	8	1836	1843	50 %	0 %	25 %	25 %	428320968
33	NC_019732	GACAC	2	10	1891	1900	40 %	0 %	20 %	40 %	428320968
34	NC_019732	GACTG	2	10	1951	1960	20 %	20 %	40 %	20 %	428320968
35	NC_019732	GCC	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320968
36	NC_019732	CCA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320968
37	NC_019732	TCGCCC	2	12	2042	2053	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428320968
38	NC_019732	CGG	2	6	2060	2065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320968
39	NC_019732	GT	3	6	2066	2071	0 %	50 %	50 %	0 %	428320968
40	NC_019732	CTG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320968
41	NC_019732	ATTT	2	8	2114	2121	25 %	75 %	0 %	0 %	428320968
42	NC_019732	AAT	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428320968
43	NC_019732	GTG	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320969
44	NC_019732	CAAT	2	8	2195	2202	50 %	25 %	0 %	25 %	428320969
45	NC_019732	GGT	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320969
46	NC_019732	ATG	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320969
47	NC_019732	GCT	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320969
48	NC_019732	CGG	2	6	2281	2286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320969
49	NC_019732	GCA	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320969
50	NC_019732	CAT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320969
51	NC_019732	GAA	2	6	2373	2378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320969
52	NC_019732	GTG	2	6	2511	2516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320969
53	NC_019732	A	6	6	2686	2691	100 %	0 %	0 %	0 %	428320970
54	NC_019732	CT	3	6	2788	2793	0 %	50 %	0 %	50 %	428320970
55	NC_019732	TTG	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320970
56	NC_019732	TGA	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320970
57	NC_019732	AGG	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320970
58	NC_019732	T	6	6	2928	2933	0 %	100 %	0 %	0 %	428320971
59	NC_019732	GGTTGC	2	12	2937	2948	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428320971
60	NC_019732	CTG	2	6	2961	2966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320971
61	NC_019732	TGGT	2	8	3061	3068	0 %	50 %	50 %	0 %	428320971
62	NC_019732	GCA	3	9	3124	3132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320971
63	NC_019732	TGA	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320971
64	NC_019732	CT	3	6	3199	3204	0 %	50 %	0 %	50 %	428320972
65	NC_019732	GCTC	2	8	3206	3213	0 %	25 %	25 %	50 %	428320972
66	NC_019732	C	6	6	3213	3218	0 %	0 %	0 %	100 %	428320972
67	NC_019732	AAC	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320972
68	NC_019732	TGC	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320972
69	NC_019732	A	6	6	3351	3356	100 %	0 %	0 %	0 %	428320972
70	NC_019732	GAACA	2	10	3460	3469	60 %	0 %	20 %	20 %	428320972
71	NC_019732	GGT	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320972
72	NC_019732	A	6	6	3583	3588	100 %	0 %	0 %	0 %	428320972
73	NC_019732	AAG	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320972
74	NC_019732	GTA	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320972
75	NC_019732	TTA	2	6	3724	3729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428320972
76	NC_019732	AGG	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320972
77	NC_019732	AGGA	2	8	3742	3749	50 %	0 %	50 %	0 %	428320972
78	NC_019732	G	8	8	3764	3771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019732	GCCC	2	8	3783	3790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_019732	C	7	7	3788	3794	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_019732	A	7	7	3857	3863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019732	CAG	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019732	CTT	2	6	4003	4008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320973
84	NC_019732	TCG	2	6	4018	4023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320973
85	NC_019732	G	6	6	4046	4051	0 %	0 %	100 %	0 %	428320973
86	NC_019732	AATCA	2	10	4155	4164	60 %	20 %	0 %	20 %	428320973
87	NC_019732	TGG	3	9	4207	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428320973
88	NC_019732	ACCT	2	8	4351	4358	25 %	25 %	0 %	50 %	428320973
89	NC_019732	T	6	6	4403	4408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019732	A	6	6	4428	4433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019732	CTA	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019732	TAG	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320974
93	NC_019732	CTT	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428320974
94	NC_019732	TAC	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320974
95	NC_019732	CAA	2	6	4711	4716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320974
96	NC_019732	A	8	8	4715	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	428320974
97	NC_019732	CCCG	2	8	4759	4766	0 %	0 %	25 %	75 %	428320974
98	NC_019732	C	6	6	4775	4780	0 %	0 %	0 %	100 %	428320974
99	NC_019732	GTT	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428320974
100	NC_019732	TGA	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320974
101	NC_019732	AGG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320974
102	NC_019732	A	6	6	4939	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	428320974
103	NC_019732	GC	3	6	5162	5167	0 %	0 %	50 %	50 %	428320974
104	NC_019732	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320974
105	NC_019732	GA	3	6	5291	5296	50 %	0 %	50 %	0 %	428320974
106	NC_019732	TCAAA	2	10	5427	5436	60 %	20 %	0 %	20 %	428320974
107	NC_019732	AAG	2	6	5531	5536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320974
108	NC_019732	CCT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428320974
109	NC_019732	CT	3	6	5563	5568	0 %	50 %	0 %	50 %	428320974
110	NC_019732	C	6	6	5604	5609	0 %	0 %	0 %	100 %	428320974
111	NC_019732	GCC	2	6	5674	5679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428320974
112	NC_019732	CTC	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428320974
113	NC_019732	TCG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320974
114	NC_019732	A	8	8	5795	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	428320974
115	NC_019732	CAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320974
116	NC_019732	GACC	2	8	5827	5834	25 %	0 %	25 %	50 %	428320974
117	NC_019732	GA	3	6	5849	5854	50 %	0 %	50 %	0 %	428320974
118	NC_019732	GGAA	2	8	5861	5868	50 %	0 %	50 %	0 %	428320974
119	NC_019732	GAA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320974
120	NC_019732	ACA	2	6	5930	5935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428320974
121	NC_019732	ACC	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428320974
122	NC_019732	TGA	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320974
123	NC_019732	GTTT	2	8	6065	6072	0 %	75 %	25 %	0 %	428320974
124	NC_019732	TGA	3	9	6108	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320974
125	NC_019732	GCA	2	6	6146	6151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428320974
126	NC_019732	GCT	3	9	6192	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428320974
127	NC_019732	CT	3	6	6319	6324	0 %	50 %	0 %	50 %	428320974
128	NC_019732	GAG	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428320974
129	NC_019732	ATC	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320974
130	NC_019732	CTC	2	6	6588	6593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428320974
131	NC_019732	GCG	2	6	6616	6621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428320974
132	NC_019732	G	7	7	6735	6741	0 %	0 %	100 %	0 %	428320974
133	NC_019732	TTTAA	2	10	6877	6886	40 %	60 %	0 %	0 %	428320974
134	NC_019732	ACT	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320974
135	NC_019732	ATG	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428320974
136	NC_019732	TAC	2	6	7149	7154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320974
137	NC_019732	CTGGT	2	10	7198	7207	0 %	40 %	40 %	20 %	428320974
138	NC_019732	TAC	2	6	7216	7221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428320974
139	NC_019732	ACTT	2	8	7238	7245	25 %	50 %	0 %	25 %	428320974
140	NC_019732	TTGG	2	8	7305	7312	0 %	50 %	50 %	0 %	428320974
141	NC_019732	AGA	2	6	7361	7366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428320974
142	NC_019732	T	7	7	7448	7454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019732	AGC	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.