MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ornithobacterium rhinotracheale DSM 15997 chromosome

Total Repeats: 51287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018016	A	6	6	15	20	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018016	TAAA	2	8	21	28	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018016	A	6	6	26	31	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018016	T	8	8	47	54	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018016	T	6	6	63	68	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018016	A	8	8	137	144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018016	TTA	2	6	191	196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389425
8	NC_018016	ACA	2	6	200	205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392389425
9	NC_018016	TAT	2	6	304	309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389425
10	NC_018016	GAG	2	6	319	324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392389425
11	NC_018016	CTAAA	2	10	377	386	60 %	20 %	0 %	20 %	392389425
12	NC_018016	TGG	2	6	398	403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392389425
13	NC_018016	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392389425
14	NC_018016	GAA	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392389425
15	NC_018016	TAA	2	6	585	590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389425
16	NC_018016	TTCA	2	8	592	599	25 %	50 %	0 %	25 %	392389425
17	NC_018016	TAA	2	6	609	614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389425
18	NC_018016	A	6	6	645	650	100 %	0 %	0 %	0 %	392389425
19	NC_018016	TTAT	2	8	676	683	25 %	75 %	0 %	0 %	392389425
20	NC_018016	ATC	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389425
21	NC_018016	A	6	6	758	763	100 %	0 %	0 %	0 %	392389425
22	NC_018016	AAT	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389425
23	NC_018016	GAT	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389425
24	NC_018016	A	6	6	901	906	100 %	0 %	0 %	0 %	392389425
25	NC_018016	TTC	2	6	922	927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389425
26	NC_018016	TGA	2	6	936	941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389425
27	NC_018016	CGT	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392389425
28	NC_018016	GCC	2	6	984	989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392389425
29	NC_018016	GATT	2	8	1016	1023	25 %	50 %	25 %	0 %	392389425
30	NC_018016	CTG	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392389425
31	NC_018016	GAAA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	25 %	0 %	392389425
32	NC_018016	AAAC	2	8	1163	1170	75 %	0 %	0 %	25 %	392389425
33	NC_018016	AAGA	2	8	1225	1232	75 %	0 %	25 %	0 %	392389425
34	NC_018016	GATT	2	8	1299	1306	25 %	50 %	25 %	0 %	392389425
35	NC_018016	GTG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392389425
36	NC_018016	TG	3	6	1322	1327	0 %	50 %	50 %	0 %	392389425
37	NC_018016	ATT	2	6	1328	1333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389425
38	NC_018016	AAGA	2	8	1368	1375	75 %	0 %	25 %	0 %	392389425
39	NC_018016	A	6	6	1506	1511	100 %	0 %	0 %	0 %	392389425
40	NC_018016	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392389425
41	NC_018016	AAT	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389425
42	NC_018016	TGA	2	6	1814	1819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389426
43	NC_018016	ACA	2	6	1873	1878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392389426
44	NC_018016	ATTGA	2	10	1893	1902	40 %	40 %	20 %	0 %	392389426
45	NC_018016	CTA	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389426
46	NC_018016	GCCTT	2	10	2049	2058	0 %	40 %	20 %	40 %	392389427
47	NC_018016	CGCAAG	2	12	2090	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389427
48	NC_018016	ACC	2	6	2106	2111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392389427
49	NC_018016	GAG	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392389427
50	NC_018016	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389427
51	NC_018016	A	8	8	2201	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	392389427
52	NC_018016	TAAA	2	8	2234	2241	75 %	25 %	0 %	0 %	392389427
53	NC_018016	CTT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389427
54	NC_018016	AGGA	2	8	2285	2292	50 %	0 %	50 %	0 %	392389427
55	NC_018016	AGC	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389427
56	NC_018016	GTT	2	6	2386	2391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392389427
57	NC_018016	TGG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392389427
58	NC_018016	TCT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389427
59	NC_018016	ACTTTT	2	12	2452	2463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392389427
60	NC_018016	AG	3	6	2486	2491	50 %	0 %	50 %	0 %	392389427
61	NC_018016	CGC	2	6	2494	2499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392389427
62	NC_018016	A	7	7	2536	2542	100 %	0 %	0 %	0 %	392389427
63	NC_018016	TG	3	6	2629	2634	0 %	50 %	50 %	0 %	392389427
64	NC_018016	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	392389427
65	NC_018016	A	8	8	2696	2703	100 %	0 %	0 %	0 %	392389427
66	NC_018016	ATT	2	6	2734	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389427
67	NC_018016	ATT	2	6	2755	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389428
68	NC_018016	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392389428
69	NC_018016	TGA	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389428
70	NC_018016	TTC	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389428
71	NC_018016	CAG	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389428
72	NC_018016	ACC	2	6	2888	2893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392389428
73	NC_018016	ACGCA	2	10	2957	2966	40 %	0 %	20 %	40 %	392389428
74	NC_018016	GTT	2	6	2978	2983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392389428
75	NC_018016	TGTT	2	8	2989	2996	0 %	75 %	25 %	0 %	392389428
76	NC_018016	CTA	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389428
77	NC_018016	CAT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389428
78	NC_018016	TGA	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389428
79	NC_018016	TA	3	6	3124	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	392389428
80	NC_018016	TGT	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392389428
81	NC_018016	TTGAAC	2	12	3167	3178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392389428
82	NC_018016	TTC	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389428
83	NC_018016	AGTTA	2	10	3215	3224	40 %	40 %	20 %	0 %	392389428
84	NC_018016	TTTG	2	8	3287	3294	0 %	75 %	25 %	0 %	392389428
85	NC_018016	CTTTG	2	10	3397	3406	0 %	60 %	20 %	20 %	392389428
86	NC_018016	AGC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389428
87	NC_018016	ATC	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389428
88	NC_018016	TCA	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389428
89	NC_018016	CAGC	2	8	3550	3557	25 %	0 %	25 %	50 %	392389428
90	NC_018016	T	7	7	3574	3580	0 %	100 %	0 %	0 %	392389428
91	NC_018016	TAATT	2	10	3602	3611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018016	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018016	T	6	6	3643	3648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018016	T	6	6	3681	3686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018016	AGAA	2	8	3740	3747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018016	AG	3	6	3791	3796	50 %	0 %	50 %	0 %	392389429
97	NC_018016	A	6	6	3883	3888	100 %	0 %	0 %	0 %	392389429
98	NC_018016	GAG	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392389429
99	NC_018016	GGA	3	9	3913	3921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392389429
100	NC_018016	GTT	2	6	3925	3930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392389429
101	NC_018016	TG	3	6	3956	3961	0 %	50 %	50 %	0 %	392389429
102	NC_018016	GGC	2	6	4033	4038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392389429
103	NC_018016	GGGC	2	8	4063	4070	0 %	0 %	75 %	25 %	392389429
104	NC_018016	GGAA	2	8	4198	4205	50 %	0 %	50 %	0 %	392389429
105	NC_018016	ATC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389429
106	NC_018016	AT	3	6	4243	4248	50 %	50 %	0 %	0 %	392389430
107	NC_018016	ATG	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389430
108	NC_018016	GCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389430
109	NC_018016	TTTAAA	2	12	4465	4476	50 %	50 %	0 %	0 %	392389430
110	NC_018016	T	6	6	4490	4495	0 %	100 %	0 %	0 %	392389430
111	NC_018016	GGT	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392389430
112	NC_018016	ATTT	2	8	4672	4679	25 %	75 %	0 %	0 %	392389430
113	NC_018016	AGA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392389430
114	NC_018016	ATT	2	6	4741	4746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389430
115	NC_018016	CAT	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389430
116	NC_018016	TTGGC	2	10	4797	4806	0 %	40 %	40 %	20 %	392389430
117	NC_018016	TTTA	2	8	4862	4869	25 %	75 %	0 %	0 %	392389430
118	NC_018016	GA	3	6	4879	4884	50 %	0 %	50 %	0 %	392389430
119	NC_018016	TTC	2	6	4902	4907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389430
120	NC_018016	TAA	2	6	4915	4920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389430
121	NC_018016	GAC	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389430
122	NC_018016	ATT	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392389430
123	NC_018016	GCA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389430
124	NC_018016	GTA	2	6	5018	5023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389430
125	NC_018016	TATT	2	8	5033	5040	25 %	75 %	0 %	0 %	392389430
126	NC_018016	AAAC	2	8	5045	5052	75 %	0 %	0 %	25 %	392389430
127	NC_018016	CA	4	8	5094	5101	50 %	0 %	0 %	50 %	392389431
128	NC_018016	A	6	6	5126	5131	100 %	0 %	0 %	0 %	392389431
129	NC_018016	GAA	2	6	5188	5193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392389431
130	NC_018016	ATA	2	6	5357	5362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389431
131	NC_018016	TA	3	6	5432	5437	50 %	50 %	0 %	0 %	392389431
132	NC_018016	A	7	7	5447	5453	100 %	0 %	0 %	0 %	392389431
133	NC_018016	AAAAT	2	10	5582	5591	80 %	20 %	0 %	0 %	392389431
134	NC_018016	A	7	7	5622	5628	100 %	0 %	0 %	0 %	392389431
135	NC_018016	T	7	7	5655	5661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018016	A	7	7	5702	5708	100 %	0 %	0 %	0 %	392389432
137	NC_018016	A	6	6	5750	5755	100 %	0 %	0 %	0 %	392389432
138	NC_018016	CAG	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392389432
139	NC_018016	CTC	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392389432
140	NC_018016	GAT	3	9	5855	5863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389432
141	NC_018016	ATG	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389432
142	NC_018016	TGA	2	6	5995	6000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389432
143	NC_018016	GGA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392389432
144	NC_018016	CTG	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392389432
145	NC_018016	A	6	6	6177	6182	100 %	0 %	0 %	0 %	392389432
146	NC_018016	CTG	2	6	6186	6191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392389432
147	NC_018016	AGAT	2	8	6241	6248	50 %	25 %	25 %	0 %	392389432
148	NC_018016	TG	3	6	6304	6309	0 %	50 %	50 %	0 %	392389432
149	NC_018016	GTT	2	6	6341	6346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392389432
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151	NC_018016	A	6	6	6378	6383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018016	TTTTTA	2	12	6408	6419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018016	ACC	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392389433
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155	NC_018016	CTT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389433
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162	NC_018016	T	6	6	6921	6926	0 %	100 %	0 %	0 %	392389433
163	NC_018016	TGC	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392389433
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175	NC_018016	TCTT	2	8	7716	7723	0 %	75 %	0 %	25 %	392389433
176	NC_018016	T	6	6	7746	7751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_018016	TTGAA	2	10	7787	7796	40 %	40 %	20 %	0 %	392389434
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181	NC_018016	ATA	2	6	7881	7886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389434
182	NC_018016	AAT	2	6	7918	7923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389434
183	NC_018016	AGT	2	6	7989	7994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389434
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185	NC_018016	AT	3	6	8081	8086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_018016	AAAT	2	8	8160	8167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018016	AT	3	6	8227	8232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018016	T	7	7	8242	8248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_018016	CTTA	2	8	8280	8287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_018016	AT	3	6	8373	8378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_018016	GA	3	6	10820	10825	50 %	0 %	50 %	0 %	392389435
242	NC_018016	TTA	2	6	10891	10896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_018016	A	6	6	10981	10986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_018016	TAAA	2	8	11002	11009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_018016	T	6	6	11031	11036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_018016	A	6	6	11042	11047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_018016	A	6	6	11052	11057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_018016	TTA	2	6	11081	11086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_018016	T	8	8	11217	11224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018016	TGA	2	6	11243	11248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018016	ATT	2	6	11281	11286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018016	A	9	9	11288	11296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018016	ATTTT	2	10	11326	11335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_018016	ACTT	2	8	11560	11567	25 %	50 %	0 %	25 %	392389436
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270	NC_018016	GGTA	2	8	11827	11834	25 %	25 %	50 %	0 %	392389436
271	NC_018016	T	6	6	11902	11907	0 %	100 %	0 %	0 %	392389436
272	NC_018016	AGT	2	6	11922	11927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392389436
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410	NC_018016	GCG	2	6	18307	18312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392389442
411	NC_018016	ACA	2	6	18346	18351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392389442
412	NC_018016	T	6	6	18391	18396	0 %	100 %	0 %	0 %	392389443
413	NC_018016	ATTA	2	8	18482	18489	50 %	50 %	0 %	0 %	392389443
414	NC_018016	T	6	6	18490	18495	0 %	100 %	0 %	0 %	392389443
415	NC_018016	GGT	2	6	18551	18556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392389443
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432	NC_018016	T	7	7	19495	19501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_018016	A	6	6	19528	19533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_018016	TTTA	2	8	19562	19569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018016	AAATC	2	10	19576	19585	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
436	NC_018016	ACT	2	6	19617	19622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392389444
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441	NC_018016	CTG	2	6	20036	20041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392389444
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452	NC_018016	TTTG	2	8	20291	20298	0 %	75 %	25 %	0 %	392389444
453	NC_018016	CTT	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392389444
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457	NC_018016	A	6	6	20462	20467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_018016	TTTTTG	2	12	20517	20528	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_018016	A	6	6	20580	20585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_018016	A	8	8	20603	20610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_018016	ATGT	2	8	20670	20677	25 %	50 %	25 %	0 %	392389445
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465	NC_018016	GA	3	6	20742	20747	50 %	0 %	50 %	0 %	392389445
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482	NC_018016	AAT	2	6	21605	21610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392389445
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484	NC_018016	T	6	6	21682	21687	0 %	100 %	0 %	0 %	392389446
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491	NC_018016	AG	3	6	21973	21978	50 %	0 %	50 %	0 %	392389446
492	NC_018016	CATTT	2	10	21983	21992	20 %	60 %	0 %	20 %	392389446
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495	NC_018016	CAA	2	6	22049	22054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392389446
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500	NC_018016	TTTGTC	2	12	22205	22216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	392389446

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