MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	AACC	2	8	74	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019967	TGAC	2	8	4432	4439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019967	GACG	2	8	5344	5351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019967	GGAG	2	8	6353	6360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019967	GGTG	2	8	6373	6380	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019967	GTCA	2	8	7984	7991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019967	TCGC	2	8	8049	8056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019967	TGAG	2	8	11829	11836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019967	GAAT	2	8	12166	12173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019967	TCAC	2	8	14182	14189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019967	AGAA	2	8	15950	15957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019967	TGGG	2	8	19042	19049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019967	GCAC	2	8	22650	22657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019967	CAGG	2	8	22715	22722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019967	AATG	2	8	29113	29120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019967	CTCC	2	8	34567	34574	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_019967	GACT	2	8	41584	41591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019967	GCTG	2	8	43515	43522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019967	TGGA	2	8	43632	43639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019967	TCAG	2	8	43744	43751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019967	GGCA	2	8	44300	44307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019967	CTGG	2	8	44406	44413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019967	CGTA	2	8	44877	44884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019967	CGTC	2	8	54350	54357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019967	CCGA	2	8	54524	54531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019967	AGAA	2	8	54678	54685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019967	GAGC	2	8	56827	56834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019967	GAGC	2	8	56836	56843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019967	ATTT	2	8	56874	56881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019967	CTAA	2	8	58587	58594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019967	CAAC	2	8	59130	59137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019967	GGAA	2	8	59311	59318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019967	CGCT	2	8	61767	61774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019967	TCGA	2	8	70113	70120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019967	ACTC	2	8	70633	70640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019967	GAAC	2	8	70726	70733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019967	TTAC	2	8	70851	70858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019967	TGAT	2	8	73457	73464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019967	GCTG	2	8	73632	73639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019967	GCTC	2	8	73810	73817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019967	CTAT	2	8	75223	75230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019967	TAGT	2	8	75237	75244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019967	CGTG	2	8	76244	76251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019967	CAAT	2	8	78165	78172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019967	CCAT	2	8	78604	78611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019967	GTCA	2	8	78785	78792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019967	CTCC	2	8	78843	78850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_019967	GAAC	2	8	80037	80044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019967	TCGT	2	8	80122	80129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019967	CTCG	2	8	80134	80141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019967	AGGC	2	8	80168	80175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019967	TTCG	2	8	80182	80189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019967	CGAC	2	8	80191	80198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019967	GATC	2	8	82184	82191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019967	TCCC	2	8	82567	82574	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_019967	TCGG	2	8	85544	85551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019967	GGTC	2	8	87953	87960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019967	CCAC	2	8	87976	87983	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_019967	ACTG	2	8	88669	88676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019967	GGCG	2	8	91200	91207	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019967	CGAG	2	8	92995	93002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019967	GTCG	2	8	93157	93164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019967	TGGC	2	8	93857	93864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019967	CTAT	2	8	94932	94939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019967	TGAG	2	8	96150	96157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019967	GCAC	2	8	96159	96166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019967	CGTC	2	8	97441	97448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019967	CGAG	2	8	97480	97487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019967	CGAC	2	8	97555	97562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019967	TTTC	2	8	97678	97685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019967	GCGG	2	8	98809	98816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019967	ACAT	2	8	98901	98908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019967	AGTC	2	8	100535	100542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019967	GCCC	2	8	103768	103775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_019967	TCCC	2	8	103893	103900	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_019967	TGTC	2	8	106169	106176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019967	GCGA	2	8	106184	106191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019967	GGCT	2	8	106353	106360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019967	GTCC	2	8	106365	106372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019967	TCCC	2	8	106390	106397	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_019967	CGGT	2	8	106465	106472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019967	TTCC	2	8	106548	106555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019967	ACGG	2	8	106765	106772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019967	TCAC	2	8	106785	106792	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019967	ACCG	2	8	106808	106815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019967	GCCA	2	8	108342	108349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019967	CAGG	2	8	108353	108360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019967	ATCG	2	8	108676	108683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019967	CGCA	2	8	108692	108699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019967	GGCC	2	8	108854	108861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019967	TTGA	2	8	109054	109061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019967	AGGC	2	8	109209	109216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019967	TCGC	2	8	109255	109262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019967	ACCC	2	8	109561	109568	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_019967	CTCG	2	8	109636	109643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019967	GCGG	2	8	110222	110229	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019967	GGAA	2	8	110587	110594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019967	GATC	2	8	112784	112791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019967	TGGT	2	8	113097	113104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019967	GTTC	2	8	115563	115570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019967	ACCG	2	8	116073	116080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019967	ACTT	2	8	116492	116499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019967	TCGT	2	8	116588	116595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019967	CGAG	2	8	116837	116844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019967	ATCC	2	8	116953	116960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019967	CTGC	2	8	118479	118486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019967	CTTC	2	8	118717	118724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019967	TTCG	2	8	118810	118817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019967	GACA	2	8	118922	118929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019967	GATC	2	8	119033	119040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019967	ATGT	2	8	119813	119820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019967	ACAG	2	8	121277	121284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019967	AGCG	2	8	124835	124842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019967	AGGG	2	8	124857	124864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019967	GGCT	2	8	125125	125132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019967	GCGT	2	8	125232	125239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019967	GCTG	2	8	125310	125317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019967	TACG	2	8	126132	126139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019967	CGCC	2	8	126215	126222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_019967	ACTC	2	8	129352	129359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019967	TGAG	2	8	132459	132466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019967	GAAC	2	8	133703	133710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019967	CGCC	2	8	135873	135880	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_019967	GGTC	2	8	136062	136069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019967	ACTC	2	8	137842	137849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019967	CAGA	2	8	137991	137998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019967	CAGG	2	8	139380	139387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019967	TTCC	2	8	143907	143914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019967	ACCT	2	8	148545	148552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019967	TGAA	2	8	148628	148635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019967	AATC	2	8	149905	149912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019967	GACT	2	8	152772	152779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019967	GAAC	2	8	157658	157665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019967	GGTC	2	8	157913	157920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019967	TGCT	2	8	158194	158201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019967	TGCT	2	8	158245	158252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019967	GATC	2	8	158868	158875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019967	AGCG	2	8	159283	159290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019967	GATC	2	8	159875	159882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019967	TCTA	2	8	163216	163223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019967	CCGT	2	8	163317	163324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019967	GGAG	2	8	164767	164774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019967	AAAT	2	8	164897	164904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019967	GACC	2	8	166108	166115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019967	GCGA	2	8	166170	166177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019967	GGTC	2	8	166473	166480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019967	GCGA	2	8	166481	166488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019967	GTGG	2	8	166571	166578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019967	ACGT	2	8	167462	167469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019967	AGTC	2	8	167735	167742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019967	ATCT	2	8	173035	173042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019967	GTTC	2	8	174885	174892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019967	GTCT	2	8	182164	182171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_019967	CGAT	2	8	182828	182835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_019967	AGTC	2	8	208017	208024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_019967	GACT	2	8	218636	218643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_019967	TCAG	2	8	225829	225836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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193	NC_019967	GTTA	2	8	229148	229155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_019967	GGAT	2	8	234449	234456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_019967	GTCA	2	8	238240	238247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
203	NC_019967	TCTA	2	8	239111	239118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.