MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natronomonas moolapensis 8.8.11 complete genome

Total Repeats: 10417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020388	C	6	6	265467	265472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1002	NC_020388	GTT	2	6	265475	265480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020388	TTG	2	6	265596	265601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020388	CAG	2	6	266891	266896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020388	AGT	2	6	266974	266979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020388	TTCA	2	8	267021	267028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_020388	AG	3	6	267033	267038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020388	CGCT	2	8	267061	267068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_020388	TAC	2	6	267147	267152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_020388	TGCGG	2	10	267159	267168	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1011	NC_020388	CAC	2	6	268296	268301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_020388	GATT	2	8	268306	268313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020388	CT	3	6	268346	268351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_020388	CGCAT	2	10	268369	268378	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_020388	TACC	2	8	268412	268419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_020388	TAC	2	6	268438	268443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_020388	CTC	2	6	268495	268500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_020388	TGA	2	6	268563	268568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020388	CTG	2	6	268579	268584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_020388	GTC	2	6	268630	268635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_020388	TTG	2	6	268758	268763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020388	GTT	2	6	268901	268906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020388	TAC	2	6	268950	268955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020388	ACCTG	2	10	268956	268965	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_020388	TGT	2	6	268976	268981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020388	TGA	2	6	269017	269022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020388	CAG	2	6	269694	269699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_020388	GCTT	2	8	269713	269720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_020388	GTC	2	6	269843	269848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020388	GTT	2	6	269875	269880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020388	CTA	2	6	269912	269917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_020388	ACT	2	6	269936	269941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_020388	GTA	2	6	270691	270696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020388	ACT	2	6	280842	280847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_020388	GAAC	2	8	280885	280892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_020388	CT	3	6	280903	280908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_020388	TCT	2	6	281237	281242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020388	ATTC	2	8	281716	281723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_020388	AGA	2	6	281785	281790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020388	GTAC	2	8	281873	281880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_020388	TCG	2	6	281959	281964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_020388	TAC	3	9	281988	281996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020388	TTCTC	2	10	282004	282013	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_020388	ACC	2	6	282066	282071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_020388	TAT	2	6	282079	282084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020388	ACC	2	6	282489	282494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_020388	ATT	2	6	283255	283260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020388	CAC	2	6	283272	283277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_020388	GTT	2	6	283303	283308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020388	TA	3	6	283369	283374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020388	CGA	3	9	283423	283431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020388	GGC	2	6	283456	283461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_020388	CCG	2	6	283479	283484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_020388	GC	3	6	283486	283491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_020388	CCG	3	9	283509	283517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_020388	CGA	2	6	283528	283533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_020388	GTC	2	6	283544	283549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_020388	G	6	6	283552	283557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020388	ACGCCA	2	12	283609	283620	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_020388	CTGA	2	8	283623	283630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_020388	ATT	2	6	283641	283646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020388	TCC	2	6	283845	283850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_020388	AGC	2	6	283885	283890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_020388	CGGCGA	2	12	283902	283913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020388	CATG	2	8	283921	283928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_020388	TAA	2	6	285625	285630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020388	CGT	2	6	285639	285644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_020388	CGCC	2	8	285697	285704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1069	NC_020388	A	6	6	285729	285734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020388	GCCG	2	8	285739	285746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_020388	CCA	2	6	286231	286236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_020388	GCC	2	6	286559	286564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_020388	CGG	2	6	286588	286593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020388	CGG	2	6	286596	286601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_020388	CCG	2	6	286615	286620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_020388	CGT	2	6	286887	286892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020388	GCT	2	6	286926	286931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_020388	A	6	6	286947	286952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020388	GGCTA	2	10	287022	287031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_020388	TCGA	2	8	287075	287082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_020388	CGG	2	6	287089	287094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_020388	CGG	2	6	287106	287111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_020388	GTCG	2	8	287132	287139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_020388	TA	3	6	288057	288062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020388	GAC	2	6	288066	288071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020388	AGC	2	6	288085	288090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_020388	GCCG	2	8	288177	288184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_020388	GA	3	6	288256	288261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020388	CGGCC	2	10	290715	290724	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1090	NC_020388	GCG	2	6	290744	290749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_020388	AT	3	6	290806	290811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020388	CGC	2	6	290819	290824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_020388	CGG	2	6	292888	292893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_020388	ACG	2	6	292904	292909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_020388	CGT	2	6	294734	294739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_020388	TAA	2	6	294756	294761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020388	CGA	2	6	294773	294778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_020388	GCGG	2	8	294796	294803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_020388	CGA	2	6	294837	294842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_020388	ACC	2	6	294895	294900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_020388	CGGG	2	8	294928	294935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_020388	CGGC	2	8	294948	294955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_020388	CGCC	2	8	295021	295028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1104	NC_020388	GGA	2	6	295089	295094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020388	TCCG	2	8	295111	295118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_020388	TA	3	6	295133	295138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020388	GAC	2	6	295159	295164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020388	CCGC	2	8	296868	296875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1109	NC_020388	GTTC	2	8	296876	296883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_020388	GAC	2	6	296897	296902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_020388	AGCG	2	8	298444	298451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_020388	GCG	2	6	298505	298510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_020388	AACGGA	2	12	298520	298531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1114	NC_020388	ACGGG	2	10	298532	298541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_020388	ACG	2	6	298616	298621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_020388	CGT	2	6	298629	298634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020388	ACG	2	6	298659	298664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_020388	CGA	2	6	298680	298685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_020388	G	7	7	299928	299934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020388	GGA	2	6	299980	299985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020388	TTCC	2	8	300269	300276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_020388	CCG	2	6	300503	300508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_020388	CGG	2	6	300966	300971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020388	CGGC	2	8	300999	301006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_020388	CCGAC	2	10	301008	301017	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1126	NC_020388	CCG	2	6	301078	301083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_020388	TGT	2	6	302319	302324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020388	ACG	2	6	302378	302383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020388	GATCG	2	10	302418	302427	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1130	NC_020388	CGT	2	6	307933	307938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020388	CGG	2	6	307942	307947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_020388	GCT	2	6	307954	307959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020388	GGA	2	6	307969	307974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020388	CCGCG	2	10	307984	307993	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1135	NC_020388	GCC	3	9	307998	308006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_020388	CCG	2	6	308010	308015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_020388	CCGAC	2	10	308019	308028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1138	NC_020388	CCG	2	6	311791	311796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1142	NC_020388	AGCG	2	8	311916	311923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1143	NC_020388	CCGAA	2	10	311935	311944	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1151	NC_020388	GC	3	6	312128	312133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1153	NC_020388	GACG	2	8	312641	312648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1165	NC_020388	GCC	2	6	324178	324183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1167	NC_020388	GCCC	2	8	324270	324277	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1168	NC_020388	GAG	2	6	324320	324325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_020388	A	6	6	327029	327034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1184	NC_020388	CCCG	2	8	329467	329474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1185	NC_020388	GAG	2	6	329486	329491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_020388	CCGA	2	8	345791	345798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1251	NC_020388	TGC	2	6	345818	345823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_020388	CGTC	2	8	346990	346997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1262	NC_020388	G	6	6	349661	349666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_020388	TCC	2	6	350269	350274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1409	NC_020388	GCC	2	6	391119	391124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_020388	GTC	2	6	391148	391153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_020388	CGG	2	6	391177	391182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1495	NC_020388	CTG	2	6	410059	410064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1498	NC_020388	CGAG	2	8	410096	410103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_020388	AGCGC	2	10	410159	410168	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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