MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	GCGAC	2	10	44599	44608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019967	CATCG	2	10	52019	52028	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019967	TCGCT	2	10	54359	54368	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_019967	CCCTT	2	10	61194	61203	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_019967	AGTTG	2	10	61444	61453	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019967	CGTCC	2	10	76187	76196	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_019967	AGGGG	2	10	78881	78890	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019967	TCCGT	2	10	82400	82409	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019967	GACGC	2	10	84040	84049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019967	CGGAT	2	10	85674	85683	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019967	GACTA	2	10	85740	85749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019967	TCGTT	2	10	91080	91089	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019967	GTATG	2	10	99535	99544	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019967	TGCCG	2	10	100255	100264	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019967	GTTCA	2	10	104883	104892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019967	CGCTA	2	10	106584	106593	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019967	CGTTT	2	10	112373	112382	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019967	CGCCC	2	10	112448	112457	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_019967	CGGTT	2	10	112669	112678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019967	CGATC	2	10	118937	118946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_019967	CTGTT	2	10	124774	124783	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019967	CGCGC	2	10	133308	133317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_019967	TGCCC	2	10	133321	133330	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_019967	GGCGG	2	10	133601	133610	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019967	GCGTC	2	10	135790	135799	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019967	TCGGA	2	10	146149	146158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019967	TCGAA	2	10	146159	146168	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019967	TCTCT	2	10	148228	148237	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019967	TTCAC	2	10	149419	149428	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019967	TGGAC	2	10	163355	163364	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019967	GCAGC	2	10	165046	165055	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019967	GCGGG	2	10	166511	166520	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019967	GCTCT	2	10	190885	190894	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019967	TCGAC	2	10	192678	192687	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019967	CGTTT	2	10	204941	204950	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019967	TCACA	2	10	223357	223366	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019967	AGACA	2	10	225754	225763	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019967	AGAGA	2	10	227381	227390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019967	TCGGC	2	10	229096	229105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019967	TCAGG	2	10	230480	230489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019967	CGACG	2	10	237049	237058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019967	CGCCT	2	10	237645	237654	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_019967	TACAG	2	10	240486	240495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019967	CTATG	2	10	254227	254236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019967	ACGAC	2	10	260655	260664	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019967	TCCCG	2	10	267490	267499	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_019967	ACTCA	2	10	269599	269608	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019967	ACTCG	2	10	273208	273217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019967	GGATA	2	10	286990	286999	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019967	AGATT	2	10	287775	287784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.