MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oceanimonas sp. GK1 plasmid pOCEGK02

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016747	CGTA	2	8	37	44	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016747	CAG	2	6	86	91	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016747	A	6	6	136	141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016747	ACC	2	6	173	178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016747	AGC	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337040
6	NC_016747	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337040
7	NC_016747	ACT	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337040
8	NC_016747	GCC	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337040
9	NC_016747	GAA	2	6	359	364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374337040
10	NC_016747	A	6	6	363	368	100 %	0 %	0 %	0 %	374337040
11	NC_016747	A	7	7	444	450	100 %	0 %	0 %	0 %	374337041
12	NC_016747	AGCG	2	8	489	496	25 %	0 %	50 %	25 %	374337041
13	NC_016747	CCG	2	6	505	510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337041
14	NC_016747	CG	3	6	517	522	0 %	0 %	50 %	50 %	374337041
15	NC_016747	GAC	2	6	606	611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337041
16	NC_016747	TGGGG	2	10	694	703	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016747	G	6	6	740	745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016747	CGC	2	6	765	770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016747	CGG	2	6	877	882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337042
20	NC_016747	CCT	2	6	906	911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374337042
21	NC_016747	GCC	2	6	917	922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337042
22	NC_016747	CAC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374337042
23	NC_016747	CGC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337042
24	NC_016747	GCC	2	6	1211	1216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337042
25	NC_016747	CCTTGG	2	12	1281	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337042
26	NC_016747	GCG	2	6	1508	1513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337042
27	NC_016747	CCCGA	2	10	1582	1591	20 %	0 %	20 %	60 %	374337042
28	NC_016747	GAC	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337042
29	NC_016747	GCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337042
30	NC_016747	CCG	2	6	2025	2030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337042
31	NC_016747	G	6	6	2069	2074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016747	GTTC	2	8	2163	2170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016747	GCC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016747	GGAC	2	8	2263	2270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016747	CT	3	6	2301	2306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016747	GAAAA	2	10	2323	2332	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016747	CCT	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016747	GAT	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016747	TGC	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016747	AC	3	6	2495	2500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016747	CTG	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016747	AG	3	6	2562	2567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016747	TGGT	2	8	2575	2582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016747	CCGA	2	8	2683	2690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016747	AGG	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016747	AAC	2	6	2706	2711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016747	AATCC	2	10	2718	2727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016747	A	6	6	2909	2914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016747	T	7	7	2931	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016747	CAG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016747	GAAC	2	8	3018	3025	50 %	0 %	25 %	25 %	374337043
52	NC_016747	TAT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374337043
53	NC_016747	AAT	2	6	3147	3152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374337043
54	NC_016747	TCT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374337043
55	NC_016747	ATA	2	6	3361	3366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374337043
56	NC_016747	TAA	2	6	3377	3382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374337043
57	NC_016747	AACA	2	8	3393	3400	75 %	0 %	0 %	25 %	374337043
58	NC_016747	AT	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	374337043
59	NC_016747	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337043
60	NC_016747	GAC	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337043
61	NC_016747	CAT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337043
62	NC_016747	CGA	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337043
63	NC_016747	CCT	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374337043
64	NC_016747	TGA	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337043
65	NC_016747	CA	3	6	3640	3645	50 %	0 %	0 %	50 %	374337043
66	NC_016747	CAT	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016747	ACC	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016747	CCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016747	AGA	2	6	3903	3908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016747	ATG	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016747	TCA	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016747	CAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016747	ATCTC	2	10	4035	4044	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016747	TAT	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016747	TTC	2	6	4095	4100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.