MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natronomonas moolapensis 8.8.11 complete genome

Total Repeats: 10417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020388	GGCG	2	8	1062868	1062875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_020388	TCG	2	6	1063312	1063317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_020388	ACCG	2	8	1064267	1064274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_020388	CG	3	6	1064287	1064292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_020388	ACGTC	2	10	1066204	1066213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4006	NC_020388	CCGAT	2	10	1066247	1066256	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4007	NC_020388	TCGG	2	8	1066316	1066323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_020388	GAC	2	6	1066359	1066364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_020388	CGG	2	6	1067243	1067248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_020388	CGT	2	6	1067262	1067267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_020388	CGC	2	6	1067271	1067276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_020388	ATAA	2	8	1067322	1067329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020388	CGGCGA	2	12	1067339	1067350	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_020388	CGG	3	9	1067351	1067359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_020388	GCC	3	9	1067886	1067894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_020388	GCC	3	9	1067912	1067920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_020388	CGA	2	6	1067936	1067941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_020388	CGA	2	6	1068302	1068307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_020388	CGG	2	6	1069699	1069704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_020388	CGC	2	6	1069710	1069715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_020388	GGTCGC	2	12	1069747	1069758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_020388	TAC	2	6	1069777	1069782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_020388	CCCCGG	3	18	1070733	1070750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_020388	AGG	2	6	1070756	1070761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020388	C	6	6	1071773	1071778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4026	NC_020388	GT	3	6	1071785	1071790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020388	CCG	2	6	1072112	1072117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_020388	CCGA	2	8	1072149	1072156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_020388	GGC	2	6	1072161	1072166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_020388	CGT	2	6	1072180	1072185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_020388	GTCC	2	8	1072215	1072222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_020388	GT	3	6	1073708	1073713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020388	CGG	2	6	1073738	1073743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_020388	CCG	2	6	1073756	1073761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_020388	CCG	2	6	1073778	1073783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_020388	ATCG	2	8	1073836	1073843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_020388	CGT	2	6	1073850	1073855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_020388	CTA	2	6	1073885	1073890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_020388	CG	5	10	1073900	1073909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_020388	GGC	2	6	1073914	1073919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_020388	CGA	2	6	1073928	1073933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_020388	GCG	2	6	1073999	1074004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_020388	CCGGA	2	10	1074105	1074114	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4044	NC_020388	CGTC	2	8	1074135	1074142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_020388	CGT	2	6	1074145	1074150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_020388	CGA	2	6	1074180	1074185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_020388	AGC	2	6	1074200	1074205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_020388	GTCG	2	8	1074275	1074282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_020388	TA	3	6	1074285	1074290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_020388	GCC	2	6	1074296	1074301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_020388	CGC	2	6	1074309	1074314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_020388	GGC	2	6	1074319	1074324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_020388	GTCG	2	8	1074645	1074652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_020388	G	6	6	1074678	1074683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_020388	GCAC	2	8	1075207	1075214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_020388	CCG	2	6	1075287	1075292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_020388	GCC	2	6	1075307	1075312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_020388	CCA	2	6	1077999	1078004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_020388	TGTA	2	8	1078030	1078037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_020388	ACGA	2	8	1078070	1078077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_020388	CTG	2	6	1078096	1078101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_020388	GAAC	2	8	1078103	1078110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_020388	CGA	2	6	1078136	1078141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_020388	TCCC	2	8	1078156	1078163	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4065	NC_020388	TA	3	6	1078185	1078190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020388	CGGC	2	8	1080280	1080287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_020388	GTC	2	6	1080289	1080294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_020388	GCG	2	6	1081882	1081887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_020388	T	7	7	1083081	1083087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020388	TA	3	6	1083093	1083098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_020388	CGA	2	6	1083137	1083142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_020388	CCGT	2	8	1083155	1083162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_020388	ACG	2	6	1083889	1083894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_020388	GCC	2	6	1083907	1083912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_020388	CGGA	2	8	1083925	1083932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_020388	G	6	6	1083971	1083976	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_020388	CGT	2	6	1084693	1084698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_020388	ACCCG	2	10	1085478	1085487	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4079	NC_020388	CG	3	6	1085500	1085505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_020388	TGT	2	6	1086035	1086040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_020388	C	6	6	1086093	1086098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4082	NC_020388	CCG	2	6	1086118	1086123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_020388	CGG	2	6	1086587	1086592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_020388	GGA	2	6	1086642	1086647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_020388	ACT	2	6	1086664	1086669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_020388	CGG	2	6	1086691	1086696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_020388	CAGGCG	2	12	1086744	1086755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_020388	C	6	6	1086772	1086777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4089	NC_020388	CCGACG	2	12	1087477	1087488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_020388	CGG	2	6	1087531	1087536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_020388	ACG	2	6	1088088	1088093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_020388	CGT	2	6	1088100	1088105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_020388	GTC	2	6	1088363	1088368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_020388	GCC	2	6	1089287	1089292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_020388	AT	3	6	1089661	1089666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020388	G	7	7	1089714	1089720	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_020388	GC	3	6	1089790	1089795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_020388	CGG	2	6	1089797	1089802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_020388	GATCG	2	10	1089806	1089815	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4100	NC_020388	GCG	2	6	1091037	1091042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_020388	GGT	2	6	1091076	1091081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020388	GTC	2	6	1091805	1091810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_020388	GC	3	6	1091826	1091831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_020388	GGC	2	6	1091834	1091839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_020388	ACG	2	6	1091868	1091873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_020388	CGA	2	6	1091913	1091918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_020388	ACGCC	2	10	1091921	1091930	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4108	NC_020388	GGAC	2	8	1091931	1091938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_020388	CCG	2	6	1091948	1091953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_020388	CTGCT	2	10	1092731	1092740	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4111	NC_020388	CGGCG	2	10	1094036	1094045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4112	NC_020388	GTC	2	6	1094088	1094093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020388	AGTGC	2	10	1094126	1094135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4114	NC_020388	TA	3	6	1094178	1094183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020388	CGA	3	9	1094191	1094199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_020388	GCCC	2	8	1094204	1094211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4117	NC_020388	TGCG	2	8	1095640	1095647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_020388	CG	3	6	1095650	1095655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_020388	ACT	2	6	1095657	1095662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_020388	GCCG	2	8	1095694	1095701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_020388	ACA	2	6	1095804	1095809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_020388	TTC	2	6	1098244	1098249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_020388	CCG	2	6	1098255	1098260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_020388	GCC	2	6	1098272	1098277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_020388	GCC	2	6	1098321	1098326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_020388	CGG	2	6	1099227	1099232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_020388	CGC	2	6	1099271	1099276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_020388	ATT	2	6	1099296	1099301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_020388	GAC	2	6	1099319	1099324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_020388	CACC	2	8	1100258	1100265	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4131	NC_020388	ACGG	2	8	1100273	1100280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4254	NC_020388	TCGGA	2	10	1143740	1143749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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