MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 1618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	AGA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019967	CGA	2	6	34	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019967	GGT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019967	AACC	2	8	74	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019967	GAT	2	6	84	89	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019967	AGG	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019967	AC	3	6	167	172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019967	AGT	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019967	AG	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019967	ACA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019967	CCA	2	6	296	301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019967	ACT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019967	GTG	2	6	381	386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019967	TA	3	6	427	432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019967	AC	3	6	1682	1687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019967	GCT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019967	GTG	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019967	GTG	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019967	TG	3	6	1807	1812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019967	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019967	TCG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019967	A	6	6	1964	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019967	GAT	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019967	GTC	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019967	TCC	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019967	TCT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019967	TGAC	2	8	4432	4439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019967	GTC	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019967	CTC	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019967	TCG	2	6	5256	5261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019967	TGA	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019967	GTT	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019967	AGT	2	6	5326	5331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019967	CTA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019967	GACG	2	8	5344	5351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019967	CGA	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019967	TGC	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019967	GCC	2	6	5545	5550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019967	ACG	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019967	CGA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019967	GC	4	8	6338	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019967	GGAG	2	8	6353	6360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019967	GGTG	2	8	6373	6380	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019967	GGT	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019967	A	6	6	6415	6420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019967	CAC	2	6	7537	7542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019967	CAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019967	CGG	2	6	7667	7672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019967	GAT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019967	CG	3	6	7802	7807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019967	CGC	2	6	7813	7818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019967	TCG	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019967	TGG	2	6	7883	7888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019967	CGA	2	6	7899	7904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019967	GTCA	2	8	7984	7991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019967	GAA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019967	CTG	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019967	TCGC	2	8	8049	8056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019967	CTC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019967	T	6	6	8091	8096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019967	GTC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019967	TA	3	6	8199	8204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019967	AT	3	6	8235	8240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019967	GTT	2	6	9706	9711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019967	TG	3	6	10072	10077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019967	TTC	2	6	10124	10129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019967	CA	3	6	10177	10182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019967	CGA	3	9	10246	10254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019967	AT	3	6	10891	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019967	GCG	2	6	10944	10949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019967	CAA	2	6	10968	10973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019967	TCT	2	6	11004	11009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019967	GA	3	6	11033	11038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019967	GCG	2	6	11059	11064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019967	CTA	2	6	11068	11073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019967	GAA	2	6	11086	11091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019967	AG	3	6	11102	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019967	TCA	2	6	11120	11125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019967	TGAG	2	8	11829	11836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019967	GAT	2	6	11876	11881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019967	CCA	2	6	11995	12000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019967	GAAT	2	8	12166	12173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019967	CAG	2	6	12285	12290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019967	TTG	2	6	14155	14160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019967	TCAC	2	8	14182	14189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019967	ACC	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019967	AGG	2	6	15587	15592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019967	AC	3	6	15658	15663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019967	GCC	2	6	15701	15706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019967	ACC	2	6	15768	15773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019967	ACA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019967	CAC	2	6	15819	15824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019967	GAA	2	6	15880	15885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019967	AGAA	2	8	15950	15957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019967	TCT	2	6	15990	15995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019967	ACA	2	6	16019	16024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019967	G	6	6	16105	16110	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019967	TC	3	6	16343	16348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019967	CGC	2	6	16456	16461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019967	ACACGT	2	12	16506	16517	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019967	AC	3	6	16571	16576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019967	TCC	2	6	16606	16611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019967	CCG	2	6	16840	16845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019967	CAG	2	6	16878	16883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019967	GGT	2	6	16951	16956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019967	AGG	2	6	17952	17957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019967	CGG	2	6	19008	19013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019967	GCC	2	6	19022	19027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019967	TGGG	2	8	19042	19049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019967	GCG	2	6	19050	19055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019967	A	6	6	19080	19085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019967	TCT	2	6	20038	20043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019967	GCAC	2	8	22650	22657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019967	GC	3	6	22663	22668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019967	GA	3	6	22704	22709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019967	CAGG	2	8	22715	22722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019967	CT	3	6	22736	22741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019967	CAA	2	6	22751	22756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019967	TC	3	6	22766	22771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019967	TTG	2	6	22776	22781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019967	TGT	2	6	23249	23254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019967	CT	3	6	24613	24618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019967	TCA	2	6	24763	24768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019967	GAA	2	6	24831	24836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019967	AT	3	6	24841	24846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019967	AT	3	6	24913	24918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019967	CGC	2	6	28100	28105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019967	GTT	2	6	28146	28151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019967	TG	3	6	28157	28162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019967	TCG	2	6	28177	28182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019967	T	6	6	29099	29104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019967	AATG	2	8	29113	29120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019967	CA	3	6	29156	29161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019967	AGC	2	6	29212	29217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019967	T	7	7	29218	29224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019967	TCG	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019967	CTA	2	6	29380	29385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019967	GTG	2	6	29396	29401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019967	GCC	2	6	29413	29418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019967	ATC	2	6	29438	29443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019967	CTA	2	6	31104	31109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019967	ACG	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019967	CTC	2	6	31149	31154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_019967	ACT	2	6	31171	31176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019967	CG	3	6	31255	31260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019967	TAC	2	6	32284	32289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019967	GCG	2	6	32298	32303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019967	GAA	2	6	34102	34107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019967	GAC	2	6	34129	34134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019967	GTC	2	6	34156	34161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019967	CAT	2	6	34194	34199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019967	CTA	2	6	34210	34215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019967	TAC	2	6	34233	34238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019967	GAA	2	6	34388	34393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_019967	TTG	2	6	34623	34628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_019967	TTG	2	6	43839	43844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_019967	TCC	2	6	83507	83512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_019967	GCG	2	6	83700	83705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_019967	CAC	2	6	83717	83722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_019967	CGG	2	6	85590	85595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_019967	GACTA	2	10	85740	85749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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457	NC_019967	TCG	2	6	87412	87417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_019967	GGTC	2	8	87953	87960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_019967	TGA	2	6	88239	88244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_019967	GTC	2	6	88341	88346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_019967	TAT	2	6	89395	89400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_019967	TG	3	6	89405	89410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
475	NC_019967	CTG	2	6	89414	89419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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