MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oceanimonas sp. GK1 plasmid pOCEGK01

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016746	ATC	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016746	CAG	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016746	CCTG	2	8	154	161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016746	CCTC	2	8	202	209	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_016746	CCG	2	6	247	252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016746	CAG	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016746	CGT	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016746	TGGG	2	8	369	376	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016746	GTAG	2	8	433	440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016746	TGA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016746	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016746	A	6	6	637	642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016746	GCT	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016746	GCC	2	6	717	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016746	TGA	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016746	GCT	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016746	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016746	CCT	2	6	837	842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016746	GGC	2	6	925	930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016746	T	7	7	1016	1022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016746	CGG	2	6	1028	1033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016746	A	6	6	1044	1049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016746	GGT	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016746	ATT	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374337030
25	NC_016746	CCA	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374337030
26	NC_016746	AC	3	6	1487	1492	50 %	0 %	0 %	50 %	374337030
27	NC_016746	GGT	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337030
28	NC_016746	CCTG	2	8	1599	1606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016746	GCC	2	6	1607	1612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016746	GAC	2	6	1643	1648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016746	GGC	2	6	1657	1662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016746	CG	3	6	1779	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016746	TC	3	6	1786	1791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016746	C	9	9	1890	1898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_016746	CAAAC	2	10	2077	2086	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016746	ATC	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016746	AAC	2	6	2144	2149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016746	CAC	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016746	GCCG	2	8	2424	2431	0 %	0 %	50 %	50 %	374337031
40	NC_016746	GCCA	2	8	2451	2458	25 %	0 %	25 %	50 %	374337031
41	NC_016746	A	6	6	2458	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	374337031
42	NC_016746	CAG	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337031
43	NC_016746	TGC	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337031
44	NC_016746	TGC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337031
45	NC_016746	GCC	2	6	2898	2903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337031
46	NC_016746	A	6	6	2916	2921	100 %	0 %	0 %	0 %	374337031
47	NC_016746	AGG	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374337031
48	NC_016746	AACG	2	8	2982	2989	50 %	0 %	25 %	25 %	374337031
49	NC_016746	TTG	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374337031
50	NC_016746	C	6	6	3047	3052	0 %	0 %	0 %	100 %	374337031
51	NC_016746	CTG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337031
52	NC_016746	G	6	6	3303	3308	0 %	0 %	100 %	0 %	374337031
53	NC_016746	CCG	2	6	3379	3384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016746	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016746	CT	3	6	3442	3447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016746	GTA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016746	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016746	ACA	2	6	3652	3657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016746	CTTCG	2	10	3692	3701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016746	CTC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016746	TAT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016746	T	7	7	3740	3746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016746	C	7	7	3769	3775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_016746	TAT	2	6	3784	3789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016746	ACA	2	6	3860	3865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016746	ACAT	2	8	3926	3933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016746	TAG	2	6	3947	3952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016746	TTA	2	6	4051	4056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016746	CGC	2	6	4165	4170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337032
70	NC_016746	T	6	6	4231	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	374337032
71	NC_016746	CCA	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374337032
72	NC_016746	CCCT	3	12	4263	4274	0 %	25 %	0 %	75 %	374337032
73	NC_016746	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337032
74	NC_016746	CGG	2	6	4425	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337032
75	NC_016746	GCG	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337032
76	NC_016746	ACCTGC	2	12	4616	4627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374337032
77	NC_016746	GCC	2	6	4660	4665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337032
78	NC_016746	GCG	2	6	4712	4717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374337032
79	NC_016746	TCG	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337032
80	NC_016746	ACC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016746	TTC	2	6	5268	5273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016746	ATTC	2	8	5283	5290	25 %	50 %	0 %	25 %	374337033
83	NC_016746	ATC	2	6	5319	5324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337033
84	NC_016746	ACCA	2	8	5420	5427	50 %	0 %	0 %	50 %	374337033
85	NC_016746	GCA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337033
86	NC_016746	CCTA	2	8	5474	5481	25 %	25 %	0 %	50 %	374337033
87	NC_016746	GTC	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337033
88	NC_016746	TAG	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337033
89	NC_016746	GCACA	2	10	5636	5645	40 %	0 %	20 %	40 %	374337033
90	NC_016746	CCAG	2	8	5692	5699	25 %	0 %	25 %	50 %	374337033
91	NC_016746	GTG	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337033
92	NC_016746	CGT	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337034
93	NC_016746	ATG	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337034
94	NC_016746	GCT	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337034
95	NC_016746	TCAA	2	8	5984	5991	50 %	25 %	0 %	25 %	374337034
96	NC_016746	TCA	3	9	5999	6007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337034
97	NC_016746	AGCA	2	8	6136	6143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016746	A	6	6	6151	6156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016746	CTG	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016746	T	6	6	6215	6220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016746	AATTT	2	10	6233	6242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016746	TC	3	6	6244	6249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016746	ATC	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337035
104	NC_016746	CTG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337035
105	NC_016746	ACA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374337035
106	NC_016746	GCC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
107	NC_016746	TGC	3	9	6357	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337035
108	NC_016746	GTA	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374337035
109	NC_016746	GCC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
110	NC_016746	GCTC	2	8	6536	6543	0 %	25 %	25 %	50 %	374337035
111	NC_016746	CAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337035
112	NC_016746	GCC	2	6	6554	6559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
113	NC_016746	GCC	3	9	6605	6613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337035
114	NC_016746	GGT	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337035
115	NC_016746	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374337035
116	NC_016746	GCT	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337035
117	NC_016746	GCC	2	6	7045	7050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337036
118	NC_016746	CGA	2	6	7068	7073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337036
119	NC_016746	GA	3	6	7077	7082	50 %	0 %	50 %	0 %	374337036
120	NC_016746	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337037
121	NC_016746	TCT	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374337037
122	NC_016746	GGT	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374337037
123	NC_016746	CAGA	2	8	7371	7378	50 %	0 %	25 %	25 %	374337037
124	NC_016746	GCA	2	6	7384	7389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374337037
125	NC_016746	TCGTA	2	10	7409	7418	20 %	40 %	20 %	20 %	374337038
126	NC_016746	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374337038
127	NC_016746	TCG	2	6	7485	7490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374337038
128	NC_016746	C	6	6	7502	7507	0 %	0 %	0 %	100 %	374337038
129	NC_016746	GCCT	2	8	7563	7570	0 %	25 %	25 %	50 %	374337038
130	NC_016746	GGCTG	2	10	7668	7677	0 %	20 %	60 %	20 %	374337038
131	NC_016746	GCC	2	6	7702	7707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374337038
132	NC_016746	GGCA	2	8	7755	7762	25 %	0 %	50 %	25 %	374337038
133	NC_016746	AG	3	6	7902	7907	50 %	0 %	50 %	0 %	374337038
134	NC_016746	A	6	6	8074	8079	100 %	0 %	0 %	0 %	374337038
135	NC_016746	TGCT	2	8	8105	8112	0 %	50 %	25 %	25 %	374337038
136	NC_016746	AAC	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374337038
137	NC_016746	A	6	6	8142	8147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016746	GAA	2	6	8219	8224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016746	ACT	2	6	8243	8248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016746	A	7	7	8315	8321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016746	GAT	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016746	GCCG	2	8	8389	8396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.