MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 1618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019967	GAA	2	6	164757	164762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019967	GGAG	2	8	164767	164774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019967	AAAT	2	8	164897	164904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019967	AAG	2	6	164972	164977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019967	ACT	3	9	164989	164997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019967	GCAGC	2	10	165046	165055	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1007	NC_019967	AGC	2	6	165070	165075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019967	GGT	2	6	165088	165093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019967	A	6	6	165123	165128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019967	CTA	2	6	166083	166088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019967	CGA	2	6	166102	166107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_019967	GACC	2	8	166108	166115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_019967	AT	3	6	166122	166127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019967	GC	3	6	166130	166135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_019967	TCGCGC	2	12	166136	166147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_019967	GCGA	2	8	166170	166177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_019967	GC	3	6	166180	166185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_019967	GGTC	2	8	166473	166480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_019967	GCGA	2	8	166481	166488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_019967	GGC	2	6	166496	166501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019967	GCGGG	2	10	166511	166520	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_019967	CAG	2	6	166551	166556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_019967	GTGG	2	8	166571	166578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019967	GC	3	6	166594	166599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_019967	CCG	2	6	166610	166615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_019967	GAG	2	6	166636	166641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019967	TAT	2	6	166685	166690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019967	CTC	2	6	166750	166755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_019967	CA	3	6	166756	166761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_019967	GAT	2	6	167442	167447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019967	ACGT	2	8	167462	167469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_019967	ATG	2	6	167552	167557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019967	CAG	2	6	167727	167732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019967	AGTC	2	8	167735	167742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_019967	CTG	2	6	167791	167796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_019967	TCG	2	6	167797	167802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019967	TTC	2	6	170656	170661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_019967	TAC	2	6	170778	170783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_019967	GCT	2	6	170980	170985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019967	CCT	2	6	171108	171113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_019967	GAG	2	6	172946	172951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019967	CGA	2	6	172989	172994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_019967	CGA	2	6	173026	173031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_019967	ATCT	2	8	173035	173042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_019967	AG	3	6	173071	173076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019967	ACG	2	6	173089	173094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019967	TCC	2	6	173164	173169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_019967	AG	3	6	173188	173193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019967	AAT	2	6	174286	174291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019967	CAA	2	6	174783	174788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_019967	T	6	6	174798	174803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019967	GTC	2	6	174817	174822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_019967	GGA	2	6	174875	174880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019967	GTTC	2	8	174885	174892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_019967	CCA	2	6	175714	175719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_019967	CCA	2	6	175734	175739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_019967	GA	4	8	175754	175761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019967	TCT	2	6	175810	175815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_019967	ATC	2	6	175820	175825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019967	GAA	2	6	175868	175873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019967	TTG	2	6	175907	175912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019967	ACT	2	6	175938	175943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_019967	CGA	2	6	175954	175959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019967	GA	3	6	175967	175972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019967	CA	3	6	176039	176044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_019967	CG	3	6	176142	176147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_019967	AC	3	6	177610	177615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_019967	GTA	2	6	177782	177787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019967	TGA	2	6	177808	177813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019967	GTT	2	6	177851	177856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019967	CCA	2	6	182132	182137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_019967	GTCT	2	8	182164	182171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_019967	CGA	2	6	182184	182189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019967	CCT	2	6	182202	182207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_019967	CGA	2	6	182298	182303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019967	TCG	2	6	182333	182338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019967	GTC	2	6	182401	182406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019967	TTC	2	6	182437	182442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_019967	GCT	2	6	182511	182516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019967	ATC	2	6	182548	182553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_019967	GGA	2	6	182571	182576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019967	GAT	2	6	182596	182601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019967	GA	3	6	182643	182648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019967	TCG	2	6	182741	182746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_019967	CTG	2	6	182782	182787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019967	CAG	3	9	182800	182808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_019967	CGAT	2	8	182828	182835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_019967	GAC	2	6	182875	182880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019967	TTG	2	6	182882	182887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019967	GTG	2	6	182914	182919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019967	AG	3	6	182920	182925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019967	GCC	2	6	182938	182943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_019967	TG	3	6	183100	183105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019967	CGA	2	6	183123	183128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_019967	CGT	2	6	183171	183176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_019967	GAC	2	6	184563	184568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_019967	GCC	2	6	184633	184638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_019967	CA	3	6	184649	184654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_019967	CTGC	2	8	184667	184674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_019967	GCTCT	2	10	190885	190894	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1101	NC_019967	TTCA	2	8	191597	191604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_019967	AC	3	6	191618	191623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_019967	TA	3	6	191644	191649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019967	GAGT	2	8	191676	191683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019967	TCC	2	6	191721	191726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_019967	CGA	2	6	191730	191735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_019967	TC	3	6	191778	191783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_019967	TC	3	6	191885	191890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_019967	CCG	2	6	191968	191973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_019967	TG	3	6	192004	192009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019967	CTC	2	6	192088	192093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_019967	CAA	2	6	192102	192107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_019967	CGG	2	6	192222	192227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_019967	ATC	2	6	192332	192337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_019967	CGT	2	6	192360	192365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_019967	GGT	2	6	192388	192393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019967	GTTC	2	8	192419	192426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_019967	TTGT	2	8	192509	192516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019967	TCC	2	6	192520	192525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_019967	CA	3	6	192564	192569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_019967	AAC	2	6	192626	192631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019967	TCGAC	2	10	192678	192687	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_019967	AAC	2	6	192734	192739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_019967	CA	3	6	192773	192778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_019967	CGT	2	6	192798	192803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_019967	CAG	2	6	192964	192969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019967	TTG	2	6	192971	192976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019967	CGA	2	6	193038	193043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_019967	AAC	2	6	193124	193129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_019967	TCG	2	6	193229	193234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_019967	TC	3	6	193320	193325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_019967	GCGA	3	12	193382	193393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_019967	CGAC	2	8	194826	194833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_019967	CGA	2	6	194862	194867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_019967	CCG	2	6	194875	194880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1271	NC_019967	AAT	2	6	216076	216081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_019967	TGG	2	6	237481	237486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_019967	GAA	2	6	237495	237500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_019967	CCT	2	6	237521	237526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1405	NC_019967	GCG	2	6	237527	237532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_019967	CCA	2	6	237543	237548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1407	NC_019967	CTG	2	6	237629	237634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_019967	GGT	3	9	237635	237643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_019967	CGCCT	2	10	237645	237654	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1410	NC_019967	GAA	2	6	237665	237670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_019967	TGTC	2	8	237701	237708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_019967	CGT	2	6	237762	237767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_019967	TCA	2	6	237782	237787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_019967	TCG	2	6	238232	238237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1419	NC_019967	TTG	2	6	238301	238306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_019967	TC	3	6	238307	238312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1421	NC_019967	CAG	2	6	239038	239043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_019967	TCTA	2	8	239111	239118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1424	NC_019967	ACC	2	6	239124	239129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1425	NC_019967	ACC	2	6	239132	239137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1426	NC_019967	CGCC	2	8	240297	240304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1427	NC_019967	CGG	2	6	240310	240315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1428	NC_019967	TC	3	6	240319	240324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1429	NC_019967	ATA	2	6	240336	240341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_019967	TA	3	6	240340	240345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_019967	TACAG	2	10	240486	240495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1432	NC_019967	TCC	2	6	241771	241776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1433	NC_019967	GGA	3	9	242951	242959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_019967	GTCT	2	8	245402	245409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1435	NC_019967	CGA	2	6	245471	245476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_019967	CGG	2	6	245480	245485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_019967	GAA	2	6	246316	246321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_019967	ACG	2	6	246328	246333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_019967	GTA	2	6	246383	246388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_019967	TGA	2	6	246417	246422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_019967	GTCGTT	2	12	247102	247113	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1443	NC_019967	TGT	2	6	247136	247141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_019967	CGG	2	6	247186	247191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1445	NC_019967	CCA	2	6	247535	247540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1447	NC_019967	TCCT	2	8	249747	249754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1448	NC_019967	AGC	2	6	249905	249910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_019967	ACTG	2	8	250003	250010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1451	NC_019967	AC	3	6	252157	252162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1452	NC_019967	GGT	2	6	252203	252208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_019967	GAC	3	9	252214	252222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_019967	GAG	2	6	253926	253931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_019967	CCT	2	6	253980	253985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1460	NC_019967	CTATG	2	10	254227	254236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1462	NC_019967	CGG	2	6	254460	254465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1464	NC_019967	TCT	2	6	255817	255822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1465	NC_019967	AAT	2	6	255854	255859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1489	NC_019967	AGT	2	6	261210	261215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_019967	CTG	2	6	261321	261326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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