MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	AC	3	6	167	172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019967	AG	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019967	TA	3	6	427	432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019967	AC	3	6	1682	1687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019967	TG	3	6	1807	1812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019967	GC	4	8	6338	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019967	CG	3	6	7802	7807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019967	TA	3	6	8199	8204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019967	AT	3	6	8235	8240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019967	TG	3	6	10072	10077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019967	CA	3	6	10177	10182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019967	AT	3	6	10891	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019967	GA	3	6	11033	11038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019967	AG	3	6	11102	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019967	AC	3	6	15658	15663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019967	TC	3	6	16343	16348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019967	AC	3	6	16571	16576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019967	GC	3	6	22663	22668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019967	GA	3	6	22704	22709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019967	CT	3	6	22736	22741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019967	TC	3	6	22766	22771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019967	CT	3	6	24613	24618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019967	AT	3	6	24841	24846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019967	AT	3	6	24913	24918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019967	TG	3	6	28157	28162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019967	CA	3	6	29156	29161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019967	CG	3	6	31255	31260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019967	TG	3	6	34501	34506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019967	AT	3	6	43436	43441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019967	TC	3	6	43470	43475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019967	GT	3	6	43720	43725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019967	AC	3	6	44852	44857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019967	CT	3	6	44902	44907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019967	AG	3	6	47144	47149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019967	TC	3	6	60895	60900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019967	TC	3	6	61875	61880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019967	CT	3	6	67057	67062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019967	CG	3	6	70288	70293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019967	GC	3	6	70586	70591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019967	AC	3	6	70795	70800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019967	GT	3	6	72534	72539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019967	TC	3	6	73581	73586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019967	CT	3	6	75468	75473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019967	TG	3	6	75939	75944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019967	AC	3	6	75992	75997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019967	CT	3	6	79389	79394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019967	GA	3	6	80466	80471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019967	GA	3	6	82090	82095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019967	CT	3	6	83079	83084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019967	TG	3	6	83405	83410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019967	CG	3	6	83640	83645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019967	CG	3	6	87503	87508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019967	CT	3	6	87633	87638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019967	CG	3	6	88502	88507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019967	TG	3	6	89405	89410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019967	GA	3	6	91119	91124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019967	GC	3	6	93092	93097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019967	GT	3	6	97582	97587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019967	GA	3	6	97645	97650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019967	CG	3	6	100311	100316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019967	CT	3	6	103834	103839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019967	CG	3	6	103874	103879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019967	AC	3	6	103996	104001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019967	GA	3	6	105025	105030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019967	GC	3	6	106622	106627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019967	GC	3	6	108408	108413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019967	GA	3	6	109112	109117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019967	TG	3	6	110052	110057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019967	TC	3	6	110246	110251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019967	AC	3	6	112008	112013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019967	AC	3	6	112719	112724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019967	AG	3	6	114631	114636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019967	GA	3	6	116287	116292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019967	TC	3	6	116611	116616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019967	CA	3	6	116777	116782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019967	CA	3	6	118461	118466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019967	GA	3	6	124894	124899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019967	TC	3	6	125798	125803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019967	TC	3	6	125911	125916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019967	TC	3	6	126237	126242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019967	TG	3	6	126774	126779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019967	TG	3	6	129160	129165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019967	CG	4	8	132573	132580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019967	TC	3	6	133269	133274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019967	GC	3	6	133298	133303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019967	TA	3	6	133377	133382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019967	AG	3	6	133427	133432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019967	CG	3	6	133573	133578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019967	TC	4	8	136152	136159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019967	GC	3	6	136409	136414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019967	AG	3	6	139538	139543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019967	GT	3	6	142488	142493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019967	GA	3	6	143490	143495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019967	GA	3	6	143662	143667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019967	TC	3	6	148393	148398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019967	AG	3	6	148478	148483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019967	GA	3	6	149913	149918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019967	CT	3	6	152413	152418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019967	GA	3	6	152797	152802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019967	CT	3	6	157895	157900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019967	CT	4	8	158141	158148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019967	GC	4	8	158291	158298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019967	GC	3	6	158300	158305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019967	TC	3	6	159302	159307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019967	TC	3	6	163391	163396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019967	AG	3	6	163454	163459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019967	TC	3	6	164659	164664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019967	CA	3	6	164716	164721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019967	AT	3	6	166122	166127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019967	GC	3	6	166130	166135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019967	GC	3	6	166180	166185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019967	GC	3	6	166594	166599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019967	CA	3	6	166756	166761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019967	AG	3	6	173071	173076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019967	AG	3	6	173188	173193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019967	GA	4	8	175754	175761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019967	GA	3	6	175967	175972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019967	CA	3	6	176039	176044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019967	CG	3	6	176142	176147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019967	AC	3	6	177610	177615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019967	GA	3	6	182643	182648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019967	AG	3	6	182920	182925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019967	TG	3	6	183100	183105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019967	CA	3	6	184649	184654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019967	AC	3	6	191618	191623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019967	TA	3	6	191644	191649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019967	TC	3	6	191778	191783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019967	TC	3	6	191885	191890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019967	TG	3	6	192004	192009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019967	CA	3	6	192564	192569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019967	CA	3	6	192773	192778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019967	TC	3	6	193320	193325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019967	GA	3	6	195495	195500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019967	GA	3	6	199924	199929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019967	GA	3	6	200436	200441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019967	AT	3	6	209633	209638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019967	GC	3	6	210423	210428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019967	GA	3	6	210472	210477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019967	AG	3	6	210969	210974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019967	TC	3	6	211077	211082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019967	GA	3	6	211104	211109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019967	GC	3	6	211283	211288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019967	TC	3	6	213547	213552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019967	AT	3	6	218857	218862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019967	TG	3	6	220231	220236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019967	GA	3	6	222388	222393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019967	GT	3	6	227269	227274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019967	GT	3	6	227278	227283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019967	CT	3	6	227557	227562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019967	CT	3	6	228560	228565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019967	GA	3	6	228871	228876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019967	TC	3	6	229067	229072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_019967	AT	3	6	233995	234000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019967	GC	3	6	234021	234026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_019967	AC	3	6	234123	234128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_019967	TC	3	6	234188	234193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.