MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 13527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019962	CCG	2	6	234182	234187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_019962	CG	4	8	234210	234217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_019962	CGGT	2	8	234240	234247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_019962	GGTTC	2	10	234253	234262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_019962	AGT	2	6	234311	234316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019962	CGG	2	6	234674	234679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019962	GTG	2	6	235202	235207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019962	CGG	2	6	235227	235232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019962	CGA	2	6	236692	236697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019962	AGT	2	6	236727	236732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019962	ACG	2	6	237328	237333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_019962	TCGAC	2	10	237795	237804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_019962	GCG	2	6	237852	237857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_019962	GTC	2	6	237878	237883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_019962	CGTT	2	8	238197	238204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_019962	GGCG	2	8	242718	242725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_019962	TAC	2	6	242736	242741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_019962	TAC	2	6	242784	242789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_019962	CGG	2	6	242805	242810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_019962	TCG	2	6	242823	242828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019962	GAC	2	6	242897	242902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019962	CGA	2	6	243116	243121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_019962	CAG	2	6	243181	243186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019962	CGA	2	6	243466	243471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019962	TG	3	6	243475	243480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019962	CCGG	2	8	243486	243493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_019962	AAC	2	6	243524	243529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_019962	GGTG	2	8	245525	245532	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019962	GCG	2	6	245538	245543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_019962	GGTC	2	8	245586	245593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_019962	CGA	2	6	251281	251286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_019962	GTT	2	6	251300	251305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019962	GGC	2	6	251388	251393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019962	G	6	6	251986	251991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019962	TCG	2	6	252599	252604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_019962	GAC	2	6	252631	252636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019962	CGTC	2	8	252644	252651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_019962	TCGC	2	8	252652	252659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_019962	GTC	2	6	252676	252681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019962	CGGT	2	8	254178	254185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_019962	TGA	2	6	254276	254281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019962	CCA	3	9	254307	254315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_019962	TAT	2	6	254641	254646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019962	AG	3	6	256085	256090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019962	TTCG	2	8	256111	256118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_019962	GAGC	2	8	257209	257216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_019962	CGA	2	6	257221	257226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_019962	GAAC	2	8	257247	257254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_019962	AGG	2	6	257258	257263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019962	TCA	2	6	257272	257277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_019962	CGCA	2	8	257308	257315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_019962	TTG	2	6	258523	258528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019962	CCGA	2	8	258579	258586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_019962	GCG	2	6	259947	259952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019962	CGC	2	6	260257	260262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_019962	CCG	2	6	260265	260270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_019962	ACG	2	6	260273	260278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_019962	CGAG	2	8	260289	260296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_019962	GCC	2	6	261382	261387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_019962	GCC	2	6	261402	261407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_019962	A	7	7	261796	261802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019962	GACG	2	8	262177	262184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_019962	GGAT	2	8	262191	262198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019962	GCC	2	6	262226	262231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_019962	GTCG	2	8	262245	262252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_019962	AGG	2	6	263042	263047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019962	ATGC	2	8	263070	263077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_019962	CGG	2	6	263093	263098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019962	TGCC	2	8	263842	263849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_019962	GGT	2	6	265264	265269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019962	GAAA	2	8	265270	265277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019962	C	6	6	265466	265471	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1073	NC_019962	CGAC	2	8	265486	265493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_019962	CGGG	2	8	265509	265516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_019962	TC	3	6	265539	265544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_019962	GGC	2	6	265545	265550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019962	GTC	2	6	265574	265579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019962	CTCG	2	8	265580	265587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_019962	GCGCG	2	10	265631	265640	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1080	NC_019962	TC	3	6	265946	265951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_019962	CGAT	2	8	265955	265962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_019962	GCC	2	6	265969	265974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_019962	CGCC	2	8	265979	265986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1084	NC_019962	CGGT	2	8	265987	265994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_019962	TCG	2	6	267346	267351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019962	CCG	2	6	267352	267357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_019962	CGC	2	6	267380	267385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_019962	CCG	2	6	268173	268178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_019962	GCCGG	2	10	268488	268497	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_019962	CGT	2	6	268507	268512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_019962	CGTCA	2	10	268536	268545	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1092	NC_019962	GCC	2	6	269388	269393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_019962	ACG	2	6	269455	269460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019962	GCT	2	6	272097	272102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_019962	CTT	2	6	272836	272841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_019962	CCG	2	6	272862	272867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_019962	TACG	2	8	272868	272875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_019962	CG	3	6	272911	272916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_019962	TCGT	2	8	273728	273735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_019962	GTC	3	9	273748	273756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_019962	CGA	2	6	273780	273785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019962	CAG	2	6	273799	273804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019962	AGC	2	6	273842	273847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_019962	CGGTC	2	10	275832	275841	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1105	NC_019962	TTA	2	6	275864	275869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019962	CGT	2	6	278226	278231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_019962	CT	3	6	278937	278942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_019962	TGG	2	6	279077	279082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019962	GTCG	2	8	279093	279100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_019962	CGA	2	6	279130	279135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_019962	CGA	2	6	279147	279152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_019962	CGAC	2	8	279164	279171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_019962	GGT	2	6	279478	279483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019962	GAA	2	6	279544	279549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019962	AGT	2	6	280331	280336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019962	GCAG	2	8	282208	282215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_019962	TGT	2	6	282225	282230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019962	GGC	2	6	282244	282249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019962	GTC	2	6	282314	282319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019962	GAC	2	6	283705	283710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019962	GCCGC	2	10	283750	283759	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1122	NC_019962	AGT	2	6	283796	283801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019962	TC	3	6	283861	283866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_019962	AGT	2	6	284202	284207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019962	CGTC	2	8	284227	284234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_019962	GAC	2	6	286020	286025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019962	CTT	2	6	286057	286062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_019962	CGT	2	6	286069	286074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_019962	CTG	2	6	286079	286084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_019962	GACT	2	8	286130	286137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_019962	TC	3	6	287188	287193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_019962	TCG	2	6	287206	287211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_019962	CCGG	2	8	287297	287304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_019962	CGG	3	9	287302	287310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_019962	CTC	2	6	287332	287337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_019962	CGG	2	6	287372	287377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_019962	TCG	2	6	287381	287386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_019962	CGG	2	6	287402	287407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_019962	TCG	2	6	287453	287458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_019962	CTCG	2	8	289737	289744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_019962	TCCG	2	8	290644	290651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1144	NC_019962	CGA	2	6	290655	290660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1146	NC_019962	AACG	2	8	290782	290789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1160	NC_019962	CGG	3	9	292781	292789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1161	NC_019962	CGGC	2	8	292791	292798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1162	NC_019962	CCG	2	6	292815	292820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1165	NC_019962	CGC	2	6	293452	293457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1169	NC_019962	CCG	2	6	295134	295139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1173	NC_019962	GGT	2	6	297359	297364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1243	NC_019962	CGAT	2	8	312355	312362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1244	NC_019962	AGGC	2	8	312411	312418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1246	NC_019962	GTT	2	6	314384	314389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_019962	TTG	2	6	314402	314407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_019962	GACTC	2	10	314469	314478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1251	NC_019962	CAG	2	6	314523	314528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_019962	GGTTT	2	10	315086	315095	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_019962	AG	3	6	315133	315138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_019962	TCGA	2	8	315158	315165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1256	NC_019962	GAG	2	6	315170	315175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_019962	GCAG	2	8	316423	316430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1258	NC_019962	TGT	2	6	316440	316445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_019962	GGC	2	6	316459	316464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_019962	GTC	2	6	316529	316534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_019962	TAC	2	6	319932	319937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_019962	TCG	2	6	319960	319965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_019962	GA	3	6	319985	319990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_019962	TC	3	6	320067	320072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_019962	TCG	2	6	321562	321567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_019962	TC	3	6	321572	321577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1267	NC_019962	GA	3	6	321587	321592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_019962	CGC	2	6	321600	321605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1270	NC_019962	AGGT	2	8	321728	321735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_019962	CGT	2	6	378871	378876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_019962	CGTT	2	8	378951	378958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1410	NC_019962	CGGC	2	8	379005	379012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_019962	CGC	2	6	379094	379099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1479	NC_019962	GT	3	6	392646	392651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1480	NC_019962	GAT	2	6	392678	392683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_019962	TCG	2	6	392861	392866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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