MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 13527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019962	GTCG	2	8	1	8	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019962	GT	3	6	163	168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019962	TAG	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019962	CGGAG	2	10	206	215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019962	C	6	6	216	221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_019962	CGA	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019962	GA	3	6	266	271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019962	GCC	2	6	309	314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019962	GA	3	6	345	350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019962	TAG	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019962	TGT	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019962	TA	3	6	488	493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019962	CCT	2	6	505	510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019962	C	6	6	524	529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_019962	G	6	6	570	575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019962	CA	3	6	603	608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019962	TCG	2	6	694	699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019962	CGTC	2	8	737	744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019962	AGCC	2	8	757	764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019962	CGG	2	6	842	847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019962	AGC	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019962	CGG	2	6	905	910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019962	ATCG	2	8	944	951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019962	TTA	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019962	GAAG	2	8	1064	1071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019962	GCC	2	6	3973	3978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019962	TCG	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019962	CGC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019962	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019962	GTCG	2	8	4970	4977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019962	TCCCG	2	10	5005	5014	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_019962	AGC	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019962	CGGT	2	8	5029	5036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019962	TGCG	2	8	6681	6688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019962	CCT	2	6	6729	6734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019962	GCTT	2	8	6767	6774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019962	GTC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019962	TCAC	2	8	6832	6839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019962	TCT	2	6	6862	6867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019962	CAC	2	6	7507	7512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019962	CGC	2	6	8753	8758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019962	TCGA	2	8	8759	8766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019962	CGT	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019962	AAC	2	6	8827	8832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019962	CGA	2	6	9500	9505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019962	GCC	2	6	9534	9539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019962	TGA	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019962	ATCC	2	8	9562	9569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019962	ACGG	2	8	9574	9581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019962	CG	3	6	9624	9629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019962	TG	3	6	11027	11032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019962	GCG	2	6	11403	11408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019962	TCGC	2	8	12171	12178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019962	CGG	3	9	12185	12193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019962	TCG	2	6	12207	12212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019962	GCC	2	6	12213	12218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019962	CGG	2	6	16569	16574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019962	GTC	2	6	16586	16591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019962	GCC	2	6	16613	16618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019962	CCG	2	6	17992	17997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019962	CAG	2	6	18015	18020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019962	CCG	2	6	18053	18058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_019962	TTA	2	6	18125	18130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019962	AAT	2	6	18154	18159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019962	CGT	2	6	18199	18204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019962	TCG	2	6	18251	18256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019962	GCG	2	6	18267	18272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019962	CGTTC	2	10	21105	21114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019962	TCC	2	6	21141	21146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019962	CTT	2	6	22049	22054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019962	CCG	2	6	22058	22063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019962	TC	3	6	22074	22079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019962	TCGG	2	8	22867	22874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019962	GCG	2	6	22875	22880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019962	GCTG	2	8	24230	24237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019962	GCG	2	6	25035	25040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019962	CTA	2	6	25065	25070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019962	TCG	2	6	25842	25847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019962	CTA	2	6	28141	28146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019962	GTC	2	6	28163	28168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019962	CGCC	2	8	28180	28187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_019962	GCC	2	6	28215	28220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019962	GA	3	6	28891	28896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019962	TTA	2	6	29228	29233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019962	TACT	2	8	29234	29241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019962	ATA	2	6	29271	29276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019962	AACA	2	8	29309	29316	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019962	TGG	2	6	29322	29327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019962	CT	3	6	29998	30003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019962	TCT	2	6	30023	30028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019962	CTT	2	6	30040	30045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019962	ATTT	2	8	30052	30059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019962	CT	3	6	30060	30065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019962	TCA	2	6	30074	30079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019962	T	6	6	30091	30096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019962	AT	3	6	30216	30221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019962	T	7	7	30227	30233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019962	CCAC	2	8	30329	30336	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_019962	TCT	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019962	TAT	2	6	30432	30437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019962	TG	8	16	30495	30510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019962	CGTT	2	8	30530	30537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019962	AC	3	6	30564	30569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019962	CGGG	2	8	30641	30648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019962	CTT	2	6	30650	30655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019962	GCA	2	6	31648	31653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019962	GTG	2	6	31672	31677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019962	CGG	2	6	32295	32300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019962	TCGG	2	8	33156	33163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019962	GTC	2	6	33172	33177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019962	CGG	2	6	33180	33185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019962	TGA	2	6	33186	33191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019962	CCG	2	6	34649	34654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019962	TCGA	2	8	34670	34677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019962	CGGC	2	8	35466	35473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019962	GT	3	6	36698	36703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019962	CGGT	2	8	36730	36737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019962	CCCG	2	8	36792	36799	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_019962	CGC	2	6	36818	36823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019962	ATA	2	6	37292	37297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019962	CGAG	2	8	37327	37334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019962	GCG	2	6	37335	37340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019962	CGT	2	6	38125	38130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019962	GTT	2	6	38762	38767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019962	GCCC	2	8	38768	38775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_019962	TCG	2	6	38798	38803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019962	GCT	2	6	38831	38836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019962	GGT	2	6	38837	38842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019962	GGA	2	6	38884	38889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019962	CGG	2	6	38956	38961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019962	GT	3	6	38989	38994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019962	GTCGC	2	10	39069	39078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019962	GTC	2	6	39082	39087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019962	CGG	2	6	39114	39119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019962	TCG	2	6	40256	40261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019962	CG	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019962	CTT	2	6	40300	40305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019962	CCCGT	2	10	40334	40343	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_019962	CGAGGA	2	12	40482	40493	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_019962	CGC	2	6	40498	40503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_019962	CCG	2	6	40523	40528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_019962	GTCT	2	8	40600	40607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019962	GACGC	2	10	40640	40649	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_019962	CACAG	2	10	40705	40714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_019962	CGA	2	6	40729	40734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019962	TCT	2	6	40749	40754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019962	GTC	2	6	40836	40841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019962	GCC	2	6	40874	40879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_019962	GCT	2	6	40924	40929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019962	A	6	6	40978	40983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_019962	TTG	2	6	41346	41351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_019962	GGC	2	6	43988	43993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_019962	CTCG	2	8	55313	55320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
276	NC_019962	GC	3	6	55322	55327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
277	NC_019962	CGTGG	2	10	55333	55342	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
278	NC_019962	CGT	2	6	55348	55353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_019962	CG	3	6	55366	55371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
280	NC_019962	GAC	2	6	55402	55407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_019962	CCGC	2	8	56657	56664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
282	NC_019962	TCG	2	6	56679	56684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_019962	CGTT	2	8	56730	56737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_019962	CAA	2	6	56794	56799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_019962	GCG	2	6	56817	56822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_019962	ACC	3	9	56842	56850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_019962	TTTCTT	2	12	56873	56884	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
288	NC_019962	CCGAA	2	10	56998	57007	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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456	NC_019962	GCG	2	6	103877	103882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_019962	CGT	2	6	108522	108527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_019962	ACG	2	6	110338	110343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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