MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nonlabens dokdonensis DSW-6

Total Repeats: 495

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020156	TTCAT	2	10	1953	1962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020156	TAAAT	2	10	8766	8775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020156	AGATA	2	10	15163	15172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020156	TTAAG	2	10	15185	15194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020156	ATCAT	2	10	17097	17106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020156	TCTAT	2	10	31123	31132	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020156	TAAAA	2	10	35426	35435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020156	ATAAA	2	10	37501	37510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020156	ATCCT	2	10	48540	48549	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_020156	AACCC	2	10	61923	61932	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_020156	ATTCC	2	10	65209	65218	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020156	AAAAG	2	10	66988	66997	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020156	TCCTT	2	10	70429	70438	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020156	AAAGG	2	10	70442	70451	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020156	TCCTT	2	10	71021	71030	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020156	AAAGG	2	10	71034	71043	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020156	CGATG	2	10	71084	71093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020156	TCCTT	2	10	71628	71637	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020156	TGGGA	2	10	71668	71677	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020156	AATTT	2	10	85666	85675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020156	AATAT	2	10	89791	89800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020156	AACTT	2	10	93077	93086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020156	TAAAC	2	10	98773	98782	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020156	AAAAC	2	10	102201	102210	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020156	GCATT	2	10	117840	117849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020156	AAAAT	2	10	121737	121746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020156	TTCAA	2	10	123052	123061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020156	TCCTT	2	10	123166	123175	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020156	ATTTA	2	10	124529	124538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020156	TCCTT	2	10	125769	125778	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020156	AGAAA	2	10	125779	125788	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020156	GAAAT	2	10	125893	125902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020156	TCCTT	2	10	125952	125961	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020156	AAAGG	2	10	125965	125974	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020156	GCAAA	2	10	127074	127083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020156	AAATT	2	10	127107	127116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020156	CTGAT	2	10	133187	133196	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020156	ATTAG	2	10	141444	141453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020156	CATTT	2	10	146992	147001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020156	TTAAT	2	10	229370	229379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020156	AATTG	2	10	238368	238377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020156	AAGTA	2	10	254560	254569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020156	ATTGC	2	10	257924	257933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020156	ATTTC	2	10	269126	269135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020156	ATTTG	2	10	269905	269914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020156	CTATT	2	10	274876	274885	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_020156	CAAAA	2	10	275684	275693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020156	AATAC	2	10	279201	279210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020156	TTTTC	2	10	288076	288085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020156	CATTT	2	10	289881	289890	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020156	GATTA	2	10	293951	293960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020156	TCATT	2	10	300148	300157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020156	AAACT	2	10	312135	312144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020156	TGTTT	2	10	320882	320891	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020156	TCCTT	2	10	324092	324101	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020156	AAAGG	2	10	324104	324113	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020156	ATTTT	2	10	324500	324509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020156	AAAAC	2	10	338289	338298	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020156	AATAA	2	10	373461	373470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020156	TTACC	2	10	386384	386393	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_020156	TTAAC	2	10	386597	386606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020156	TTGTA	2	10	420147	420156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020156	TATTT	2	10	422116	422125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020156	AATTT	2	10	463346	463355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020156	AACTT	2	10	475395	475404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020156	TTTTA	2	10	479684	479693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020156	AGAAC	2	10	488286	488295	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020156	TTTAA	2	10	489051	489060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020156	TAAAA	2	10	497705	497714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020156	AAAAT	2	10	499032	499041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020156	TTTAA	2	10	499641	499650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020156	AGCTA	2	10	502702	502711	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020156	TGATA	2	10	520803	520812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020156	ATTAA	2	10	522057	522066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020156	AGCAA	2	10	531826	531835	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020156	AAACA	2	10	552648	552657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020156	ATTTT	2	10	559506	559515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020156	ATGCG	2	10	655925	655934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020156	TAAAA	2	10	669737	669746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020156	TAGGA	2	10	692829	692838	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020156	TATTC	2	10	693768	693777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020156	TATTT	2	10	696043	696052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020156	ATTTA	2	10	704125	704134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020156	TCATT	2	10	711282	711291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020156	AACAT	2	10	712159	712168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020156	ATCCC	2	10	728403	728412	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_020156	TGTTT	2	10	739007	739016	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020156	TGTTA	2	10	802260	802269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020156	GTTTT	2	10	810016	810025	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020156	ATAAA	2	10	816063	816072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020156	TTAGT	2	10	819485	819494	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020156	TAAAA	2	10	822192	822201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020156	AAAAT	2	10	822242	822251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020156	CTTTT	2	10	831066	831075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020156	TGTTC	2	10	833063	833072	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020156	TAGAT	2	10	845568	845577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020156	ATACT	2	10	851649	851658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020156	GTAGT	2	10	869922	869931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020156	GTGAT	2	10	870483	870492	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020156	TAATA	2	10	900503	900512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020156	TTAAA	2	10	903039	903048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020156	AGTTA	2	10	903724	903733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020156	AAAAC	2	10	919704	919713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020156	TTATT	2	10	923369	923378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020156	AAATA	2	10	961927	961936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020156	AATTA	2	10	970528	970537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020156	AATTA	2	10	986185	986194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020156	TCAAC	2	10	995865	995874	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020156	AGCAA	2	10	998500	998509	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020156	TTTAA	2	10	1000865	1000874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020156	TTAAA	2	10	1002766	1002775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020156	ATTTT	2	10	1019761	1019770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020156	ACCCA	2	10	1027776	1027785	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_020156	ATCCC	2	10	1034947	1034956	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_020156	AATTC	2	10	1055760	1055769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020156	AAGAA	2	10	1081876	1081885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020156	CATAC	2	10	1081949	1081958	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_020156	AAAGT	2	10	1083551	1083560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020156	AATTT	2	10	1090676	1090685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020156	TCTTA	2	10	1094996	1095005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020156	ATTGT	2	10	1107954	1107963	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020156	AAATA	2	10	1109047	1109056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020156	AAACC	2	10	1114720	1114729	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_020156	TTTTG	2	10	1139780	1139789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020156	TTTAT	2	10	1145825	1145834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020156	TAAAA	2	10	1161055	1161064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020156	AGATT	2	10	1173732	1173741	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020156	TTTAA	2	10	1192686	1192695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020156	AATAA	2	10	1217315	1217324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020156	TAGTT	3	15	1218156	1218170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020156	TAAAA	2	10	1230099	1230108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020156	ATTAA	2	10	1250753	1250762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020156	GCGAT	2	10	1266934	1266943	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020156	TCTAT	2	10	1282601	1282610	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020156	TTTAA	2	10	1318952	1318961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020156	AAATT	2	10	1328569	1328578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020156	AAAGT	2	10	1331538	1331547	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020156	AACTG	2	10	1345909	1345918	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020156	AGGGA	2	10	1372466	1372475	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020156	TGAGT	2	10	1376401	1376410	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020156	TCCTT	2	10	1383630	1383639	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_020156	AAAGG	2	10	1383643	1383652	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020156	TCCTT	2	10	1383821	1383830	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020156	AAAGG	2	10	1383834	1383843	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020156	CAAAA	2	10	1385077	1385086	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020156	TCCTT	2	10	1389208	1389217	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_020156	TCCTT	2	10	1389395	1389404	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_020156	GATTC	2	10	1392852	1392861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_020156	TTTAC	2	10	1507236	1507245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_020156	GATTT	2	10	1666748	1666757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_020156	TTAGG	2	10	1787680	1787689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020156	GATTT	2	10	1790323	1790332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020156	TGCAA	2	10	1793612	1793621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_020156	AAATA	2	10	2422778	2422787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_020156	ATTTA	2	10	2427700	2427709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_020156	AATTA	2	10	2440445	2440454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020156	AAATA	2	10	2440591	2440600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020156	TTATT	2	10	2446420	2446429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_020156	AGCAA	2	10	2451117	2451126	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_020156	AGAAA	2	10	2455819	2455828	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020156	GTTTT	2	10	2455936	2455945	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_020156	CCTTT	2	10	2461165	2461174	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_020156	AAGGA	2	10	2461178	2461187	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020156	AAAAT	2	10	2477308	2477317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020156	TTATT	3	15	2482558	2482572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020156	TTTTA	2	10	2499930	2499939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020156	TAATG	2	10	2499983	2499992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_020156	TTTCT	2	10	2507409	2507418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_020156	TTGAT	2	10	2522285	2522294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020156	TTAAA	2	10	2528724	2528733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020156	ATTAT	2	10	2537691	2537700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020156	AAAAT	2	10	2537972	2537981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020156	GGTAA	2	10	2538297	2538306	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020156	TGTAG	2	10	2538717	2538726	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_020156	AAATT	2	10	2559091	2559100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_020156	TTTTA	2	10	2594159	2594168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_020156	ATTAA	2	10	2601025	2601034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_020156	AATCA	2	10	2640029	2640038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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324	NC_020156	GACAT	2	10	2758030	2758039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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404	NC_020156	GATCT	2	10	3315465	3315474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_020156	AAGTG	2	10	3361813	3361822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
413	NC_020156	TTATT	2	10	3365279	3365288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_020156	CGCAT	2	10	3416984	3416993	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_020156	CTTTA	2	10	3417671	3417680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
423	NC_020156	TTTTA	2	10	3442767	3442776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_020156	TTAAA	2	10	3443428	3443437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.