MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Oligotropha carboxidovorans OM5 plasmid pOC167

Total Repeats: 3710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015685	AGC	2	6	112	117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738958
2	NC_015685	ACCGG	2	10	132	141	20 %	0 %	40 %	40 %	337738958
3	NC_015685	CT	3	6	154	159	0 %	50 %	0 %	50 %	337738958
4	NC_015685	TCT	2	6	187	192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738958
5	NC_015685	GC	3	6	220	225	0 %	0 %	50 %	50 %	337738958
6	NC_015685	CCG	2	6	230	235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738958
7	NC_015685	AGC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738958
8	NC_015685	TC	3	6	316	321	0 %	50 %	0 %	50 %	337738958
9	NC_015685	AGA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738958
10	NC_015685	GCC	2	6	366	371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738958
11	NC_015685	CGG	2	6	443	448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738958
12	NC_015685	GGC	2	6	491	496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738958
13	NC_015685	CCG	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738958
14	NC_015685	ACG	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738958
15	NC_015685	GC	3	6	671	676	0 %	0 %	50 %	50 %	337738958
16	NC_015685	ATC	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738958
17	NC_015685	T	7	7	812	818	0 %	100 %	0 %	0 %	337738958
18	NC_015685	CGT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738958
19	NC_015685	TG	3	6	915	920	0 %	50 %	50 %	0 %	337738958
20	NC_015685	ATCC	2	8	944	951	25 %	25 %	0 %	50 %	337738958
21	NC_015685	TCT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738958
22	NC_015685	TGT	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738958
23	NC_015685	CGG	2	6	1027	1032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738958
24	NC_015685	TTTC	2	8	1048	1055	0 %	75 %	0 %	25 %	337738958
25	NC_015685	ACGG	2	8	1082	1089	25 %	0 %	50 %	25 %	337738958
26	NC_015685	CAAA	2	8	1192	1199	75 %	0 %	0 %	25 %	337738958
27	NC_015685	ATG	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738959
28	NC_015685	CAT	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738959
29	NC_015685	TGA	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738959
30	NC_015685	CT	4	8	1438	1445	0 %	50 %	0 %	50 %	337738959
31	NC_015685	CGA	2	6	1467	1472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738959
32	NC_015685	GTG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337738959
33	NC_015685	GATC	2	8	1536	1543	25 %	25 %	25 %	25 %	337738959
34	NC_015685	CAA	2	6	1624	1629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738959
35	NC_015685	CGG	2	6	1693	1698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738959
36	NC_015685	CGA	2	6	1755	1760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738959
37	NC_015685	TC	3	6	1806	1811	0 %	50 %	0 %	50 %	337738959
38	NC_015685	GC	4	8	1821	1828	0 %	0 %	50 %	50 %	337738959
39	NC_015685	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738959
40	NC_015685	CGCA	2	8	1926	1933	25 %	0 %	25 %	50 %	337738959
41	NC_015685	CTC	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337738959
42	NC_015685	CAC	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738959
43	NC_015685	AGC	2	6	2138	2143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738959
44	NC_015685	TTGA	2	8	2248	2255	25 %	50 %	25 %	0 %	337738959
45	NC_015685	GAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015685	AAAAG	2	10	2343	2352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015685	TCCG	2	8	2366	2373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015685	CT	3	6	2380	2385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015685	GA	3	6	2443	2448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015685	CGT	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015685	ACG	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738960
52	NC_015685	GCG	2	6	2530	2535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
53	NC_015685	TGG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337738960
54	NC_015685	CG	3	6	2578	2583	0 %	0 %	50 %	50 %	337738960
55	NC_015685	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
56	NC_015685	TGG	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337738960
57	NC_015685	CGC	2	6	2922	2927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738960
58	NC_015685	GGA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337738960
59	NC_015685	GGC	2	6	2959	2964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
60	NC_015685	GAT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738960
61	NC_015685	TCT	2	6	3223	3228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738960
62	NC_015685	AC	3	6	3233	3238	50 %	0 %	0 %	50 %	337738960
63	NC_015685	GCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
64	NC_015685	GCG	2	6	3374	3379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
65	NC_015685	GGAA	2	8	3388	3395	50 %	0 %	50 %	0 %	337738960
66	NC_015685	GGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
67	NC_015685	CCG	3	9	3486	3494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738960
68	NC_015685	TCGA	2	8	3499	3506	25 %	25 %	25 %	25 %	337738960
69	NC_015685	GAG	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337738960
70	NC_015685	GTC	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738960
71	NC_015685	TCC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337738960
72	NC_015685	GCGCG	2	10	3595	3604	0 %	0 %	60 %	40 %	337738960
73	NC_015685	TCCGC	2	10	3609	3618	0 %	20 %	20 %	60 %	337738960
74	NC_015685	GCG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738960
75	NC_015685	ACCTC	2	10	3741	3750	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_015685	TCG	2	6	3755	3760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015685	CGC	2	6	3783	3788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015685	AAACTG	2	12	3840	3851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015685	CGC	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015685	CGTG	2	8	4001	4008	0 %	25 %	50 %	25 %	337738961
81	NC_015685	GC	3	6	4035	4040	0 %	0 %	50 %	50 %	337738961
82	NC_015685	TC	4	8	4053	4060	0 %	50 %	0 %	50 %	337738961
83	NC_015685	GCG	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738961
84	NC_015685	GCGCT	2	10	4235	4244	0 %	20 %	40 %	40 %	337738961
85	NC_015685	TCGG	2	8	4377	4384	0 %	25 %	50 %	25 %	337738962
86	NC_015685	CAAG	2	8	4396	4403	50 %	0 %	25 %	25 %	337738962
87	NC_015685	GAC	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738962
88	NC_015685	GAC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738962
89	NC_015685	GAGC	2	8	4528	4535	25 %	0 %	50 %	25 %	337738962
90	NC_015685	CGGC	2	8	4642	4649	0 %	0 %	50 %	50 %	337738962
91	NC_015685	AGCG	2	8	4661	4668	25 %	0 %	50 %	25 %	337738962
92	NC_015685	CGC	3	9	4669	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738962
93	NC_015685	CGG	2	6	4687	4692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015685	CCG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015685	TTTTC	2	10	4798	4807	0 %	80 %	0 %	20 %	337738963
96	NC_015685	ACG	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738963
97	NC_015685	CGATG	2	10	4913	4922	20 %	20 %	40 %	20 %	337738963
98	NC_015685	GTA	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738963
99	NC_015685	GTT	2	6	5038	5043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738963
100	NC_015685	CAGAA	2	10	5069	5078	60 %	0 %	20 %	20 %	337738963
101	NC_015685	GATC	2	8	5080	5087	25 %	25 %	25 %	25 %	337738963
102	NC_015685	GCC	2	6	5230	5235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738964
103	NC_015685	CG	3	6	5253	5258	0 %	0 %	50 %	50 %	337738964
104	NC_015685	CCCG	2	8	5311	5318	0 %	0 %	25 %	75 %	337738964
105	NC_015685	GCC	2	6	5356	5361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738964
106	NC_015685	TCA	2	6	5366	5371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738964
107	NC_015685	CCG	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738964
108	NC_015685	CGG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738964
109	NC_015685	CCGT	2	8	5567	5574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015685	ATA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015685	GATTC	2	10	5629	5638	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015685	AGA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015685	TC	3	6	5686	5691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015685	GCGG	2	8	5702	5709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015685	CAA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015685	TTTG	2	8	5805	5812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015685	GCTCG	2	10	5895	5904	0 %	20 %	40 %	40 %	337738965
118	NC_015685	GC	4	8	5986	5993	0 %	0 %	50 %	50 %	337738965
119	NC_015685	CCG	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738965
120	NC_015685	GC	3	6	6120	6125	0 %	0 %	50 %	50 %	337738965
121	NC_015685	GCG	2	6	6150	6155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738965
122	NC_015685	TGC	2	6	6188	6193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738965
123	NC_015685	CG	3	6	6222	6227	0 %	0 %	50 %	50 %	337738965
124	NC_015685	GCT	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738965
125	NC_015685	GCG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738965
126	NC_015685	GAT	2	6	6393	6398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738965
127	NC_015685	AAG	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738965
128	NC_015685	CG	3	6	6479	6484	0 %	0 %	50 %	50 %	337738965
129	NC_015685	TCG	2	6	6515	6520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738965
130	NC_015685	ACCTG	2	10	6521	6530	20 %	20 %	20 %	40 %	337738965
131	NC_015685	CGA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738965
132	NC_015685	GGCC	2	8	6582	6589	0 %	0 %	50 %	50 %	337738965
133	NC_015685	TGG	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337738965
134	NC_015685	TCG	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738965
135	NC_015685	CG	4	8	6762	6769	0 %	0 %	50 %	50 %	337738965
136	NC_015685	ATCTC	2	10	6791	6800	20 %	40 %	0 %	40 %	337738965
137	NC_015685	GTG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337738965
138	NC_015685	CGC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738965
139	NC_015685	TGC	2	6	6998	7003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738965
140	NC_015685	CCG	2	6	7011	7016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738965
141	NC_015685	TCCC	2	8	7057	7064	0 %	25 %	0 %	75 %	337738965
142	NC_015685	CGG	2	6	7187	7192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738966
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160	NC_015685	CGA	2	6	8131	8136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738967
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169	NC_015685	TGTGG	2	10	8627	8636	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015685	GTC	2	6	8638	8643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015685	TGA	2	6	8677	8682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015685	GTTG	2	8	8712	8719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015685	GCT	2	6	8757	8762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_015685	GAA	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015685	TCG	2	6	8805	8810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_015685	GGGAAG	2	12	8858	8869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_015685	GCAA	2	8	11586	11593	50 %	0 %	25 %	25 %	337738969
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246	NC_015685	GCGA	2	8	11629	11636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
247	NC_015685	CTG	2	6	11662	11667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_015685	CGA	2	6	11684	11689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_015685	CGA	2	6	11734	11739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_015685	CG	3	6	12564	12569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
264	NC_015685	AAGG	2	8	12581	12588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015685	AGC	2	6	12615	12620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_015685	CAA	2	6	12625	12630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_015685	A	7	7	12634	12640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015685	GC	3	6	12645	12650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_015685	GA	3	6	12664	12669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015685	GAGG	2	8	12839	12846	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015685	ACC	2	6	12942	12947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738971
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399	NC_015685	CCG	2	6	18568	18573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337738976
400	NC_015685	ACC	2	6	18626	18631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738976
401	NC_015685	CGA	2	6	18639	18644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337738976
402	NC_015685	GAT	2	6	18666	18671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738976
403	NC_015685	GTG	2	6	18682	18687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337738976
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406	NC_015685	CTTCGT	2	12	18726	18737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	337738976
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495	NC_015685	CGG	2	6	23152	23157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337738981
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498	NC_015685	CCG	2	6	23221	23226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_015685	GAT	2	6	23294	23299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_015685	CCCG	2	8	23317	23324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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