MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 13527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019962	CGC	2	6	1450624	1450629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_019962	CGAT	2	8	1450655	1450662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_019962	GCA	2	6	1450711	1450716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_019962	TCG	2	6	1450729	1450734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019962	GAC	2	6	1450797	1450802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_019962	CGGTT	2	10	1450812	1450821	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_019962	TCGA	2	8	1451080	1451087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_019962	TGT	2	6	1451101	1451106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_019962	CGGC	2	8	1451129	1451136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_019962	GCT	2	6	1451165	1451170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_019962	TGT	2	6	1455046	1455051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019962	GTC	2	6	1455054	1455059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_019962	CCG	2	6	1455190	1455195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_019962	CGGA	2	8	1455203	1455210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_019962	GTC	2	6	1456045	1456050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_019962	TCGAT	2	10	1456056	1456065	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5017	NC_019962	TCC	2	6	1456630	1456635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_019962	TCG	2	6	1456652	1456657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_019962	CGA	2	6	1457126	1457131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019962	CGC	2	6	1457156	1457161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_019962	TC	3	6	1457239	1457244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_019962	GTA	2	6	1458822	1458827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019962	GC	3	6	1458834	1458839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_019962	CGT	2	6	1458842	1458847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_019962	TCA	2	6	1458899	1458904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_019962	CGA	2	6	1458925	1458930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_019962	ATAG	2	8	1458991	1458998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019962	CCG	2	6	1459019	1459024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_019962	GGC	2	6	1459027	1459032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_019962	TCG	2	6	1459039	1459044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_019962	GTC	2	6	1459549	1459554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019962	TCG	2	6	1459596	1459601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_019962	TC	3	6	1459637	1459642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_019962	TCG	2	6	1459678	1459683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_019962	CGTCC	2	10	1459719	1459728	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5036	NC_019962	CGG	2	6	1459758	1459763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_019962	CCGGA	2	10	1459764	1459773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5038	NC_019962	TGC	2	6	1459799	1459804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_019962	CTG	2	6	1459838	1459843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_019962	TG	3	6	1460333	1460338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019962	AGCG	2	8	1460375	1460382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_019962	GACC	2	8	1461586	1461593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_019962	CCG	2	6	1461595	1461600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_019962	ACT	2	6	1461633	1461638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_019962	GGA	2	6	1461647	1461652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_019962	GCG	2	6	1461754	1461759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_019962	CG	4	8	1461776	1461783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_019962	CG	3	6	1461800	1461805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_019962	TCCG	2	8	1461872	1461879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_019962	AGT	2	6	1461941	1461946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019962	CGG	2	6	1462794	1462799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_019962	CCG	2	6	1462850	1462855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_019962	GGCC	2	8	1462881	1462888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_019962	GGCGA	2	10	1462908	1462917	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5055	NC_019962	GA	3	6	1464714	1464719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019962	GCCGA	2	10	1464796	1464805	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5057	NC_019962	GAC	2	6	1465373	1465378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_019962	CCGA	2	8	1465397	1465404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_019962	CTT	2	6	1466635	1466640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_019962	CGC	2	6	1467125	1467130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_019962	GTC	2	6	1467137	1467142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_019962	TAG	2	6	1468985	1468990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_019962	GGA	2	6	1469086	1469091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019962	GTT	2	6	1469095	1469100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_019962	GTA	2	6	1469151	1469156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019962	CCG	2	6	1470093	1470098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_019962	ACC	2	6	1470176	1470181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_019962	GTC	2	6	1470494	1470499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_019962	TGT	2	6	1476200	1476205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019962	TG	3	6	1476274	1476279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_019962	TTC	2	6	1476315	1476320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_019962	CCT	2	6	1476322	1476327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_019962	CGGT	2	8	1477133	1477140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_019962	CGA	2	6	1477156	1477161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_019962	CCG	2	6	1477162	1477167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_019962	CAG	2	6	1477190	1477195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_019962	CCGTCC	2	12	1477201	1477212	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_019962	TCG	2	6	1477248	1477253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019962	ATCG	2	8	1477257	1477264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_019962	CGT	2	6	1477321	1477326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_019962	CGA	2	6	1477327	1477332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_019962	G	6	6	1477627	1477632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_019962	GAC	2	6	1477657	1477662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_019962	CGG	3	9	1478512	1478520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_019962	GCT	2	6	1479546	1479551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_019962	ACGA	2	8	1480825	1480832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_019962	CGA	2	6	1480867	1480872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_019962	CCG	2	6	1482712	1482717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_019962	AATA	2	8	1482739	1482746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_019962	CCG	2	6	1483295	1483300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_019962	TC	3	6	1483301	1483306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_019962	CT	3	6	1483324	1483329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_019962	CCG	2	6	1483330	1483335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_019962	AGC	2	6	1483370	1483375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_019962	ACCTC	2	10	1485889	1485898	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5096	NC_019962	TAA	2	6	1487868	1487873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_019962	CG	4	8	1487886	1487893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_019962	CGG	2	6	1487914	1487919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_019962	AT	3	6	1489411	1489416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019962	CTT	2	6	1489421	1489426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_019962	GTG	2	6	1489478	1489483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019962	CAG	2	6	1489485	1489490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_019962	CGG	2	6	1489525	1489530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_019962	GA	3	6	1489546	1489551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_019962	CGG	2	6	1489569	1489574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_019962	TCGG	2	8	1489580	1489587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_019962	GTC	2	6	1489628	1489633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_019962	GCT	2	6	1489700	1489705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_019962	AGT	2	6	1494031	1494036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_019962	GGC	2	6	1494103	1494108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_019962	GGCGA	2	10	1495588	1495597	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_019962	GTC	2	6	1495603	1495608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_019962	CGA	2	6	1495641	1495646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019962	CGT	2	6	1495655	1495660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_019962	CCGC	2	8	1495688	1495695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5116	NC_019962	CCG	2	6	1495723	1495728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_019962	CGA	2	6	1496125	1496130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_019962	TTCACT	2	12	1496151	1496162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019962	CA	3	6	1496170	1496175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_019962	TCG	2	6	1499818	1499823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_019962	GCC	2	6	1500202	1500207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_019962	TC	3	6	1500948	1500953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_019962	TCG	2	6	1500975	1500980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_019962	GCC	2	6	1500988	1500993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_019962	GCT	2	6	1501858	1501863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_019962	GCGT	2	8	1501884	1501891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_019962	CGGAA	2	10	1501913	1501922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5128	NC_019962	CAA	2	6	1501943	1501948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_019962	GACG	2	8	1501978	1501985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5257	NC_019962	GA	3	6	1538942	1538947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_019962	CCGGC	2	10	1542785	1542794	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5263	NC_019962	ACG	2	6	1544567	1544572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_019962	ATA	2	6	1544641	1544646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5267	NC_019962	GATA	2	8	1544657	1544664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_019962	CGG	2	6	1554075	1554080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5295	NC_019962	GC	3	6	1554089	1554094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5296	NC_019962	GCGCTC	2	12	1554144	1554155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5369	NC_019962	CT	3	6	1570446	1570451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5370	NC_019962	ATG	2	6	1572802	1572807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_019962	CGC	2	6	1573673	1573678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5378	NC_019962	GTC	2	6	1573693	1573698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5380	NC_019962	CTC	2	6	1573739	1573744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5382	NC_019962	GCC	2	6	1574713	1574718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5383	NC_019962	CGA	2	6	1575229	1575234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5385	NC_019962	GAC	2	6	1575548	1575553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5386	NC_019962	CCGGTC	2	12	1575557	1575568	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5387	NC_019962	GCCG	2	8	1575583	1575590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5388	NC_019962	AGG	2	6	1575625	1575630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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