MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.02

Total Repeats: 4987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019730	T	6	6	36	41	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019730	A	6	6	53	58	100 %	0 %	0 %	0 %	428314828
3	NC_019730	ACAA	2	8	119	126	75 %	0 %	0 %	25 %	428314828
4	NC_019730	TC	3	6	128	133	0 %	50 %	0 %	50 %	428314828
5	NC_019730	GAA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314828
6	NC_019730	ATT	2	6	188	193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314828
7	NC_019730	GGA	2	6	211	216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314828
8	NC_019730	AGA	2	6	308	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314829
9	NC_019730	CTG	2	6	324	329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314829
10	NC_019730	CAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314829
11	NC_019730	GA	3	6	485	490	50 %	0 %	50 %	0 %	428314829
12	NC_019730	GCG	2	6	526	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314829
13	NC_019730	CCG	2	6	560	565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314829
14	NC_019730	TTGA	2	8	603	610	25 %	50 %	25 %	0 %	428314829
15	NC_019730	ACA	2	6	648	653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314829
16	NC_019730	GCTT	2	8	754	761	0 %	50 %	25 %	25 %	428314829
17	NC_019730	CT	3	6	779	784	0 %	50 %	0 %	50 %	428314829
18	NC_019730	TTC	2	6	812	817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314829
19	NC_019730	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	428314829
20	NC_019730	ATT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019730	GTTT	2	8	1041	1048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019730	TCGG	2	8	1070	1077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019730	AATC	2	8	1089	1096	50 %	25 %	0 %	25 %	428314830
24	NC_019730	TTC	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314830
25	NC_019730	AAC	2	6	1136	1141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314830
26	NC_019730	TAA	2	6	1158	1163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314830
27	NC_019730	CTG	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314830
28	NC_019730	ATCGCT	2	12	1240	1251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428314830
29	NC_019730	AAT	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314830
30	NC_019730	ACT	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314830
31	NC_019730	T	8	8	1308	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	428314830
32	NC_019730	CTT	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019730	TCT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019730	AAC	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019730	GAA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
36	NC_019730	TGAC	2	8	1585	1592	25 %	25 %	25 %	25 %	428314831
37	NC_019730	TGC	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
38	NC_019730	CT	3	6	1640	1645	0 %	50 %	0 %	50 %	428314831
39	NC_019730	GAA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
40	NC_019730	AGC	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
41	NC_019730	TTG	2	6	1951	1956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314831
42	NC_019730	CAA	2	6	2046	2051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314831
43	NC_019730	AGG	2	6	2054	2059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314831
44	NC_019730	AAG	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
45	NC_019730	ATC	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314831
46	NC_019730	AGC	2	6	2366	2371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
47	NC_019730	TAG	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314831
48	NC_019730	A	6	6	2478	2483	100 %	0 %	0 %	0 %	428314831
49	NC_019730	GCT	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
50	NC_019730	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
51	NC_019730	AGA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
52	NC_019730	CTC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314831
53	NC_019730	GTC	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
54	NC_019730	AAC	2	6	2641	2646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314831
55	NC_019730	TCA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314831
56	NC_019730	TTG	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314831
57	NC_019730	C	6	6	2746	2751	0 %	0 %	0 %	100 %	428314831
58	NC_019730	CCG	2	6	2813	2818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314831
59	NC_019730	ACA	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314831
60	NC_019730	GCA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
61	NC_019730	GA	3	6	3022	3027	50 %	0 %	50 %	0 %	428314831
62	NC_019730	CAAAA	2	10	3108	3117	80 %	0 %	0 %	20 %	428314831
63	NC_019730	CAG	3	9	3157	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
64	NC_019730	TCAA	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	428314831
65	NC_019730	CTT	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314831
66	NC_019730	ACC	3	9	3280	3288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314831
67	NC_019730	CTG	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
68	NC_019730	GAC	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
69	NC_019730	ATTGC	2	10	3412	3421	20 %	40 %	20 %	20 %	428314831
70	NC_019730	GCC	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314831
71	NC_019730	CGA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
72	NC_019730	GCG	3	9	3610	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314831
73	NC_019730	AAG	2	6	3634	3639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
74	NC_019730	GAA	2	6	3699	3704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
75	NC_019730	GCT	2	6	3714	3719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
76	NC_019730	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
77	NC_019730	GCA	2	6	3904	3909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
78	NC_019730	AAG	2	6	3927	3932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
79	NC_019730	TGG	2	6	4066	4071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314831
80	NC_019730	GAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314831
81	NC_019730	ACTTA	2	10	4123	4132	40 %	40 %	0 %	20 %	428314831
82	NC_019730	CTG	2	6	4183	4188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
83	NC_019730	AGC	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314831
84	NC_019730	AGCTG	2	10	4295	4304	20 %	20 %	40 %	20 %	428314831
85	NC_019730	TCC	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314831
86	NC_019730	AAAC	2	8	4763	4770	75 %	0 %	0 %	25 %	428314831
87	NC_019730	TGC	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
88	NC_019730	GA	3	6	4861	4866	50 %	0 %	50 %	0 %	428314831
89	NC_019730	TTA	2	6	4897	4902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314831
90	NC_019730	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314831
91	NC_019730	GCT	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314831
92	NC_019730	ACA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314831
93	NC_019730	AG	3	6	5037	5042	50 %	0 %	50 %	0 %	428314831
94	NC_019730	A	6	6	5074	5079	100 %	0 %	0 %	0 %	428314831
95	NC_019730	AGTT	2	8	5166	5173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019730	T	6	6	5172	5177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019730	TATT	2	8	5198	5205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019730	GAC	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019730	G	6	6	5278	5283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019730	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019730	T	6	6	5387	5392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019730	CGC	2	6	5507	5512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019730	CCGAAG	2	12	5543	5554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314832
104	NC_019730	AGA	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
105	NC_019730	GAA	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
106	NC_019730	ATG	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314832
107	NC_019730	GAC	2	6	5829	5834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314832
108	NC_019730	AAGA	2	8	5898	5905	75 %	0 %	25 %	0 %	428314832
109	NC_019730	GGA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314832
110	NC_019730	GAA	2	6	5931	5936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
111	NC_019730	TCTAAA	2	12	5946	5957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428314832
112	NC_019730	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
113	NC_019730	A	6	6	6051	6056	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
114	NC_019730	GGA	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314832
115	NC_019730	AAAAC	2	10	6103	6112	80 %	0 %	0 %	20 %	428314832
116	NC_019730	GGA	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314832
117	NC_019730	ACT	2	6	6155	6160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314832
118	NC_019730	GA	3	6	6191	6196	50 %	0 %	50 %	0 %	428314832
119	NC_019730	AACT	2	8	6199	6206	50 %	25 %	0 %	25 %	428314832
120	NC_019730	GAA	2	6	6303	6308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
121	NC_019730	GCAC	2	8	6378	6385	25 %	0 %	25 %	50 %	428314832
122	NC_019730	A	6	6	6426	6431	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
123	NC_019730	TGC	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314832
124	NC_019730	A	6	6	6573	6578	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
125	NC_019730	GCT	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314832
126	NC_019730	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	428314832
127	NC_019730	CAA	2	6	6899	6904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314832
128	NC_019730	A	6	6	6910	6915	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
129	NC_019730	GAA	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
130	NC_019730	AAAT	2	8	6967	6974	75 %	25 %	0 %	0 %	428314832
131	NC_019730	AGA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
132	NC_019730	A	6	6	7054	7059	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
133	NC_019730	A	6	6	7162	7167	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
134	NC_019730	AGC	3	9	7194	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314832
135	NC_019730	A	7	7	7218	7224	100 %	0 %	0 %	0 %	428314832
136	NC_019730	GCA	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314832
137	NC_019730	GAA	3	9	7299	7307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
138	NC_019730	GCATT	2	10	7321	7330	20 %	40 %	20 %	20 %	428314832
139	NC_019730	CTC	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314832
140	NC_019730	CAG	2	6	7432	7437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314832
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142	NC_019730	AGA	2	6	7496	7501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314832
143	NC_019730	CAA	2	6	7524	7529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314832
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149	NC_019730	T	6	6	7913	7918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019730	TACT	2	8	7992	7999	25 %	50 %	0 %	25 %	428314833
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159	NC_019730	GTT	2	6	8812	8817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019730	CTC	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_019730	CAG	2	6	9151	9156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314834
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168	NC_019730	TAT	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314834
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171	NC_019730	CTCCC	2	10	9535	9544	0 %	20 %	0 %	80 %	428314834
172	NC_019730	CTCCCC	2	12	9558	9569	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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182	NC_019730	TGAA	2	8	10116	10123	50 %	25 %	25 %	0 %	428314835
183	NC_019730	GGCT	2	8	10159	10166	0 %	25 %	50 %	25 %	428314835
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267	NC_019730	CT	4	8	13918	13925	0 %	50 %	0 %	50 %	428314837
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390	NC_019730	A	6	6	20159	20164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_019730	CAG	2	6	20212	20217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_019730	A	6	6	20272	20277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_019730	A	6	6	20319	20324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_019730	ACT	2	6	20356	20361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_019730	ACG	2	6	20378	20383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_019730	A	7	7	20397	20403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_019730	A	6	6	20415	20420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_019730	AT	3	6	20429	20434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_019730	CAA	2	6	20544	20549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_019730	A	6	6	20568	20573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_019730	AAAG	2	8	20849	20856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
402	NC_019730	GAATTA	2	12	20859	20870	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
403	NC_019730	C	6	6	20875	20880	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
404	NC_019730	CCA	2	6	20891	20896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
405	NC_019730	AGA	2	6	20984	20989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_019730	GCTATT	2	12	21038	21049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
408	NC_019730	T	6	6	21052	21057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_019730	T	6	6	21090	21095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_019730	GT	3	6	21096	21101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
412	NC_019730	ATT	2	6	21146	21151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_019730	GCT	2	6	21903	21908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_019730	TGG	2	6	21939	21944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_019730	TAT	2	6	22197	22202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_019730	CAG	2	6	22249	22254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_019730	GAA	2	6	22354	22359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_019730	GTC	2	6	22422	22427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_019730	TTCT	2	8	22609	22616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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